Heatmap: Cluster_20 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_01303	0.46	0.85	1.0	0.54	0.79	0.59	0.56	0.39	0.26	0.25	0.27	0.37	0.23	0.18	0.29	0.32	0.36	0.73	0.69	0.6
Gb_01348	0.64	0.56	0.87	1.0	0.75	0.5	0.22	0.58	0.33	0.3	0.47	0.47	0.23	0.19	0.43	0.38	0.56	0.84	1.0	0.34
Gb_01384	0.75	0.58	0.58	1.0	0.98	0.74	0.71	0.55	0.16	0.22	0.91	0.38	0.33	0.26	0.86	0.15	0.18	0.68	1.0	0.09
Gb_01495	0.97	0.98	1.0	0.8	0.59	0.18	0.44	0.33	0.32	0.24	0.21	0.21	0.19	0.14	0.18	0.39	0.37	0.6	0.66	0.2
Gb_03928	0.65	0.5	1.0	0.82	0.56	0.25	0.16	0.31	0.21	0.22	0.25	0.17	0.31	0.23	0.26	0.27	0.25	0.67	0.53	0.4
Gb_04416	0.71	0.86	1.0	0.41	0.77	0.81	0.4	0.36	0.23	0.21	0.21	0.27	0.35	0.46	0.22	0.27	0.35	0.71	0.79	0.5
Gb_04586	0.52	0.7	1.0	0.83	0.51	0.22	0.42	0.24	0.18	0.18	0.22	0.22	0.1	0.08	0.27	0.16	0.13	0.42	0.57	0.33
Gb_04742	0.8	0.84	0.96	1.0	0.85	0.41	0.4	0.52	0.48	0.47	0.53	0.39	0.32	0.31	0.56	0.59	0.54	0.81	0.76	0.63
Gb_05051	0.65	0.73	0.88	0.36	0.7	1.0	0.31	0.3	0.2	0.19	0.13	0.18	0.16	0.14	0.15	0.32	0.33	0.76	0.37	0.41
Gb_05631	0.73	0.65	0.71	1.0	0.62	0.43	0.29	0.39	0.35	0.28	0.33	0.33	0.17	0.13	0.33	0.4	0.48	0.63	0.47	0.63
Gb_06605	0.5	0.93	0.93	0.53	1.0	0.59	0.43	0.48	0.29	0.3	0.39	0.37	0.21	0.17	0.43	0.23	0.32	0.75	0.85	0.65
Gb_06607	0.57	0.7	0.72	0.84	0.94	0.5	0.46	0.46	0.28	0.33	0.51	0.41	0.23	0.26	0.53	0.2	0.3	0.69	1.0	0.62
Gb_06984	0.6	0.51	1.0	0.72	0.84	0.51	0.21	0.29	0.12	0.1	0.2	0.41	0.2	0.23	0.2	0.14	0.3	0.73	0.42	0.27
Gb_07361	0.36	0.71	0.75	0.44	0.73	0.55	0.44	0.54	0.44	0.49	0.32	0.62	0.39	0.52	0.33	0.52	0.5	1.0	0.66	0.57
Gb_07901	0.41	0.76	1.0	0.52	0.48	0.46	0.23	0.28	0.16	0.16	0.2	0.32	0.03	0.04	0.18	0.2	0.36	0.44	0.4	0.3
Gb_08028	0.66	0.41	0.84	1.0	0.65	0.64	0.51	0.35	0.21	0.21	0.31	0.34	0.2	0.22	0.27	0.24	0.37	0.71	0.91	0.52
Gb_08080	0.62	0.54	0.73	0.8	0.85	0.68	0.62	0.43	0.25	0.26	0.34	0.38	0.34	0.34	0.34	0.2	0.27	1.0	0.8	0.55
Gb_08114	0.82	0.73	1.0	0.46	0.64	0.45	0.27	0.34	0.16	0.17	0.12	0.32	0.06	0.05	0.12	0.23	0.31	0.69	0.5	0.48
Gb_08210	0.59	0.36	1.0	0.76	0.54	0.37	0.3	0.44	0.28	0.3	0.36	0.37	0.14	0.12	0.34	0.27	0.36	0.46	0.64	0.27
Gb_09048	0.99	0.74	1.0	0.73	0.75	0.57	0.13	0.38	0.36	0.33	0.39	0.28	0.28	0.2	0.42	0.41	0.61	0.79	0.48	0.55
Gb_09359	0.76	0.7	0.81	0.59	0.94	0.41	0.53	0.41	0.24	0.24	0.28	0.21	0.28	0.25	0.27	0.15	0.17	1.0	0.7	0.55
