Heatmap: Cluster_47 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00671	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	1.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.04
Gb_00786	0.1	0.0	0.0	1.0	0.77	0.32	0.0	0.06	0.02	0.03	0.0	0.04	0.01	0.03	0.04	0.27	0.41	0.74	0.2	0.19
Gb_00787	0.09	0.0	0.0	1.0	0.74	0.34	0.0	0.08	0.01	0.04	0.01	0.04	0.0	0.0	0.05	0.2	0.27	0.96	0.32	0.19
Gb_01126	0.42	0.47	0.32	0.36	0.26	1.0	0.17	0.12	0.05	0.08	0.03	0.4	0.05	0.08	0.03	0.05	0.28	0.22	0.15	0.72
Gb_01667	0.14	0.1	0.28	0.0	0.27	1.0	0.38	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.01	0.13
Gb_01712	0.73	0.38	0.64	0.41	0.51	1.0	0.53	0.22	0.2	0.2	0.37	0.11	0.07	0.06	0.26	0.37	0.31	0.25	0.22	0.65
Gb_01844	0.14	0.03	0.04	0.08	0.08	1.0	0.25	0.15	0.09	0.16	0.23	0.04	0.2	0.1	0.26	0.2	0.01	0.1	0.1	0.13
Gb_02374	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_02917	0.8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03273	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04004	0.12	0.02	0.04	0.12	0.13	1.0	0.25	0.1	0.04	0.02	0.04	0.07	0.1	0.07	0.03	0.1	0.1	0.18	0.08	0.1
Gb_04404	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.79	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04453	0.21	0.0	0.25	0.26	1.0	0.8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04629	0.22	0.24	0.27	0.0	0.11	0.34	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.03	0.0	0.12	0.16	0.3	1.0
Gb_05511	0.26	0.49	0.38	0.43	0.49	1.0	0.5	0.18	0.08	0.03	0.17	0.2	0.11	0.17	0.19	0.1	0.11	0.39	0.24	0.3
Gb_08123	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_08493	0.06	0.05	0.1	0.11	0.06	1.0	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.06	0.17
Gb_10444	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	1.0	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.03	0.03	0.01	0.04
Gb_10500	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Gb_11065	0.01	0.0	0.0	0.16	0.15	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.1	0.21	0.08	0.1
Gb_11266	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.49	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_11921	0.05	0.01	0.1	0.07	0.11	1.0	0.08	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.18	0.07	0.17
Gb_14613	0.01	0.0	0.0	0.14	0.07	1.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.07	0.45	0.07	0.1
Gb_15051	0.07	0.13	0.17	0.01	0.06	1.0	0.07	0.02	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.04	0.0	0.03
Gb_15555	0.15	0.09	0.09	0.14	0.3	1.0	0.15	0.37	0.47	0.56	0.39	0.16	0.47	0.29	0.34	0.36	0.68	0.14	0.12	0.95
Gb_16135	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.05	0.06
Gb_16377	0.12	0.0	0.0	0.0	0.45	0.4	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Gb_16378	0.15	0.69	0.31	1.0	0.67	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.0	0.0
Gb_17288	0.06	0.01	0.16	0.08	0.09	1.0	0.24	0.04	0.04	0.04	0.02	0.05	0.02	0.03	0.03	0.22	0.21	0.09	0.14	0.1
Gb_18516	0.08	0.0	0.07	0.15	0.08	1.0	0.16	0.08	0.02	0.02	0.0	0.03	0.02	0.09	0.05	0.07	0.04	0.1	0.0	0.02
Gb_19063	0.47	0.5	1.0	0.18	0.52	0.08	0.07	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.02	0.0
Gb_20397	0.06	0.0	0.01	0.51	0.32	1.0	0.09	0.11	0.07	0.06	0.16	0.05	0.06	0.07	0.27	0.18	0.18	0.28	0.06	0.21
