Heatmap: Cluster_215 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00117	0.07	0.36	0.36	0.17	0.39	0.34	0.36	0.22	0.14	0.21	0.15	0.18	0.1	0.06	0.24	0.17	0.22	0.25	1.0	0.39
Gb_00334	0.07	0.02	0.05	0.04	0.01	0.92	1.0	0.13	0.06	0.06	0.01	0.03	0.03	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.06
Gb_01492	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.01
Gb_02335	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.87	1.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.0	0.01
Gb_02357	0.01	0.0	0.02	0.02	0.02	0.83	1.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.01	0.01
Gb_03013	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.97	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04115	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04336	0.07	0.15	0.18	0.02	0.2	0.05	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01
Gb_04754	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	1.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.19	0.17	0.5	0.0
Gb_05500	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.28	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.05
Gb_05738	0.19	0.03	0.01	0.0	0.09	0.01	1.0	0.05	0.05	0.01	0.48	0.06	0.05	0.08	0.24	0.0	0.0	0.06	0.0	0.03
Gb_06044	0.73	0.84	0.77	0.33	0.66	0.03	1.0	0.14	0.11	0.1	0.11	0.05	0.09	0.08	0.14	0.05	0.05	0.5	0.44	0.19
Gb_06238	0.13	0.04	0.07	0.13	0.2	0.11	1.0	0.14	0.08	0.11	0.03	0.04	0.04	0.05	0.03	0.14	0.23	0.44	0.46	0.16
Gb_06278	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17
Gb_07172	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07248	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.8	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.04	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_07628	0.07	0.24	0.4	0.03	0.16	0.0	1.0	0.04	0.09	0.06	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.23	0.07	0.27	0.02
Gb_07869	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.42	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_08076	0.14	0.17	0.18	0.0	0.03	0.32	0.89	0.02	0.02	0.0	0.12	0.03	0.05	0.0	0.05	0.0	0.0	0.05	1.0	0.1
Gb_08135	0.5	0.82	0.65	0.38	0.56	0.31	1.0	0.25	0.16	0.17	0.25	0.07	0.15	0.09	0.23	0.23	0.21	0.34	0.14	0.2
Gb_08222	0.02	0.05	0.01	0.03	0.16	1.0	0.68	0.2	0.13	0.11	0.17	0.19	0.1	0.1	0.15	0.07	0.08	0.58	0.04	0.32
Gb_08299	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_08866	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.78	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01
Gb_08876	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.1	1.0	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0
Gb_09828	0.32	0.0	0.01	0.0	0.11	0.06	1.0	0.08	0.06	0.04	0.27	0.17	0.13	0.09	0.19	0.0	0.0	0.17	0.0	0.14
Gb_11176	0.0	0.0	0.03	0.0	0.04	0.1	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.3	0.0
Gb_11178	0.02	0.0	0.02	0.02	0.02	0.0	1.0	0.03	0.02	0.03	0.1	0.06	0.01	0.01	0.12	0.04	0.07	0.2	0.85	0.2
Gb_12611	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_13155	0.04	0.0	0.02	0.0	0.0	1.0	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.17
Gb_14480	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14883	0.05	0.27	0.06	0.01	0.01	1.0	0.77	0.09	0.01	0.01	0.1	0.12	0.01	0.02	0.07	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05
Gb_14884	0.08	0.29	0.04	0.0	0.02	0.79	1.0	0.25	0.18	0.02	0.55	0.12	0.54	0.44	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05
Gb_15002	0.19	0.17	0.2	0.25	0.72	0.14	0.7	0.08	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.04	0.04	1.0	0.96	0.38
Gb_15152	0.56	0.61	0.5	0.58	0.63	0.34	0.85	0.22	0.16	0.16	0.15	0.26	0.31	0.28	0.13	0.15	0.14	0.39	1.0	0.6
Gb_15222	0.17	0.08	0.21	0.19	0.36	0.06	0.78	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.05	0.0	0.06	0.18	1.0	0.44
