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Heatmap: Cluster_185 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.73 0.17 -0.24 0.26 0.26 0.02 0.15 0.47 0.34 0.28 0.33 0.22 0.51 -1.19 -0.79 -0.5 -0.95 0.29 -0.39 -1.04 -4.54 0.63 -1.33 -1.02 0.85 0.2
0.62 0.55 0.19 0.21 0.12 -0.02 0.35 0.59 0.26 0.37 0.1 -0.05 0.38 -0.88 -1.36 -1.23 -1.04 -0.16 -0.53 -0.51 -1.97 0.66 -1.2 -0.46 0.93 -0.0
0.71 0.04 -0.22 0.23 0.21 0.09 0.33 0.29 0.05 -0.01 0.02 -0.02 0.74 -0.18 -1.12 -0.58 -0.96 0.03 -0.64 -0.65 -2.41 1.46 -1.26 -0.96 0.21 0.07
-0.05 -0.37 -0.13 0.49 -0.07 -0.94 -0.21 0.44 -0.19 0.39 0.14 0.01 0.55 -0.02 -0.76 -0.33 -1.27 -0.45 -0.58 -0.65 -1.2 1.69 -0.78 -0.64 0.5 0.43
0.59 0.23 -0.18 0.01 0.07 -0.22 -0.08 -0.01 0.01 0.2 0.28 0.07 0.67 -0.33 -0.32 -0.33 -0.3 -0.13 -0.35 -0.04 -3.32 0.63 0.09 0.15 0.05 -0.21
0.47 -0.07 0.03 0.22 0.79 0.8 0.29 0.24 0.11 0.17 0.19 0.04 0.38 -1.05 -1.52 -1.17 -1.1 -0.49 -1.22 -0.44 -0.87 0.87 -0.16 0.17 -0.15 0.01
0.65 0.15 0.13 0.2 -0.24 -0.59 -0.13 0.17 -0.18 0.03 0.08 0.15 0.66 -0.21 -0.58 -0.17 -0.23 -0.23 -0.4 -0.35 -1.66 0.8 -0.77 -0.68 0.78 0.27
0.6 -0.2 -0.5 0.31 0.26 -0.04 0.11 0.16 0.12 0.13 0.52 0.43 0.53 0.07 -0.49 -0.5 -1.11 -0.16 -0.87 -0.97 -1.24 0.45 -0.31 -0.02 0.26 0.28
0.76 0.14 -0.2 0.74 -0.09 -0.61 0.5 0.73 0.71 0.47 0.78 0.24 0.48 -1.27 -1.48 -1.42 -2.29 -0.55 -0.93 -1.36 -2.85 -0.03 -1.17 -0.85 1.32 0.17
0.73 0.05 -0.35 0.03 0.11 -0.17 0.16 0.37 0.27 0.08 0.38 0.35 0.76 -0.99 -0.79 -1.18 -0.7 -0.17 -0.41 -0.8 -4.13 1.26 -0.81 -0.49 0.5 0.11
0.32 -0.16 -0.35 0.39 0.3 -0.26 0.1 0.3 0.07 0.09 0.2 0.03 0.24 0.21 -0.16 -0.03 -0.42 -0.04 -0.23 -0.76 -2.6 0.51 -0.66 -0.35 0.67 0.2
0.77 0.4 0.36 0.22 -0.29 -0.78 -0.33 -0.08 -0.88 -0.74 -0.63 -0.43 0.72 -0.78 -0.2 -0.13 -0.44 0.29 -0.1 -0.45 -1.41 1.28 -0.57 -0.49 0.84 0.29
0.77 0.34 0.1 -0.02 -0.14 -0.22 0.23 0.27 -0.08 -0.16 -0.16 -0.13 0.75 -0.01 -0.4 -0.16 -0.32 0.02 0.02 -0.43 -3.07 1.11 -0.62 -0.85 0.05 -0.4
1.06 -0.05 -0.17 1.14 0.72 -0.08 0.1 0.09 -0.28 -0.31 0.14 -0.08 1.11 -0.9 -1.99 -1.3 -1.74 -1.37 -2.36 -1.89 -3.19 1.54 0.0 -0.7 0.28 0.16
