1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_85 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.05 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.5 0.13 0.28 0.23 0.1 0.05 0.08 0.08 0.0 0.16 0.28 0.58 1.76 0.75
10.26 0.29 4.16 1.32 0.41 0.49 1.17 0.36 0.22 0.15 0.0 0.46 0.0 0.14 0.22 0.0 0.36 16.01 19.97 23.15
10.49 0.43 0.52 6.15 5.73 35.83 0.01 5.57 1.81 2.6 0.88 3.29 0.59 0.62 0.63 8.19 9.58 14.01 9.59 2.54
0.81 0.06 0.01 0.0 0.05 0.0 0.15 0.06 0.25 0.1 0.21 0.0 0.12 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 7.17 0.0
10.43 0.17 5.07 0.71 1.31 3.2 0.45 0.07 0.14 0.16 0.03 0.07 0.0 0.01 0.07 0.02 0.05 37.58 33.24 30.58
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0
2.03 0.06 0.17 0.0 0.0 0.82 1.17 0.01 0.02 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.9
0.26 0.4 0.26 0.12 0.19 0.51 2.33 0.21 0.18 0.23 0.28 0.21 0.2 0.19 0.1 0.35 0.29 0.32 0.6 0.24
2.74 1.44 1.42 0.7 0.36 1.75 0.7 0.12 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.71 0.0 1.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
2.26 3.72 3.95 1.44 2.36 0.11 5.41 0.48 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 4.47 9.78 5.18
3.34 0.0 0.42 0.61 1.35 11.64 0.17 0.19 0.04 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.09 0.02 2.06 1.93 2.08
7.19 0.0 0.38 1.21 1.36 11.12 0.78 0.23 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 5.33 4.87 5.61
0.04 0.0 0.15 0.0 0.08 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0
0.07 0.0 0.15 0.0 0.84 0.5 0.46 0.36 0.97 0.77 0.38 0.32 0.97 0.23 0.46 0.7 0.9 0.13 2.72 0.0
0.08 0.0 0.0 0.23 0.0 1.5 0.03 0.11 0.0 0.0 1.02 0.0 0.0 0.08 0.41 0.05 0.07 1.19 3.77 0.0
0.39 0.0 0.21 0.0 0.0 0.88 8.51 0.68 0.86 1.18 0.72 0.79 0.07 0.14 0.68 0.46 0.73 2.17 5.35 1.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.26 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.36 1.19 0.48 0.22 0.41 0.48 1.77 0.37 0.1 0.03 0.0 3.54 0.0
1.48 0.36 0.26 0.53 0.62 0.0 1.69 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.1 2.46
0.08 0.0 0.0 0.25 0.09 0.23 5.37 0.12 0.09 0.22 0.0 0.03 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.44 27.8 60.72
1.0 0.61 0.6 0.33 0.47 0.13 4.26 0.12 0.14 0.1 0.05 0.16 0.04 0.02 0.04 0.0 0.05 1.3 3.11 3.37
5.22 0.0 2.86 0.4 0.6 0.09 0.22 0.14 0.25 0.18 0.28 0.13 0.0 0.0 0.32 0.09 0.12 5.98 8.0 10.84
4.08 0.03 1.17 0.47 0.34 0.04 0.22 0.14 0.43 0.4 0.72 0.11 0.05 0.06 0.49 0.1 0.32 8.89 8.73 15.27
11.78 0.11 1.86 0.96 1.23 0.04 0.15 0.17 0.05 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.09 13.86 23.01 23.64
0.41 0.0 0.0 0.0 0.27 0.31 12.36 0.3 0.0 0.0 0.25 0.21 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 1.82 5.18 1.4
3.92 0.01 0.1 0.0 0.08 4.29 0.0 0.13 0.06 0.05 0.04 0.03 0.08 0.14 0.04 0.01 0.0 1.54 1.39 2.34
0.04 0.0 0.0 0.07 0.06 0.02 0.04 0.06 0.05 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.22 0.44 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0
