1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_56 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.02 0.19 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.07 0.04 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.15 0.0
0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.09 0.0 0.0 1.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.18 0.21 0.02
0.01 0.03 0.05 0.05 0.01 0.03 0.01 0.09 0.11 0.18 0.4 0.03 0.25 0.23 0.22 0.0 0.19 0.0 0.0 0.05
2.58 0.27 0.33 0.4 0.0 0.07 0.0 1.21 0.24 0.39 0.12 0.0 0.0 0.14 0.0 0.45 0.13 5.01 0.47 0.0
1.08 0.78 0.56 0.0 0.25 0.13 0.0 0.79 0.47 0.29 0.29 0.0 0.35 1.75 0.1 0.63 0.19 2.89 0.25 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.05 0.06 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.27 0.24 0.0 0.69 0.0 0.13 0.07 0.14 0.07 0.06 0.0 0.0 0.08 0.04 0.28 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0
0.25 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.03 0.05 0.12 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.12 0.2 0.09 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.11
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.17 0.0
0.61 0.92 0.48 0.45 0.3 0.0 0.53 0.21 0.05 0.21 0.04 0.01 0.13 0.2 0.04 0.17 0.05 0.08 0.36 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.15 0.14 0.0 0.39 0.26 0.14 0.34 0.21 0.2 0.28 0.06 0.26 0.2 0.33 0.0 0.15 0.65 0.33 1.12 0.2
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0
1.04 0.15 0.44 0.87 0.72 0.59 0.36 0.37 0.46 0.73 0.23 0.24 0.06 0.03 0.11 0.54 0.28 0.84 0.57 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.19 0.0
0.13 0.39 0.0 0.0 0.04 0.05 0.07 0.1 0.06 0.07 0.09 0.02 0.0 0.02 0.08 0.07 0.14 0.35 0.24 0.07
0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0
0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.26 0.05 0.05 0.04 0.12 0.48 0.01 0.04 0.1 0.02 0.05 0.02 0.08 0.14 0.01 0.03 0.13 0.08 0.05 0.29
3.52 5.46 4.16 5.3 4.96 3.17 6.24 8.27 7.68 7.63 15.32 11.16 1.42 2.16 11.2 11.89 6.61 13.8 1.88 3.65
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.54 0.0 0.0 1.38 1.32 1.53 0.27 6.15 3.09 4.71 1.21 3.27 0.76 1.05 2.5 4.25 1.84 5.92 0.26 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.02 0.33 0.14 0.0 0.0 0.02 0.03 0.07 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.04 0.0 0.01 0.02
0.03 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.21 0.03 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.27 0.22 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.38 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 1.23 3.08 0.0 0.0 0.0 0.0 3.61 0.0
0.22 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.31 0.0 0.09 0.0 0.0 0.06 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.03 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.04 0.12 0.09 0.05 0.03 0.07 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.03 0.0 0.0 0.05 0.04 0.08 0.01 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.09 0.09
3.77 0.0 1.56 0.0 0.79 0.0 6.11 0.59 1.46 0.83 0.72 0.0 0.0 0.26 2.74 1.2 0.0 1.44 1.01 0.6
0.45 0.0 0.42 0.44 0.07 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.11 0.0 0.06 0.28 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.02 0.02
1.47 0.4 0.0 0.57 0.63 0.0 0.15 0.19 0.0 0.12 0.39 0.0 0.07 0.0 0.17 0.0 0.0 0.67 0.93 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0
0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 1.87 1.29 0.11 0.0 1.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.22 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.37 0.23 0.37 0.17 0.11 0.0 0.15 0.03 0.08 0.06 0.05 0.0 0.06 0.0 0.04 0.0 0.0 0.14 0.25 0.05
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.03 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.04 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 3.92 0.0 0.0 0.69 0.1 0.12 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.19 0.13 0.0 0.5 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.18 0.01 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0
0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
1.1 0.0 0.11 1.06 0.0 0.0 0.2 0.1 0.03 0.18 0.11 0.0 0.04 0.12 0.2 0.26 0.0 0.0 0.07 0.1
0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.16 0.06 0.05 0.14 0.16 0.03 0.03 0.01 0.07 0.11 0.0 0.0 0.12 0.0 0.02
0.06 0.09 0.05 0.04 0.0 0.1 0.01 0.14 0.59 0.75 0.46 0.1 1.67 0.99 0.4 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09
0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.18 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)