Heatmap: Cluster_183 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.21 0.09 0.49 0.0 0.14 0.4 5.4 0.08 0.04 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.08 0.21 0.0 0.0 0.54 0.04
4.4 4.24 3.93 2.56 5.37 2.43 21.48 5.86 4.29 5.64 11.95 5.35 8.47 4.82 12.67 8.13 6.85 4.58 10.21 19.06
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 33.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.48 1.14 4.61 1.02 0.75 3.95 47.42 0.03 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 1.31 3.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.6 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.11 3.84
0.03 0.12 0.0 0.0 0.0 0.48 0.28 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.01 0.05 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0
1.87 0.07 0.16 0.06 0.48 0.1 16.04 0.04 0.05 0.08 0.03 0.32 0.04 0.03 0.04 0.22 0.35 0.35 0.43 9.96
0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.37 0.07 0.12 0.0 0.28 0.05 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 1.03 0.0
32.18 53.8 9.46 12.51 52.19 635.67 352.73 7.15 9.74 14.06 0.97 4.03 4.34 5.91 3.56 31.95 29.74 84.33 0.0 192.96
3.97 0.31 1.35 1.98 0.73 7.33 13.93 0.35 0.11 0.25 0.18 0.52 0.09 0.08 0.19 0.61 0.88 1.14 0.25 3.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.17 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.87 0.22 0.04 0.21 0.12 0.03 0.11 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0
15.75 0.32 3.05 4.06 3.76 6.39 285.87 8.48 5.35 7.23 0.09 14.42 3.61 7.0 0.04 3.83 6.67 9.63 1.01 43.29
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 4.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 4.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01
6.56 5.96 11.6 2.89 2.64 9.29 17.1 5.17 4.23 3.97 3.84 7.31 3.98 6.77 2.5 5.21 4.13 7.19 3.43 12.62
0.56 20.69 0.0 0.4 4.16 25.03 196.81 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 2.27 15.83
772.2 1750.25 732.32 358.74 161.56 3.25 534.38 3.37 0.17 0.06 0.02 0.07 0.06 0.08 0.0 1.2 0.19 2.0 0.58 5.34
1.86 1.42 1.19 1.46 1.17 9.31 8.07 1.87 0.48 0.43 1.35 4.47 0.34 0.65 1.47 0.51 0.61 1.6 1.19 9.83
5.37 4.59 5.25 3.75 4.3 28.81 18.02 6.24 1.46 2.79 2.48 12.54 2.79 3.48 1.85 2.5 2.07 5.94 3.31 29.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 11.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.06 3.27 0.15 0.14 0.11 0.1 0.03 0.0 0.02 0.09 0.0 0.16 0.09 0.31 0.0
0.13 0.04 0.01 0.05 0.08 0.09 2.99 0.04 0.02 0.03 0.0 0.1 0.0 0.02 0.02 0.0 0.05 0.22 0.01 0.24
1.81 70.67 8.1 8.57 1.14 5.59 398.19 3.84 13.98 20.65 2.8 12.15 6.26 11.49 0.95 1.6 2.61 1.17 0.0 5.61
2.14 10.25 2.76 1.02 0.91 3.19 8.01 1.12 1.94 2.27 1.11 0.37 0.7 0.94 1.02 2.77 1.14 0.85 0.9 0.28
3.48 20.98 4.93 2.44 1.71 8.08 15.75 1.74 2.92 2.9 1.11 0.53 1.47 1.74 0.89 3.77 1.48 1.31 1.89 0.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 177.61 0.44 1.22 0.49 0.0 0.0 0.93 0.88 0.05 0.2 0.0 0.0 0.0 7.43
0.1 0.11 0.15 0.0 0.11 0.06 7.96 0.04 0.08 0.06 0.28 0.13 0.06 0.0 0.05 0.0 0.11 0.35 0.18 0.17
0.37 39.05 0.37 0.0 1.43 35.52 553.16 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.17 0.18 2.5
0.98 10.45 0.07 0.34 0.08 3.3 104.62 0.17 0.07 0.04 0.07 0.19 0.12 0.13 0.0 0.0 0.0 2.28 0.05 25.6
0.24 14.36 2.57 0.17 1.25 6.0 24.6 2.4 11.77 6.06 2.28 0.42 5.3 5.07 3.38 1.22 1.18 3.4 23.88 1.91
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1130.35 5511.28 1773.57 1767.92 203.62 356.71 1816.71 486.97 367.2 443.73 78.84 1570.35 1018.08 1463.28 60.28 235.44 423.29 30.36 1.46 62.8
0.78 3.91 1.59 0.68 0.97 0.19 3.32 0.77 0.53 0.77 2.47 1.97 1.03 0.5 1.52 0.18 0.34 0.67 0.0 1.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.53 6.7 2.47 1.58 6.64 6.85 10.64 4.88 2.92 2.87 4.98 4.81 0.7 0.15 4.79 0.62 1.79 3.43 3.7 13.04