Gb_09474	0.57	0.7	1.0	0.57	0.54	0.6	0.33	0.37	0.21	0.22	0.3	0.34	0.21	0.17	0.28	0.2	0.35	0.5	0.58	0.41
Gb_09834	0.46	0.72	1.0	0.48	0.63	0.38	0.44	0.33	0.37	0.34	0.25	0.31	0.11	0.08	0.26	0.35	0.38	0.62	0.75	0.44
Gb_11570	0.54	0.72	0.85	0.75	0.86	0.5	0.43	0.55	0.39	0.41	0.52	0.62	0.43	0.44	0.5	0.29	0.61	0.69	1.0	0.71
Gb_11612	0.56	0.7	1.0	0.25	0.38	0.11	0.23	0.23	0.25	0.23	0.28	0.21	0.14	0.11	0.27	0.21	0.2	0.32	0.48	0.27
Gb_12103	0.92	0.52	0.74	1.0	0.83	0.58	0.63	0.56	0.36	0.34	0.59	0.38	0.5	0.41	0.6	0.32	0.33	0.64	0.62	0.47
Gb_12247	0.65	0.63	0.81	0.68	0.64	0.56	0.53	0.33	0.26	0.27	0.23	0.28	0.25	0.23	0.23	0.25	0.3	0.68	1.0	0.38
Gb_13169	0.72	0.89	1.0	0.51	0.68	0.29	0.72	0.39	0.46	0.49	0.45	0.27	0.18	0.17	0.46	0.45	0.48	0.6	0.66	0.35
Gb_13217	1.0	0.76	0.72	0.61	0.49	0.3	0.47	0.33	0.26	0.24	0.3	0.25	0.22	0.18	0.33	0.32	0.2	0.35	0.59	0.29
Gb_13296	0.93	0.7	0.87	0.59	0.76	0.88	0.67	0.57	0.27	0.31	0.36	0.5	0.41	0.35	0.38	0.27	0.38	0.93	1.0	0.79
Gb_14061	0.54	0.67	0.78	1.0	0.63	0.37	0.43	0.4	0.31	0.39	0.53	0.39	0.26	0.22	0.59	0.31	0.34	0.67	0.91	0.49
Gb_14376	0.64	0.85	1.0	0.19	0.19	0.01	0.11	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.07	0.5	0.13
Gb_14413	0.6	0.74	0.9	0.46	0.84	0.88	0.67	0.55	0.53	0.54	0.42	0.52	0.24	0.23	0.54	0.49	0.61	0.81	1.0	0.78
Gb_14650	0.52	0.74	0.9	0.7	0.67	0.43	0.33	0.43	0.33	0.35	0.52	0.32	0.23	0.2	0.5	0.33	0.35	0.68	1.0	0.46
Gb_14838	0.51	0.76	1.0	0.7	0.59	0.38	0.2	0.33	0.18	0.18	0.29	0.2	0.23	0.3	0.3	0.24	0.21	0.65	0.66	0.37
Gb_14992	1.0	0.62	0.76	0.88	0.66	0.64	0.7	0.55	0.34	0.31	0.5	0.28	0.42	0.37	0.52	0.36	0.39	0.88	0.72	0.68
Gb_15034	0.82	0.91	0.86	0.6	1.0	0.81	0.52	0.4	0.17	0.16	0.13	0.21	0.1	0.1	0.14	0.17	0.19	1.0	0.78	0.24
Gb_15189	0.56	0.52	0.9	0.38	0.59	0.19	0.53	0.34	0.46	0.5	0.59	0.21	0.24	0.2	0.59	0.47	0.39	0.58	1.0	0.69
Gb_15913	0.84	0.86	0.82	0.6	0.75	1.0	0.71	0.32	0.31	0.37	0.24	0.28	0.02	0.04	0.22	0.42	0.41	0.74	0.68	0.47
Gb_16514	0.68	1.0	0.9	0.79	0.84	0.31	0.43	0.49	0.35	0.36	0.31	0.38	0.24	0.25	0.31	0.32	0.44	0.93	0.84	0.54
Gb_16544	0.72	0.69	1.0	0.96	0.89	0.68	0.63	0.37	0.19	0.21	0.23	0.32	0.14	0.13	0.26	0.27	0.32	0.79	0.79	0.33
Gb_17178	0.87	0.68	0.77	0.82	0.89	0.74	0.6	0.62	0.39	0.4	0.61	0.38	0.53	0.43	0.61	0.29	0.29	0.87	1.0	0.65
Gb_18208	0.55	0.8	1.0	0.34	0.57	0.54	0.15	0.24	0.12	0.13	0.08	0.15	0.01	0.01	0.09	0.17	0.25	0.56	0.25	0.32