Gb_15223	0.11	0.04	0.12	0.11	0.22	0.08	0.38	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.0	0.02	0.09	1.0	0.23
Gb_15332	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
Gb_15761	0.05	0.02	0.02	0.04	0.05	0.04	1.0	0.07	0.1	0.06	0.19	0.06	0.13	0.19	0.19	0.18	0.12	0.23	0.01	0.0
Gb_16226	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.41	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.44	0.01
Gb_16241	0.08	0.04	0.18	0.24	0.9	0.16	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	1.0	0.08
Gb_16852	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.05	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.73	0.12
Gb_17470	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17756	0.06	0.03	0.05	0.04	0.02	0.03	0.78	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.07	1.0	0.1
Gb_17810	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18012	0.01	0.01	0.03	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18578	0.03	0.15	0.03	0.11	0.11	0.2	0.63	0.03	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.33	1.0	0.41
Gb_19320	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.05	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.0	0.03
Gb_19419	0.01	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_20079	0.02	0.24	0.08	0.06	0.21	0.11	1.0	0.08	0.05	0.1	0.09	0.19	0.06	0.09	0.11	0.02	0.04	0.03	0.01	0.11
Gb_22073	0.35	0.47	0.39	0.37	0.44	0.21	0.81	0.11	0.07	0.1	0.09	0.05	0.03	0.03	0.11	0.29	0.22	1.0	0.46	0.53
Gb_22164	0.5	0.24	0.46	0.19	0.28	0.16	1.0	0.16	0.15	0.18	0.02	0.14	0.04	0.05	0.04	0.24	0.17	0.57	0.21	0.48
Gb_22167	0.53	0.27	0.75	0.53	0.24	0.11	1.0	0.1	0.16	0.18	0.04	0.1	0.05	0.08	0.05	0.21	0.14	0.44	0.08	0.59
Gb_22209	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22728	0.68	0.14	0.46	0.43	0.85	0.37	0.62	0.23	0.22	0.31	0.3	0.31	0.08	0.12	0.32	0.3	0.39	0.27	1.0	0.69
Gb_22730	0.4	0.14	0.31	0.49	0.48	0.26	0.34	0.19	0.13	0.17	0.2	0.18	0.07	0.08	0.23	0.15	0.24	0.15	1.0	0.19
Gb_22908	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.68	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_22909	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.48	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_23544	0.05	0.02	0.04	0.02	0.12	0.11	1.0	0.12	0.04	0.09	0.07	0.02	0.1	0.09	0.09	0.03	0.03	0.47	0.26	0.08
Gb_23770	0.05	0.07	0.01	0.03	0.05	0.31	1.0	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.01	0.04	0.41	0.23
Gb_24157	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.39	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02
Gb_24283	0.06	0.17	0.05	0.1	0.15	0.03	1.0	0.05	0.09	0.11	0.13	0.05	0.05	0.04	0.05	0.16	0.06	0.15	0.35	0.14
Gb_24284	0.09	0.06	0.08	0.07	0.23	0.03	1.0	0.07	0.09	0.07	0.1	0.06	0.04	0.07	0.08	0.13	0.05	0.18	0.52	0.29
Gb_24285	0.07	0.04	0.07	0.07	0.16	0.0	1.0	0.05	0.07	0.08	0.1	0.04	0.01	0.02	0.05	0.11	0.07	0.13	0.6	0.22
Gb_24353	0.05	0.16	0.11	0.04	0.21	0.03	1.0	0.03	0.02	0.02	0.02	0.08	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.01
Gb_25374	0.15	0.35	0.13	0.09	0.3	1.0	0.81	0.26	0.27	0.22	0.55	0.15	0.23	0.31	0.39	0.21	0.1	0.08	0.25	0.05
Gb_25440	0.14	0.08	0.15	0.1	0.1	0.99	1.0	0.13	0.05	0.05	0.06	0.17	0.09	0.06	0.05	0.05	0.11	0.02	0.01	0.31
Gb_25568	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15
Gb_25686	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26467	0.1	0.22	0.11	0.09	0.14	0.04	1.0	0.04	0.03	0.07	0.06	0.04	0.06	0.03	0.08	0.07	0.07	0.18	0.13	0.35
Gb_26476	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.02	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0
Gb_27114	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_27115	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.08
Gb_27421	0.25	0.15	0.34	0.11	0.11	0.01	1.0	0.04	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.05	0.32	0.03	0.38
