Heatmap: Cluster_29 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00045	0.99	0.5	1.0	0.65	0.69	0.44	0.56	0.59	0.59	0.61	0.85	0.39	0.56	0.46	0.78	0.65	0.49	0.67	0.38	0.41
Gb_00157	0.51	0.69	1.0	0.59	0.44	0.3	0.37	0.49	0.27	0.29	0.46	0.32	0.37	0.37	0.42	0.24	0.23	0.44	0.62	0.34
Gb_00250	0.56	0.72	1.0	0.61	0.75	0.41	0.25	0.41	0.24	0.25	0.25	0.28	0.48	0.46	0.27	0.31	0.3	0.74	0.66	0.48
Gb_00415	0.86	0.67	1.0	0.58	0.64	0.3	0.28	0.41	0.46	0.41	0.41	0.31	0.4	0.31	0.39	0.65	0.39	0.59	0.33	0.26
Gb_00498	0.79	0.74	1.0	0.37	0.9	0.35	0.38	0.55	0.42	0.4	0.73	0.37	0.41	0.38	0.67	0.34	0.41	0.61	0.55	0.61
Gb_00754	0.95	0.27	0.51	1.0	0.5	0.24	0.23	0.45	0.35	0.3	0.51	0.26	0.25	0.23	0.46	0.72	0.81	0.65	0.37	0.3
Gb_01051	0.88	0.5	0.7	1.0	0.6	0.35	0.3	0.5	0.34	0.36	0.4	0.29	0.48	0.44	0.38	0.3	0.35	0.38	0.37	0.26
Gb_02334	1.0	0.86	0.68	0.73	1.0	0.49	0.54	0.72	0.84	0.69	0.68	0.53	0.7	0.63	0.74	0.83	0.65	0.74	0.6	0.45
Gb_02503	1.0	0.46	0.68	0.41	0.34	0.04	0.29	0.46	0.46	0.48	0.7	0.15	0.28	0.24	0.45	0.33	0.39	0.16	0.25	0.52
Gb_02670	0.85	0.55	0.97	0.87	1.0	0.57	0.22	0.63	0.38	0.38	0.51	0.5	0.72	0.5	0.51	0.3	0.4	0.68	0.67	0.53
Gb_03695	0.88	1.0	0.84	0.73	0.8	0.48	0.79	0.57	0.4	0.35	0.7	0.47	0.31	0.38	0.66	0.39	0.5	0.57	0.95	0.89
Gb_04302	0.94	0.3	1.0	0.41	0.73	0.38	0.48	0.61	0.56	0.51	0.81	0.24	0.57	0.45	0.91	0.37	0.41	0.61	0.22	0.46
Gb_06266	0.78	0.96	1.0	0.87	0.77	0.36	0.49	0.56	0.3	0.28	0.46	0.35	0.37	0.33	0.44	0.27	0.37	0.48	0.46	0.33
Gb_06510	0.99	0.96	1.0	0.63	0.62	0.5	0.14	0.45	0.19	0.16	0.36	0.24	0.29	0.24	0.42	0.22	0.28	0.67	0.34	0.38
Gb_06512	0.97	0.46	1.0	0.95	0.82	0.48	0.23	0.59	0.56	0.47	0.66	0.42	0.41	0.3	0.64	0.64	0.49	0.81	0.46	0.35
Gb_06645	0.83	0.61	1.0	0.79	0.77	0.44	0.39	0.51	0.38	0.36	0.42	0.43	0.19	0.2	0.43	0.35	0.64	0.53	0.64	0.32
Gb_06903	0.44	0.84	1.0	0.37	0.38	0.14	0.34	0.29	0.24	0.24	0.34	0.29	0.31	0.28	0.34	0.19	0.18	0.29	0.37	0.27
Gb_08559	0.73	0.66	0.93	1.0	0.52	0.22	0.31	0.42	0.43	0.38	0.54	0.36	0.49	0.52	0.46	0.6	0.44	0.38	0.26	0.21
Gb_09375	0.59	0.7	1.0	0.35	0.33	0.17	0.07	0.28	0.16	0.14	0.2	0.13	0.23	0.23	0.24	0.28	0.22	0.28	0.14	0.1
