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Heatmap: Cluster_68 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.5 0.25 -0.06 0.24 0.21 0.12 -0.84 0.21 -0.06 -0.41 -0.65 -1.32 0.51 0.06 -0.6 -0.12 -0.5 0.75 0.61 -0.77
-0.01 -0.37 -2.68 1.17 0.27 -0.03 -2.12 0.4 -0.11 0.48 -0.81 -2.66 0.46 0.52 -0.03 0.58 0.23 -0.62 0.81 -2.36
-1.36 0.19 -1.79 -1.5 -1.2 -0.55 0.56 -0.45 0.42 0.28 0.85 -1.58 1.15 0.77 0.76 -0.17 -0.9 -0.91 0.29 0.02
0.58 0.65 -0.99 -0.33 -0.3 -0.76 -1.92 0.42 0.06 0.19 0.83 -0.55 0.46 -0.1 0.78 -0.13 -0.7 -0.11 0.37 -2.24
0.21 0.16 -1.27 -1.33 -0.36 -1.7 -2.06 0.36 0.23 0.46 1.07 -0.34 1.18 0.7 0.88 -0.28 -0.47 -0.35 -0.58 -2.79
-0.66 0.1 -0.15 -0.25 0.5 0.22 -0.5 0.24 -0.12 -0.14 -0.32 -0.28 0.43 0.36 -0.07 -0.35 -0.32 0.21 0.46 -0.08
-0.08 -0.74 -0.37 0.16 0.15 -0.18 -1.42 0.2 0.22 -0.03 0.33 -0.47 0.76 0.36 0.35 -0.01 0.06 0.31 -0.11 -1.06
-0.84 0.04 -0.36 -1.42 -0.73 - -0.66 0.49 0.67 0.29 0.52 -0.93 1.4 1.09 0.29 -0.72 -0.74 -1.1 -0.11 0.35
-0.58 -0.45 -1.55 -1.72 -0.88 -2.59 -0.12 0.55 0.72 -0.19 1.28 -0.7 1.02 0.93 0.65 -0.77 -1.82 -0.67 0.29 0.09
-0.11 0.15 -1.09 -0.9 -0.3 -0.87 -0.2 0.69 0.47 0.67 1.01 -0.6 0.69 0.0 0.83 -1.26 -4.11 -0.79 0.42 -0.57
-1.56 -0.89 -1.07 0.23 1.17 -1.34 -0.15 0.38 -0.54 -0.14 0.02 -0.01 1.29 0.09 -0.04 -1.23 -0.61 -0.25 1.0 -0.7
0.72 -0.19 -0.06 0.51 0.39 -1.06 -0.62 -0.04 0.04 0.03 -0.36 -1.58 1.05 0.76 -0.25 -0.66 -1.01 -0.13 0.28 -0.59
0.36 -0.11 -0.33 -0.39 0.19 -0.66 -0.36 0.01 0.06 -0.08 0.27 -1.47 1.09 0.77 0.25 -0.57 -1.01 -0.29 0.19 -0.08
-0.2 -0.31 -1.51 -1.45 -0.42 -2.1 -0.22 -0.2 0.14 -0.01 0.25 -1.56 1.42 0.94 0.15 -0.81 -1.64 -0.5 1.21 0.74
-0.24 0.47 -0.88 -0.16 0.1 -0.62 -0.99 0.12 0.36 0.18 0.37 -0.92 0.87 0.42 0.35 -0.04 -0.64 -0.19 0.12 -0.39
0.83 0.41 -0.29 0.55 0.26 -0.9 -3.8 0.25 -0.02 -0.29 0.19 -1.09 0.95 0.32 0.09 -1.53 -1.82 -0.21 0.68 -0.21
-0.26 0.38 -0.56 -0.45 0.12 -1.31 -0.08 -0.06 0.05 0.07 -0.22 -1.52 1.51 1.32 -0.06 -0.56 -1.44 -0.67 0.49 -1.43
0.42 -1.16 -1.2 0.48 -0.07 -2.09 0.62 -0.11 0.37 0.54 1.29 -0.59 0.55 0.12 1.25 -0.76 -1.76 -1.5 -1.05 -2.14