Gb_20896	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	1.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0
Gb_20897	0.01	0.01	0.01	0.04	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21293	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0
Gb_21467	0.02	0.0	0.1	0.0	0.04	1.0	0.08	0.02	0.03	0.03	0.09	0.02	0.0	0.02	0.07	0.03	0.01	0.0	0.02	0.04
Gb_23488	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	1.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.04
Gb_23505	0.01	0.08	0.03	0.02	0.13	1.0	0.02	0.08	0.05	0.07	0.32	0.04	0.02	0.01	0.66	0.12	0.03	0.08	0.0	0.71
Gb_24745	0.68	0.56	1.0	0.0	0.4	0.45	0.45	0.04	0.02	0.0	0.0	0.03	0.0	0.01	0.0	0.05	0.0	0.33	0.06	0.11
Gb_24746	0.83	1.0	0.56	0.29	0.28	0.23	0.76	0.06	0.0	0.0	0.0	0.07	0.04	0.03	0.0	0.0	0.22	0.08	0.22	0.17
Gb_25235	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	1.0	0.11	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01
Gb_25874	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	1.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03
Gb_27390	0.27	0.15	0.25	0.2	0.26	1.0	0.09	0.18	0.07	0.08	0.13	0.12	0.1	0.1	0.12	0.08	0.16	0.24	0.16	0.18
Gb_29502	0.06	0.07	0.17	0.05	0.03	1.0	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.03	0.03	0.0	0.06
Gb_30563	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.08	0.04	0.01	0.01	0.02	0.0	0.03	0.05	0.0	0.02	0.03	0.01	0.12
Gb_30772	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	1.0	0.02	0.05	0.03	0.03	0.02	0.04	0.0	0.01	0.03	0.05	0.03	0.3	0.07	0.21
Gb_31158	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	1.0	0.04	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.03	0.01	0.0
Gb_31529	0.14	0.0	0.02	0.28	0.15	0.9	0.0	0.14	0.2	0.24	1.0	0.3	0.17	0.3	0.0	0.05	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_32318	0.04	0.03	0.02	0.14	0.21	1.0	0.03	0.09	0.06	0.07	0.07	0.1	0.13	0.14	0.09	0.1	0.13	0.24	0.09	0.16
Gb_33275	0.8	0.59	0.69	1.0	0.85	0.81	0.47	0.21	0.33	0.1	0.4	0.18	0.25	0.2	0.48	0.52	0.2	0.2	0.3	0.89
Gb_33455	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	1.0	0.1	0.04	0.01	0.01	0.06	0.01	0.0	0.0	0.12	0.02	0.03	0.03	0.0	0.21
Gb_34309	0.07	0.05	0.06	0.0	0.17	0.78	1.0	0.23	0.21	0.24	0.27	0.08	0.33	0.13	0.38	0.01	0.02	0.0	0.02	0.0
Gb_34310	0.09	0.0	0.07	0.0	0.07	1.0	0.98	0.15	0.09	0.08	0.34	0.08	0.06	0.02	0.2	0.09	0.02	0.0	0.0	0.0
Gb_34493	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	1.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_35239	0.01	0.02	0.07	0.01	0.1	0.19	0.0	0.1	0.15	0.13	0.04	0.01	0.02	0.05	0.03	0.02	0.16	0.15	0.02	1.0
Gb_35630	0.66	0.0	0.19	0.62	0.22	0.3	1.0	0.06	0.02	0.07	0.12	0.02	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.11	0.48
Gb_36277	0.05	0.04	0.04	0.02	0.04	1.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38598	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.75	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.05	0.03	0.13
Gb_39638	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_40027	0.02	0.02	0.02	0.0	0.08	1.0	0.0	0.02	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.52
Gb_41416	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41460	0.24	0.47	0.56	0.0	0.11	1.0	0.48	0.28	0.31	0.09	0.25	0.52	0.07	0.2	0.43	0.3	0.38	0.87	0.02	0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)