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Heatmap: Cluster_327 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.41 -0.33 0.0 0.23 0.5 -0.5 -1.02 0.16 -0.0 -0.27 0.19 -0.3 -0.17 -0.12 0.11 0.45 0.39 0.01 -0.13 -0.51
0.13 -1.66 -0.51 -0.5 -0.64 -1.14 0.32 0.16 0.37 0.74 1.12 -0.3 -0.22 -0.55 1.0 0.56 0.59 -0.96 -2.3 -0.93
0.4 -0.44 -0.08 0.34 -0.01 -1.19 -1.29 0.08 0.13 -0.37 0.61 -0.73 0.41 0.56 0.37 0.78 0.07 -0.51 -0.82 -0.5
0.6 0.06 0.05 0.07 0.11 -1.15 -1.12 0.3 0.02 -0.42 0.49 -0.39 -0.53 -0.46 0.53 0.55 0.42 -0.27 -0.04 -0.43
0.27 -0.57 0.16 0.44 -0.04 -0.6 -1.35 0.29 -0.01 -0.32 0.42 -0.49 -0.25 -0.08 0.19 0.63 0.53 -0.18 0.22 -0.76
0.6 0.54 0.18 0.42 0.31 -1.11 -0.15 0.01 0.03 -0.25 0.13 -0.52 0.09 0.05 0.05 0.29 -0.2 -0.4 -0.25 -1.09
0.29 -0.51 0.14 -0.05 -0.25 -1.46 -1.08 0.41 0.4 0.55 0.91 0.03 -0.02 -0.01 0.8 0.54 0.46 -0.99 -3.7 -2.4
0.4 -1.17 -0.62 0.29 0.04 -0.85 -0.13 0.26 0.2 -0.03 0.18 -0.31 -0.05 -0.21 0.24 0.22 0.39 0.38 0.01 -0.31
0.19 -1.04 -0.51 0.26 -0.31 -0.85 -0.37 0.44 0.14 0.0 0.42 -0.25 -0.11 -0.59 0.35 0.63 0.51 0.07 0.13 -0.47
0.1 -0.85 -0.55 0.05 -0.25 -0.63 -0.46 0.28 0.23 0.07 0.12 -0.37 0.34 -0.02 0.1 0.41 0.57 0.19 0.09 -0.33
0.46 0.08 -0.16 0.22 0.28 -0.36 0.21 -0.04 0.19 -0.25 -0.15 -0.73 0.2 0.56 -0.18 -0.24 -1.59 -0.23 0.67 -0.41
0.34 -0.56 -0.29 0.31 0.05 -0.38 0.2 -0.2 0.44 0.23 0.05 -1.15 0.32 0.64 -0.28 0.37 -0.7 -0.61 0.36 -0.56
-0.06 -0.22 -1.21 0.38 0.13 -0.7 -1.53 0.67 0.05 -0.16 0.78 -0.17 0.17 0.07 0.5 -0.71 -0.32 0.02 0.62 -0.48
0.53 -0.13 -0.26 0.45 -0.17 -2.94 -0.84 -0.06 0.39 0.16 1.08 -0.57 -0.93 -1.16 0.95 0.8 0.11 -0.46 -0.31 -1.21
0.46 -0.04 0.04 0.36 0.2 -1.64 -1.31 0.15 0.34 -0.09 0.62 -0.7 -0.27 -0.25 0.49 0.01 -0.35 0.29 0.29 -0.54
0.63 -0.4 0.33 0.06 0.34 -0.49 -0.62 -0.02 0.13 -0.05 0.41 -0.33 -0.58 -0.52 0.35 0.13 0.18 -0.18 -0.45 0.16
0.46 -1.12 -0.21 0.43 0.31 -1.57 -0.64 -0.09 0.08 -0.17 0.94 -0.16 0.16 0.39 0.6 0.08 0.18 -0.8 -1.24 -0.15