-0.63 -0.74 -2.42 -0.4 -0.08 -1.46 0.15 -0.51 0.22 0.01 0.89 -0.93 1.26 0.54 0.92 0.79 0.18 -0.59 -2.53 -0.53
0.06 -0.04 -1.02 -0.22 0.3 -0.47 -1.09 0.23 -0.16 -0.38 0.55 -0.52 0.83 0.96 0.31 -0.08 -0.57 0.37 -0.79 -0.41
-0.59 0.6 -0.52 -1.09 0.29 -0.28 -0.36 -0.01 0.16 0.05 -0.31 -1.86 1.16 0.84 -0.26 -0.87 -1.38 0.44 0.67 -0.22
-0.6 0.93 -0.38 -1.23 0.16 -0.04 -0.43 0.19 -0.2 -0.25 -0.33 -2.06 1.03 0.78 -0.11 -0.93 -1.88 0.42 0.91 -0.3
0.56 0.16 -0.16 -0.12 -0.06 -0.52 -1.2 0.04 -0.28 -0.17 0.47 -0.91 0.88 0.47 0.61 -0.26 -0.35 -0.29 0.14 -0.84
0.51 0.8 0.02 -0.02 0.3 0.48 -1.49 -0.34 -0.39 -0.66 -0.31 -1.16 -0.09 -0.15 -0.35 -0.28 -0.96 0.9 0.87 -0.41
-0.66 -0.11 -2.28 -1.57 -1.23 -2.01 -0.19 0.05 -0.11 0.37 0.57 -2.44 1.12 0.41 0.67 -0.57 -1.31 -0.64 1.87 -0.04
0.43 -0.15 -0.27 -0.3 0.14 0.52 -0.83 0.07 -0.09 -0.12 -0.14 -1.06 0.96 0.65 -0.08 -0.63 -0.74 0.22 0.24 -0.61
0.73 0.3 0.36 1.02 1.12 -0.92 0.48 -0.25 -0.89 -1.14 0.09 -0.78 -0.41 -0.66 -0.35 -0.88 -1.77 0.05 0.21 0.01
-1.86 -0.58 -1.06 -0.86 -0.24 0.38 -1.33 0.53 0.62 0.79 0.13 0.14 0.5 0.32 0.28 -0.24 -0.95 0.79 0.41 -1.78
-2.03 -1.78 -1.11 -0.35 -0.35 0.23 -1.92 0.12 0.68 0.81 -0.44 0.56 1.13 1.16 -0.2 0.13 -0.94 0.71 -0.71 -2.29
0.12 -0.37 -0.58 0.33 0.82 -0.08 -0.74 0.07 -0.08 -0.27 0.31 -0.86 1.1 0.87 0.09 -0.46 -0.8 -0.67 -0.5 -0.7
0.48 -0.27 -0.57 0.48 -0.57 -1.86 -2.69 -0.02 0.07 -0.02 0.75 -0.4 0.44 0.36 0.59 0.22 -0.25 0.25 0.58 -1.75
0.32 1.31 -0.21 0.13 0.72 -0.55 -0.15 -0.02 -0.39 -0.64 -0.79 -1.26 0.77 -0.08 -0.53 -0.4 -0.87 0.02 0.39 -0.45
0.28 -0.77 -0.95 -0.1 0.39 -2.31 -1.24 -0.02 0.02 -0.19 -0.04 -1.72 1.34 0.8 0.07 -0.22 -1.39 -0.14 1.37 -0.72
0.18 0.05 -0.2 0.5 0.2 0.67 -0.48 0.17 -0.34 -0.26 -0.02 -0.55 0.57 0.3 -0.02 -0.41 -0.79 0.01 0.31 -1.36
0.51 0.66 -1.25 0.04 -0.06 -0.43 -1.33 -0.11 0.2 -0.01 -0.25 -2.94 1.08 0.6 -0.39 0.3 -0.65 -0.08 0.74 -0.91
0.02 -0.85 -0.57 -0.48 -0.32 -0.77 -2.31 0.39 0.14 0.2 1.19 -0.23 1.01 0.46 1.17 -1.1 -0.45 -0.36 -0.52 -1.13
