1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_128 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.17 0.16 0.23 0.25 0.28 0.38 0.06 0.53 0.11 0.07 0.24 0.11 0.35 0.26 0.1 0.03 0.12 0.17 0.03 0.09
0.29 0.12 0.22 0.5 0.96 0.32 0.02 5.94 2.12 1.86 2.64 0.83 2.51 1.85 2.2 0.16 0.54 1.14 0.03 0.09
0.3 0.07 0.41 0.87 1.76 0.43 0.0 6.32 1.91 2.53 3.3 0.93 3.78 2.18 2.4 0.16 0.37 1.33 0.04 0.22
0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.21 0.0 0.41 0.11 0.14 0.02 0.04 0.02 0.36 0.05 0.03 0.0 0.09 0.04 0.23
0.22 0.59 0.44 0.33 0.39 1.79 0.03 2.94 0.36 0.48 1.07 0.28 1.3 0.56 0.35 0.0 0.1 0.35 0.26 0.58
0.02 0.0 0.0 0.14 0.22 1.1 0.02 2.95 0.39 0.3 2.14 0.4 1.69 0.68 0.73 0.08 0.03 0.16 0.06 0.71
0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.07 0.18 3.13 1.27 1.46 1.98 0.93 3.13 0.84 0.61 0.0 0.09 0.06 0.0 0.0
5.04 0.2 0.62 0.57 1.38 2.11 0.12 6.81 1.99 2.21 1.75 1.42 3.31 2.54 0.8 0.55 0.52 2.84 4.74 2.89
3.9 0.48 2.25 3.51 2.26 20.96 2.37 18.84 4.41 5.54 5.13 6.62 12.24 11.31 3.09 6.29 7.65 0.59 0.01 0.56
0.19 0.0 0.04 0.39 0.39 10.73 1.72 17.35 4.35 4.86 6.71 3.95 14.34 8.54 5.74 5.2 6.0 5.36 0.43 11.75
0.05 0.48 0.18 0.04 0.12 0.34 0.19 1.23 0.09 0.15 0.34 0.49 1.73 1.36 0.07 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.04 0.03 0.0 0.0 0.03 0.54 0.02 4.98 1.5 1.37 2.61 1.26 3.38 1.85 1.33 0.08 0.42 0.05 0.0 2.2
6.27 1.7 4.77 12.61 22.31 31.32 5.92 47.64 5.54 9.33 21.99 35.63 17.82 13.99 25.94 8.65 9.84 26.51 5.66 7.76
1.45 0.33 0.57 1.31 2.34 0.57 0.02 6.63 2.88 3.12 2.42 1.07 2.29 1.71 2.08 0.92 0.97 2.26 0.18 0.23
6.9 4.96 4.34 2.45 1.39 5.97 0.23 8.8 2.01 1.47 4.42 1.46 10.66 6.21 3.55 0.92 0.49 0.96 0.87 2.93
6.02 5.41 5.36 5.59 13.09 32.67 29.95 37.91 5.55 7.48 21.78 18.34 39.02 24.78 18.82 0.97 1.85 1.48 6.9 12.55
2.74 0.81 1.81 1.92 1.1 1.34 0.03 4.99 0.98 1.13 1.24 1.58 1.77 1.73 0.76 0.51 1.61 0.11 0.09 1.0
12.17 2.47 5.98 5.57 3.05 6.97 0.13 10.1 3.37 3.4 3.28 2.81 2.23 2.5 3.06 2.26 4.9 2.2 0.12 2.65
9.93 12.59 8.78 17.01 19.68 30.3 5.77 24.08 5.81 5.22 20.21 23.04 14.34 13.97 17.65 3.26 11.36 6.86 11.66 2.36
0.0 0.12 0.0 0.52 0.28 0.03 0.07 0.46 0.3 0.03 0.18 0.53 0.25 0.13 0.11 0.04 0.15 0.05 0.06 0.0
3.28 1.1 5.09 0.36 0.61 2.52 0.07 3.77 0.51 1.2 0.08 1.2 1.84 1.11 0.06 0.0 0.08 1.37 0.08 2.36
0.93 0.58 0.64 1.13 0.37 0.28 0.53 8.38 1.0 1.37 0.83 0.93 6.46 5.14 0.65 0.04 0.11 1.64 1.84 0.16
0.04 0.07 0.08 0.06 0.01 0.12 0.0 0.55 0.04 0.09 0.27 0.06 0.61 0.39 0.14 0.0 0.03 0.02 0.0 0.25
7.65 5.39 5.1 5.43 3.0 11.04 0.95 21.87 2.12 2.78 5.67 3.87 10.49 8.5 3.37 0.56 0.49 8.83 2.77 11.86
