Heatmap: Cluster_123 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00654	0.02	0.01	0.0	0.04	0.01	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.01
Gb_01530	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02241	0.06	0.1	0.15	0.07	0.02	0.01	1.0	0.07	0.06	0.04	0.12	0.02	0.05	0.04	0.11	0.0	0.06	0.31	0.04	0.28
Gb_02658	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	1.0
Gb_05410	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_06396	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79
Gb_07565	0.18	0.02	0.12	0.18	0.09	0.01	1.0	0.09	0.16	0.17	0.25	0.07	0.06	0.07	0.2	0.13	0.16	0.02	0.01	0.03
Gb_07887	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0
Gb_07943	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_08490	0.08	0.19	0.15	0.12	0.07	0.02	1.0	0.05	0.08	0.09	0.02	0.03	0.03	0.06	0.04	0.05	0.1	0.06	0.1	0.07
Gb_08932	0.17	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.05	0.07	0.07	0.12	0.08	0.01	0.01	0.03	0.14	0.12	0.12	0.0	0.03	1.0
Gb_09216	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10442	0.07	0.07	0.05	0.06	0.13	0.22	1.0	0.1	0.04	0.05	0.11	0.08	0.05	0.04	0.08	0.03	0.04	0.1	0.18	0.1
Gb_10575	0.55	0.36	0.31	0.18	0.2	0.0	1.0	0.19	0.44	0.18	0.68	0.07	0.11	0.26	0.39	0.17	0.48	0.0	0.23	0.09
Gb_10579	0.34	0.37	0.29	0.18	0.17	0.02	1.0	0.13	0.21	0.24	0.46	0.1	0.09	0.09	0.33	0.35	0.32	0.03	0.09	0.17
Gb_10924	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.03	0.0	0.0
Gb_11718	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_12801	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_13826	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0	0.59	1.0
Gb_14134	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14223	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14343	0.69	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.05	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	1.0
Gb_14359	0.05	0.03	0.04	0.04	0.06	0.04	1.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.62	0.03	0.07
Gb_15108	0.95	0.5	1.0	0.0	0.25	0.35	0.27	0.16	0.27	0.04	0.29	0.28	0.1	0.0	0.14	0.75	0.0	0.52	0.0	0.94
Gb_15700	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_17392	0.01	0.2	0.18	0.01	0.03	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.19
Gb_17741	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_18003	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.39	0.0	0.1	0.0
Gb_18450	0.04	0.0	0.08	0.14	0.0	0.0	0.5	0.03	0.0	0.07	0.12	0.01	0.0	0.02	0.04	0.4	0.06	0.07	0.07	1.0
Gb_18734	0.22	0.28	0.17	0.19	0.25	0.33	1.0	0.17	0.18	0.16	0.37	0.11	0.12	0.08	0.36	0.27	0.18	0.3	0.35	0.26
Gb_18945	0.02	0.1	0.02	0.04	0.02	0.17	1.0	0.17	0.19	0.2	0.1	0.16	0.06	0.1	0.21	0.14	0.09	0.54	0.0	0.01
Gb_18954	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19142	0.29	0.16	0.23	0.24	0.21	0.01	1.0	0.04	0.05	0.04	0.04	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.06	0.03	0.03	0.06
Gb_19592	0.12	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	1.0	0.04	0.0	0.0	0.16	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.11
Gb_19708	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_19759	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	1.0
Gb_19991	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_22452	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23272	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24190	0.08	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.21	0.0	0.0	0.02	1.0
Gb_24617	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24686	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24695	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24910	0.08	0.06	0.03	0.0	0.08	0.0	1.0	0.02	0.05	0.08	0.0	0.02	0.02	0.02	0.09	0.0	0.03	0.0	0.11	0.24
Gb_25454	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	1.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.17	0.18
Gb_26254	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0
Gb_26608	0.98	0.84	0.5	0.25	0.25	0.48	0.28	0.33	0.44	0.51	0.13	0.34	0.42	0.35	0.24	0.17	0.11	0.56	0.49	1.0
Gb_26731	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26733	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_27450	0.04	0.06	0.06	0.07	0.04	0.0	1.0	0.09	0.17	0.11	0.1	0.12	0.08	0.07	0.05	0.16	0.07	0.02	0.19	0.16
Gb_28507	0.0	0.05	0.09	0.07	0.0	0.02	1.0	0.03	0.06	0.04	0.14	0.01	0.02	0.01	0.06	0.0	0.02	0.04	0.14	0.1
Gb_29418	0.02	0.14	0.0	0.31	0.0	0.0	1.0	0.04	0.05	0.02	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.11	0.0
Gb_29859	0.5	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94
Gb_30219	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.09	0.01
Gb_30222	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28
Gb_30226	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02
Gb_30611	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.05	1.0	0.08	0.06	0.07	0.04	0.08	0.08	0.06	0.05	0.04	0.11	0.0	0.0	0.0
Gb_33169	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33542	0.02	0.0	0.0	0.0	0.06	0.26	1.0	0.01	0.01	0.01	0.03	0.0	0.03	0.05	0.02	0.03	0.04	0.05	0.12	0.28
Gb_33994	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.08	0.0
Gb_34181	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.01	0.0
Gb_34506	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.07	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	1.0
Gb_34863	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_35149	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_35665	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.15	0.03	0.07	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.15	0.0	1.0
Gb_35760	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_35787	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37460	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_39229	0.53	0.26	1.0	0.38	0.0	0.0	0.52	0.08	0.0	0.0	0.0	0.06	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.24	0.22
Gb_39707	0.1	0.0	0.21	0.0	0.4	0.0	1.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.08	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.07	0.16
Gb_40814	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_40846	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41174	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_41280	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_41448	0.19	0.09	0.0	0.0	0.09	0.09	0.51	0.22	0.19	0.31	0.26	0.04	0.4	0.32	0.07	0.06	0.14	0.07	0.08	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)