Heatmap: Cluster_183 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00973	0.04	0.02	0.09	0.0	0.03	0.07	1.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.0	0.0	0.1	0.01
Gb_01231	0.2	0.2	0.18	0.12	0.25	0.11	1.0	0.27	0.2	0.26	0.56	0.25	0.39	0.22	0.59	0.38	0.32	0.21	0.48	0.89
Gb_01660	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01716	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.07	0.0
Gb_01820	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01834	0.01	0.02	0.1	0.02	0.02	0.08	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.07
Gb_05304	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.01	0.45
Gb_06161	0.05	0.24	0.0	0.0	0.0	1.0	0.59	0.03	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_06252	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.08	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0
Gb_06366	0.12	0.0	0.01	0.0	0.03	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.02	0.03	0.62
Gb_06917	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.36	0.06	0.12	0.0	0.27	0.05	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_07673	0.05	0.08	0.01	0.02	0.08	1.0	0.55	0.01	0.02	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.13	0.0	0.3
Gb_07987	0.28	0.02	0.1	0.14	0.05	0.53	1.0	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.08	0.02	0.22
Gb_08249	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_08622	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	1.0	0.25	0.04	0.24	0.14	0.04	0.12	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0
Gb_09975	0.06	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	1.0	0.03	0.02	0.03	0.0	0.05	0.01	0.02	0.0	0.01	0.02	0.03	0.0	0.15
Gb_11097	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_11099	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_11147	0.38	0.35	0.68	0.17	0.15	0.54	1.0	0.3	0.25	0.23	0.22	0.43	0.23	0.4	0.15	0.3	0.24	0.42	0.2	0.74
Gb_12980	0.0	0.11	0.0	0.0	0.02	0.13	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.08
Gb_14622	0.44	1.0	0.42	0.2	0.09	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15430	0.19	0.14	0.12	0.15	0.12	0.95	0.82	0.19	0.05	0.04	0.14	0.45	0.03	0.07	0.15	0.05	0.06	0.16	0.12	1.0
Gb_15431	0.18	0.16	0.18	0.13	0.15	0.98	0.61	0.21	0.05	0.09	0.08	0.42	0.09	0.12	0.06	0.08	0.07	0.2	0.11	1.0
Gb_15446	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17868	0.3	0.0	0.03	0.0	0.0	0.02	1.0	0.05	0.04	0.03	0.03	0.01	0.0	0.01	0.03	0.0	0.05	0.03	0.09	0.0
Gb_17904	0.04	0.01	0.0	0.02	0.03	0.03	1.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.03	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.07	0.0	0.08
Gb_18231	0.0	0.18	0.02	0.02	0.0	0.01	1.0	0.01	0.04	0.05	0.01	0.03	0.02	0.03	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01
Gb_18782	0.21	1.0	0.27	0.1	0.09	0.31	0.78	0.11	0.19	0.22	0.11	0.04	0.07	0.09	0.1	0.27	0.11	0.08	0.09	0.03
Gb_18786	0.17	1.0	0.23	0.12	0.08	0.39	0.75	0.08	0.14	0.14	0.05	0.03	0.07	0.08	0.04	0.18	0.07	0.06	0.09	0.02
Gb_19117	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04
Gb_19974	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	1.0	0.0	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.04	0.02	0.02
Gb_21396	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.06	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21398	0.01	0.1	0.0	0.0	0.0	0.03	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.24
Gb_21814	0.01	0.58	0.1	0.01	0.05	0.24	1.0	0.1	0.48	0.25	0.09	0.02	0.22	0.21	0.14	0.05	0.05	0.14	0.97	0.08
Gb_22457	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22789	0.21	1.0	0.32	0.32	0.04	0.06	0.33	0.09	0.07	0.08	0.01	0.28	0.18	0.27	0.01	0.04	0.08	0.01	0.0	0.01
Gb_23316	0.2	1.0	0.41	0.18	0.25	0.05	0.85	0.2	0.14	0.2	0.63	0.5	0.26	0.13	0.39	0.05	0.09	0.17	0.0	0.37
Gb_23598	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24001	0.19	0.51	0.19	0.12	0.51	0.53	0.82	0.37	0.22	0.22	0.38	0.37	0.05	0.01	0.37	0.05	0.14	0.26	0.28	1.0
