Heatmap: Cluster_208 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
1.15 0.67 0.04 0.0 0.49 0.48 0.08 1.93 0.66 0.82 3.21 0.7 12.89 4.14 0.8 0.29 0.08 0.11 0.01 0.27
0.14 0.0 0.0 0.0 0.05 1.62 0.19 10.07 0.04 0.23 0.25 0.55 10.43 17.4 0.3 0.0 0.06 0.16 0.0 29.16
2.81 2.7 6.63 0.88 1.13 3.57 12.42 13.71 0.78 0.95 2.13 2.46 8.83 10.36 1.08 0.0 0.07 0.05 0.03 10.59
0.02 0.48 0.06 0.03 0.05 0.34 6.3 2.93 2.49 2.55 6.75 4.54 10.22 7.55 3.59 0.0 0.1 0.04 0.01 1.11
0.03 0.21 0.07 0.0 0.0 0.05 0.11 0.18 0.03 0.08 0.3 0.26 0.0 0.03 0.06 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 2.0 0.24 7.36 0.02 0.0 0.23 0.41 6.73 12.47 0.18 0.0 0.01 0.06 0.0 19.49
1.07 0.93 0.12 0.0 0.57 2.35 0.05 5.14 0.07 0.05 0.92 2.27 1.92 1.85 0.39 0.0 0.02 0.06 0.01 2.05
1.71 1.05 2.9 1.34 1.01 2.53 0.02 2.49 0.38 0.55 1.06 2.46 1.65 1.72 0.53 0.33 0.45 3.86 0.13 6.19
0.13 0.0 0.02 0.0 0.14 0.35 0.0 2.94 0.8 0.91 1.11 0.26 2.39 1.55 0.54 0.09 0.19 0.21 0.02 11.26
0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.22 0.04 0.05 0.46 0.05 2.4 0.71 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.52 0.2 0.8 0.0 0.09 0.1 0.75 2.51 0.36 0.35 1.29 1.38 4.33 1.89 0.84 0.0 0.0 0.23 0.42 3.58
9.09 6.53 8.14 1.73 0.15 12.38 8.68 45.75 4.22 4.66 5.29 7.21 53.95 59.6 1.83 0.15 1.69 0.82 0.04 0.88
3.22 8.75 0.1 0.0 0.0 2.13 17.56 27.19 1.71 2.9 3.32 7.84 28.25 21.44 0.72 0.0 0.07 0.0 0.24 29.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.19 1.18 0.11 0.25 1.43 0.06 3.31 3.4 4.49 5.86 0.35 18.07 4.97 3.31 0.0 0.02 0.02 0.69 1.08
0.04 0.06 0.05 0.3 0.04 0.03 0.68 1.32 0.44 0.35 1.41 0.52 8.15 5.21 0.74 0.02 0.0 0.1 0.0 0.14
2.42 2.7 1.89 0.57 1.23 19.65 0.47 9.07 4.17 4.94 7.99 4.18 9.49 8.88 6.16 2.26 3.02 2.77 0.74 2.91
0.36 0.12 0.27 0.32 0.13 0.26 0.19 0.67 0.3 0.23 0.71 0.3 0.55 0.37 0.89 0.69 0.84 0.44 0.02 2.13
0.21 0.15 0.22 0.0 0.04 0.12 0.04 1.21 0.14 0.18 0.3 0.15 2.17 0.91 0.17 0.0 0.02 0.02 0.0 0.5
0.44 1.36 3.19 1.08 0.71 0.57 0.62 6.24 0.87 0.74 4.63 5.87 6.16 3.42 2.96 0.03 0.45 0.05 0.04 8.78
15.69 9.49 22.29 10.42 3.92 8.1 6.33 43.31 5.27 7.21 15.25 8.75 41.49 30.67 8.16 0.12 0.46 0.33 0.27 6.45
12.5 13.99 26.45 8.07 2.65 10.74 4.86 31.09 3.55 4.88 10.44 6.37 21.84 13.01 6.42 0.21 0.35 0.39 0.26 5.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.98 5.79 0.0 9.48 3.17 6.75 47.96 34.41 16.49 15.19 22.54 32.0 121.2 126.48 5.41 2.76 17.16 2.57 2.96 1.7
0.05 0.1 0.01 0.05 0.03 0.01 0.11 0.05 0.02 0.01 0.02 0.01 0.07 0.06 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.3
5.36 15.78 19.65 1.63 0.76 7.28 14.46 21.0 0.67 1.52 1.71 4.78 8.31 8.39 0.29 0.0 0.03 0.32 0.06 17.92
9.21 33.51 0.38 0.0 1.31 6.24 29.7 41.34 1.5 1.78 11.82 14.14 23.57 20.27 4.45 0.0 0.38 0.13 0.0 14.18
81.08 34.73 2.86 9.06 38.54 229.28 2.02 394.33 152.3 296.07 171.45 294.97 772.81 1164.59 98.5 28.7 289.58 12.52 0.01 8.68
0.05 0.0 0.01 0.24 0.3 0.31 0.41 1.36 1.23 1.1 0.93 1.08 1.51 1.52 0.85 0.52 0.49 0.47 0.02 4.1
0.04 0.09 0.04 0.06 0.08 0.09 0.06 0.89 0.02 0.0 0.32 0.65 1.51 2.21 0.26 0.0 0.0 0.0 0.13 1.04
0.25 0.67 0.0 0.0 0.11 0.96 9.07 18.91 3.77 3.17 18.71 6.84 151.22 112.74 11.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.02 0.02 0.06 0.0 0.01 6.25 5.86 4.53 6.36 9.95 32.15 8.52 3.68 1.37 3.57 0.23 0.09 0.03
0.32 0.5 0.0 0.0 0.41 0.77 0.0 1.22 0.89 1.35 2.57 2.5 1.98 2.38 1.91 0.12 0.16 0.0 0.03 3.09
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.16 0.04 0.0 0.18 0.0 0.4 0.09 0.11 0.0 0.0 0.0 0.04 0.56
