1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_89 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.32 1.0 0.39 0.58 0.0 0.0 0.23 0.39 0.0 0.1 0.69 0.0 0.0 0.0 0.48 0.58 0.13 0.08 0.64 0.45
0.34 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.36 0.16 0.14 0.22 0.25 0.0 0.33 0.14 1.0 0.0 0.58 0.0 0.35 0.0
0.02 0.03 0.0 0.08 0.06 0.04 0.41 0.1 0.04 0.09 1.0 0.09 0.05 0.09 0.75 0.53 0.05 0.02 0.23 0.09
0.03 0.03 0.01 0.01 0.02 0.02 0.21 0.09 0.04 0.02 1.0 0.07 0.09 0.07 0.8 0.37 0.03 0.05 0.21 0.23
0.14 0.52 0.44 0.61 0.0 0.11 0.86 0.33 0.14 0.05 0.66 0.1 0.04 0.1 0.6 0.87 1.0 0.08 0.24 0.13
0.03 0.05 0.02 0.1 0.01 0.02 0.11 0.11 0.05 0.1 1.0 0.11 0.09 0.1 0.8 0.36 0.08 0.02 0.18 0.06
0.25 0.09 0.09 0.46 0.06 0.0 0.77 0.23 0.08 0.0 0.78 0.2 0.47 0.42 0.41 0.76 0.12 0.07 1.0 0.07
0.04 0.33 0.24 0.33 0.05 0.02 0.09 0.14 0.09 0.11 1.0 0.14 0.08 0.09 0.81 0.48 0.36 0.05 0.2 0.14
0.16 0.31 0.29 0.55 0.06 0.2 0.2 0.42 0.08 0.04 0.32 0.07 0.05 0.05 0.32 1.0 0.06 0.11 0.6 0.13
0.19 0.21 0.26 0.65 0.05 0.0 0.45 0.24 0.14 0.11 0.73 0.01 0.16 0.14 0.5 1.0 0.2 0.0 0.28 0.12
0.19 0.15 0.0 0.07 0.07 0.03 0.13 0.13 0.22 0.18 0.99 0.11 0.19 0.2 1.0 0.35 0.3 0.02 0.28 0.1
0.06 0.09 0.02 0.06 0.04 0.05 0.09 0.11 0.16 0.18 1.0 0.17 0.23 0.18 0.86 0.29 0.44 0.03 0.13 0.13
0.03 0.19 0.03 0.11 0.02 0.02 0.08 0.11 0.12 0.11 1.0 0.12 0.17 0.17 0.75 0.18 0.29 0.03 0.15 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.47 0.22 0.0 0.0 0.25 0.15 0.2 0.1 0.45 0.0 0.0 0.0 1.0 0.22
0.58 0.2 0.0 0.27 0.33 0.07 0.17 0.29 0.34 0.36 0.92 0.11 0.03 0.09 1.0 0.66 0.07 0.24 0.82 0.28
0.05 0.0 0.0 0.23 0.03 0.08 0.12 0.25 0.0 0.03 0.91 0.16 0.09 0.14 0.82 0.41 0.0 0.03 1.0 0.15
0.02 0.06 0.02 0.12 0.03 0.02 0.12 0.17 0.02 0.02 1.0 0.1 0.08 0.09 0.68 0.36 0.08 0.0 0.34 0.13
0.05 0.0 0.02 0.18 0.0 0.0 0.05 0.15 0.02 0.01 1.0 0.06 0.06 0.06 0.5 0.2 0.05 0.04 0.24 0.06
0.27 0.05 0.34 0.51 0.11 0.42 0.2 0.29 0.08 0.04 0.28 0.07 0.0 0.05 0.22 1.0 0.09 0.01 0.57 0.13
0.39 0.0 0.12 0.15 0.11 0.14 0.37 0.25 0.17 0.15 1.0 0.11 0.41 0.23 0.59 0.38 0.2 0.2 0.7 0.62
0.38 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.58 0.33 0.2 0.05 0.84 0.35 0.33 0.24 0.48 0.75 0.31 0.14 1.0 0.4
0.05 0.02 0.02 0.05 0.07 0.04 0.16 0.23 0.03 0.08 0.98 0.13 0.2 0.2 1.0 0.26 0.09 0.02 0.53 0.16
0.02 0.03 0.12 0.35 0.06 0.06 1.0 0.27 0.4 0.82 0.89 0.13 0.27 0.24 0.93 0.54 0.23 0.0 0.39 0.28
0.02 0.95 0.25 0.56 0.0 0.05 0.13 0.39 0.03 0.0 0.95 0.2 0.24 0.28 1.0 0.54 0.27 0.0 0.17 0.09