Gb_25701	0.19	1.0	0.19	0.07	0.14	0.11	0.55	0.02	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.13	0.28	0.06
Gb_25854	0.76	0.97	0.39	0.26	0.35	0.54	1.0	0.32	0.38	0.31	0.27	0.3	0.24	0.17	0.3	0.21	0.19	0.34	0.44	0.78
Gb_26153	0.08	0.0	0.31	0.25	0.31	0.37	1.0	0.08	0.15	0.13	0.22	0.06	0.13	0.12	0.27	0.22	0.0	0.14	0.08	0.0
Gb_26370	0.7	0.64	1.0	0.55	0.48	0.38	0.49	0.36	0.22	0.19	0.35	0.28	0.17	0.16	0.35	0.48	0.33	0.28	0.53	0.42
Gb_26602	0.28	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.76	0.03	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	1.0
Gb_26605	0.55	0.22	0.25	0.18	0.2	0.06	1.0	0.07	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.28	0.11	0.9
Gb_26727	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26753	0.24	0.37	0.61	0.33	0.2	0.32	1.0	0.28	0.07	0.06	0.1	0.0	0.19	0.04	0.07	0.18	0.14	0.04	0.0	0.3
Gb_27137	0.06	0.13	0.01	0.01	0.01	0.96	1.0	0.24	0.01	0.01	0.06	0.3	0.17	0.23	0.04	0.0	0.0	0.07	0.06	0.05
Gb_29311	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_29595	0.05	0.04	0.01	0.0	0.0	0.01	1.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.24	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09
Gb_29596	0.05	0.47	0.94	0.36	0.05	0.08	1.0	0.16	0.09	0.18	0.06	0.05	0.33	0.62	0.09	0.02	0.19	0.01	0.0	0.44
Gb_29689	0.27	0.77	0.09	0.06	0.08	0.51	1.0	0.28	0.27	0.08	0.12	0.16	0.78	0.65	0.18	0.0	0.09	0.26	0.0	0.19
Gb_29867	0.17	0.0	0.24	0.0	0.0	0.09	1.0	0.07	0.04	0.09	0.08	0.02	0.04	0.11	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30375	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30461	0.36	0.25	0.32	0.31	0.29	0.79	1.0	0.42	0.35	0.31	0.46	0.32	0.45	0.39	0.49	0.27	0.34	0.27	0.31	0.75
Gb_31148	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
Gb_31199	0.15	0.1	0.1	0.0	0.04	0.14	0.88	0.03	0.25	0.16	0.0	0.0	0.04	0.33	0.01	0.02	0.0	1.0	0.02	0.09
Gb_31201	0.25	0.01	0.05	0.05	0.07	0.0	1.0	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.03	0.38	0.0	0.0	0.0	0.09	0.02	0.05
Gb_33325	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	1.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0
Gb_33506	0.1	0.26	0.27	0.05	0.11	0.42	1.0	0.38	0.34	0.41	0.07	0.72	0.63	0.48	0.05	0.01	0.07	0.07	0.02	0.58
Gb_35084	0.28	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.76	0.03	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	1.0
Gb_35295	0.13	0.09	0.08	0.13	0.08	0.13	1.0	0.03	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02
Gb_35507	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_35946	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36415	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18
Gb_36786	0.32	0.14	0.25	0.1	0.05	0.07	0.95	0.2	0.07	0.08	0.1	0.25	0.23	0.16	0.07	0.04	0.11	0.02	0.03	1.0
Gb_37133	0.42	0.32	0.07	0.23	0.15	0.09	1.0	0.29	0.27	0.3	0.24	0.11	0.2	0.19	0.26	0.0	0.08	0.06	0.13	0.58
Gb_37312	0.04	0.06	0.03	0.0	0.0	0.15	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33
Gb_37313	0.03	0.04	0.01	0.0	0.0	0.07	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17
Gb_37861	0.07	1.0	0.12	0.09	0.16	0.42	0.39	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.07	0.01	0.03
Gb_38759	0.24	0.0	0.29	0.0	0.21	0.09	1.0	0.19	0.06	0.04	0.0	0.25	0.0	0.07	0.0	0.11	0.46	0.18	0.05	0.06
Gb_38935	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09
Gb_39606	0.07	0.51	0.21	0.03	0.1	0.09	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01
Gb_40125	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41302	0.39	1.0	0.62	0.15	0.22	0.07	0.45	0.06	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.03	0.3	0.12	0.03	0.16	0.03
Gb_41361	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41756	0.28	0.79	0.28	0.05	0.02	0.25	0.47	0.14	0.13	0.13	0.29	1.0	0.68	0.6	0.22	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)