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Heatmap: Cluster_324 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.95 0.06 0.34 0.67 0.69 -1.5 -0.52 -0.31 -0.07 -0.14 -0.1 -0.85 -0.0 -0.26 -0.14 -0.11 -0.5 0.06 0.23 -0.41
1.15 0.03 0.35 0.91 0.2 -2.02 -1.05 -0.4 -0.27 -0.28 0.3 -1.0 -0.85 -1.2 0.47 0.52 -0.8 0.3 0.41 -0.64
0.61 0.05 0.03 0.81 0.54 -2.4 -1.17 -0.63 -0.09 -1.04 0.74 -0.91 0.35 -0.65 0.27 1.03 -1.02 -0.43 0.29 -0.57
1.0 -1.04 -0.23 0.71 0.26 -2.99 -0.9 -0.54 -0.12 -0.3 0.55 -1.16 -0.2 -0.44 0.81 1.05 -0.06 -0.07 -0.63 -0.23
0.8 0.22 0.11 0.35 0.43 -1.47 -0.61 -0.23 0.06 -0.1 0.66 -0.91 -0.64 -1.13 0.72 -0.08 -0.65 -0.05 0.36 -0.22
1.18 -0.66 0.17 0.7 0.31 -2.59 -0.26 -0.29 0.01 -0.17 0.54 -0.91 -0.32 -0.67 0.4 0.41 -0.12 -0.67 0.17 -0.63
0.23 -0.2 -0.2 -0.01 0.41 -0.52 -0.18 0.05 -0.09 -0.13 0.35 -0.28 -0.12 -0.31 0.42 0.01 -0.26 0.17 0.23 -0.0
0.45 0.05 -0.68 0.26 0.28 -0.88 0.07 -0.24 -0.25 -0.34 0.81 -0.85 -0.06 -0.45 0.77 -0.13 -0.61 -0.36 0.4 0.14
1.04 0.23 0.63 -0.13 0.37 -1.18 -0.23 -0.36 -0.19 -0.34 0.37 -1.55 -0.2 -0.36 0.19 -0.11 -0.5 -0.13 -0.11 0.45
1.17 -0.04 0.4 0.64 0.83 -0.37 -0.08 -0.49 -0.84 -0.91 0.14 -1.32 -0.33 -0.64 0.25 -0.38 -0.31 0.12 -0.35 0.04
0.92 -0.05 0.17 0.43 0.16 -0.76 -0.22 -0.32 -0.58 -0.55 0.82 -1.68 -0.49 -0.82 0.94 -0.58 -0.68 -0.4 0.15 0.6
0.35 0.08 -0.18 -0.11 -0.03 -0.72 -0.56 -0.02 0.2 -0.05 0.8 -0.54 -0.01 -0.19 0.74 -0.07 -0.49 -0.31 0.18 -0.11
0.77 1.13 0.22 0.05 0.61 -0.72 -0.24 -0.45 -0.47 -0.56 0.28 -0.77 -1.69 -1.87 0.22 0.24 0.09 0.34 0.42 -1.27
1.0 0.26 0.48 0.73 0.73 -0.79 -0.45 -0.04 -0.48 -0.49 -0.31 -0.11 -0.82 -0.56 -0.49 -0.85 -0.46 0.26 0.41 -0.19
0.39 -0.58 -0.13 0.07 -0.03 -4.07 -0.03 -0.37 0.06 0.1 0.98 -0.59 -0.31 -0.63 0.94 0.63 0.18 -0.57 0.55 -1.69
0.41 -0.08 -0.07 0.13 -0.03 -0.22 -0.31 -0.06 -0.15 -0.16 0.6 -0.62 -0.13 -0.34 0.46 0.13 -0.23 -0.1 0.28 -0.1
0.58 0.04 0.15 0.22 0.46 -0.26 -0.85 -0.03 -0.29 -0.31 -0.12 -0.42 -0.63 -0.58 -0.1 -0.47 -0.12 0.29 1.02 0.05
0.55 0.0 0.05 0.51 0.04 -0.52 -0.11 -0.17 -0.35 -0.54 0.61 -0.58 0.11 -0.25 0.47 -0.61 -0.6 0.04 0.54 -0.39