0.47 0.07 0.09 0.17 0.08 0.41 0.39 0.42 0.1 -0.14 -0.15 0.11 0.61 0.0 -0.53 -0.3 -0.5 -0.71 -0.7 -0.72 -2.58 0.2 -0.14 -0.44 0.65 0.35
0.61 0.17 0.08 0.45 0.22 -0.32 0.0 0.18 0.04 -0.25 0.28 0.47 0.62 -0.35 -0.55 -0.34 -0.68 -0.06 -0.37 -0.69 -2.6 0.8 -0.44 -1.07 0.54 0.02
1.29 0.64 -0.26 -0.11 -1.18 -1.46 -0.97 -0.6 -0.89 -0.23 0.02 0.34 1.2 -1.16 -1.43 -1.22 -0.78 -0.23 -0.54 -0.86 -2.27 1.68 -0.98 0.23 0.71 0.72
1.43 0.19 0.15 -0.48 -0.88 0.11 0.32 0.72 0.21 -0.57 0.16 -0.3 0.69 -0.48 -0.59 -0.95 -0.68 -0.16 -0.95 -0.88 -4.97 -0.14 0.06 -2.18 1.35 0.28
0.82 0.23 0.21 0.02 -1.39 -2.36 -1.37 -0.34 -1.02 -0.19 0.17 0.65 1.04 -0.71 -1.47 -1.13 -1.41 -1.17 -1.38 -0.93 -3.76 1.72 -0.94 -0.19 1.32 1.37
0.72 -0.21 -0.14 0.53 0.5 -0.0 0.11 0.17 0.22 0.04 0.29 0.11 0.77 -0.4 -0.06 -0.45 -0.56 -0.51 -0.34 -0.76 -3.41 0.95 -1.15 -0.64 0.28 -0.37
0.88 0.11 0.07 0.22 0.16 -0.1 0.08 -0.04 -0.62 -0.6 -0.51 -0.3 1.02 -0.18 -0.41 -0.28 -0.47 0.11 -0.47 -0.58 -0.51 1.12 -0.64 -0.7 0.3 -0.09
0.69 0.25 0.3 0.66 -0.02 -0.96 -0.42 -0.07 -0.32 -0.29 0.1 0.48 1.07 -0.67 -0.52 -0.66 -0.52 -0.14 -0.57 -0.33 -2.19 0.91 -0.83 -0.62 0.18 0.62
1.03 0.36 0.02 0.02 0.13 0.38 0.58 0.56 -0.94 -0.77 -1.34 -1.7 0.69 -0.48 -0.93 -0.97 -0.91 -0.51 -0.65 -0.59 -1.62 1.54 -1.04 -0.43 1.24 -0.41
0.57 0.07 -0.3 0.01 -0.16 -0.21 0.39 0.68 0.53 0.41 0.43 0.15 0.43 -0.74 -1.28 -0.94 -1.42 -0.38 -0.99 -0.58 -1.8 0.5 -0.44 -0.38 1.07 0.32
0.21 0.18 0.26 0.5 0.23 -0.33 -0.05 0.16 -0.52 -0.21 0.18 0.4 0.49 -0.44 -0.54 -0.53 -0.38 -0.16 -0.48 -0.48 -2.82 0.96 -0.54 -0.05 0.39 0.44
1.19 1.27 0.95 0.61 -0.62 -2.87 -1.5 -0.84 -0.81 -0.14 0.11 0.58 1.21 -3.08 -3.03 -2.33 -0.64 0.17 -0.72 0.37 -3.34 0.32 -2.3 -0.49 0.85 0.69
1.12 -0.02 0.12 -0.05 -0.93 -2.03 -0.9 -0.51 -1.86 -0.85 -0.28 0.45 1.58 -1.66 -1.99 -1.7 0.23 -0.74 -1.27 -0.89 -0.43 2.19 -0.9 -0.98 0.45 0.53
0.8 0.5 0.18 0.92 0.53 0.48 0.42 0.22 -0.13 -0.39 0.1 0.62 1.08 -3.12 -2.85 -2.63 -2.52 -2.1 -2.07 -1.73 -2.04 0.77 -0.66 0.13 1.08 -0.13