0.08 0.0 0.2 0.92 0.0 0.1 0.18 0.25 0.06 0.1 0.26 0.07 0.08 0.03 0.0 1.0 0.0 0.25 0.82 0.28
0.4 0.0 0.04 0.74 0.2 0.46 0.6 0.31 0.13 0.09 0.93 0.27 0.24 0.26 0.84 1.0 0.15 0.1 0.72 0.27
0.13 0.31 0.27 0.4 0.1 0.48 0.07 0.26 0.08 0.03 0.35 0.3 0.02 0.03 0.26 1.0 0.18 0.17 0.76 0.17
0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 1.0 0.0 0.06 0.09 0.34 0.3 0.22 0.0 0.07 0.0
0.04 0.0 0.01 0.21 0.0 0.0 0.1 0.13 0.08 0.13 1.0 0.08 0.17 0.16 0.91 0.15 0.1 0.05 0.22 0.1
0.01 1.0 0.63 0.48 0.03 0.02 0.21 0.19 0.0 0.01 0.05 0.01 0.01 0.0 0.02 0.54 0.6 0.01 0.05 0.07
0.2 0.05 0.02 0.35 0.12 0.11 0.04 0.35 0.37 0.21 0.95 0.27 0.03 0.04 0.98 0.4 1.0 0.09 0.56 0.06
0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 1.0 0.0 0.06 0.09 0.34 0.3 0.22 0.0 0.07 0.0
0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.31 0.03 0.05 1.0 0.11 0.1 0.12 0.14 0.13 0.0 0.21 0.67 0.33
0.13 0.31 0.27 0.4 0.1 0.48 0.07 0.26 0.08 0.03 0.35 0.3 0.02 0.03 0.26 1.0 0.18 0.17 0.76 0.17
0.07 0.0 0.01 0.05 0.02 0.03 0.1 0.1 0.03 0.07 1.0 0.07 0.06 0.04 0.55 0.09 0.04 0.02 0.23 0.1
0.08 0.08 0.08 0.06 0.07 0.06 0.21 0.29 0.05 0.04 1.0 0.21 0.17 0.21 0.75 0.72 0.06 0.04 0.47 0.3
0.22 1.0 0.38 0.28 0.06 0.03 0.12 0.11 0.09 0.08 0.36 0.23 0.06 0.07 0.25 0.19 0.19 0.05 0.27 0.03
0.06 0.05 0.02 0.14 0.02 0.03 0.07 0.19 0.03 0.01 1.0 0.11 0.12 0.18 0.74 0.29 0.05 0.0 0.29 0.1
0.06 0.02 0.02 0.16 0.05 0.03 0.02 0.13 0.04 0.02 0.99 0.1 0.09 0.11 1.0 0.14 0.01 0.06 0.25 0.15
0.31 0.91 0.81 1.0 0.15 0.01 0.18 0.25 0.03 0.03 0.37 0.15 0.07 0.1 0.41 0.18 0.09 0.1 0.54 0.11
0.26 0.44 0.49 0.58 0.2 0.15 0.37 0.49 0.06 0.08 0.88 0.06 0.09 0.13 0.74 1.0 0.24 0.16 0.92 0.64
0.06 0.02 0.02 0.16 0.05 0.03 0.02 0.13 0.04 0.02 0.99 0.1 0.09 0.11 1.0 0.14 0.01 0.06 0.25 0.15
0.13 0.07 0.05 0.28 0.04 0.07 0.17 0.2 0.05 0.06 1.0 0.09 0.13 0.15 0.76 0.39 0.07 0.05 0.3 0.22
0.05 0.03 0.01 0.16 0.03 0.02 0.06 0.13 0.02 0.04 1.0 0.12 0.08 0.06 0.9 0.32 0.07 0.03 0.22 0.1
0.02 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.1 0.09 0.06 0.02 1.0 0.13 0.11 0.07 0.78 0.21 0.06 0.0 0.23 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.14 0.0 0.05 1.0 0.11 0.0 0.04 0.37 0.0 0.0 0.0 0.53 0.09
0.08 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.22 0.22 0.0 0.0 1.0 0.07 0.08 0.14 0.53 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0
0.1 0.47 0.22 1.0 0.07 0.03 0.2 0.14 0.05 0.11 0.57 0.12 0.16 0.15 0.53 0.22 0.1 0.05 0.31 0.1
0.07 0.58 0.25 1.0 0.08 0.02 0.36 0.2 0.05 0.07 0.16 0.02 0.12 0.09 0.11 0.57 0.31 0.06 0.27 0.1