0.74 0.18 0.02 0.29 0.45 -0.51 -0.39 -0.2 -0.33 -0.29 0.39 -0.93 -0.51 -0.91 0.38 -0.21 -0.51 0.2 0.43 0.28
0.65 0.12 -0.29 -0.05 0.34 -1.59 -0.75 -0.33 0.06 -0.09 0.51 -0.88 -0.14 -0.39 0.55 0.38 -0.02 0.19 0.34 -0.33
1.5 0.1 0.7 1.11 0.64 -0.79 -0.65 -0.18 -0.61 -0.81 -0.34 -1.49 0.08 -0.09 -0.24 -0.94 -1.68 -0.33 0.2 -0.52
0.82 -0.38 -0.18 0.27 0.36 -0.74 0.19 -0.23 -0.11 -0.31 0.33 -0.61 0.06 -0.15 0.07 -0.21 -0.3 0.25 0.24 -0.3
0.86 -0.21 0.31 0.43 0.49 -1.04 -0.51 -0.09 -0.05 -0.26 0.52 -0.68 -0.46 -0.77 0.46 -0.12 -0.16 -0.23 -0.06 0.02
0.56 0.27 -0.26 0.33 0.33 -0.3 -0.29 -0.0 0.12 -0.01 0.18 -0.73 -0.22 -0.46 0.07 0.26 -0.65 -0.44 0.36 0.05
0.75 -0.14 0.14 -0.16 0.32 -2.6 0.29 -0.37 -0.37 -0.3 0.51 -1.12 -0.52 -0.95 0.79 0.67 -0.19 -0.33 0.7 -0.49
0.82 -0.03 -0.04 0.55 0.63 -1.01 -0.66 -0.27 -0.12 -0.18 0.24 -1.07 -0.29 -0.5 0.3 0.09 -0.04 0.41 0.06 -0.54
0.45 -0.23 -0.28 0.24 0.39 -0.37 -0.57 -0.13 -0.12 -0.15 0.98 -0.73 -0.35 -0.61 0.97 0.12 -0.41 -0.05 -0.64 -0.23
0.44 -0.02 -0.18 0.03 0.62 -0.24 -0.19 -0.05 -0.32 -0.23 0.48 -0.57 0.19 -0.19 0.56 -0.45 -0.56 0.05 -0.15 -0.05
-0.01 -0.27 -0.58 0.05 0.73 -0.56 -0.34 0.12 -0.07 -0.16 0.64 -0.37 -0.15 -0.27 0.57 -0.38 -0.5 0.09 0.07 0.37
-0.29 0.3 -0.64 -0.42 0.47 -1.19 0.58 -0.09 -0.07 0.0 0.72 -0.67 -0.14 -0.42 0.68 -0.53 -0.23 0.01 0.03 0.31
0.38 -0.16 -0.33 0.01 0.32 -0.53 -0.08 -0.16 -0.08 -0.2 0.52 -0.54 -0.11 -0.24 0.57 0.05 -0.24 -0.05 0.43 -0.26
1.12 -0.3 -0.1 1.17 0.42 -1.5 0.59 -0.16 -0.13 -0.47 -0.6 -1.09 -0.4 -0.86 -0.4 -0.48 -0.27 -0.21 0.68 -0.15
0.14 0.24 -0.02 0.1 -0.07 -0.4 -0.82 -0.01 -0.02 -0.12 0.67 -0.22 -0.34 -0.58 0.72 -0.07 0.16 -0.21 -0.1 0.08
0.77 -0.04 0.02 0.78 0.22 -1.23 -0.66 -0.06 0.21 -0.11 0.51 -0.78 -0.07 -0.33 0.41 0.2 -0.35 -0.37 -0.11 -0.74
1.22 0.14 0.46 0.52 0.47 -1.81 -0.8 -0.21 -0.32 -0.51 0.12 -0.64 -0.68 -0.69 -0.02 0.23 -0.31 -0.34 0.42 0.1
0.41 -0.73 -0.38 0.38 0.04 -2.15 0.04 -0.58 -0.02 -0.12 0.78 -1.03 -0.16 -0.06 0.76 0.94 0.09 -0.69 -1.25 0.44
0.98 0.29 0.35 0.35 0.41 -0.6 -0.23 -0.46 0.04 -0.19 0.06 -1.4 0.09 -0.08 0.02 -0.07 -0.96 -0.21 0.0 -0.01
1.06 -0.15 -0.07 0.81 0.36 -0.97 -0.48 -0.25 -0.15 -0.37 0.2 -0.83 -0.44 -0.75 0.19 0.24 -0.29 -0.12 0.33 -0.09