0.36 -1.58 -0.7 -1.69 -0.04 -0.96 -1.36 0.66 0.13 0.26 1.01 0.05 0.6 -0.02 1.3 -0.99 -0.13 0.17 -0.73 -0.87
0.08 -0.29 -0.41 0.17 -0.11 -0.9 -1.22 0.0 0.24 0.18 0.41 -1.53 1.25 0.98 0.34 -0.67 -1.16 -0.49 0.22 -0.33
-0.69 1.72 -0.9 0.92 -1.01 0.73 -7.62 0.23 -1.77 -1.48 -3.43 -0.01 2.31 1.36 -4.33 -3.65 -1.97 -0.88 -3.1 -5.24
0.29 -0.32 -0.05 -0.43 0.08 -0.46 -0.88 0.07 0.1 -0.24 0.33 -1.44 1.19 0.72 0.38 -0.23 -0.78 -0.17 0.33 -0.93
0.43 -0.35 -0.35 0.11 1.03 -1.87 -0.76 0.28 -0.48 -0.29 0.1 -1.04 0.64 0.93 -0.39 -0.12 -1.1 0.34 0.88 -3.47
-0.57 -2.61 -1.39 0.93 0.47 -2.43 -1.14 0.3 0.55 0.12 0.56 -2.07 1.32 0.45 -0.36 0.52 -0.09 0.07 -0.25 -1.15
0.06 0.88 -0.42 -0.12 -0.34 -1.22 0.61 0.02 -0.02 -0.04 0.75 -0.94 0.44 0.42 -0.05 -1.58 -1.25 0.25 0.59 -1.37
-0.83 0.26 -0.46 -0.21 0.06 -0.35 -0.1 0.12 0.72 0.5 0.36 -0.43 -0.02 -0.01 0.42 0.06 -0.43 0.18 -0.17 -0.74
-0.1 0.42 -0.2 -0.84 -0.08 -0.44 -0.2 -0.2 -0.08 -0.04 0.49 -1.54 1.18 0.82 0.46 -1.01 -1.33 -0.4 0.49 -0.44
-0.3 1.28 0.34 -0.26 0.31 -0.01 -0.1 0.1 -0.12 -0.13 -0.14 -1.9 0.2 -0.4 0.13 -1.09 -1.75 -0.0 0.97 -0.57
-0.1 0.61 -0.23 -0.43 0.34 -0.52 0.35 -0.2 -0.1 -0.02 0.32 -1.74 0.77 0.67 0.27 -1.29 -1.52 -0.07 0.37 -0.2
-0.37 1.15 0.11 -0.38 0.61 -0.35 0.02 0.02 -0.01 0.02 0.01 -1.73 -0.06 -0.02 0.0 -1.52 -2.12 0.17 0.88 0.02
-1.17 -0.54 0.05 -1.49 -0.83 -5.34 0.34 -0.5 0.65 0.75 -0.03 -3.09 1.15 1.27 -0.6 -0.29 -1.0 -1.21 1.67 -1.51
0.28 - - 0.25 - - 2.05 -1.28 0.04 0.95 -0.52 - -1.27 -1.93 -0.78 -0.93 - 0.1 2.7 -
0.83 -0.79 0.03 -0.05 -0.07 -0.89 -3.34 0.56 -0.77 -0.71 -0.8 -1.32 1.1 0.76 -1.02 -0.71 -0.94 0.82 1.25 -0.26
0.15 -0.17 -0.41 0.33 -0.28 -0.1 -0.6 0.1 -0.19 -0.53 0.11 -0.45 0.08 0.06 0.01 0.71 0.48 0.15 -0.04 -0.17
-0.37 -2.09 -0.74 -0.48 0.7 -0.18 -0.99 0.07 0.43 0.33 0.28 -0.77 0.75 0.26 0.61 -0.94 -0.57 0.79 -0.63 0.3
0.15 - 0.52 - 0.55 1.55 -2.73 -0.05 -0.75 -1.38 - -1.01 1.56 0.33 -2.96 -0.37 -0.91 1.09 0.79 -0.03
0.31 1.32 0.09 -0.19 0.95 -1.05 0.11 -0.33 -0.53 -0.47 -0.37 -2.44 0.6 0.4 -0.2 -0.25 -1.13 0.04 0.11 -0.87
-0.46 -0.33 -2.81 0.53 -0.83 0.09 -0.29 0.19 -0.21 -0.09 0.04 -1.81 0.77 0.23 0.48 0.59 -1.23 -0.57 1.49 -0.99