0.82 -0.42 0.2 0.46 -0.83 -0.99 -1.36 -0.19 0.0 0.33 1.14 -1.02 0.15 -0.13 1.05 0.04 -0.24 -0.26 -1.38 -1.01
0.25 -0.41 0.03 0.69 -0.54 -1.33 -0.67 0.22 0.06 -0.4 1.04 -0.38 -0.11 -0.23 0.86 0.74 0.02 -0.8 -0.33 -1.86
0.14 -1.55 -0.2 0.11 -0.58 -2.16 -2.21 1.0 0.0 0.07 1.43 -0.04 -0.07 -0.23 1.38 0.02 0.3 -0.12 -4.44 -2.75
0.87 -0.55 0.34 0.56 0.04 -0.5 -1.17 0.15 -0.01 0.02 0.63 -0.68 0.04 -0.11 0.56 -0.39 -0.28 -0.13 -0.37 -0.76
-0.03 -1.77 -0.54 0.01 -0.53 -1.66 -0.93 0.38 0.38 0.03 1.16 -0.94 0.26 -0.14 1.26 0.54 0.38 -0.04 -0.61 -2.18
0.93 0.35 0.29 0.05 0.0 -1.39 -1.3 0.27 0.23 0.26 0.3 -0.75 0.57 0.32 0.16 0.16 -0.24 -0.53 -0.59 -2.28
0.2 -0.39 -0.15 0.3 -0.04 -1.6 0.27 0.1 0.38 -0.05 0.35 -0.92 -0.72 -0.56 0.33 0.51 0.64 -0.44 0.43 -0.54
0.7 -0.55 -0.16 0.34 0.02 -2.16 -0.28 0.17 0.54 0.16 0.77 -0.76 -0.7 -0.71 0.69 0.77 0.27 -1.02 -0.26 -1.37
0.35 -0.13 -0.17 0.02 0.17 -2.07 -1.05 -0.11 0.09 0.07 0.79 -0.32 -0.44 -0.51 0.71 0.36 0.27 0.3 -0.0 -0.54
0.7 0.07 -0.06 0.44 0.19 -1.52 -0.18 -0.05 0.21 -0.12 0.59 -0.94 -0.36 -0.33 0.5 0.55 -0.29 -0.38 0.02 -0.95
1.59 -1.1 0.15 0.81 -0.6 -1.32 -0.93 0.1 -0.08 -0.2 0.78 -0.88 -0.27 -0.9 0.48 0.66 0.29 -1.25 -0.87 -1.35
0.37 0.0 -0.17 0.93 0.34 -0.21 -0.17 0.03 -0.28 -0.39 0.2 -0.72 0.25 0.07 0.12 -0.13 -0.35 -0.13 -0.11 -0.6
0.48 0.14 0.58 0.37 0.03 -0.24 0.13 0.07 -0.31 -0.42 0.09 -0.19 -1.12 -0.97 -0.08 0.69 0.23 -0.5 0.36 -0.94
0.65 -0.2 -0.11 0.68 0.21 -0.21 -2.14 0.62 0.1 -0.33 -0.28 -0.27 -0.42 -0.36 -0.53 0.69 0.62 0.25 -0.44 -1.25
0.6 -0.64 -0.01 0.47 -0.23 -0.53 -1.77 0.0 -0.02 -0.05 0.9 -0.81 0.15 -0.2 0.74 0.63 0.43 -0.71 -1.23 -0.62
0.15 0.28 -0.08 0.8 0.27 -1.09 0.33 0.12 -0.58 -0.5 0.66 -0.46 -0.14 -0.34 0.54 -0.44 -0.11 -0.02 -0.44 -0.4
0.68 0.26 0.64 1.11 -0.06 -0.86 -1.77 0.2 0.29 -0.5 0.41 -0.91 -0.86 -1.09 0.57 0.89 -0.01 -0.28 -1.84 -1.85
0.83 -0.64 -0.14 0.18 -0.15 -1.72 -0.57 0.25 0.28 0.02 0.25 -0.57 -0.18 -0.14 0.5 1.07 0.57 -0.7 -0.25 -2.81