0.08 -0.68 -0.34 0.28 0.24 0.14 0.31 0.1 0.08 0.27 0.44 0.35 0.28 0.24 -0.29 -0.21 -1.14 -0.77 -1.11 -0.72 -1.02 0.54 -0.29 0.27 0.62 0.19
0.16 0.09 -0.01 0.7 0.59 0.25 0.24 0.34 0.16 0.03 0.07 0.18 0.23 -0.69 -0.61 -0.48 -0.65 -0.14 -0.22 -0.4 -2.41 0.93 -0.65 -0.4 0.19 -0.35
0.69 0.27 0.36 0.46 -0.1 -0.86 -0.53 0.1 -0.5 -0.13 0.28 0.83 0.8 -0.78 -1.12 -1.41 -0.74 -0.6 -0.72 -0.88 -2.21 1.06 -0.66 -0.37 1.08 0.36
0.51 0.51 0.07 0.53 0.7 0.36 0.4 0.26 0.25 0.31 0.15 -0.12 0.11 -0.12 -0.58 -0.89 -0.55 -0.24 -0.27 -0.49 -5.5 0.85 -1.27 -0.99 0.25 -0.8
0.12 -0.29 -0.11 0.31 0.29 0.17 0.23 0.4 0.35 0.14 0.24 0.23 0.29 -0.18 -0.15 0.08 -0.66 -0.32 -0.03 -0.57 -2.45 0.66 -0.48 -0.7 0.23 -0.1
0.99 0.1 -0.25 -0.2 -0.57 -0.47 -0.51 -0.29 -0.37 -0.12 0.05 0.88 1.17 -1.18 -1.18 -0.38 -0.5 -0.13 -0.43 -1.14 -2.38 1.74 0.02 -1.02 0.23 -0.28
0.63 0.34 0.39 0.48 0.53 0.66 0.52 0.39 0.45 0.28 0.45 0.54 0.74 -1.13 -0.76 -1.16 -1.29 -0.71 -1.19 -1.41 -3.4 0.84 -1.69 -1.32 -0.02 -0.46
0.49 -0.11 -0.46 0.28 0.54 0.13 0.22 0.35 0.3 0.26 0.68 0.21 0.34 -0.51 -0.4 -0.65 -0.89 -0.79 -1.01 -0.97 -3.68 0.97 -0.41 0.04 0.51 -0.25
0.86 0.26 0.16 0.66 0.29 0.44 0.39 0.55 -0.03 0.08 0.28 0.36 0.9 0.08 -1.05 -0.64 -1.21 -0.84 -1.25 -1.05 -3.2 -0.11 -1.53 -1.07 0.43 0.32
0.34 0.1 0.06 0.18 0.18 0.05 0.19 0.21 0.03 0.08 0.01 0.14 0.43 -0.09 -0.48 -0.19 -0.33 -0.06 -0.4 -0.14 -1.58 0.59 -0.24 -0.23 0.07 -0.07
0.75 0.1 -0.12 0.18 0.26 0.0 0.68 0.76 -0.01 0.13 0.0 -0.32 0.82 -1.0 -1.56 -0.22 -1.14 -0.65 -0.78 -0.79 -5.08 0.6 -1.28 -0.52 0.9 0.65
-0.01 0.16 0.08 0.77 0.32 -0.64 -0.26 0.02 0.09 0.4 0.9 0.77 -0.01 -0.61 -1.08 -1.13 -1.13 -0.36 -0.75 -0.67 -2.22 1.27 -0.66 -0.63 0.38 0.25
0.7 0.09 -0.29 0.86 0.4 0.1 -0.0 0.5 0.01 0.52 0.6 0.26 0.22 -0.15 -0.62 -0.58 -0.7 -0.81 -0.69 -1.05 - 0.03 -0.78 -0.67 0.43 0.55
0.41 -0.04 0.19 0.32 0.04 -0.24 0.32 0.42 0.25 0.33 0.32 0.19 0.36 -0.52 -0.93 -0.58 -0.62 0.07 -0.53 -0.62 -2.65 0.97 -0.52 -0.54 0.23 0.14
0.64 -0.07 -0.04 0.49 0.23 0.16 0.29 0.55 0.53 0.29 0.44 0.28 0.43 -1.35 -1.51 -1.39 -1.33 -1.01 -1.16 -1.36 -2.53 1.22 -0.49 -0.12 0.55 0.1
