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Heatmap: Cluster_209 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.82 0.17 0.78 0.73 0.33 -0.45 -1.01 -0.19 -0.21 -0.22 0.17 -0.43 -0.45 -0.67 0.32 -0.24 -0.43 -0.07 -0.39 -0.19
1.62 0.21 0.92 1.24 -0.03 -2.51 -1.94 -0.75 0.11 -0.21 0.1 -2.05 -1.72 -1.2 -0.07 0.72 0.25 -0.05 -1.52 -1.32
0.82 -0.33 0.73 0.77 0.28 -2.0 -0.92 -0.25 0.12 -0.08 0.28 -0.59 -0.1 -0.15 0.08 0.39 0.26 -0.2 -0.84 -0.97
1.18 0.46 0.92 0.65 0.45 -0.96 -0.07 -0.38 -0.33 -0.47 -0.23 -0.78 0.04 -0.07 -0.08 -0.42 -0.77 -0.14 -0.92 -0.64
0.95 0.1 0.34 0.7 0.67 -0.7 -0.65 -0.16 -0.49 -0.56 -0.71 -0.51 -1.01 -0.88 -0.83 0.12 -0.03 0.66 0.77 -0.49
1.37 1.5 0.86 1.12 0.57 -1.62 -0.99 -0.67 -0.49 -0.53 -0.17 -1.37 -0.86 -0.84 -0.22 -0.0 -1.54 -0.59 -0.99 -1.02
0.35 0.62 -0.05 0.64 0.47 -1.01 -2.0 -0.05 -0.03 -0.41 0.1 -0.53 -0.28 -0.15 0.06 0.3 -0.13 0.52 0.24 -0.85
0.9 0.04 0.38 0.87 0.68 -0.16 -0.0 -0.04 -0.34 -0.46 -0.34 -0.33 -1.0 -0.8 -0.21 0.16 0.19 0.42 -1.65 -0.92
0.69 0.62 1.28 0.6 0.68 -2.76 0.11 -0.5 -0.23 -0.3 -0.09 -0.67 -0.82 -0.72 -0.45 -0.23 -0.97 -0.12 -0.15 0.05
0.91 0.44 0.62 0.58 0.88 -1.63 -0.79 -0.03 -0.25 -0.66 -0.56 -0.52 -0.83 -0.54 -0.7 0.22 -0.22 0.52 0.2 -0.58
0.78 0.05 0.91 0.54 0.42 -0.22 -0.92 -0.07 -0.46 -0.74 0.35 -0.6 -0.29 -0.52 0.36 -0.38 -0.19 -0.07 -0.22 -0.48
1.01 0.39 0.8 0.85 0.31 -4.6 -0.48 -0.49 -0.51 -0.3 0.39 -1.13 -1.63 -1.87 0.26 0.54 0.1 0.24 0.43 -1.81
0.83 0.36 0.83 0.58 0.47 -1.01 -0.5 -0.28 0.02 -0.04 -0.1 -0.78 -0.44 -0.63 -0.08 0.04 -0.06 0.17 -0.5 -0.74
0.37 0.64 0.67 0.75 0.66 -1.03 -0.13 -0.29 0.08 -0.01 0.04 -0.24 -1.45 -1.2 -0.07 0.11 0.2 0.03 -0.44 -1.25
1.02 0.55 1.16 1.01 0.36 -0.95 -1.87 -0.41 -0.57 -0.87 -0.46 -1.03 -1.24 -1.3 -0.52 0.56 -0.44 0.17 0.65 -0.78
1.08 -0.87 0.23 0.98 0.78 -0.66 -1.86 -0.09 -0.3 -0.48 0.07 -0.67 -1.04 -1.1 -0.15 0.44 -0.68 0.31 0.43 -0.0
0.2 0.4 1.09 0.22 0.23 -0.85 -0.65 -0.24 0.02 -0.13 -0.03 -0.39 -0.44 -0.57 -0.02 0.45 -0.03 -0.04 -0.18 -0.38
1.49 1.01 1.11 1.65 -0.34 -1.55 -2.62 -0.84 0.06 -0.23 -0.45 -1.62 -2.36 -1.81 -0.29 0.28 -0.19 -0.12 -1.18 -1.7
0.75 -0.04 -0.21 0.62 0.32 -1.22 -0.89 -0.34 0.18 -0.45 0.51 -0.93 -0.33 0.1 0.12 0.42 0.28 0.1 -0.61 -0.16
