1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_123 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.2 0.15 0.0 0.44 0.07 0.15 12.36 0.04 0.0 0.04 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.43 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 4196.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.26 0.4 0.62 0.29 0.09 0.06 4.07 0.29 0.25 0.16 0.48 0.1 0.19 0.18 0.44 0.0 0.24 1.26 0.15 1.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.49
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29
0.0 1.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.39
2.19 0.25 1.45 2.22 1.13 0.14 12.47 1.12 1.97 2.12 3.13 0.9 0.78 0.83 2.49 1.58 2.0 0.19 0.08 0.35
2.2 2.24 1.55 3.39 2.05 0.56 330.73 0.83 0.2 0.25 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 1.69 4.25 2.16 0.05 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.75 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.29 7.67 6.02 4.78 2.68 0.62 41.12 1.96 3.26 3.81 0.72 1.18 1.37 2.67 1.71 2.19 3.93 2.52 4.19 2.88
0.1 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.04 0.04 0.07 0.05 0.01 0.01 0.02 0.08 0.07 0.07 0.0 0.02 0.58
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.62 3.41 2.25 3.13 6.52 10.97 48.98 5.04 2.05 2.49 5.15 3.91 2.3 1.95 4.08 1.26 1.84 5.12 8.79 5.1
2.39 1.57 1.34 0.76 0.86 0.0 4.33 0.84 1.88 0.8 2.93 0.31 0.48 1.13 1.67 0.76 2.07 0.0 1.01 0.39
2.36 2.56 2.05 1.24 1.2 0.11 6.98 0.88 1.49 1.69 3.2 0.72 0.65 0.59 2.27 2.46 2.24 0.18 0.65 1.2
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0
0.06 0.18 0.0 0.1 0.97 0.0 7159.53 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.77 0.65
0.09 0.04 0.07 0.07 2.15 1.71 30597.63 0.62 0.25 0.13 0.04 0.01 0.02 0.3 0.0 0.01 0.14 1.53 0.06 0.07
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.04
0.09 0.04 0.07 0.07 2.15 1.71 30597.63 0.62 0.25 0.13 0.04 0.01 0.02 0.3 0.0 0.01 0.14 1.53 0.06 0.07
0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 1.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.48
16.74 10.69 11.15 11.49 20.21 13.58 318.67 22.56 0.13 0.63 0.16 2.49 0.07 0.35 0.35 10.54 3.76 198.27 8.65 22.78
40.0 20.83 41.93 0.0 10.39 14.6 11.53 6.82 11.4 1.86 11.97 11.79 4.14 0.0 5.86 31.55 0.0 21.98 0.0 39.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25
0.14 3.71 3.21 0.18 0.55 0.44 18.26 0.04 0.03 0.04 0.07 0.05 0.01 0.03 0.0 0.18 0.02 0.11 0.41 3.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.2 0.0 0.05 0.0
0.02 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.2 0.01 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.01 0.01 0.15 0.02 0.03 0.03 0.39
1.97 2.45 1.53 1.63 2.21 2.88 8.78 1.47 1.55 1.42 3.28 0.95 1.01 0.74 3.15 2.38 1.6 2.61 3.07 2.25
1.73 7.32 1.57 3.26 1.81 12.74 73.95 12.5 14.3 15.0 7.6 11.9 4.11 7.29 15.27 10.08 6.59 39.66 0.08 0.6
0.49 0.39 1.09 0.25 7.58 9.09 88729.87 2.61 0.85 0.36 0.05 0.09 0.1 0.78 0.0 0.07 0.83 6.98 2.46 5.06
3.69 2.06 2.89 3.04 2.7 0.15 12.75 0.51 0.67 0.52 0.53 0.38 0.15 0.25 0.34 0.25 0.71 0.37 0.36 0.81
0.14 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 1.1 0.05 0.0 0.0 0.18 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.6
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 1.79
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.18 0.11 41.23 268.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 25.72 185.14 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.24 0.11 0.0 0.32 0.0 4.16 0.09 0.2 0.31 0.0 0.09 0.09 0.08 0.39 0.0 0.12 0.0 0.47 1.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.62 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.11 0.11
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 1.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
4.55 3.93 2.31 1.14 1.16 2.23 1.32 1.52 2.05 2.37 0.61 1.57 1.94 1.63 1.13 0.8 0.5 2.62 2.27 4.66
0.02 0.0 0.06 0.0 0.75 0.18 586.81 0.14 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.16 0.17 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 29.82 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 0.51 0.49 0.66 0.37 0.0 8.88 0.83 1.53 0.96 0.86 1.06 0.68 0.64 0.48 1.39 0.58 0.2 1.73 1.4
0.0 0.12 0.22 0.17 0.0 0.06 2.47 0.08 0.15 0.09 0.34 0.01 0.04 0.04 0.14 0.0 0.06 0.09 0.36 0.24
0.03 0.27 0.0 0.6 0.0 0.0 1.92 0.08 0.1 0.03 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.21 0.0
0.08 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 8.35 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.32 0.76 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.36 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 1.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02
0.13 0.08 0.04 0.72 0.83 2.67 49.56 4.2 3.12 3.56 2.02 3.95 3.98 2.83 2.24 1.99 5.65 0.02 0.0 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 409.91 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.14 0.62 2.35 0.02 0.04 0.01 0.07 0.01 0.07 0.12 0.04 0.06 0.09 0.11 0.27 0.66
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0
0.03 0.0 0.01 0.0 0.08 0.0 2.53 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.04 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.23 171.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.36 3.07 0.62 1.53 5.33 0.0 0.03 0.0 0.0 2.95 0.0 0.0 3.17 0.0 21.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
0.2 0.1 0.38 0.15 0.0 0.0 0.2 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.09 0.08
0.08 0.0 0.16 0.0 0.32 0.0 0.79 0.03 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.05 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
1.84 0.05 0.28 0.13 0.42 25.95 123.41 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.38
0.19 0.09 0.0 0.0 0.09 0.09 0.51 0.21 0.19 0.3 0.25 0.04 0.39 0.31 0.07 0.06 0.14 0.07 0.08 0.98

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)