0.08 0.37 0.14 0.34 0.01 0.0 0.27 0.22 0.02 0.04 1.0 0.09 0.1 0.07 0.59 0.33 0.05 0.07 0.21 0.07
0.04 0.07 0.06 0.24 0.02 0.02 0.12 0.09 0.21 0.31 1.0 0.07 0.09 0.08 0.8 0.16 0.31 0.02 0.11 0.07
0.04 0.0 0.06 0.0 0.06 0.02 0.06 0.14 0.0 0.04 1.0 0.12 0.11 0.14 0.75 0.28 0.05 0.02 0.12 0.0
0.06 0.02 0.02 0.16 0.05 0.03 0.02 0.13 0.04 0.02 0.99 0.1 0.09 0.11 1.0 0.14 0.01 0.06 0.25 0.15
0.11 1.0 0.61 0.28 0.06 0.03 0.25 0.13 0.03 0.04 0.06 0.02 0.08 0.06 0.06 0.44 0.19 0.04 0.16 0.07
0.1 0.13 0.12 0.13 0.04 0.03 0.26 0.28 0.06 0.1 0.76 0.25 0.14 0.2 0.59 1.0 0.05 0.01 0.6 0.2
0.1 0.15 0.05 0.36 0.06 0.04 0.14 0.13 0.08 0.09 1.0 0.11 0.2 0.21 0.93 0.26 0.24 0.05 0.27 0.11
0.03 0.07 0.03 0.07 0.06 0.1 0.17 0.25 0.1 0.09 1.0 0.3 0.15 0.11 0.65 0.45 0.04 0.03 0.13 0.28
0.14 0.29 0.0 0.86 0.0 0.19 0.13 0.18 0.02 0.24 0.44 0.25 0.29 0.12 1.0 0.2 0.04 0.03 0.47 0.42
0.04 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.2 0.21 0.03 0.21 0.78 0.09 0.23 0.11 1.0 0.74 0.0 0.0 0.14 0.12
0.31 0.0 0.07 0.7 0.0 0.08 0.31 0.19 0.09 0.32 1.0 0.23 0.31 0.03 0.4 0.0 0.34 0.08 0.37 0.12
0.24 0.0 0.05 0.77 0.11 0.05 0.33 0.33 0.26 0.16 1.0 0.22 0.52 0.28 0.58 0.77 0.22 0.26 0.35 0.2
0.15 0.25 0.22 0.92 0.13 0.32 0.07 0.17 0.05 0.0 0.47 0.07 0.07 0.15 0.27 1.0 0.18 0.12 0.55 0.15
0.02 0.04 0.03 0.04 0.02 0.02 0.13 0.22 0.02 0.02 1.0 0.12 0.11 0.12 0.78 0.24 0.05 0.02 0.15 0.12
0.36 1.0 0.58 0.52 0.09 0.01 0.18 0.1 0.13 0.13 0.29 0.06 0.12 0.1 0.31 0.11 0.13 0.03 0.18 0.06
0.07 0.02 0.03 0.06 0.02 0.04 0.19 0.14 0.08 0.17 1.0 0.1 0.1 0.13 0.91 0.21 0.14 0.03 0.33 0.19
0.06 0.01 0.04 0.1 0.03 0.04 0.14 0.16 0.04 0.05 0.99 0.11 0.12 0.12 1.0 0.27 0.05 0.07 0.32 0.19
0.04 0.02 0.02 0.04 0.03 0.03 0.08 0.24 0.03 0.03 1.0 0.16 0.1 0.12 0.72 0.38 0.04 0.06 0.53 0.17
0.25 0.3 0.41 0.6 0.07 0.0 0.54 0.24 0.17 0.07 0.76 0.17 0.11 0.15 0.4 1.0 0.08 0.43 0.26 0.18
0.11 0.38 0.11 0.55 0.04 0.14 1.0 0.2 0.06 0.12 0.8 0.12 0.23 0.3 0.63 0.98 0.23 0.03 0.46 0.07
0.04 0.04 0.03 0.02 0.08 0.04 0.06 0.19 0.02 0.02 1.0 0.16 0.1 0.12 0.58 0.27 0.01 0.01 0.4 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 1.0 0.05 0.07 0.0 0.52 0.22 0.0 0.0 0.17 0.15
0.15 0.09 0.07 0.13 0.12 0.09 0.31 0.29 0.46 0.8 1.0 0.29 0.19 0.19 0.73 0.22 0.36 0.1 0.63 0.33
0.03 0.04 0.02 0.23 0.01 0.02 0.11 0.09 0.1 0.19 1.0 0.06 0.07 0.09 0.89 0.2 0.18 0.03 0.17 0.09
0.04 0.03 0.02 0.29 0.02 0.01 0.1 0.06 0.16 0.24 1.0 0.05 0.1 0.1 0.92 0.13 0.3 0.01 0.09 0.06
0.09 0.03 0.04 0.0 0.03 0.02 0.11 0.29 0.07 0.06 1.0 0.24 0.14 0.15 0.76 0.45 0.08 0.11 0.83 0.21
