Heatmap: Cluster_47 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.24 0.0 0.0 0.34 0.3 47.52 0.37 0.25 0.05 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.11 0.2 0.24 0.33 0.4 1.77
1.13 0.0 0.0 11.19 8.62 3.58 0.05 0.7 0.25 0.29 0.0 0.45 0.16 0.3 0.39 3.01 4.58 8.23 2.24 2.13
0.94 0.0 0.0 10.41 7.66 3.53 0.05 0.81 0.12 0.41 0.08 0.46 0.0 0.02 0.52 2.12 2.82 10.0 3.36 1.95
3.4 3.82 2.59 2.91 2.08 8.12 1.35 0.94 0.39 0.64 0.28 3.25 0.41 0.61 0.26 0.43 2.27 1.82 1.24 5.85
0.23 0.17 0.47 0.0 0.45 1.67 0.63 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.01 0.21
3.71 1.9 3.26 2.06 2.61 5.07 2.68 1.11 1.02 1.02 1.88 0.58 0.37 0.3 1.31 1.87 1.59 1.27 1.13 3.3
0.2 0.04 0.06 0.11 0.11 1.38 0.34 0.21 0.12 0.22 0.32 0.05 0.27 0.14 0.36 0.27 0.02 0.14 0.13 0.18
0.03 0.07 0.05 0.05 0.19 339.36 2.83 0.08 0.06 0.04 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.05 0.11 0.4 0.11 3.64
0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.04 0.1 0.31 0.33 2.58 0.65 0.26 0.11 0.05 0.09 0.17 0.25 0.18 0.07 0.27 0.27 0.46 0.2 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.7 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.38 0.0 0.46 0.46 1.81 1.44 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.16 0.17 0.0 0.07 0.22 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.08 0.11 0.2 0.66
4.49 8.41 6.38 7.38 8.39 16.99 8.54 2.99 1.44 0.51 2.89 3.39 1.92 2.88 3.17 1.77 1.89 6.65 4.1 5.02
0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 3.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.67 0.58 1.08 1.19 0.67 10.97 0.11 0.27 0.15 0.16 0.26 0.12 0.09 0.08 0.18 0.22 0.12 0.55 0.71 1.85
0.74 2.14 6.46 1.43 16.32 875.48 10.83 13.82 10.41 8.44 4.97 1.32 2.15 5.99 9.89 3.09 22.63 22.72 6.16 35.98
0.06 0.3 0.74 0.36 1.32 279.45 0.2 1.44 0.73 0.32 1.35 0.18 0.5 0.33 2.57 0.14 0.7 1.51 0.35 0.35
1.25 0.17 0.1 20.59 18.92 129.84 0.02 1.8 0.13 0.15 0.15 0.4 0.29 0.46 0.22 9.45 12.45 27.13 10.19 12.64
0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 5.76 11.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
1.25 0.25 2.71 1.85 3.04 26.66 2.12 0.5 0.02 0.0 0.0 0.06 0.02 0.01 0.03 0.31 0.72 4.91 1.93 4.46
0.58 0.0 0.08 7.94 3.72 55.9 0.01 1.18 0.0 0.04 0.04 0.21 0.05 0.09 0.08 2.57 3.65 25.31 4.18 5.54
3.79 7.3 9.75 0.73 3.55 56.13 3.99 0.88 0.51 0.69 0.07 0.48 0.33 0.47 0.24 0.35 0.19 2.08 0.07 1.77
0.65 0.38 0.39 0.59 1.3 4.39 0.68 1.62 2.08 2.47 1.73 0.7 2.05 1.26 1.49 1.56 2.99 0.63 0.51 4.16
0.0 0.0 0.04 0.0 0.95 51.65 1.18 0.09 0.04 0.04 0.41 0.03 0.11 0.26 0.34 0.0 0.01 0.0 2.57 3.22
0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.01 0.04 0.02 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.53 0.11 1.3 0.7 0.75 8.3 2.01 0.37 0.29 0.35 0.16 0.43 0.18 0.22 0.25 1.86 1.72 0.74 1.19 0.8
0.04 0.0 0.03 0.07 0.04 0.47 0.08 0.04 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.04 0.02 0.03 0.02 0.05 0.0 0.01
1.43 1.53 3.06 0.56 1.58 0.24 0.22 0.05 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.07 0.07 0.0
4.55 0.16 0.66 39.9 25.28 78.53 6.88 8.7 5.66 4.67 12.3 4.15 4.94 5.39 20.82 13.78 14.27 21.66 4.49 16.59
