Heatmap: Cluster_179 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00039	0.56	1.11	0.42	-0.83	0.52	-0.39	-0.55	0.05	-0.49	-0.37	0.21	-0.15	-0.29	-0.79	0.44	-0.84	-0.92	-0.29	0.46	-0.05
Gb_00224	0.49	-0.5	1.94	-1.28	0.23	-0.52	-0.4	0.27	-0.74	-0.71	0.73	-2.36	-4.85	-4.6	1.02	-0.38	0.05	0.01	0.3	-0.72
Gb_00291	0.25	1.27	0.84	-0.72	0.25	-0.4	-0.09	0.27	-0.04	0.04	0.04	-0.15	-0.98	-1.84	0.29	-1.0	-0.48	-0.29	-0.62	0.35
Gb_00497	0.78	0.87	0.79	0.14	0.76	-0.38	-0.36	-0.31	-0.57	-0.51	0.15	-0.85	-1.7	-2.04	0.19	-0.75	-0.76	0.39	0.36	0.11
Gb_00509	0.02	-0.03	0.35	1.26	-0.42	-1.71	-0.08	0.09	0.22	0.04	0.47	0.12	-0.41	-0.24	0.27	0.17	-0.5	-0.47	-0.53	-0.85
Gb_00608	0.52	0.01	0.14	0.11	-0.28	0.19	-0.72	-0.08	-0.45	-0.11	0.23	-0.81	-0.25	-0.26	0.23	-0.13	-0.02	0.22	0.23	0.46
Gb_02473	0.62	-0.47	-0.76	-1.35	1.13	0.39	-0.64	-0.13	-1.8	-0.81	-0.39	-0.21	-1.11	-0.49	-0.23	0.28	0.42	1.32	0.21	-0.01
Gb_02492	0.27	-0.0	0.65	-0.11	0.48	0.34	0.35	-0.21	-0.53	-0.38	0.24	-0.6	-2.65	-2.68	0.35	-0.41	-0.49	0.85	0.17	0.29
Gb_02508	-0.92	-0.22	-0.24	0.14	0.63	0.43	-2.01	0.64	-0.34	-0.39	0.45	0.38	-0.12	-0.23	0.31	-0.19	0.21	0.68	-0.89	-0.85
Gb_02560	-0.37	0.93	0.3	-0.25	0.49	-0.5	-0.25	0.03	0.11	0.09	-0.1	-0.44	-0.26	-0.43	-0.01	-0.45	-0.21	0.24	0.31	-0.22
Gb_02682	-1.41	-0.84	-1.89	-1.02	-0.18	0.24	-2.65	0.52	-0.72	-0.63	1.09	-0.33	0.6	0.32	1.11	-0.42	0.44	0.22	0.73	-0.66
Gb_02813	0.58	0.67	0.34	0.3	1.42	0.02	0.08	-0.26	-2.18	-1.11	-1.63	-0.72	-0.6	-0.64	-1.9	-1.17	-1.26	0.75	0.38	0.85
Gb_04410	-0.05	-1.65	-1.27	0.51	1.22	-2.97	-2.05	0.49	-0.44	-0.09	-0.65	-0.52	0.35	1.24	-0.87	-0.83	-0.24	1.26	0.66	-2.28
Gb_04423	-1.12	-0.22	-2.0	0.55	1.47	-2.81	-3.53	0.45	-0.53	-0.29	-0.59	0.42	0.4	0.12	-0.98	0.15	0.57	1.15	0.41	-4.66
Gb_05515	-0.89	0.2	0.87	-3.43	0.2	-1.2	0.49	0.72	0.97	1.0	0.69	0.2	-1.2	-2.37	0.25	-0.68	-0.34	-0.62	-5.77	0.18
Gb_05824	-0.16	1.73	1.1	-0.46	0.49	0.1	-0.44	-0.19	-0.87	-1.12	-0.84	-1.67	-0.88	-1.11	-0.03	-1.29	-1.29	1.29	-0.03	-0.48
Gb_05870	-1.03	-0.24	0.07	-0.92	0.11	-0.37	0.12	0.32	-0.44	-0.46	0.41	-0.02	0.18	0.11	0.45	-0.66	-0.62	0.53	0.73	0.2
