Heatmap: Cluster_85 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00023	0.03	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.29	0.07	0.16	0.13	0.05	0.03	0.05	0.04	0.0	0.09	0.16	0.33	1.0	0.43
Gb_00080	0.44	0.01	0.18	0.06	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.69	0.86	1.0
Gb_01162	0.29	0.01	0.01	0.17	0.16	1.0	0.0	0.16	0.05	0.07	0.02	0.09	0.02	0.02	0.02	0.23	0.27	0.39	0.27	0.07
Gb_02626	0.11	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_02627	0.28	0.0	0.13	0.02	0.03	0.09	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.88	0.81
Gb_03461	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_03773	1.0	0.03	0.08	0.0	0.0	0.4	0.58	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.44
Gb_04015	0.11	0.17	0.11	0.05	0.08	0.22	1.0	0.09	0.08	0.1	0.12	0.09	0.09	0.08	0.04	0.15	0.12	0.14	0.26	0.1
Gb_04341	1.0	0.53	0.52	0.26	0.13	0.64	0.26	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.26	0.0	0.51
Gb_04975	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_06796	0.23	0.38	0.4	0.15	0.24	0.01	0.55	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	1.0	0.53
Gb_06987	0.29	0.0	0.04	0.05	0.12	1.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.18	0.17	0.18
Gb_06988	0.65	0.0	0.03	0.11	0.12	1.0	0.07	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.48	0.44	0.5
Gb_07110	0.13	0.0	0.53	0.0	0.27	0.0	0.16	0.14	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_09073	0.02	0.0	0.05	0.0	0.31	0.18	0.17	0.13	0.36	0.28	0.14	0.12	0.36	0.09	0.17	0.26	0.33	0.05	1.0	0.0
Gb_10411	0.02	0.0	0.0	0.06	0.0	0.4	0.01	0.03	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.02	0.11	0.01	0.02	0.31	1.0	0.0
Gb_11383	0.05	0.0	0.02	0.0	0.0	0.1	1.0	0.08	0.1	0.14	0.08	0.09	0.01	0.02	0.08	0.05	0.09	0.26	0.63	0.18
Gb_12156	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_14199	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.1	0.33	0.13	0.06	0.12	0.14	0.5	0.1	0.03	0.01	0.0	1.0	0.0
Gb_14236	0.6	0.15	0.11	0.21	0.25	0.0	0.69	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	1.0
Gb_15314	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.46	1.0
Gb_17201	0.23	0.14	0.14	0.08	0.11	0.03	1.0	0.03	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.31	0.73	0.79
Gb_17207	0.48	0.0	0.26	0.04	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.55	0.74	1.0
Gb_17211	0.27	0.0	0.08	0.03	0.02	0.0	0.01	0.01	0.03	0.03	0.05	0.01	0.0	0.0	0.03	0.01	0.02	0.58	0.57	1.0
Gb_17418	0.5	0.0	0.08	0.04	0.05	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.97	1.0
Gb_19593	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	1.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.42	0.11
Gb_20740	0.91	0.0	0.02	0.0	0.02	1.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.0	0.0	0.36	0.32	0.54
Gb_21970	0.08	0.0	0.0	0.15	0.14	0.04	0.09	0.14	0.11	0.07	0.0	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.12	0.5	1.0	0.01
Gb_21974	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.14	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	1.0	0.0
Gb_22876	1.0	0.0	0.17	0.0	0.16	0.0	0.0	0.07	0.02	0.01	0.02	0.11	0.02	0.0	0.0	0.0	0.05	0.07	0.47	0.04
Gb_24184	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_24448	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	1.0	0.0
Gb_24768	0.11	0.0	0.16	0.0	0.19	0.12	0.03	0.23	0.07	0.13	0.42	0.41	0.42	0.46	0.2	1.0	0.07	0.26	0.78	0.47
Gb_24769	0.08	0.08	0.1	0.09	0.17	0.23	0.02	0.23	0.07	0.04	0.36	0.27	0.24	0.29	0.26	0.57	0.06	0.22	1.0	0.45
Gb_25237	0.0	0.0	0.0	0.01	0.09	0.12	0.37	0.07	0.04	0.08	0.24	0.04	0.11	0.03	0.19	0.02	0.09	0.09	1.0	0.13
Gb_28132	1.0	0.07	0.11	0.06	0.04	0.91	0.02	0.04	0.0	0.01	0.05	0.1	0.02	0.07	0.02	0.35	0.04	0.06	0.03	0.62
Gb_28600	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_29228	0.42	0.83	0.51	0.31	0.26	0.34	0.35	0.4	0.36	0.29	0.36	0.27	0.23	0.23	0.36	0.3	0.31	0.32	1.0	0.48
Gb_29895	0.39	0.21	0.38	0.33	0.24	0.04	0.73	0.15	0.19	0.22	0.12	0.02	0.05	0.09	0.23	0.05	0.16	0.73	1.0	0.51
Gb_31062	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_31435	0.63	0.05	0.04	0.28	0.18	0.12	0.76	0.02	0.02	0.0	0.0	0.11	0.0	0.01	0.0	0.0	0.12	0.45	1.0	0.42
Gb_31673	0.96	0.34	0.35	0.23	0.19	1.0	0.09	0.29	0.27	0.21	0.36	0.17	0.26	0.23	0.33	0.32	0.18	0.48	0.42	0.69
Gb_32280	1.0	0.01	0.12	0.0	0.02	0.08	0.01	0.06	0.01	0.01	0.0	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.31	0.26	0.42
Gb_32367	0.19	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.61	0.02	0.05	0.0	0.0	0.59	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	1.0	0.83
Gb_32682	1.0	0.0	0.25	0.04	0.04	0.02	0.0	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.53	0.8	0.18
Gb_35341	0.08	0.33	0.09	0.04	0.04	0.04	0.02	0.13	0.11	0.07	0.28	0.07	0.1	0.15	0.2	0.01	0.0	0.07	1.0	0.01
Gb_36055	0.67	0.45	0.56	0.76	0.51	0.16	0.54	0.36	0.44	0.46	0.76	0.24	0.15	0.18	0.73	0.47	0.39	0.57	1.0	0.6
Gb_36269	0.06	0.02	0.16	0.05	0.29	0.28	0.03	0.32	0.11	0.11	0.5	0.22	0.37	0.64	0.39	1.0	0.04	0.38	0.72	0.75
Gb_36424	0.98	0.02	0.18	0.03	0.06	1.0	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.03	0.01	0.0	0.0	0.11	0.05	0.92
Gb_36430	1.0	0.04	0.31	0.08	0.06	1.0	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.07	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.1	0.06	0.91
Gb_36508	0.07	0.0	0.09	0.03	0.06	0.0	0.02	0.04	0.03	0.02	0.06	0.04	0.02	0.02	0.02	0.0	0.0	0.74	0.92	1.0
Gb_36909	0.01	0.02	0.01	0.0	0.03	0.01	0.01	0.22	0.48	0.54	0.15	0.05	0.24	0.15	0.14	0.09	0.16	0.13	1.0	0.01
Gb_37080	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.32	0.41	0.0	0.0	1.0	0.28
Gb_38556	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_39787	0.03	0.05	0.07	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.04	0.52	0.33
Gb_39790	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.65	0.14
Gb_40254	0.96	1.0	0.31	0.03	0.16	0.79	0.46	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.31	0.59
Gb_40255	0.92	1.0	0.32	0.02	0.16	0.9	0.57	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.09	0.24	0.78
Gb_40261	1.0	0.03	0.13	0.04	0.1	0.51	0.39	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.31	0.65

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)