Heatmap: Cluster_56 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00027	0.12	1.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.12	0.39	0.22	0.0	0.37	0.09	0.0	0.0	0.32	0.0	0.81	0.0
Gb_02771	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.08	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0
Gb_03709	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.85	1.0	0.11
Gb_03716	0.04	0.08	0.12	0.12	0.04	0.09	0.02	0.21	0.27	0.45	1.0	0.09	0.63	0.58	0.56	0.0	0.48	0.0	0.0	0.12
Gb_03806	0.52	0.05	0.07	0.08	0.0	0.01	0.0	0.24	0.05	0.08	0.02	0.0	0.0	0.03	0.0	0.09	0.03	1.0	0.09	0.0
Gb_03807	0.37	0.27	0.19	0.0	0.08	0.05	0.0	0.27	0.16	0.1	0.1	0.0	0.12	0.61	0.04	0.22	0.07	1.0	0.09	0.0
Gb_04025	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04145	0.71	0.79	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.04	0.77	0.85	0.35	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0
Gb_04263	0.39	0.34	0.0	1.0	0.0	0.19	0.1	0.2	0.1	0.09	0.0	0.0	0.12	0.06	0.41	0.0	0.0	0.0	0.38	0.0
Gb_04562	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_04711	1.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.13	0.19	0.47	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0
Gb_04788	0.58	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.95
Gb_06017	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.81	0.0
Gb_06566	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.64	1.0	0.48	0.14	0.0	0.0	0.04	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	0.55
Gb_06812	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0
Gb_07103	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.83	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07167	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.08	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.11	1.0	0.0
Gb_07593	0.66	1.0	0.52	0.49	0.32	0.0	0.58	0.23	0.06	0.23	0.05	0.01	0.14	0.22	0.04	0.18	0.05	0.09	0.39	0.0
Gb_07967	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.9	0.0	0.99	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0
Gb_08196	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_08267	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.47	0.18	0.0	0.0	0.15	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	0.0
Gb_08285	0.95	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.61	0.05	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_08819	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.85	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0
Gb_08971	0.14	0.12	0.0	0.35	0.23	0.12	0.3	0.19	0.18	0.25	0.05	0.23	0.18	0.29	0.0	0.13	0.58	0.29	1.0	0.18
Gb_09334	0.93	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.68	0.16	0.0	0.0	0.58	0.0	0.0	0.22	0.0	1.0	0.0	0.0	0.23	0.0
Gb_09962	1.0	0.14	0.42	0.84	0.69	0.57	0.35	0.35	0.45	0.7	0.22	0.23	0.05	0.03	0.11	0.52	0.27	0.81	0.55	0.05
Gb_11698	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_12793	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_12835	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_13325	0.34	1.0	0.0	0.0	0.11	0.13	0.19	0.26	0.16	0.19	0.22	0.06	0.0	0.04	0.21	0.18	0.36	0.89	0.62	0.18
Gb_13604	0.93	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_13967	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.61	0.0
Gb_14353	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.81	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16527	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.0
Gb_17365	0.54	0.11	0.1	0.08	0.25	1.0	0.03	0.07	0.2	0.03	0.1	0.05	0.17	0.3	0.02	0.06	0.28	0.16	0.11	0.61
Gb_17895	0.23	0.36	0.27	0.35	0.32	0.21	0.41	0.54	0.5	0.5	1.0	0.73	0.09	0.14	0.73	0.78	0.43	0.9	0.12	0.24
Gb_18227	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18920	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19654	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0
Gb_20303	0.09	0.0	0.0	0.22	0.22	0.25	0.04	1.0	0.5	0.77	0.2	0.53	0.12	0.17	0.41	0.69	0.3	0.96	0.04	0.0
Gb_21060	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21165	0.08	0.0	0.08	1.0	0.42	0.0	0.0	0.06	0.09	0.22	0.0	0.0	0.03	0.06	0.07	0.0	0.11	0.0	0.03	0.06
Gb_21572	0.14	0.0	0.0	0.0	0.6	0.0	1.0	0.13	0.05	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.0
Gb_21708	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0	1.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21718	0.0	0.69	0.56	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.99	0.0
Gb_21851	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.85	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_22365	0.68	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0
Gb_22510	1.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.19	0.08	0.03	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.1	0.0
Gb_23636	0.0	0.44	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	0.21	0.3	1.0	0.73	0.39	0.28	0.54	0.35	0.24	0.0	0.0	0.0	0.8
Gb_24786	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.04	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_25352	0.26	0.29	0.0	0.0	0.57	0.46	0.86	0.13	0.21	0.0	0.25	0.07	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.11	1.0	0.92
Gb_26127	0.62	0.0	0.26	0.0	0.13	0.0	1.0	0.1	0.24	0.14	0.12	0.0	0.0	0.04	0.45	0.2	0.0	0.24	0.17	0.1
Gb_26950	1.0	0.0	0.93	0.98	0.16	0.0	0.0	0.03	0.05	0.0	0.15	0.0	0.0	0.05	0.0	0.24	0.0	0.13	0.62	0.0
Gb_27316	0.78	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.17	0.0	0.0	0.0	0.14	0.12	0.0	1.0	0.33	0.0	0.65	0.58
Gb_28008	1.0	0.27	0.0	0.39	0.43	0.0	0.1	0.13	0.0	0.08	0.26	0.0	0.05	0.0	0.12	0.0	0.0	0.45	0.63	0.0
Gb_28327	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29008	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.86	0.0	0.26	0.0
Gb_29232	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.69	0.06	0.0	0.63	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30643	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_31358	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	1.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32191	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32241	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32355	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_32568	1.0	0.63	0.99	0.46	0.3	0.0	0.42	0.09	0.22	0.17	0.14	0.0	0.16	0.0	0.12	0.0	0.0	0.37	0.68	0.13
Gb_32904	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.21	0.0	0.0	0.26	0.07	0.13	0.0	0.48	0.8	0.4	0.0	0.0	0.0
Gb_33450	0.49	0.0	0.19	0.0	0.21	0.0	0.25	0.13	0.65	1.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.2	0.0
Gb_33526	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.18	0.03	0.03	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.05	0.03	0.0	0.13	0.05
Gb_34629	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.46	0.02	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_34681	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.35	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0
Gb_35571	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36465	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.35	0.18	1.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.51	0.71	0.0	0.0	0.64	0.0
Gb_37047	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37237	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37282	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37618	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37976	0.7	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.85	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_38834	1.0	0.0	0.1	0.96	0.0	0.0	0.18	0.09	0.03	0.17	0.1	0.0	0.04	0.11	0.18	0.24	0.0	0.0	0.06	0.09
Gb_39782	0.17	0.0	0.18	0.0	0.0	1.0	0.38	0.31	0.84	0.99	0.16	0.17	0.07	0.45	0.7	0.0	0.0	0.73	0.0	0.13
Gb_40003	0.04	0.05	0.03	0.02	0.0	0.06	0.0	0.08	0.35	0.45	0.28	0.06	1.0	0.59	0.24	0.0	0.0	0.01	0.0	0.05
Gb_40556	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41840	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)