1.19 0.44 0.24 0.84 -0.05 -0.76 0.23 0.63 -0.06 0.07 0.19 0.2 1.17 -1.51 -1.78 -1.22 -1.41 -0.86 -1.72 -1.01 -2.92 1.03 -1.66 -0.99 0.73 0.16
0.91 0.77 0.66 0.68 -0.31 -1.53 -0.86 -0.72 -0.22 0.08 0.66 1.07 1.2 -0.64 -1.46 -0.95 -1.01 -0.33 -1.22 -0.61 -2.06 0.63 -1.53 -0.24 0.16 0.05
0.42 -0.59 0.21 1.5 0.71 -0.38 -0.5 0.08 -1.99 -1.21 -0.84 -0.63 1.23 -0.64 -2.25 -1.6 -1.5 -2.01 -2.02 -1.79 -3.2 2.28 -1.21 -2.11 1.05 0.69
1.18 0.5 0.38 1.27 0.29 -1.66 -0.02 0.61 0.36 0.39 0.88 0.2 1.08 -3.27 -4.9 -1.74 -2.56 -0.73 -0.9 -1.35 -2.06 0.17 -0.27 -1.32 0.42 -0.32
0.81 0.62 0.19 1.03 0.43 -1.13 -0.39 0.3 -0.16 0.23 0.74 0.35 1.21 -1.27 -1.52 -1.13 -1.95 -0.97 -0.43 -1.15 -3.36 0.81 -0.85 -0.28 -0.03 0.04
0.67 -0.1 -0.74 0.37 0.71 0.56 0.57 0.5 0.43 0.07 0.2 -0.3 0.5 -0.27 -0.92 -0.87 -0.98 -0.01 0.04 -0.74 -3.95 0.0 -1.4 -0.57 0.76 -0.05
0.7 0.06 0.19 0.51 0.34 -0.07 -0.08 -0.1 -1.08 -0.89 -0.57 -0.14 1.04 -0.43 -0.76 -0.34 -0.87 -0.8 -0.93 -0.95 -1.8 1.58 -1.35 -0.71 1.14 0.31
0.91 -0.29 -0.44 -0.42 -0.78 -1.28 -0.18 -0.45 -0.17 0.08 0.26 0.37 0.96 -0.56 -1.06 -0.87 -1.18 0.34 -0.23 -0.8 -2.91 1.68 -0.36 -0.13 0.97 -0.01
1.13 0.03 0.02 0.08 -0.2 -1.0 -0.74 -0.21 -0.12 -0.28 0.15 0.13 1.17 -0.84 -0.29 -0.81 -0.98 -0.29 -0.69 -1.61 -1.08 1.64 -0.14 -0.77 0.3 0.22
0.95 -0.23 -0.41 0.54 0.29 -0.12 0.14 0.03 0.11 0.18 0.15 0.26 0.97 -0.2 -0.67 -0.86 -0.98 -0.5 -0.73 -1.35 -2.54 1.44 -1.09 -0.58 0.04 -0.05
0.32 0.27 0.24 0.45 0.34 0.26 0.18 0.36 0.34 -0.02 0.13 0.23 0.47 -0.53 -0.52 -0.57 -0.8 -0.34 -0.67 -0.45 -0.96 0.49 -0.56 -0.43 0.07 0.05
0.83 -0.33 -0.6 0.3 -0.14 -1.0 -0.21 -0.51 -0.43 0.06 0.65 0.64 0.86 -0.42 -1.39 -1.05 -1.29 -0.95 -1.57 -2.25 -0.45 1.73 0.23 0.33 0.58 -0.4
0.71 0.26 -0.09 0.23 0.11 -0.44 0.15 0.47 0.17 0.12 0.23 0.25 0.55 -1.24 -1.4 -1.3 -0.39 -0.31 -0.48 -0.85 -2.59 1.01 0.03 -0.33 0.64 0.13
0.01 0.22 -0.62 0.8 0.77 -0.49 0.86 0.66 0.61 0.71 1.25 0.79 0.34 -2.73 -1.21 -2.32 -3.32 -0.59 -1.64 -1.88 - 1.31 -1.84 -1.76 0.49 -1.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.