2.06 2.89 2.2 1.56 0.09 0.02 3.51 14.22 12.8 8.82 0.0 16.88 0.27 0.61 0.0 0.31 11.06 0.41 1.14 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.15 0.07 0.09 0.18 0.01 0.52 0.19 0.2 0.0 0.11 0.04 0.01 0.19
6.56 17.1 12.5 3.32 0.27 9.14 23.2 47.17 2.34 2.49 5.49 9.32 23.92 24.3 2.83 0.31 0.92 0.22 0.29 23.65
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.05 0.0 0.01 0.33 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.01 0.11 0.04 0.03 0.18 0.04 0.96 0.33 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05
0.13 0.47 0.27 0.0 0.03 0.81 0.51 0.32 0.17 0.45 0.59 0.38 1.24 1.05 0.13 0.0 0.0 0.0 0.04 1.38
0.0 0.11 0.1 0.0 0.05 1.22 0.06 0.35 0.05 0.03 0.08 0.07 0.53 0.48 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.16
34.55 16.9 28.14 12.95 6.76 15.99 4.6 61.24 9.47 10.86 17.5 31.56 43.25 35.82 8.27 1.44 8.62 6.62 2.15 4.72
6.61 5.96 6.43 8.25 11.43 11.74 19.81 28.93 5.31 6.8 12.42 21.06 37.1 28.7 11.35 1.19 3.56 8.94 11.57 42.11
7.33 13.63 12.77 10.85 10.82 15.26 22.32 34.24 6.68 8.21 14.55 27.87 28.86 22.39 12.68 0.63 3.9 9.82 20.0 38.77
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.12 14.18 13.14 15.07 2.98 0.6 132.83 27.12 2.84 2.17 4.11 0.07 0.03 2.33
0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 4.38 4.65 9.93 10.01 13.53 3.94 0.09 43.82 9.43 1.31 0.6 1.31 0.0 0.0 12.84
0.39 0.14 0.18 0.03 0.04 0.0 0.16 0.42 0.23 0.18 2.31 0.2 1.23 0.71 1.97 0.02 0.0 0.0 0.0 1.75
0.25 0.0 0.13 0.0 0.0 0.77 0.4 1.01 0.41 0.1 0.35 0.06 5.82 4.04 0.18 0.06 0.0 0.07 0.01 1.09
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.23 0.11 0.0 0.07 0.06 0.03 0.14 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2
2.81 13.94 29.3 9.94 4.97 26.85 4.14 40.48 3.41 3.57 4.34 8.16 30.65 38.83 1.6 1.6 4.12 8.35 2.16 19.94
3.1 3.3 0.36 0.1 0.23 2.03 0.93 2.48 0.55 0.84 0.84 1.43 4.47 5.07 0.29 0.07 0.31 0.14 0.01 5.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.59 3.4 5.42 1.12 0.67 1.99 1.39 3.14 1.45 1.71 3.32 2.1 9.01 9.28 1.8 1.61 1.81 0.65 0.02 1.57
0.31 0.04 0.12 0.12 0.12 0.02 0.01 0.22 0.01 0.07 0.0 0.0 0.05 0.18 0.0 0.0 0.0 0.25 0.06 0.69
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.05 0.03 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
3.68 23.02 9.2 2.68 0.9 16.85 7.86 13.78 1.43 1.42 0.26 1.84 21.87 31.04 0.15 0.1 0.09 0.2 0.03 13.67
0.56 5.75 0.0 0.0 0.0 8.91 2.75 6.61 0.0 0.42 1.8 7.58 0.15 0.26 0.0 0.0 0.79 0.36 0.0 0.0
0.19 0.11 0.07 0.13 0.18 0.91 0.26 0.66 0.14 0.2 0.74 0.37 0.47 0.38 0.55 0.11 0.3 0.32 0.39 1.38
16.85 6.98 11.83 1.4 1.41 5.79 2.01 14.49 7.96 8.54 6.85 9.81 14.2 10.21 2.57 0.36 3.63 2.83 1.58 41.96
10.36 32.84 12.53 1.04 1.93 8.86 10.38 31.69 10.38 8.13 19.34 15.26 62.3 58.97 9.82 0.0 0.84 1.73 0.06 13.04
11.02 41.83 25.06 2.53 3.32 9.97 17.73 34.58 11.96 12.55 16.8 10.68 92.78 103.4 6.59 0.0 2.8 3.49 0.05 7.33
0.08 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.02 0.03 0.3 0.03 0.83 0.15 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.09 0.03 0.16 0.04 0.06 0.13 0.06 0.77 0.12 0.05 0.01 0.03 0.02 0.0 0.04
0.04 0.0 0.0 0.08 0.08 0.15 0.0 0.78 0.02 0.01 0.03 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.03 0.05 0.37 0.0
0.37 0.0 0.43 0.0 0.29 0.83 0.14 0.05 0.16 0.4 0.23 0.06 0.17 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.54 0.3 0.02 0.0 0.43 0.27 0.05 0.84 0.28 0.43 1.09 0.34 5.31 1.76 0.35 0.02 0.05 0.02 0.01 0.24
0.6 0.12 0.04 0.0 0.0 0.08 0.0 0.97 0.43 0.34 1.2 0.4 10.08 3.88 0.14 0.05 0.0 0.13 0.04 0.52

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)