0.73 0.1 0.32 0.43 0.68 8.84 0.17 15.61 9.91 9.62 0.79 10.52 13.05 3.76 0.23 0.0 0.02 0.93 0.0 1.64
0.05 0.03 0.07 0.09 0.28 0.13 0.02 2.72 1.33 1.48 3.11 0.48 0.45 0.32 1.46 0.28 0.84 0.34 0.03 0.0
284.13 177.69 222.06 435.62 314.68 261.66 2.91 239.46 69.24 57.83 29.32 105.97 59.93 77.38 19.21 74.8 106.54 9.01 0.1 5.05
0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 1.56 0.77 1.0 0.05 0.1 0.12 0.04 0.45 0.15 0.17 0.02 0.01 0.23 0.06 0.3
0.57 0.36 1.0 0.85 1.51 0.78 0.06 8.09 3.01 3.35 3.9 1.74 1.68 0.92 2.48 0.76 1.33 1.58 0.33 0.02
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.3 0.11 9.53 0.01 0.05 0.17 0.27 7.95 14.2 0.05 0.05 0.1 0.01 0.0 9.37
0.24 0.03 0.1 0.07 0.05 0.02 0.67 4.3 1.67 2.05 4.72 0.63 6.58 2.71 1.94 0.0 0.18 0.03 0.0 0.57
6.35 0.0 0.0 0.76 6.11 99.88 0.0 202.56 0.22 0.23 2.15 48.29 36.57 22.6 7.37 1.15 1.2 0.29 1.07 0.09
0.45 0.0 0.0 0.21 0.26 8.57 0.0 16.65 0.01 0.02 0.57 3.4 5.05 3.0 1.24 0.13 0.11 0.03 0.09 0.08
4.05 1.73 2.08 0.54 0.88 14.82 1.12 120.16 20.01 22.95 20.54 56.16 40.34 43.57 11.34 4.07 5.32 3.62 3.58 17.18
0.07 0.02 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.45 0.34 0.35 0.43 0.09 0.11 0.1 0.23 0.03 0.05 0.15 0.01 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.03 0.01 0.11 0.43 8.48 0.05 47.7 1.66 1.98 1.8 5.05 10.02 11.07 1.06 0.0 0.0 0.04 0.03 1.43
0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.33 0.15 0.14 0.08 0.03 0.05 0.02 0.05 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0
0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 19.08 0.0 17.49 0.49 0.51 1.13 1.13 13.4 16.51 0.35 0.03 2.1 0.0 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.04 0.02 3.49 0.06 0.07 0.79 0.52 5.9 10.08 0.72 0.04 0.12 0.03 0.0 0.03
4.18 8.04 7.7 0.53 0.98 10.77 0.57 132.3 7.32 11.25 15.92 28.59 134.43 86.15 5.99 0.07 0.78 0.16 0.01 18.68
1.08 0.0 0.45 0.0 0.25 1.96 0.02 5.41 0.67 0.73 0.9 0.6 1.6 1.15 0.5 0.05 0.04 0.3 0.2 0.24
0.41 0.0 0.01 0.0 0.06 0.59 0.55 0.44 0.03 0.03 0.1 0.25 0.39 0.49 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04
2.36 1.02 0.92 3.62 2.9 6.31 0.21 8.76 0.38 0.47 6.22 6.47 5.76 4.95 2.84 0.32 0.3 2.37 0.07 1.08
1.03 0.63 0.53 1.62 1.83 2.79 0.02 4.66 0.18 0.31 2.94 3.69 2.5 2.0 2.24 0.06 0.25 1.07 0.15 0.4
1.31 0.88 0.91 0.43 1.07 11.37 1.61 33.5 10.45 12.9 16.92 14.91 32.14 27.42 11.8 3.17 6.5 0.12 0.08 2.43
1.34 0.5 0.73 0.65 0.83 4.9 0.18 2.36 0.26 0.35 0.97 0.68 0.46 0.37 0.88 0.06 0.04 0.71 0.45 0.93
5.34 24.24 11.02 0.01 0.14 8.71 31.28 36.98 2.44 4.23 4.69 7.88 35.48 22.32 5.11 0.18 0.91 0.46 0.1 0.45