Gb_06217	-0.69	1.07	0.4	-0.08	0.57	-0.12	-1.84	-0.09	-0.29	-0.15	0.73	-0.27	-0.36	-0.18	0.71	-1.3	-1.12	0.07	0.47	-0.76
Gb_06409	-0.06	0.84	0.44	-1.44	0.48	0.11	0.3	0.2	-0.7	-0.36	-0.06	-0.72	-0.62	-0.93	0.43	-0.8	-0.5	0.67	0.06	0.33
Gb_06581	0.54	0.73	0.13	-0.16	0.06	0.62	-0.69	-0.06	-0.64	-0.64	0.31	-0.87	-0.14	-0.57	0.43	-0.64	-0.5	-0.18	0.36	0.3
Gb_06654	0.11	0.68	0.69	-0.04	0.76	0.71	0.81	-0.23	-1.36	-1.2	-1.25	-1.21	0.06	0.07	-0.78	-1.65	-1.37	0.65	0.47	-0.34
Gb_06655	0.2	-1.03	-0.17	0.38	0.88	1.04	0.98	-0.39	-1.06	-0.95	-0.66	-0.87	-0.15	0.07	-0.35	-0.55	-0.9	0.45	0.22	-0.19
Gb_06915	-0.56	-0.61	0.08	0.06	0.4	-0.53	-0.35	0.2	-0.58	-0.7	0.7	-0.02	-0.05	-0.21	0.96	-1.32	-0.9	0.72	0.79	-0.66
Gb_07306	-2.91	-2.34	-3.01	-1.38	0.72	-0.03	-0.82	0.6	0.02	-0.03	0.26	0.77	-0.92	-0.42	0.38	-0.76	0.07	1.7	0.67	-1.01
Gb_07855	0.8	-0.12	0.33	0.27	0.67	0.15	-1.21	0.08	-0.66	-0.76	-0.08	-1.06	-4.39	-9.09	0.49	0.43	-0.09	1.17	0.09	-0.01
Gb_08442	-0.5	-0.25	-0.47	-0.52	-0.48	-0.62	-0.46	0.26	-0.1	-0.2	0.23	-0.07	0.49	0.32	0.17	-0.07	0.18	0.25	0.8	0.03
Gb_08503	-1.01	-0.19	-0.09	0.17	0.15	-0.12	-0.23	0.32	-0.25	-0.36	0.38	0.1	0.19	0.37	0.26	-0.35	0.26	0.08	0.11	-0.56
Gb_09101	0.52	0.77	0.24	0.23	0.3	0.74	-0.34	0.02	-0.47	-0.61	0.42	-0.9	-0.2	0.04	0.33	-0.51	-0.77	-0.22	-0.54	-0.88
Gb_09584	-0.06	0.05	-0.12	-0.18	0.29	-0.19	-0.56	-0.01	-0.19	-0.18	0.41	-0.41	0.4	0.15	0.34	-0.22	-0.22	0.1	0.2	-0.04
Gb_09693	-0.92	1.17	-0.88	-0.46	0.7	-0.05	-1.67	0.16	-0.06	-0.12	0.13	-0.71	0.21	-0.16	0.19	-0.75	-0.78	0.43	0.5	0.28
Gb_11281	0.18	1.29	1.45	-0.17	0.94	-0.61	-0.14	-0.31	-0.48	-0.77	-0.63	-0.51	-1.68	-1.69	-0.6	-1.09	-0.86	0.34	0.44	-0.09
Gb_11829	-0.97	-1.73	-1.16	0.13	0.82	0.07	-0.73	0.44	-0.51	-0.29	0.1	0.83	-0.32	-0.39	0.18	-0.5	0.91	0.6	0.1	-0.69
Gb_11916	0.51	0.19	0.24	-0.41	0.74	0.3	-0.54	0.05	-0.63	-0.42	0.63	-0.65	-0.67	-1.14	0.51	-0.98	-0.84	0.49	0.05	0.36
Gb_12114	0.93	1.35	1.77	0.65	1.09	-0.34	-0.98	-0.66	-1.53	-1.18	-2.26	-1.43	-1.31	-1.38	-2.39	-1.39	0.02	0.05	0.08	-0.6