Gb_18873	0.66	0.69	1.0	0.92	0.87	0.65	0.39	0.48	0.37	0.37	0.3	0.44	0.38	0.35	0.3	0.51	0.65	0.81	0.66	0.59
Gb_19317	0.97	0.65	0.8	0.41	0.85	0.7	0.67	0.46	0.46	0.34	0.5	0.58	0.33	0.36	0.56	0.63	0.46	1.0	0.78	0.8
Gb_19524	0.17	0.35	0.26	0.16	0.62	0.06	0.37	0.26	0.2	0.24	0.19	0.26	0.08	0.07	0.2	0.21	0.26	0.53	1.0	0.4
Gb_20647	0.71	0.87	1.0	0.77	0.72	0.5	0.35	0.41	0.28	0.27	0.44	0.32	0.16	0.17	0.42	0.41	0.29	0.69	0.69	0.35
Gb_20783	0.53	0.49	0.87	0.69	0.59	0.13	0.28	0.37	0.32	0.37	0.27	0.31	0.29	0.25	0.37	0.54	0.4	1.0	0.81	0.73
Gb_21405	0.81	0.76	1.0	0.8	0.69	0.48	0.26	0.48	0.4	0.36	0.37	0.31	0.1	0.11	0.4	0.46	0.42	0.75	0.66	0.43
Gb_21489	0.76	0.95	0.99	0.96	0.87	0.67	0.46	0.68	0.58	0.55	0.67	0.59	0.62	0.57	0.7	0.48	0.56	0.9	1.0	0.98
Gb_21685	0.45	0.87	0.78	0.61	0.74	0.54	0.69	0.41	0.4	0.44	0.54	0.36	0.28	0.29	0.54	0.4	0.58	0.81	1.0	0.78
Gb_21697	0.68	0.59	1.0	0.78	0.73	0.68	0.26	0.42	0.31	0.28	0.25	0.39	0.26	0.25	0.25	0.32	0.41	0.7	0.61	0.49
Gb_22157	0.67	0.42	0.63	0.73	0.67	1.0	0.4	0.47	0.29	0.28	0.34	0.46	0.31	0.33	0.32	0.29	0.51	0.76	0.5	0.52
Gb_22479	0.33	0.38	0.32	0.26	0.59	0.57	0.6	0.36	0.21	0.24	0.09	0.31	0.17	0.15	0.12	0.26	0.35	1.0	0.68	0.49
Gb_23933	0.51	0.66	0.54	0.29	0.72	0.21	0.63	0.28	0.37	0.37	0.45	0.32	0.13	0.14	0.5	0.5	0.48	0.65	1.0	0.51
Gb_23962	0.61	0.67	0.62	0.71	0.77	0.58	0.78	0.51	0.53	0.5	0.44	0.4	0.47	0.48	0.52	0.56	0.38	1.0	0.87	0.72
Gb_24569	0.3	0.45	0.61	0.42	0.64	0.33	0.5	0.38	0.47	0.51	0.34	0.58	0.19	0.15	0.31	0.5	0.76	0.76	1.0	0.62
Gb_25569	0.63	0.79	1.0	0.82	0.89	0.63	0.51	0.41	0.25	0.25	0.34	0.39	0.4	0.4	0.38	0.26	0.34	0.82	0.58	0.55
Gb_25575	0.67	1.0	0.74	0.49	0.63	0.18	0.61	0.32	0.37	0.39	0.51	0.26	0.4	0.42	0.6	0.33	0.2	0.51	0.57	0.64
Gb_26150	0.74	1.0	0.79	0.64	0.72	0.41	0.6	0.37	0.49	0.47	0.44	0.37	0.29	0.32	0.42	0.54	0.47	0.89	0.86	0.69
Gb_26464	0.86	0.65	0.74	1.0	0.77	0.5	0.1	0.46	0.36	0.34	0.37	0.36	0.26	0.26	0.37	0.42	0.4	0.8	0.57	0.48
Gb_28910	0.53	0.49	0.99	1.0	0.64	0.28	0.59	0.48	0.24	0.25	0.43	0.3	0.25	0.28	0.44	0.41	0.47	0.91	1.0	0.4
Gb_29260	0.68	1.0	0.72	0.58	0.71	0.18	0.2	0.31	0.17	0.19	0.22	0.15	0.11	0.15	0.24	0.34	0.27	0.8	0.65	0.61
Gb_29817	0.43	0.6	0.88	0.6	0.55	0.18	0.44	0.38	0.43	0.43	0.26	0.24	0.16	0.16	0.25	0.59	0.48	0.89	1.0	0.48
Gb_30012	0.54	0.85	0.82	0.44	0.7	0.35	0.76	0.41	0.45	0.44	0.55	0.36	0.49	0.42	0.58	0.45	0.49	0.64	1.0	0.82
