1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_128 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.33 0.3 0.43 0.47 0.53 0.72 0.11 1.0 0.2 0.13 0.45 0.2 0.66 0.49 0.19 0.06 0.22 0.32 0.06 0.16
0.05 0.02 0.04 0.08 0.16 0.05 0.0 1.0 0.36 0.31 0.44 0.14 0.42 0.31 0.37 0.03 0.09 0.19 0.01 0.01
0.05 0.01 0.06 0.14 0.28 0.07 0.0 1.0 0.3 0.4 0.52 0.15 0.6 0.35 0.38 0.03 0.06 0.21 0.01 0.04
0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.5 0.0 1.0 0.26 0.35 0.06 0.1 0.05 0.86 0.11 0.07 0.0 0.23 0.11 0.55
0.07 0.2 0.15 0.11 0.13 0.61 0.01 1.0 0.12 0.16 0.36 0.1 0.44 0.19 0.12 0.0 0.03 0.12 0.09 0.2
0.01 0.0 0.0 0.05 0.07 0.37 0.01 1.0 0.13 0.1 0.72 0.13 0.57 0.23 0.25 0.03 0.01 0.05 0.02 0.24
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 1.0 0.41 0.47 0.63 0.3 1.0 0.27 0.2 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0
0.74 0.03 0.09 0.08 0.2 0.31 0.02 1.0 0.29 0.32 0.26 0.21 0.49 0.37 0.12 0.08 0.08 0.42 0.7 0.42
0.19 0.02 0.11 0.17 0.11 1.0 0.11 0.9 0.21 0.26 0.24 0.32 0.58 0.54 0.15 0.3 0.36 0.03 0.0 0.03
0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.62 0.1 1.0 0.25 0.28 0.39 0.23 0.83 0.49 0.33 0.3 0.35 0.31 0.02 0.68
0.03 0.28 0.11 0.02 0.07 0.2 0.11 0.71 0.05 0.09 0.2 0.29 1.0 0.79 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.11 0.0 1.0 0.3 0.27 0.52 0.25 0.68 0.37 0.27 0.02 0.08 0.01 0.0 0.44
0.13 0.04 0.1 0.26 0.47 0.66 0.12 1.0 0.12 0.2 0.46 0.75 0.37 0.29 0.54 0.18 0.21 0.56 0.12 0.16
0.22 0.05 0.09 0.2 0.35 0.09 0.0 1.0 0.43 0.47 0.36 0.16 0.34 0.26 0.31 0.14 0.15 0.34 0.03 0.03
0.65 0.47 0.41 0.23 0.13 0.56 0.02 0.83 0.19 0.14 0.42 0.14 1.0 0.58 0.33 0.09 0.05 0.09 0.08 0.28
0.15 0.14 0.14 0.14 0.34 0.84 0.77 0.97 0.14 0.19 0.56 0.47 1.0 0.63 0.48 0.02 0.05 0.04 0.18 0.32
0.55 0.16 0.36 0.39 0.22 0.27 0.01 1.0 0.2 0.23 0.25 0.32 0.36 0.35 0.15 0.1 0.32 0.02 0.02 0.2
1.0 0.2 0.49 0.46 0.25 0.57 0.01 0.83 0.28 0.28 0.27 0.23 0.18 0.21 0.25 0.19 0.4 0.18 0.01 0.22
0.33 0.42 0.29 0.56 0.65 1.0 0.19 0.79 0.19 0.17 0.67 0.76 0.47 0.46 0.58 0.11 0.37 0.23 0.38 0.08
0.0 0.23 0.0 0.99 0.54 0.06 0.13 0.88 0.57 0.06 0.34 1.0 0.48 0.24 0.22 0.08 0.28 0.09 0.11 0.0
0.64 0.22 1.0 0.07 0.12 0.5 0.01 0.74 0.1 0.23 0.02 0.24 0.36 0.22 0.01 0.0 0.02 0.27 0.02 0.46
0.11 0.07 0.08 0.13 0.04 0.03 0.06 1.0 0.12 0.16 0.1 0.11 0.77 0.61 0.08 0.0 0.01 0.2 0.22 0.02
0.07 0.12 0.13 0.1 0.02 0.2 0.01 0.9 0.06 0.16 0.45 0.1 1.0 0.63 0.23 0.0 0.05 0.03 0.0 0.41
0.35 0.25 0.23 0.25 0.14 0.5 0.04 1.0 0.1 0.13 0.26 0.18 0.48 0.39 0.15 0.03 0.02 0.4 0.13 0.54
0.05 0.01 0.02 0.03 0.04 0.57 0.01 1.0 0.63 0.62 0.05 0.67 0.84 0.24 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.1