0.01 0.0 0.0 0.07 0.01 3.27 0.0 0.01 0.02 0.03 0.05 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0
0.03 0.02 0.05 0.17 0.02 4.55 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 30.45 0.0 0.71 0.16 0.16 0.03 0.38 0.06 0.04 0.04 0.02 0.24 0.09 0.01 36.41
0.05 0.0 0.22 0.0 0.08 2.25 0.18 0.04 0.08 0.06 0.2 0.04 0.0 0.04 0.16 0.07 0.03 0.0 0.05 0.09
0.88 0.31 0.75 1.32 0.85 27.85 14.67 0.09 0.1 0.07 0.03 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.11 0.22 0.01 1.12
0.06 0.43 0.17 0.09 0.69 5.44 0.12 0.46 0.28 0.38 1.76 0.22 0.1 0.07 3.6 0.65 0.19 0.46 0.01 3.84
0.47 0.38 0.69 0.0 0.27 0.31 0.31 0.03 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.23 0.04 0.07
0.23 0.28 0.16 0.08 0.08 0.06 0.21 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.06 0.02 0.06 0.05
2.02 1.1 2.19 1.63 2.22 252.78 26.75 1.94 1.91 1.74 1.14 0.16 0.25 0.51 3.56 0.42 2.3 3.04 2.14 2.15
1.27 1.98 1.77 13.84 11.79 645.61 3.67 7.51 1.24 0.96 3.71 0.98 0.47 0.18 6.15 5.36 7.33 6.3 3.99 20.64
40.33 22.73 38.14 30.02 39.12 150.28 12.82 27.75 11.07 11.73 19.09 17.31 14.87 14.62 18.75 12.47 24.51 35.78 24.42 27.52
2.14 2.61 6.34 1.73 1.19 37.32 1.04 0.89 0.33 0.22 0.23 0.06 0.03 0.14 0.59 0.3 0.95 1.17 0.05 2.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.06 0.03 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.04 0.0 0.01 0.02 0.0 0.08
4.49 3.67 3.38 4.56 4.68 115.61 2.18 5.94 2.98 3.37 2.84 4.57 0.56 1.2 3.06 5.98 3.41 34.77 8.25 23.91
0.42 0.0 0.01 5.47 3.88 158.97 6.13 1.33 0.18 0.1 0.88 0.6 2.12 2.31 1.48 0.74 1.81 5.26 1.21 0.71
0.13 0.0 0.01 0.26 0.14 0.83 0.0 0.13 0.18 0.22 0.92 0.27 0.15 0.27 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0
3.85 2.76 1.74 14.5 22.38 105.54 3.03 9.98 6.4 7.74 7.57 10.73 13.43 14.59 9.83 11.05 14.11 25.14 9.53 16.52
0.63 0.46 0.54 0.79 0.66 0.64 0.37 0.16 0.26 0.08 0.31 0.14 0.2 0.16 0.38 0.41 0.16 0.16 0.23 0.7
0.0 0.0 0.07 1.34 1.38 46.19 4.72 2.0 0.52 0.6 2.61 0.31 0.09 0.11 5.59 0.85 1.18 1.53 0.2 9.66
0.06 0.05 0.06 0.0 0.16 0.77 0.98 0.22 0.2 0.24 0.26 0.08 0.32 0.13 0.37 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0
0.13 0.0 0.09 0.0 0.1 1.39 1.37 0.21 0.13 0.11 0.48 0.11 0.08 0.02 0.27 0.13 0.03 0.0 0.0 0.0
0.03 0.03 0.09 0.02 1.3 46.06 2.18 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03
0.32 0.97 3.34 0.34 4.83 9.35 0.0 5.08 7.38 6.71 2.19 0.62 0.91 2.74 1.75 1.06 7.8 7.36 1.26 50.32
0.14 0.0 0.04 0.13 0.05 0.06 0.22 0.01 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1
12.23 8.21 9.74 4.59 8.36 223.34 25.27 0.33 0.18 0.29 1.44 0.28 0.35 0.73 1.09 0.05 0.29 0.37 0.0 0.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.63 5.74 0.05 0.05 0.0 0.07 0.03 0.02 0.06 0.1 0.06 0.0 0.36 0.24 1.0
0.02 0.0 0.16 0.05 0.02 11.92 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.11
0.09 0.08 0.07 0.0 0.36 4.52 0.02 0.11 0.03 0.07 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.07 0.06 0.01 2.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.18 0.22 0.0 0.04 0.39 0.19 0.11 0.12 0.04 0.1 0.2 0.03 0.08 0.17 0.12 0.15 0.34 0.01 0.16

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)