Gb_30105	0.37	0.52	0.45	0.67	0.6	0.65	0.43	0.44	0.56	0.46	0.5	0.54	0.41	0.65	0.5	0.54	0.59	0.91	1.0	0.69
Gb_30890	0.87	0.61	0.99	0.68	1.0	0.71	0.46	0.61	0.38	0.36	0.57	0.53	0.22	0.23	0.56	0.29	0.37	1.0	0.92	0.67
Gb_32195	0.76	0.71	1.0	0.68	0.86	0.8	0.38	0.35	0.22	0.18	0.23	0.32	0.03	0.03	0.28	0.23	0.35	0.82	0.74	0.46
Gb_32348	0.69	0.72	0.88	0.73	0.76	0.42	0.52	0.54	0.42	0.42	0.55	0.46	0.37	0.3	0.56	0.35	0.51	0.69	1.0	0.66
Gb_32531	0.75	0.77	0.86	0.7	1.0	0.32	0.15	0.38	0.28	0.25	0.34	0.27	0.27	0.32	0.33	0.4	0.28	0.74	0.6	0.29
Gb_34330	1.0	0.67	0.87	0.79	0.69	0.46	0.24	0.45	0.43	0.38	0.56	0.28	0.23	0.22	0.59	0.43	0.38	0.73	0.53	0.6
Gb_34973	0.67	0.92	0.96	0.56	1.0	0.66	0.79	0.61	0.5	0.44	0.47	0.54	0.32	0.25	0.51	0.55	0.55	0.99	0.81	0.65
Gb_35444	0.6	0.66	1.0	0.52	0.61	0.67	0.47	0.4	0.3	0.31	0.37	0.35	0.23	0.24	0.36	0.34	0.3	0.56	0.61	0.48
Gb_35471	0.62	0.67	0.66	0.54	0.63	0.32	0.16	0.43	0.3	0.25	0.39	0.4	0.19	0.31	0.41	0.27	0.21	0.88	1.0	0.58
Gb_35765	0.78	0.43	0.99	1.0	0.8	0.63	0.39	0.44	0.21	0.21	0.34	0.38	0.24	0.25	0.28	0.22	0.31	0.99	0.63	0.45
Gb_36095	0.86	0.97	1.0	0.71	0.71	0.44	0.83	0.48	0.31	0.34	0.39	0.33	0.28	0.24	0.42	0.25	0.3	0.8	0.95	0.61
Gb_37117	1.0	0.53	0.92	0.86	0.92	0.55	0.38	0.62	0.39	0.37	0.5	0.46	0.29	0.3	0.42	0.44	0.78	0.85	0.82	0.48
Gb_37226	0.72	0.61	1.0	0.69	0.54	0.39	0.32	0.4	0.31	0.3	0.38	0.32	0.13	0.14	0.34	0.38	0.34	0.56	0.97	0.28
Gb_38788	0.58	0.66	0.82	0.88	0.82	0.47	0.5	0.48	0.5	0.5	0.51	0.4	0.33	0.31	0.58	0.53	0.55	1.0	0.89	0.75
Gb_39051	0.91	0.57	1.0	0.97	0.86	0.62	0.55	0.54	0.38	0.36	0.51	0.53	0.23	0.21	0.46	0.33	0.43	0.9	0.98	0.57
Gb_40256	0.6	0.57	1.0	0.57	0.65	0.65	0.55	0.43	0.42	0.37	0.33	0.46	0.46	0.47	0.35	0.43	0.5	0.59	0.83	0.36
Gb_40802	0.67	0.5	1.0	0.57	0.57	0.65	0.35	0.43	0.19	0.2	0.25	0.35	0.23	0.21	0.29	0.2	0.34	0.64	0.62	0.39
Gb_41048	0.64	0.38	0.48	0.31	1.0	0.1	0.19	0.37	0.2	0.2	0.6	0.28	0.08	0.08	0.7	0.57	0.5	0.87	0.95	0.53
Gb_41049	0.81	0.8	0.88	0.81	0.81	0.21	0.23	0.4	0.22	0.25	0.58	0.27	0.12	0.09	0.65	0.48	0.36	0.88	1.0	0.65
Gb_41192	0.84	0.57	1.0	0.6	0.77	0.78	0.39	0.48	0.3	0.32	0.43	0.43	0.51	0.43	0.37	0.26	0.38	0.8	0.56	0.56
Gb_41770	1.0	0.43	0.72	0.75	0.77	0.77	0.74	0.65	0.39	0.39	0.57	0.39	0.34	0.32	0.57	0.41	0.56	0.89	0.81	0.69

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)