Gb_28426	0.07	0.02	0.02	0.28	0.7	0.06	0.1	0.02	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.22	1.0	0.1
Gb_28427	0.02	0.01	0.01	0.12	0.3	0.03	0.34	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.04	1.0	0.0
Gb_28669	0.16	0.13	0.06	0.05	0.12	1.0	0.7	0.07	0.08	0.07	0.04	0.04	0.08	0.11	0.05	0.07	0.06	0.1	0.25	0.13
Gb_29250	0.33	0.32	0.3	0.18	0.43	0.03	1.0	0.05	0.04	0.06	0.07	0.12	0.02	0.04	0.05	0.03	0.06	0.13	0.17	0.47
Gb_29676	0.07	0.09	0.08	0.09	0.12	0.39	1.0	0.05	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.09	0.26
Gb_29783	0.01	0.06	0.03	0.0	0.02	0.0	1.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01
Gb_30214	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30221	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02
Gb_30679	0.23	0.09	0.19	0.09	0.24	0.07	1.0	0.03	0.01	0.02	0.0	0.02	0.01	0.0	0.06	0.0	0.0	0.09	0.68	0.05
Gb_31490	0.58	0.58	0.83	0.27	0.32	0.0	1.0	0.1	0.1	0.13	0.15	0.38	0.06	0.04	0.19	0.14	0.2	0.24	0.2	0.69
Gb_31499	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32327	0.04	0.11	0.06	0.03	0.12	0.24	1.0	0.12	0.2	0.17	0.28	0.12	0.11	0.08	0.31	0.19	0.2	0.21	0.18	0.08
Gb_32713	0.06	0.01	0.0	0.03	0.0	0.62	1.0	0.08	0.05	0.03	0.01	0.03	0.06	0.08	0.02	0.04	0.01	0.02	0.15	0.27
Gb_33119	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.19	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33276	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.03	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33582	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.97	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_34467	0.06	0.03	0.06	0.03	0.02	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01
Gb_34837	0.08	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_35675	0.19	0.13	0.1	0.1	0.31	0.0	1.0	0.05	0.03	0.06	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.11	0.05	0.06
Gb_35716	0.02	0.0	0.04	0.0	0.0	0.27	1.0	0.06	0.0	0.04	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_35888	0.0	0.01	0.02	0.01	0.03	0.22	0.47	0.07	0.07	0.06	0.04	0.06	0.11	0.13	0.05	0.03	0.09	0.15	1.0	0.34
Gb_36125	0.01	0.0	0.02	0.06	0.05	0.05	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.18	0.03	0.58
Gb_36126	0.03	0.04	0.05	0.07	0.09	0.09	1.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.31	0.09	0.42
Gb_36279	0.01	0.0	0.0	0.05	0.05	0.08	1.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.04	0.25	0.02	0.06
Gb_37684	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.08	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.2	0.06
Gb_38082	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.98	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	1.0
Gb_38211	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	1.0	0.09	0.0	0.0	0.06	0.04	0.0	0.07	0.0	0.11	0.0	0.89	0.45	0.11
Gb_38666	0.1	0.07	0.2	0.0	0.07	0.21	1.0	0.06	0.03	0.04	0.03	0.06	0.02	0.03	0.0	0.07	0.24	0.19	0.11	0.3
Gb_38677	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07
Gb_38993	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	1.0	0.65	0.02	0.01	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.07	0.06	0.11	0.15
Gb_39002	0.6	0.45	0.59	0.4	0.57	0.14	0.98	0.34	0.4	0.38	0.82	0.25	0.25	0.19	0.73	0.42	0.28	0.53	0.75	1.0
Gb_39126	0.0	0.03	0.0	0.22	0.08	0.07	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.13	0.12	0.0	0.08
Gb_39675	0.06	0.0	0.04	0.13	0.21	0.15	1.0	0.05	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.95	0.18
Gb_39931	0.05	0.03	0.01	0.12	0.24	0.01	1.0	0.02	0.0	0.01	0.02	0.06	0.0	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.0	0.7
Gb_41427	0.04	0.0	0.0	0.0	0.28	0.09	1.0	0.05	0.14	0.12	0.0	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.07	0.07

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)