0.38 -0.1 0.29 0.48 0.48 -1.63 -0.21 -0.2 -0.38 -0.26 0.84 -0.84 -0.74 -0.73 0.78 0.19 -0.03 -0.07 0.4 -1.18
0.69 -0.07 0.11 0.51 0.49 -0.96 -0.05 0.02 -0.1 -0.26 0.45 -0.53 0.16 0.07 0.41 -0.46 -1.07 -0.32 -0.27 -0.18
0.85 0.17 -0.24 0.04 0.02 -0.72 -0.26 -0.28 -0.09 -0.31 0.69 -0.87 -0.12 -0.46 0.75 0.23 -0.33 -0.2 0.05 -0.32
1.23 -0.29 0.77 0.65 -0.14 -4.07 -0.31 -0.24 -0.2 -0.44 0.39 -0.92 -0.71 -0.84 0.62 0.03 -0.11 -0.4 0.19 -0.09
0.42 -0.23 -0.25 0.54 0.49 -1.08 0.02 -0.24 -0.14 -0.23 0.52 -1.01 0.24 -0.01 0.42 -0.56 -0.7 -0.06 0.5 -0.1
0.24 -1.61 -0.71 -0.14 0.03 -2.94 -1.0 0.08 0.28 0.34 1.22 -0.76 0.29 -0.57 1.22 0.48 0.01 -0.99 -0.44 -0.03
0.86 0.24 0.17 0.22 0.52 -0.63 -0.29 -0.19 0.04 -0.15 0.29 -0.98 0.02 -0.29 0.17 -0.02 -1.09 0.02 -0.05 -0.2
0.35 0.1 0.13 0.04 0.04 -0.7 -0.55 0.02 -0.05 -0.24 0.67 -0.48 -0.41 -0.64 0.62 0.1 -0.07 -0.22 0.33 -0.0
1.24 -0.32 0.27 0.68 0.21 -1.15 -0.96 -0.51 -0.38 -0.57 0.46 -1.2 -0.26 -0.3 0.34 0.52 0.06 -0.17 -0.76 0.11
0.71 0.08 0.08 0.16 0.08 -1.27 0.19 -0.28 -0.02 -0.36 0.55 -0.83 -0.65 -0.83 0.39 -0.03 0.14 -0.42 0.18 0.52
0.66 0.16 0.19 0.53 0.22 -1.27 -0.16 -0.22 0.1 -0.09 0.38 -1.16 -0.23 -0.61 0.36 0.1 -0.4 -0.19 0.44 -0.35
0.81 -0.12 -0.14 0.5 0.14 -1.01 -0.25 -0.53 -0.17 -0.36 0.55 -0.82 -0.78 -0.93 0.69 0.57 0.05 -0.25 0.36 -0.31
0.76 0.41 0.4 0.65 -0.0 -1.45 0.11 -0.22 0.15 -0.01 0.47 -1.35 0.24 0.01 0.48 0.01 -0.51 -0.66 -0.67 -1.46
1.16 -0.36 0.25 0.64 0.04 -4.42 -0.31 -0.21 0.01 -0.21 0.87 -1.14 -0.84 -1.03 0.86 -0.92 -1.25 -0.08 0.54 0.18
0.33 0.12 -0.2 -0.11 0.27 -0.48 0.68 0.02 0.03 -0.09 0.55 -0.85 0.08 0.05 0.55 -0.62 -1.11 -0.15 -0.17 -0.18
0.71 -0.73 -0.73 0.53 0.65 -0.94 0.09 -0.2 -0.34 -0.43 0.65 -0.87 -0.28 -0.46 0.49 -0.16 -0.43 -0.22 0.6 0.12
0.38 0.44 0.42 0.05 0.32 -1.19 -0.03 -0.12 -0.16 -0.26 0.61 -0.53 -0.62 -0.99 0.56 -0.03 -0.52 -0.16 0.24 0.08
1.05 -0.66 0.21 0.66 0.41 -1.84 -0.14 -0.37 -0.05 -0.24 0.59 -1.01 -0.4 -0.33 0.56 0.14 -0.2 -0.47 0.08 -0.59
0.88 0.15 0.24 0.72 0.49 -0.51 -0.1 -0.22 -0.19 -0.46 0.29 -1.09 -1.22 -1.28 0.23 0.03 -0.23 0.19 0.25 -0.31