54.43 291.06 55.05 21.58 40.58 30.63 159.29 6.99 1.2 0.74 0.49 9.01 0.22 0.69 0.58 3.42 1.32 37.61 80.21 17.3
25.12 32.29 12.8 8.47 11.72 17.98 33.17 10.77 12.55 10.32 8.99 10.1 8.01 5.79 9.93 6.82 6.46 11.37 14.51 26.03
0.03 0.0 0.1 0.08 0.1 0.12 0.33 0.03 0.05 0.04 0.07 0.02 0.04 0.04 0.09 0.07 0.0 0.05 0.03 0.0
17.56 15.89 24.96 13.81 12.04 9.6 12.2 8.98 5.38 4.78 8.82 7.02 4.35 4.11 8.68 12.02 8.12 6.99 13.29 10.48
31.95 1.31 0.99 0.25 0.36 0.2 86.12 3.81 0.51 0.53 1.11 1.99 1.41 0.49 0.47 0.15 0.1 1.87 3.91 113.56
18.43 7.54 8.32 6.16 6.92 2.13 33.79 2.24 0.37 0.28 0.3 0.97 0.29 0.29 0.11 0.49 0.81 9.47 3.85 30.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.69 1.08 1.78 0.96 0.59 0.92 2.9 0.81 0.21 0.16 0.29 0.0 0.55 0.11 0.21 0.52 0.42 0.12 0.0 0.86
0.48 1.09 0.05 0.08 0.09 8.1 8.45 2.0 0.05 0.09 0.5 2.53 1.44 1.94 0.33 0.0 0.0 0.61 0.55 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.68
84.09 75.05 25.56 6.46 1.04 10.91 1760.44 287.76 0.05 0.2 5.01 424.67 35.78 28.12 3.95 0.0 0.0 1.4 1.26 151.76
2.47 25.79 51.61 19.77 2.49 4.6 54.64 9.0 5.16 9.87 3.47 2.93 17.91 34.1 5.07 1.16 10.37 0.35 0.22 24.31
1.08 3.07 0.35 0.25 0.32 2.01 3.97 1.12 1.06 0.31 0.47 0.63 3.12 2.59 0.72 0.0 0.35 1.04 0.02 0.76
0.13 0.0 0.2 0.0 0.0 0.08 0.81 0.06 0.04 0.08 0.06 0.02 0.03 0.09 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 10.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
40.31 27.7 35.93 34.5 32.21 88.01 111.62 47.33 38.59 34.34 50.9 35.32 50.01 43.33 54.45 30.16 38.3 30.62 34.41 83.42
0.3 0.08 0.03 0.0 0.02 0.02 12.86 0.02 0.02 0.02 0.01 0.07 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.3
0.94 0.61 0.61 0.0 0.25 0.86 5.57 0.2 1.57 0.99 0.0 0.01 0.27 2.07 0.05 0.12 0.0 6.34 0.1 0.54
1.69 0.06 0.36 0.35 0.44 0.0 6.68 0.11 0.47 0.14 0.04 0.05 0.23 2.51 0.01 0.0 0.0 0.57 0.12 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.15 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
43.76 115.11 121.0 20.97 48.71 189.96 447.8 171.12 152.82 183.54 31.58 320.28 283.71 213.85 21.75 6.59 30.42 30.64 7.07 261.07
31.95 1.31 0.99 0.25 0.36 0.2 86.12 3.81 0.51 0.53 1.11 1.99 1.41 0.49 0.47 0.15 0.1 1.87 3.91 113.56
1.04 0.74 0.63 1.07 0.63 1.02 7.91 0.25 0.17 0.17 0.21 0.5 0.29 0.14 0.44 0.12 0.05 0.1 0.43 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 1.21 6.65 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.22
330.06 142.12 253.71 102.45 56.8 73.4 981.16 211.78 71.78 83.54 107.73 260.89 233.2 162.82 72.95 38.66 111.12 25.64 26.06 1034.47
0.4 0.3 0.07 0.22 0.15 0.08 0.96 0.28 0.26 0.29 0.23 0.11 0.19 0.18 0.25 0.0 0.08 0.06 0.13 0.56
6.13 8.47 4.08 0.28 0.29 21.28 144.02 0.4 0.01 0.03 0.0 0.4 0.07 0.04 0.0 0.05 0.0 0.53 0.02 47.44
3.82 5.65 1.6 0.2 0.28 9.73 136.34 0.17 0.0 0.0 0.03 0.64 0.01 0.06 0.0 0.0 0.02 0.04 0.03 23.06
34.13 479.55 56.23 41.05 75.85 200.19 189.34 7.28 2.21 4.3 1.3 0.55 0.47 0.9 2.41 0.74 0.16 32.29 6.85 16.48
0.2 0.0 0.24 0.0 0.17 0.07 0.81 0.16 0.05 0.03 0.0 0.2 0.0 0.06 0.0 0.09 0.38 0.15 0.04 0.05
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.88 6.46 2.62 0.36 1.25 1.1 12.6 0.2 0.06 0.04 0.05 0.04 0.28 0.77 0.08 0.07 0.08 0.14 0.45 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
76.64 197.2 122.75 30.27 43.3 13.0 88.58 12.23 4.87 5.53 5.32 6.68 4.66 8.73 5.77 59.56 23.85 6.38 31.71 6.71
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.93 42.73 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.67 13.21 4.68 0.82 0.27 4.27 7.86 2.33 2.12 2.24 4.92 16.78 11.45 10.03 3.76 0.26 0.07 0.03 0.01 0.05

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)