Gb_12637	-0.44	-0.02	0.4	-0.83	0.87	-0.37	-0.11	0.43	0.04	0.1	0.09	0.11	-0.62	-0.71	0.15	-0.19	-0.3	0.46	-0.29	0.02
Gb_13287	-0.09	0.19	0.73	-1.15	0.65	-1.36	0.65	-0.16	-0.73	-0.8	0.96	-0.65	-0.53	-0.56	0.67	-0.34	-0.43	0.08	0.59	-0.79
Gb_14072	0.15	0.99	0.45	0.15	0.4	-0.43	-0.9	-0.0	-0.15	-0.41	-0.13	-0.55	-0.05	-0.21	-0.03	-0.48	-0.62	0.15	0.37	0.01
Gb_15086	0.45	1.34	1.4	0.09	0.52	-1.33	0.86	-0.45	-0.96	-1.03	-2.04	-1.46	-1.7	-2.17	-1.15	-0.46	-0.68	0.65	0.58	0.0
Gb_15103	-0.28	0.5	0.05	-0.71	0.03	1.63	-0.38	0.06	-0.56	-0.2	0.38	-0.21	-2.3	-2.32	0.22	-0.34	0.02	0.11	0.03	-0.01
Gb_15185	0.92	0.33	0.8	0.74	1.82	-0.83	-0.4	-0.62	-1.15	-1.3	-3.35	-1.14	0.03	-0.97	-2.49	-2.78	-2.07	0.59	1.11	-0.41
Gb_15381	0.42	0.85	0.75	0.23	1.0	-0.29	0.15	-0.42	-0.65	-0.71	-1.2	-0.62	-2.19	-1.78	-0.66	-0.95	-0.4	1.24	0.22	0.05
Gb_15737	-0.07	1.12	0.8	-0.42	0.83	-0.12	-0.19	-0.1	-1.08	-0.63	-0.24	-0.28	-1.65	-1.38	-1.04	-0.91	-1.5	0.67	0.98	0.52
Gb_17773	0.09	-0.6	-0.51	-0.59	0.23	-0.02	-0.81	0.24	0.51	0.43	0.54	-0.54	-0.73	-1.05	0.59	0.11	0.18	0.27	0.55	-0.7
Gb_17879	0.12	0.87	0.81	-1.38	-0.06	-0.39	-0.06	0.62	0.23	-0.33	-0.01	0.14	-1.68	-2.03	0.25	0.03	-0.03	-0.42	0.38	-0.2
Gb_17928	-0.1	-0.22	0.15	0.18	0.37	-1.75	0.37	0.15	0.26	-0.24	0.19	0.01	-0.75	-1.35	0.32	-0.18	0.29	0.22	0.37	-0.01
Gb_18242	0.04	0.97	0.35	-0.78	0.53	-0.39	0.57	-0.33	-0.54	-0.35	-0.17	-0.98	-0.64	-0.82	-0.3	-0.48	-0.53	0.75	0.21	0.62
Gb_18455	0.7	0.08	1.03	-0.33	0.55	0.25	0.32	-0.14	-0.72	-0.72	-0.46	-0.31	-2.6	-2.65	-0.12	-0.64	-0.25	0.66	0.56	0.18
Gb_18556	1.11	0.8	1.15	0.55	0.55	-0.68	-0.75	-0.31	-0.9	-0.94	-1.0	-0.87	-0.81	-0.82	-0.84	-0.92	-1.52	0.54	0.76	0.12
Gb_18973	0.26	0.95	0.68	-0.07	0.49	-0.37	-0.69	-0.1	-0.38	-0.54	0.14	-0.51	-0.25	-0.73	0.01	0.07	-0.45	0.01	0.12	-0.0
Gb_19160	0.46	1.06	0.28	-1.25	0.34	-2.21	0.0	-0.4	0.12	0.07	0.77	-1.55	-0.75	-0.95	0.42	-0.17	-0.26	0.25	0.33	-0.23
Gb_19688	-0.57	0.21	0.29	-0.34	-0.52	-0.55	-0.06	0.24	0.57	0.47	0.22	0.1	-0.49	-0.18	-0.08	0.48	0.5	-0.07	-0.07	-1.99