1.07 0.11 0.17 0.81 0.73 -1.6 0.11 -0.21 -0.35 -0.38 0.38 -1.05 -1.01 -0.96 0.3 -0.59 -1.06 0.2 0.43 -0.32
0.51 0.24 0.06 0.22 0.37 -1.1 -0.27 -0.28 -0.23 0.0 0.62 -0.99 -0.32 -0.46 0.45 0.43 -0.25 -0.06 0.26 -0.59
0.59 -0.21 -0.05 0.49 0.5 -0.31 -0.83 -0.15 -0.21 -0.41 0.18 -0.63 -0.13 -0.26 0.08 0.02 -0.2 -0.09 0.82 -0.35
1.02 -0.25 0.15 0.6 0.35 -0.02 -0.28 -0.33 -0.55 -0.55 0.53 -1.04 -1.49 -1.66 0.59 -0.09 -0.53 0.03 0.68 -0.15
0.67 -0.71 0.21 0.36 0.32 -4.49 -0.13 -0.19 0.04 0.15 0.59 -1.03 -0.91 -0.89 0.62 0.47 0.45 -0.18 0.44 -0.83
0.69 0.1 -0.3 -0.41 0.74 0.13 -0.36 -0.09 -0.1 -0.17 0.36 -0.43 0.0 -0.09 0.16 -0.11 0.22 -0.49 -0.49 -0.21
0.74 0.01 -0.21 0.4 0.44 0.35 -0.55 -0.16 -0.21 -0.21 0.48 -0.48 -0.46 -0.6 0.35 -0.37 -0.04 -0.01 -0.01 -0.56
0.49 0.14 -0.29 0.32 0.24 -0.93 0.18 -0.2 -0.29 -0.34 0.81 -1.04 -0.37 -0.54 0.73 0.17 -0.39 -0.27 0.52 -0.77
0.43 -0.57 -0.41 0.16 0.42 -0.42 0.02 -0.2 -0.26 -0.35 0.77 -0.69 -1.25 -1.49 0.87 0.13 -0.17 0.14 0.63 -0.04
0.45 0.74 0.5 0.5 0.48 -0.59 -0.5 -0.16 -0.6 -0.79 -0.09 -0.75 -0.9 -1.43 0.12 -0.95 -0.75 0.18 1.21 0.19
0.98 -0.34 0.55 0.53 0.48 -0.65 0.25 -0.26 -0.44 -0.53 0.34 -0.95 -0.38 -0.62 0.3 -0.57 -0.82 0.08 0.34 -0.27
0.56 -0.6 -0.38 0.27 -0.1 -1.07 -0.63 -0.22 0.1 -0.11 0.94 -0.72 -0.29 -0.66 0.88 0.34 -0.15 -0.35 0.01 0.26
0.5 -0.59 -0.77 0.26 0.29 -0.81 -0.44 -0.1 -0.07 -0.05 0.62 -0.78 -0.57 -0.82 0.68 0.13 -0.39 0.35 0.77 -0.07
0.43 0.36 -0.41 0.3 0.44 -0.67 0.25 -0.34 -0.33 -0.49 0.43 -1.18 -0.33 -0.61 0.41 0.36 -0.4 0.34 0.32 -0.31
0.51 -0.3 -0.2 0.39 -0.12 -0.55 -0.46 -0.29 -0.32 -0.47 0.72 -1.02 -0.13 -0.4 0.75 -0.1 0.09 -0.01 0.12 0.41
0.42 0.26 -0.08 0.34 0.35 -0.33 -0.43 0.08 0.04 -0.18 0.54 -0.41 -0.2 -0.44 0.53 -0.04 -0.5 -0.06 -0.43 -0.27
0.33 -1.03 -0.64 0.42 -0.43 -0.11 0.05 -0.06 -0.22 -0.25 0.98 -0.51 0.32 0.16 0.69 -0.47 -0.92 -0.9 0.47 0.1
1.16 0.26 0.43 0.66 0.14 -2.72 -0.51 -0.24 -0.04 0.02 0.76 -1.53 -0.9 -0.83 0.55 -0.18 -0.44 0.35 0.22 -2.35
-0.11 -0.01 -0.61 0.26 0.11 0.46 0.29 -0.4 -0.41 -0.46 0.58 -1.18 -1.02 -1.3 0.53 0.34 -0.1 0.26 0.52 0.26

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.