2.21 0.0 0.36 0.0 0.35 0.0 0.0 0.15 0.05 0.03 0.05 0.25 0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.16 1.04 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.53 0.03 0.06 0.08 0.03 0.04 0.0 0.04 0.04 0.01 0.0 0.61 0.0 34.95 0.0
1.73 0.0 2.5 0.0 2.87 1.8 0.47 3.5 1.04 1.95 6.5 6.24 6.4 7.06 3.05 15.35 1.11 4.03 12.02 7.26
1.4 1.34 1.62 1.51 2.84 3.76 0.28 3.83 1.22 0.72 5.96 4.5 3.94 4.76 4.29 9.31 0.96 3.59 16.44 7.44
0.09 0.0 0.11 0.34 2.27 3.22 9.7 1.83 1.02 2.08 6.23 1.06 2.84 0.7 5.02 0.49 2.25 2.37 26.35 3.55
21.66 1.5 2.29 1.36 0.89 19.61 0.53 0.94 0.11 0.15 1.07 2.25 0.38 1.48 0.47 7.64 0.97 1.28 0.69 13.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
3.6 7.09 4.32 2.64 2.24 2.87 2.98 3.41 3.09 2.51 3.04 2.27 1.95 2.0 3.06 2.59 2.68 2.74 8.54 4.13
4.66 2.45 4.49 3.96 2.84 0.45 8.67 1.77 2.22 2.65 1.42 0.28 0.57 1.05 2.7 0.54 1.86 8.7 11.89 6.12
0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0
3.79 0.29 0.27 1.67 1.07 0.73 4.56 0.15 0.12 0.0 0.0 0.69 0.0 0.05 0.0 0.0 0.73 2.72 6.02 2.51
17.47 6.19 6.37 4.13 3.55 18.22 1.7 5.33 4.91 3.81 6.63 3.03 4.74 4.26 5.97 5.78 3.25 8.76 7.7 12.66
33.96 0.23 3.93 0.05 0.65 2.66 0.43 2.1 0.38 0.28 0.04 0.63 0.42 0.38 0.08 0.04 0.02 10.46 8.87 14.3
0.09 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.27 0.01 0.02 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.45 0.38
5.56 0.0 1.39 0.25 0.24 0.09 0.0 0.11 0.11 0.09 0.09 0.14 0.05 0.04 0.0 0.0 0.02 2.96 4.48 1.02
0.07 0.28 0.08 0.03 0.04 0.04 0.01 0.11 0.09 0.06 0.23 0.06 0.08 0.13 0.16 0.01 0.0 0.06 0.84 0.0
97.09 65.26 81.53 110.81 73.67 23.83 78.81 51.72 63.26 67.06 110.17 34.6 22.35 25.6 106.24 67.63 56.86 81.95 144.97 87.32
1.11 0.29 2.82 0.83 5.15 4.87 0.55 5.58 1.86 1.9 8.85 3.81 6.59 11.37 6.81 17.64 0.78 6.63 12.7 13.15
36.6 0.72 6.73 1.27 2.39 37.21 0.35 2.66 0.34 0.43 1.28 2.28 0.91 1.15 0.4 0.0 0.0 4.12 1.9 34.12
36.31 1.32 11.22 2.8 2.07 36.48 0.27 2.37 0.62 0.53 0.79 2.5 0.54 0.48 0.17 0.05 0.08 3.69 2.31 33.23
0.99 0.0 1.26 0.42 0.86 0.0 0.24 0.52 0.37 0.3 0.86 0.52 0.26 0.24 0.23 0.0 0.0 10.44 12.85 14.03
0.02 0.05 0.02 0.0 0.07 0.03 0.03 0.52 1.11 1.25 0.36 0.11 0.57 0.36 0.32 0.22 0.38 0.3 2.32 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.11 0.14 0.0 0.0 0.35 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.09 0.13 0.18 0.0 0.0 0.0 2.81 0.04 0.06 0.03 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.1 1.46 0.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.51 0.11
49.64 51.9 16.05 1.57 8.32 41.14 23.88 1.27 0.93 0.36 0.38 0.71 0.75 0.66 0.44 0.55 0.28 4.27 16.04 30.53
36.3 39.26 12.48 0.97 6.32 35.42 22.56 1.2 0.62 0.46 0.62 0.88 1.21 1.51 0.36 0.49 0.33 3.45 9.26 30.46
2.27 0.07 0.29 0.1 0.22 1.17 0.89 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.71 1.48

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)