0.02 0.01 0.02 0.03 0.09 0.04 0.01 0.88 0.43 0.48 1.0 0.15 0.15 0.1 0.47 0.09 0.27 0.11 0.01 0.0
0.65 0.41 0.51 1.0 0.72 0.6 0.01 0.55 0.16 0.13 0.07 0.24 0.14 0.18 0.04 0.17 0.24 0.02 0.0 0.01
0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 1.0 0.49 0.64 0.03 0.06 0.08 0.03 0.29 0.1 0.11 0.01 0.01 0.15 0.04 0.19
0.07 0.04 0.12 0.11 0.19 0.1 0.01 1.0 0.37 0.41 0.48 0.22 0.21 0.11 0.31 0.09 0.16 0.19 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.01 0.67 0.0 0.0 0.01 0.02 0.56 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.66
0.04 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.1 0.65 0.25 0.31 0.72 0.1 1.0 0.41 0.29 0.0 0.03 0.0 0.0 0.09
0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.49 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.24 0.18 0.11 0.04 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0
0.03 0.0 0.0 0.01 0.02 0.51 0.0 1.0 0.0 0.0 0.03 0.2 0.3 0.18 0.07 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01
0.03 0.01 0.02 0.0 0.01 0.12 0.01 1.0 0.17 0.19 0.17 0.47 0.34 0.36 0.09 0.03 0.04 0.03 0.03 0.14
0.17 0.04 0.0 0.0 0.07 0.04 0.03 1.0 0.77 0.78 0.96 0.2 0.25 0.21 0.51 0.07 0.12 0.33 0.02 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.18 0.0 1.0 0.03 0.04 0.04 0.11 0.21 0.23 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.02 0.0 0.03 0.0 0.07 0.0 0.0 1.0 0.46 0.44 0.25 0.11 0.16 0.07 0.15 0.0 0.0 0.21 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.92 0.03 0.03 0.06 0.06 0.7 0.87 0.02 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.35 0.01 0.01 0.08 0.05 0.59 1.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.03 0.06 0.06 0.0 0.01 0.08 0.0 0.98 0.05 0.08 0.12 0.21 1.0 0.64 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.14
0.2 0.0 0.08 0.0 0.05 0.36 0.0 1.0 0.12 0.14 0.17 0.11 0.3 0.21 0.09 0.01 0.01 0.06 0.04 0.04
0.7 0.0 0.02 0.0 0.09 1.0 0.93 0.74 0.05 0.05 0.18 0.42 0.66 0.83 0.16 0.0 0.0 0.01 0.04 0.07
0.27 0.12 0.1 0.41 0.33 0.72 0.02 1.0 0.04 0.05 0.71 0.74 0.66 0.57 0.32 0.04 0.03 0.27 0.01 0.12
0.22 0.14 0.11 0.35 0.39 0.6 0.0 1.0 0.04 0.07 0.63 0.79 0.54 0.43 0.48 0.01 0.05 0.23 0.03 0.09
0.04 0.03 0.03 0.01 0.03 0.34 0.05 1.0 0.31 0.39 0.51 0.45 0.96 0.82 0.35 0.09 0.19 0.0 0.0 0.07
0.27 0.1 0.15 0.13 0.17 1.0 0.04 0.48 0.05 0.07 0.2 0.14 0.09 0.08 0.18 0.01 0.01 0.15 0.09 0.19
0.14 0.66 0.3 0.0 0.0 0.24 0.85 1.0 0.07 0.11 0.13 0.21 0.96 0.6 0.14 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01
0.1 0.23 0.08 0.05 0.01 0.15 0.19 0.83 0.06 0.04 0.14 0.18 0.99 1.0 0.11 0.0 0.03 0.0 0.0 0.12