0.22 -0.81 -1.11 0.44 0.1 -1.52 -1.73 0.36 0.13 0.15 0.97 -0.59 -0.74 -1.02 0.86 0.39 0.32 0.29 0.32 -0.54
-0.13 -0.42 -0.4 0.87 0.39 -0.16 -1.03 0.34 -0.28 -0.48 -0.02 -0.03 -1.03 -0.99 0.25 0.46 0.35 1.0 -0.03 -1.07
-0.18 -0.29 -0.23 -0.1 0.16 -0.96 -0.9 0.27 0.1 -0.08 0.8 -0.37 0.03 -0.17 0.92 0.26 0.1 -0.26 -0.09 -0.37
0.24 -0.65 -0.07 0.09 -0.38 -1.85 -1.36 0.49 -0.06 -0.2 0.95 0.09 0.62 0.35 0.93 -0.14 0.04 -0.77 -0.33 -1.09
0.74 -0.23 0.16 0.42 0.41 -1.02 -0.76 0.05 0.0 -0.24 0.28 -1.57 0.76 0.53 0.14 -0.45 -0.83 -0.29 0.17 -0.55
0.53 -0.21 0.22 0.8 0.37 -0.96 -0.59 0.09 -0.03 -0.19 0.24 -0.47 -0.46 -0.65 0.25 -0.46 -0.25 0.13 0.46 -0.16
1.18 -0.02 0.27 0.8 0.84 -2.03 -0.79 -0.08 0.18 -0.03 -0.67 -0.79 -0.31 -0.55 -0.41 -0.08 -0.84 0.09 0.62 -0.81
-0.25 -0.08 -0.43 -0.01 0.18 -0.96 -0.84 0.15 0.43 0.29 0.6 -0.66 -0.06 -0.21 0.71 0.16 0.26 -0.26 -0.48 0.15
0.02 -0.87 -0.57 -0.04 -0.37 0.37 0.17 0.27 -0.12 0.07 0.71 0.15 -0.67 -1.04 0.87 -0.77 -0.16 0.02 0.65 -0.56
0.55 0.59 0.54 0.77 0.01 -1.57 -0.56 -0.25 -0.03 -0.28 0.46 -0.95 0.06 -0.11 0.44 0.21 -0.28 -0.84 -0.13 -0.87
0.44 -0.87 0.0 0.85 -0.22 -2.37 -1.06 0.13 0.26 0.0 0.56 -0.48 -0.22 -0.27 0.41 0.71 0.58 -0.41 -0.11 -1.13
0.56 -0.34 0.1 0.86 0.48 -0.06 -1.74 0.38 -0.23 -0.39 -0.06 -0.61 0.45 0.21 -0.03 0.39 0.16 -0.13 -0.91 -1.74
0.8 0.98 0.7 0.24 -0.01 -3.68 -1.19 -0.45 0.72 0.18 0.04 -0.61 -1.21 -1.83 -0.5 1.81 0.87 -6.83 -7.33 -7.08
0.89 0.28 0.3 -1.01 -0.66 -5.19 -1.01 -0.05 0.89 0.5 0.04 -0.52 -2.03 -1.7 -0.18 2.03 1.35 - - -5.82
0.64 -0.61 0.35 0.35 0.27 0.22 -1.41 0.28 -0.57 -0.3 0.7 -0.33 -0.94 -1.27 0.66 -0.03 0.1 0.38 -0.87 -0.05
0.7 0.01 0.1 0.19 0.21 -1.08 -0.56 -0.19 0.15 -0.3 0.31 -0.79 -0.27 -0.26 0.2 0.49 -0.04 0.05 0.26 -0.3
0.23 0.21 0.2 0.75 0.24 -0.84 -1.07 0.11 0.32 -0.09 -0.17 -0.1 -1.3 -0.75 -0.64 0.88 0.92 -0.2 -0.19 -1.32
-0.72 -0.49 -0.67 0.33 -0.79 -1.67 -1.44 -0.01 0.62 0.31 0.55 -0.04 -0.1 0.1 0.46 1.18 0.81 -0.6 -0.29 -1.13