0.8 0.0 0.42 0.06 0.58 -1.65 -0.78 -0.21 0.06 -0.12 0.05 -1.52 -0.14 -0.09 -0.13 0.7 -0.07 0.27 -0.22 -0.21
0.37 1.03 0.71 0.62 0.61 -0.22 -1.88 -0.23 -0.36 -0.66 0.07 -1.01 -0.1 -0.29 -0.03 -0.05 -0.86 0.21 -0.04 -0.61
1.28 -0.82 0.65 0.43 0.24 -1.64 -0.81 -0.61 -0.44 -0.3 0.97 -0.92 -1.99 -2.07 0.97 -0.06 0.24 -0.3 -0.08 -0.03
0.38 0.75 0.73 0.33 0.59 -0.42 -0.36 -0.28 0.01 -0.27 -0.22 -0.85 -0.63 -0.54 -0.29 0.33 -0.18 0.15 -0.02 -0.7
1.85 0.85 1.83 1.55 0.52 -3.25 -2.65 -0.88 -1.36 -1.41 -0.26 -2.19 -1.07 -1.27 -0.08 -1.2 -1.29 -0.72 -1.3 -1.54
1.04 -0.36 0.42 0.68 0.42 -0.83 -0.58 -0.3 -0.03 -0.43 -0.42 -0.52 -0.55 -0.45 -0.32 0.56 0.65 0.21 -1.06 -0.38
0.58 0.27 0.69 1.12 -0.21 -1.14 -0.74 -0.4 -0.17 -0.4 0.03 -0.43 -0.39 -0.37 0.14 0.48 0.1 -0.43 0.05 -0.86
0.45 0.02 0.18 0.85 0.69 0.35 -0.6 -0.35 -0.54 -0.69 0.1 -0.78 -0.5 -0.63 0.33 0.41 -0.11 0.23 -0.42 -0.7
0.42 1.0 0.77 -0.59 0.34 -0.74 0.21 -0.13 -0.74 -0.84 0.41 -0.42 -1.66 -1.6 0.17 -0.58 -0.5 0.58 0.83 -0.52
0.08 0.46 0.44 0.87 0.64 -1.1 -0.58 -0.25 -0.1 -0.44 -0.47 -0.45 -1.02 -0.76 -0.84 0.21 0.22 0.48 0.58 -0.2
0.54 -0.26 0.58 0.56 0.6 -0.56 -1.0 0.13 -0.21 -0.28 0.16 -0.22 -0.78 -1.02 0.2 0.01 0.24 0.33 -0.32 -0.26
0.61 0.85 0.23 0.28 0.26 -0.4 -1.31 -0.06 -0.2 -0.32 0.08 -0.72 -1.07 -1.06 0.12 0.82 0.48 -0.36 0.21 -0.99
1.0 0.12 0.72 0.66 0.42 -1.69 -0.95 -0.2 -0.06 -0.53 0.23 -0.36 -0.04 -0.51 0.07 -0.02 -0.36 -0.15 0.06 -0.7
1.11 0.16 0.98 0.78 0.6 -0.9 -1.39 -0.37 -0.22 -0.42 -0.74 -0.89 -1.17 -0.94 -0.88 0.38 -0.21 0.53 0.48 -0.78
0.49 0.82 0.54 0.03 -0.27 -2.09 -0.3 -0.51 0.24 0.21 0.29 -1.17 -0.84 -0.69 0.08 0.93 0.53 -0.39 -0.07 -1.12
0.8 0.86 0.84 0.93 0.3 -1.18 -1.16 -0.46 -0.03 -0.3 -0.58 -0.85 -1.43 -0.99 -0.39 0.86 -0.33 0.11 -0.11 -0.68
0.85 0.14 1.52 0.9 0.37 -3.44 -0.86 -0.66 -0.25 -0.33 0.6 -1.0 -2.48 -2.79 0.62 0.21 -0.27 -0.43 -0.24 -0.49
0.53 0.73 0.95 0.69 0.12 -1.82 -0.88 -0.47 0.04 -0.19 0.03 -0.57 -0.3 -0.27 -0.12 0.47 -0.02 -0.49 0.07 -1.18
0.34 0.63 0.37 0.21 -0.1 -2.62 -0.64 -0.42 0.32 0.06 0.19 -0.94 -0.97 -0.94 0.19 0.98 0.24 0.15 0.18 -0.45
1.33 0.37 0.88 0.45 0.54 -1.28 -0.62 -0.53 -0.53 -0.67 0.12 -1.35 -0.25 -0.54 -0.09 0.04 -0.3 0.04 -0.84 0.12