0.06 0.0 0.02 0.04 0.0 0.01 0.01 0.08 0.02 0.01 1.0 0.08 0.08 0.04 0.55 0.24 0.03 0.04 0.09 0.04
0.09 0.13 0.09 0.22 0.04 0.09 0.04 0.32 0.14 0.09 0.35 0.43 0.09 0.08 0.36 0.35 1.0 0.06 0.15 0.05
0.02 0.0 0.03 0.2 0.13 0.03 0.24 0.13 0.03 0.04 1.0 0.08 0.03 0.08 0.7 0.2 0.08 0.05 0.21 0.14
0.16 0.19 0.0 0.2 0.0 0.0 0.28 0.19 0.08 0.25 0.74 0.08 0.35 0.13 1.0 0.86 0.11 0.0 0.66 0.0
0.16 0.1 0.18 0.72 0.0 0.0 0.16 0.18 0.11 0.13 0.5 0.06 0.26 0.29 0.43 1.0 0.16 0.04 0.36 0.23
0.05 0.05 0.03 0.07 0.02 0.03 0.1 0.1 0.06 0.08 1.0 0.1 0.14 0.18 0.86 0.2 0.13 0.02 0.13 0.08
0.05 0.08 0.03 0.08 0.03 0.0 0.15 0.16 0.07 0.08 1.0 0.11 0.21 0.17 0.86 0.31 0.21 0.02 0.1 0.14
0.05 0.64 0.02 0.77 0.05 0.0 0.16 0.16 0.02 0.06 1.0 0.18 0.06 0.14 0.61 0.51 0.23 0.03 0.14 0.18
0.01 0.02 0.01 0.03 0.03 0.0 0.04 0.1 0.01 0.01 1.0 0.08 0.05 0.08 0.85 0.18 0.02 0.03 0.14 0.07
0.49 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.2 0.03 0.42 0.61 0.11 0.41 0.15 1.0 0.39 0.17 0.0 0.66 0.36
0.23 0.1 0.24 0.6 0.1 0.1 0.18 0.18 0.14 0.17 1.0 0.19 0.3 0.27 0.88 0.55 0.31 0.12 0.65 0.12
0.05 0.13 0.01 0.07 0.05 0.04 0.01 0.11 0.05 0.05 1.0 0.14 0.15 0.13 0.55 0.21 0.07 0.0 0.1 0.1
0.02 0.01 0.05 0.06 0.03 0.04 0.12 0.16 0.03 0.03 1.0 0.12 0.04 0.1 0.63 0.22 0.02 0.0 0.34 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.18 0.17 0.21 0.36 0.98 0.09 0.11 0.04 1.0 0.17 0.32 0.0 0.3 0.0
0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 1.0 0.0 0.06 0.09 0.34 0.3 0.22 0.0 0.07 0.0
0.05 0.02 0.05 0.07 0.03 0.03 0.02 0.2 0.03 0.03 0.33 0.02 0.05 0.06 0.28 1.0 0.03 0.05 0.14 0.01
0.46 0.0 0.91 0.94 0.61 0.0 0.38 0.29 0.12 0.08 0.69 0.2 0.17 0.0 1.0 0.0 0.16 0.8 0.55 0.12
0.12 0.11 0.12 0.38 0.08 0.1 0.1 0.33 0.03 0.03 0.4 0.06 0.04 0.04 0.41 1.0 0.21 0.07 0.34 0.1
0.17 0.08 0.11 0.94 0.07 0.17 0.3 0.18 0.13 0.14 1.0 0.11 0.29 0.29 0.83 0.63 0.37 0.11 0.14 0.39
0.17 0.08 0.11 0.94 0.07 0.17 0.3 0.18 0.13 0.14 1.0 0.11 0.29 0.29 0.83 0.63 0.37 0.11 0.14 0.39
0.1 0.09 0.07 0.44 0.04 0.05 0.14 0.18 0.08 0.07 1.0 0.13 0.17 0.21 0.84 0.34 0.16 0.04 0.2 0.14
0.07 0.0 0.04 0.08 0.03 0.01 0.11 0.1 0.05 0.05 1.0 0.09 0.05 0.06 0.95 0.25 0.06 0.01 0.13 0.05
0.04 0.3 0.19 0.21 0.04 0.04 0.06 0.1 0.07 0.09 1.0 0.09 0.08 0.09 0.97 0.31 0.2 0.03 0.14 0.12
0.02 0.15 0.06 0.69 0.01 0.02 0.07 0.11 0.03 0.04 1.0 0.09 0.09 0.11 0.79 0.33 0.05 0.03 0.14 0.1
0.12 0.0 0.04 0.13 0.0 0.0 0.23 0.06 0.18 0.27 1.0 0.05 0.1 0.06 0.98 0.15 0.06 0.0 0.15 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)