0.04 0.02 0.05 0.01 0.01 0.06 0.01 0.78 0.03 0.06 0.13 0.14 1.0 0.91 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.11
0.74 0.28 0.35 0.26 0.32 1.0 0.13 0.63 0.26 0.25 0.18 0.36 0.59 0.56 0.15 0.18 0.2 0.19 0.0 0.11
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 1.0 0.02 0.04 0.08 0.03 0.39 0.43 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.01 0.05 0.03 0.0 0.04 0.34 0.0 0.44 0.24 0.2 0.01 0.46 1.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.53 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18
0.08 0.0 0.0 0.01 0.16 0.42 0.0 1.0 0.0 0.0 0.02 0.2 0.2 0.15 0.07 0.02 0.01 0.0 0.01 0.07
0.8 0.01 0.06 0.37 0.05 1.0 0.01 0.36 0.12 0.13 0.04 0.03 0.33 0.34 0.08 0.01 0.01 0.0 0.03 0.15
0.04 0.0 0.0 0.0 0.24 0.6 0.02 1.0 0.13 0.16 0.19 0.08 0.8 0.65 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39
0.01 0.0 0.03 0.0 0.05 0.27 0.3 0.41 0.04 0.04 0.04 0.1 0.01 0.0 0.03 0.03 0.02 0.04 0.08 1.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.18 0.0 0.51 0.25 0.17 0.08 0.09 0.3 1.0 0.08 0.02 0.02 0.01 0.09 0.26
0.11 0.19 0.14 0.06 0.01 0.05 0.01 1.0 0.65 0.47 0.71 0.31 0.99 0.72 0.46 0.14 0.26 0.07 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.31 0.18 0.57 0.2 1.0 0.83 0.26 0.06 0.25 0.0 0.2 0.05
0.8 0.36 0.59 0.5 0.42 1.0 0.05 0.76 0.14 0.1 0.14 0.39 0.44 0.4 0.11 0.2 0.34 0.29 0.14 0.08
0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.04 0.0 1.0 0.02 0.0 0.17 0.26 0.16 0.28 0.08 0.0 0.04 0.45 0.21 0.03
0.1 0.17 0.59 0.06 0.08 0.18 0.02 1.0 0.06 0.07 0.13 0.37 0.9 0.54 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.31
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 1.0 0.03 0.04 0.14 0.07 0.34 0.18 0.07 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 1.0 0.03 0.01 0.04 0.09 0.05 0.02 0.04 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0
0.06 0.07 0.02 0.01 0.03 0.12 0.01 0.76 0.22 0.35 0.58 0.22 1.0 0.68 0.19 0.0 0.01 0.01 0.01 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.76 0.01 0.01 0.04 0.05 0.71 1.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.16 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.21 0.08 0.73 0.16 1.0 0.55 0.48 0.0 0.0 0.0 0.02 0.25
0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.48 0.09 0.17 0.21 0.09 1.0 0.39 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03
0.02 0.01 0.0 0.07 0.03 0.73 0.0 1.0 0.32 0.34 0.34 0.18 0.51 0.28 0.22 0.06 0.12 0.13 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.19 0.0 1.0 0.21 0.2 0.24 0.07 0.05 0.02 0.17 0.01 0.02 0.05 0.0 0.01
0.47 0.33 0.05 0.0 0.07 0.16 0.32 1.0 0.04 0.0 0.45 0.86 0.98 0.68 0.44 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)