Gb_19801	0.11	-0.04	0.25	-0.03	0.2	-1.25	-0.3	-0.14	-0.25	-0.34	0.87	-0.22	0.01	-0.2	0.78	-0.37	-0.19	0.04	-0.24	0.07
Gb_20042	0.12	1.46	0.4	-1.39	0.72	-0.35	0.52	-0.32	-0.63	-0.77	0.46	-1.13	-1.39	-1.02	-0.09	-0.31	-0.36	0.37	-0.2	0.22
Gb_20271	0.16	-0.86	0.13	0.02	0.05	-0.14	-0.55	0.43	-0.59	-0.63	0.3	-0.37	0.23	-0.01	0.19	-0.15	-0.38	0.62	0.44	0.08
Gb_20319	0.72	-0.06	0.63	0.03	0.56	-0.36	-0.58	-0.11	-0.21	-0.2	0.25	-0.31	-0.61	-0.84	0.24	-0.36	-0.51	0.06	0.31	0.13
Gb_20530	0.57	1.09	0.89	-0.43	0.91	-0.71	-0.36	-0.5	-0.67	-1.16	-0.03	-0.85	-3.0	-4.44	0.09	0.06	-0.78	0.14	0.76	0.62
Gb_22181	-1.2	0.62	0.72	-0.64	2.09	-2.08	1.48	-0.47	-0.4	-0.15	-0.59	-0.82	-0.9	-1.52	-0.71	-4.06	-3.85	-0.29	0.66	-0.32
Gb_22600	0.47	0.03	0.23	0.13	0.61	-0.18	-0.35	-0.08	-0.19	-0.11	0.08	-0.41	-0.77	-0.88	0.14	-0.14	-0.16	0.38	0.12	0.21
Gb_22796	0.3	-0.53	0.26	0.66	0.0	-1.04	-0.98	-0.29	-0.42	-0.52	0.26	-0.72	0.45	0.7	0.29	-0.36	-0.56	0.0	0.51	0.2
Gb_23190	0.72	0.65	0.61	0.37	0.26	0.06	0.11	-0.02	-0.46	-0.65	-0.44	0.02	-2.52	-1.92	-0.46	-0.17	-0.17	0.74	0.25	-0.4
Gb_25487	-0.4	1.32	0.62	-1.45	0.57	0.33	0.64	-0.53	-1.08	-1.02	-1.08	-0.52	-2.25	-2.1	-1.0	-0.29	0.0	0.69	0.57	0.89
Gb_25850	0.68	1.5	1.37	0.96	1.26	-0.87	-0.09	-0.99	-1.61	-1.03	-0.68	-1.76	-	-3.72	-1.52	-1.21	-1.7	0.89	0.36	-0.7
Gb_26882	-0.35	0.24	0.9	-0.53	0.22	-0.19	0.19	-0.34	-0.25	-0.05	0.47	0.28	-1.12	-0.63	0.47	-0.01	0.03	-0.17	-0.25	-0.24
Gb_27659	0.59	0.99	0.35	0.55	0.42	-1.09	0.2	-0.01	-0.85	-1.55	-0.12	-1.02	0.56	0.05	-0.31	-0.87	-0.37	-0.18	0.47	-0.68
Gb_29052	0.72	0.48	0.55	0.25	0.39	-0.97	-0.79	-0.18	-0.28	-0.31	0.0	-0.99	-0.55	-0.76	0.11	-0.13	-0.68	0.68	0.35	0.18
Gb_29123	0.11	-0.2	0.57	-1.12	1.09	0.46	-0.13	-0.23	-0.63	-1.81	-0.01	-0.77	0.34	0.15	-0.18	-0.87	0.14	0.71	-0.36	0.03
Gb_29694	0.57	1.03	1.61	0.14	0.73	0.2	0.23	-0.25	-1.25	-1.14	-0.56	-0.0	-3.22	-2.81	-0.71	-1.61	-1.04	0.42	0.44	-0.75
Gb_30588	0.58	0.47	0.16	-1.62	0.27	0.68	1.22	-0.03	-1.0	-1.15	-0.37	-0.81	-0.03	-0.43	-0.36	-1.5	-1.31	1.16	-2.35	0.67
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.