0.76 1.73 0.61 0.35 0.04 1.09 1.41 6.16 0.46 0.32 1.02 1.32 7.37 7.43 0.8 0.01 0.24 0.01 0.0 0.89
0.38 0.18 0.56 0.06 0.08 0.58 0.07 8.29 0.34 0.63 1.43 1.53 10.57 9.67 0.45 0.0 0.11 0.0 0.01 1.21
186.88 71.12 88.76 65.09 81.35 251.54 32.48 158.5 66.49 61.87 46.33 91.24 149.18 141.18 38.04 46.13 49.15 48.88 1.01 27.74
0.3 0.03 0.03 0.09 0.0 7.6 0.02 22.09 0.51 0.98 1.76 0.64 8.63 9.58 0.43 0.0 0.0 0.0 0.01 0.81
0.05 0.31 0.18 0.0 0.28 2.29 0.0 2.98 1.64 1.33 0.04 3.17 6.81 0.93 0.0 0.0 0.0 0.21 0.01 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.75 0.0 0.0 0.07 1.47 3.93 0.0 9.27 0.02 0.03 0.18 1.9 1.81 1.4 0.64 0.2 0.09 0.02 0.05 0.66
5.14 0.09 0.36 2.4 0.32 6.45 0.09 2.33 0.79 0.87 0.24 0.18 2.11 2.18 0.52 0.05 0.04 0.02 0.18 0.98
0.42 0.0 0.0 0.03 2.57 6.46 0.2 10.84 1.45 1.69 2.09 0.84 8.72 7.05 0.92 0.0 0.0 0.02 0.0 4.25
0.07 0.0 0.13 0.0 0.2 1.17 1.33 1.82 0.19 0.16 0.18 0.44 0.04 0.0 0.12 0.14 0.11 0.2 0.36 4.39
0.05 0.02 0.03 0.02 0.38 1.25 0.0 3.63 1.76 1.21 0.57 0.61 2.13 7.1 0.59 0.13 0.17 0.08 0.67 1.86
0.57 1.01 0.77 0.33 0.05 0.25 0.06 5.39 3.5 2.52 3.84 1.69 5.32 3.87 2.49 0.75 1.38 0.36 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.09 0.06 0.18 0.06 0.31 0.26 0.08 0.02 0.08 0.0 0.06 0.02
15.93 7.21 11.69 9.88 8.32 19.83 0.99 15.16 2.68 1.94 2.8 7.8 8.63 7.91 2.11 4.06 6.8 5.66 2.81 1.5
0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.08 0.01 2.09 0.05 0.01 0.35 0.54 0.33 0.58 0.16 0.0 0.09 0.94 0.43 0.05
1.3 2.13 7.51 0.83 1.04 2.24 0.26 12.77 0.75 0.91 1.7 4.67 11.48 6.94 0.45 0.02 0.19 0.05 0.02 3.99
0.0 0.11 0.1 0.0 0.0 1.94 0.0 20.3 0.57 0.8 2.87 1.5 6.96 3.6 1.38 0.14 0.0 0.0 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.17 0.0 21.46 0.63 0.25 0.92 1.87 1.14 0.36 0.95 0.0 0.12 0.1 0.65 0.0
1.18 1.44 0.36 0.12 0.62 2.39 0.12 15.65 4.47 7.15 11.95 4.42 20.48 13.85 3.97 0.0 0.14 0.28 0.13 1.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.02 0.0 7.77 0.11 0.09 0.44 0.49 7.18 10.18 0.16 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0
0.23 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.4 0.3 0.12 1.05 0.23 1.44 0.79 0.69 0.0 0.0 0.0 0.04 0.35
0.04 0.03 0.08 0.0 0.0 0.16 0.0 2.0 0.38 0.71 0.9 0.38 4.19 1.65 0.41 0.05 0.02 0.0 0.01 0.12
1.17 0.34 0.07 4.44 1.81 43.98 0.02 60.16 18.99 20.27 20.63 10.65 30.53 17.14 13.53 3.73 7.48 7.79 0.07 0.97
0.1 0.0 0.11 0.0 0.31 7.14 0.03 37.8 7.87 7.7 9.06 2.77 1.73 0.67 6.36 0.27 0.75 1.84 0.0 0.37
0.74 0.52 0.07 0.0 0.11 0.25 0.51 1.57 0.06 0.0 0.7 1.35 1.53 1.07 0.69 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)