-0.15 0.58 -0.15 -0.07 0.03 -1.53 -0.48 0.14 0.17 -0.01 0.17 -0.6 0.57 0.46 0.16 0.2 -0.55 -0.11 0.39 -0.74
-0.03 0.44 -0.57 0.15 -0.73 -1.91 -1.18 -0.04 0.07 0.42 0.75 -1.22 -0.02 -0.25 0.93 -0.32 0.42 -0.11 0.39 -0.01
-0.09 0.09 -0.43 -0.57 0.27 -0.28 0.07 0.11 0.09 0.08 0.33 -1.07 0.78 0.41 0.28 -0.47 -1.02 -0.19 0.49 -0.28
-0.01 -0.27 -0.11 -0.38 -0.14 0.4 -0.97 0.35 0.03 0.12 0.29 0.05 0.03 -0.09 0.19 0.31 0.27 0.07 -0.47 -0.39
0.69 0.05 -0.52 1.03 0.2 -1.83 -2.28 -0.04 -0.26 -0.37 -0.29 -0.92 0.16 -0.25 -0.2 0.11 -0.25 0.89 0.99 -1.09
-0.14 -0.23 -0.28 0.1 0.03 -1.55 -1.76 0.09 0.34 0.06 0.26 -0.73 0.76 0.6 0.06 0.43 -0.04 0.16 0.45 -1.1
0.54 1.12 -0.31 1.4 1.14 -1.58 -2.67 0.33 -2.06 -2.0 -0.42 0.22 1.29 1.1 -1.25 -2.37 -2.28 -0.51 -1.81 -2.56
0.08 0.59 -0.23 0.08 0.0 -0.41 0.46 -0.07 0.52 0.66 0.86 -0.43 -0.11 -0.18 0.77 -0.68 -1.17 -0.8 -0.79 -2.87
-0.48 -1.89 -1.69 -0.25 0.04 -1.61 0.35 -0.17 0.19 0.03 0.68 -0.91 1.03 1.0 0.95 0.15 -0.68 0.07 -2.37 0.12
0.56 0.13 -0.18 0.02 0.45 -0.12 -0.41 0.02 -0.12 -0.15 -0.08 -1.7 1.02 0.66 -0.17 -0.95 -1.47 -0.03 0.35 -0.37
0.02 -0.26 -0.14 -0.03 0.44 0.02 -0.47 0.18 -0.08 -0.06 -0.57 -0.86 0.97 0.67 -0.55 -0.89 -1.13 0.65 0.22 -0.1
0.23 -0.12 -0.85 -0.37 0.09 -1.4 0.01 -0.21 0.06 0.08 0.31 -1.28 0.96 0.59 0.29 -0.01 -0.87 -0.4 0.8 -0.35
0.2 -0.49 -0.81 -0.14 0.03 -1.8 -0.13 -0.35 -0.04 -0.13 0.61 -1.53 1.12 0.91 0.49 0.38 -0.92 -0.79 -0.14 0.15
-0.2 0.36 -0.77 -0.72 -0.0 -0.67 -0.2 0.22 0.07 0.06 0.33 -0.48 0.55 0.08 0.63 -0.31 -0.51 0.39 0.17 -0.13
0.49 0.29 -0.17 0.24 0.5 -0.3 -0.8 0.19 -0.02 -0.08 -0.52 -0.34 0.75 0.64 -0.28 -0.83 -0.38 0.07 -0.29 -0.54
0.4 -0.15 0.43 0.16 -0.25 -2.73 -1.5 0.46 -0.01 0.2 0.69 -0.52 0.84 0.28 0.71 -0.63 0.25 -1.14 -0.61 -0.81
0.18 -0.39 -0.24 -0.23 0.35 -0.35 -1.05 0.33 0.01 0.08 0.23 -0.72 0.93 0.47 0.23 -0.73 -0.98 0.31 -0.11 0.04
0.02 -0.4 -0.15 0.03 0.3 -0.68 -1.1 0.17 0.24 0.3 0.31 -0.75 0.99 0.71 0.22 -0.76 -0.87 0.18 -1.08 0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.