1.25 0.9 1.07 1.0 0.59 -0.31 -1.75 -0.41 -0.52 -0.68 -0.67 -1.27 -0.71 -0.58 -0.88 0.38 -0.89 0.08 -0.33 -1.34
0.74 0.88 0.9 0.86 0.29 -1.96 -1.59 -0.34 0.0 -0.32 0.09 -0.97 -1.74 -1.37 -0.01 0.95 0.16 -0.08 -0.19 -1.78
0.62 0.35 0.29 0.06 0.5 -0.32 -0.33 -0.24 0.06 -0.1 -0.15 -0.94 -0.57 -0.72 -0.02 0.3 0.29 0.33 -0.1 -0.39
0.64 0.55 0.74 0.41 0.25 -1.54 -0.49 -0.27 0.17 -0.1 0.03 -0.36 -1.22 -1.27 0.1 0.56 0.29 -0.18 0.25 -1.44
0.34 0.72 0.75 0.8 0.4 -1.15 -1.38 -0.12 -0.06 -0.32 -0.02 -0.84 -1.17 -0.98 0.12 0.18 0.21 0.33 0.07 -0.64
0.57 -0.51 0.92 0.69 0.34 -1.49 -0.65 -0.31 -0.31 -0.39 0.35 -0.31 -0.44 -0.47 -0.01 0.73 -0.18 -0.03 -0.22 -0.41
0.73 0.3 1.14 -0.11 0.55 -1.18 -0.96 -0.6 0.34 0.08 0.29 -0.72 -0.3 -1.13 -0.08 0.03 -0.38 0.19 -0.06 -0.65
0.72 0.23 1.07 0.38 -0.04 -1.46 -0.94 -0.49 0.32 0.34 0.38 -0.87 0.13 -0.68 0.12 -0.02 0.12 -0.1 -0.87 -1.07
1.06 -0.13 0.82 0.46 0.4 -1.14 -0.45 -0.32 -0.14 -0.35 0.02 -0.73 -0.14 -0.25 -0.0 -0.01 -0.19 -0.2 -0.34 -0.07
1.79 1.44 1.61 1.22 0.35 -5.04 -0.27 -1.13 -0.89 -1.36 0.4 -1.51 -1.25 -1.68 0.26 -1.77 -2.39 -1.03 -2.69 -2.32
0.85 1.43 1.66 0.61 0.34 -1.67 -0.86 -0.64 -0.95 -1.32 -0.18 -1.84 -3.98 -4.1 0.35 -0.05 -1.2 -0.31 0.91 -1.03
0.75 0.39 0.63 0.93 0.77 -0.85 -0.37 -0.17 -0.87 -0.82 -0.15 -1.25 -0.81 -0.81 -0.35 -0.43 -0.74 0.77 0.43 -0.2
0.56 0.65 0.85 0.89 -0.09 -1.62 -1.52 -0.2 0.37 -0.08 -0.35 -1.33 -0.32 -0.25 -0.51 1.28 -0.01 -0.14 -1.04 -2.19
0.84 -0.32 0.83 0.76 0.15 -2.12 -0.57 -0.56 0.22 -0.0 0.01 -0.43 -1.33 -1.04 -0.02 1.09 0.59 -0.6 -0.27 -1.56
1.03 0.62 0.88 0.91 0.11 -1.23 -1.02 -0.4 0.08 -0.11 0.05 -0.95 -0.4 -0.67 0.14 0.75 -0.67 -0.57 -1.22 -0.96
0.58 0.17 1.05 0.53 0.4 -3.69 -0.37 -0.77 -0.29 -0.05 0.44 -1.18 -0.84 -0.96 0.58 0.21 0.41 -0.43 0.03 -0.45
0.88 -0.47 0.71 0.85 -0.01 -1.3 -0.48 -0.68 -0.57 -0.51 0.87 -1.29 -0.87 -1.17 1.04 -0.57 -0.26 -0.21 0.2 0.09
0.78 0.43 0.53 0.8 0.68 -0.12 -1.01 -0.06 -0.26 -0.7 0.41 -0.52 -1.46 -1.41 0.55 -0.11 -0.55 0.25 -1.05 -0.31
0.84 0.11 0.61 0.21 0.29 -1.48 -1.28 -0.15 0.32 0.04 -0.51 -0.61 -0.82 -1.14 -0.21 1.4 0.67 -0.02 -1.07 -1.56
1.26 -1.09 1.0 1.06 0.1 -4.53 -0.79 -1.44 -0.82 -0.61 1.16 -1.55 -2.07 -2.05 1.24 -0.79 -0.76 -0.7 -0.09 0.7

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.