0.16 -0.51 -0.06 -0.12 -0.35 -1.07 -0.9 0.18 0.36 -0.02 0.64 -0.41 0.51 0.71 0.46 0.28 0.26 -0.52 -1.01 -0.41
0.66 0.75 0.47 0.02 0.31 -1.15 -0.83 0.35 0.45 0.01 0.03 -0.9 -0.63 -0.78 -0.01 0.35 -0.79 0.06 0.4 -1.19
0.63 -0.17 -0.55 0.36 0.66 -1.14 -0.28 0.1 0.4 -0.01 0.34 -0.3 -0.45 -0.51 0.26 0.11 -0.09 0.11 -0.08 -0.69
1.01 -0.22 -1.03 - -1.0 -0.57 1.32 0.64 0.76 0.21 -0.44 -0.42 -0.39 -0.7 -1.01 -0.98 -1.88 0.04 1.53 -1.0
0.29 -0.75 -0.42 0.61 0.06 -2.63 -1.1 0.44 0.79 0.63 0.63 -0.42 -0.62 -0.81 0.95 0.69 0.4 -0.57 -1.4 -2.47
0.35 -0.75 -0.16 0.25 0.03 -1.35 -1.03 0.04 0.44 0.16 0.66 -0.71 0.23 -0.02 0.5 0.05 -0.24 0.01 0.25 -0.31
-0.17 -0.14 -0.37 -0.46 -0.26 -1.15 -0.89 -0.08 0.32 -0.02 0.74 -0.44 0.03 -0.37 0.8 1.34 0.82 -0.81 -0.41 -2.91
0.58 0.16 -0.03 0.29 0.22 -0.86 -0.89 0.3 0.51 -0.0 0.03 -0.8 0.26 0.13 0.06 0.17 -0.5 0.04 -0.03 -0.98
0.09 0.35 0.05 -0.03 -0.19 -0.06 -0.38 0.23 0.19 -0.03 0.21 -0.32 -0.09 -0.58 0.11 0.24 0.04 -0.23 0.6 -0.94
0.29 0.18 -0.18 0.32 0.11 -0.91 -0.95 0.16 0.18 -0.03 0.56 -0.58 0.07 -0.09 0.53 0.25 -0.57 0.15 0.04 -0.8
0.02 -0.86 0.03 0.5 -0.13 -0.84 -0.82 0.13 0.24 0.06 0.77 -0.5 0.13 0.04 0.67 0.14 -0.02 -0.43 -0.37 -0.13
0.49 -0.02 0.17 1.07 0.23 -0.63 -1.25 0.19 0.38 -0.34 0.27 -0.3 -0.8 -0.65 0.31 -0.03 -0.58 0.04 0.05 -0.42
0.73 -0.1 -0.07 0.45 -0.17 -3.54 -1.38 -0.21 0.77 0.39 0.75 -0.5 -0.35 -0.45 0.68 0.76 0.16 -1.18 -0.76 -1.0
0.61 0.08 0.38 1.31 0.77 -1.1 -1.89 0.36 -0.93 -1.37 -0.01 -1.74 0.45 -0.47 0.09 -0.48 -1.4 1.04 0.24 -2.11
0.2 -0.68 -0.18 -0.07 -0.23 -0.36 -0.22 0.12 0.15 -0.09 0.96 -0.37 -0.65 -0.65 0.77 0.31 0.15 0.08 -0.36 -0.17
0.37 -0.49 -0.38 0.7 0.27 0.36 -0.92 0.27 -0.04 -0.33 0.19 -0.46 -0.27 -0.21 0.08 0.3 0.24 0.38 -0.64 -0.63
-0.15 -0.55 -0.33 0.25 0.2 -0.63 0.33 0.49 0.52 -0.24 0.47 -0.55 -0.96 -0.98 0.42 0.33 0.6 -0.08 0.16 -1.25
0.95 -0.82 0.04 0.57 -0.09 -0.78 -0.84 0.07 0.09 -0.22 0.57 -0.83 0.43 0.24 0.31 0.22 -0.25 -0.4 -1.1 -0.17

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.