Gb_09521	0.57	0.38	0.53	1.0	0.56	0.16	0.16	0.36	0.25	0.21	0.34	0.45	0.38	0.39	0.29	0.26	0.31	0.51	0.38	0.31
Gb_11121	0.83	0.57	1.0	0.83	0.76	0.29	0.29	0.56	0.45	0.36	0.41	0.33	0.53	0.37	0.38	0.26	0.35	0.61	0.64	0.52
Gb_12624	0.56	0.39	1.0	0.51	0.62	0.35	0.24	0.43	0.21	0.21	0.28	0.36	0.16	0.16	0.27	0.16	0.14	0.54	0.29	0.26
Gb_12666	0.65	0.86	1.0	0.42	0.33	0.12	0.1	0.29	0.24	0.21	0.31	0.26	0.22	0.22	0.27	0.46	0.39	0.24	0.13	0.15
Gb_12918	1.0	0.48	0.89	0.88	0.59	0.42	0.32	0.55	0.34	0.29	0.38	0.34	0.76	0.66	0.35	0.26	0.33	0.45	0.4	0.26
Gb_13510	1.0	0.79	0.88	1.0	0.72	0.37	0.31	0.51	0.39	0.29	0.44	0.24	0.46	0.39	0.53	0.36	0.3	0.59	0.42	0.27
Gb_14285	0.43	0.3	1.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.12	0.05	0.08	0.0	0.07	0.02	0.01	0.0	0.04	0.1	0.12	0.23	0.0
Gb_15142	0.54	0.36	0.48	0.56	0.94	0.18	0.24	0.53	0.64	0.45	0.49	0.25	0.2	0.16	0.47	0.78	1.0	0.43	0.38	0.16
Gb_16891	0.78	0.52	1.0	0.87	0.98	0.57	0.37	0.7	0.46	0.45	0.91	0.59	0.66	0.58	0.79	0.5	0.52	0.81	0.6	0.62
Gb_17406	0.77	0.61	1.0	0.58	0.34	0.1	0.17	0.36	0.21	0.21	0.41	0.19	0.21	0.15	0.42	0.19	0.2	0.23	0.35	0.21
Gb_17455	0.47	0.48	1.0	0.7	0.48	0.29	0.3	0.53	0.38	0.42	0.48	0.4	0.19	0.13	0.52	0.26	0.34	0.48	0.42	0.17
Gb_18228	0.91	0.38	0.21	1.0	0.42	0.11	0.07	0.2	0.15	0.09	0.02	0.04	0.11	0.03	0.08	0.0	0.07	0.09	0.16	0.06
Gb_22317	0.94	0.91	1.0	0.85	0.74	0.24	0.21	0.8	0.5	0.58	0.9	0.39	0.91	0.77	0.87	0.48	0.42	0.62	0.53	0.39
Gb_22387	0.91	1.0	0.99	0.65	0.95	0.45	0.7	0.68	0.57	0.55	0.78	0.63	0.37	0.3	0.87	0.68	0.64	0.82	0.8	0.6
Gb_22474	0.58	0.21	0.32	0.32	0.3	0.2	0.13	0.43	0.71	0.64	0.41	0.34	0.2	0.24	0.5	1.0	0.36	0.33	0.14	0.17
Gb_23002	0.63	0.73	0.89	1.0	0.76	0.15	0.18	0.45	0.33	0.3	0.41	0.33	0.52	0.59	0.38	0.34	0.26	0.41	0.54	0.27
Gb_23099	0.81	0.13	0.19	0.88	0.59	0.28	0.23	0.7	0.89	0.82	0.81	0.63	0.6	0.66	0.82	1.0	0.53	0.53	0.19	0.45
Gb_24422	1.0	0.3	0.57	0.41	0.45	0.2	0.26	0.35	0.19	0.21	0.31	0.2	0.28	0.2	0.27	0.15	0.31	0.25	0.32	0.18
Gb_24863	1.0	0.56	0.94	0.89	0.79	0.48	0.36	0.66	0.58	0.52	0.64	0.47	0.7	0.68	0.64	0.54	0.69	0.94	0.49	0.39
Gb_25345	1.0	0.42	0.45	0.45	0.33	0.09	0.18	0.36	0.34	0.32	0.38	0.12	0.23	0.22	0.38	0.47	0.27	0.33	0.25	0.09
Gb_25882	0.75	1.0	0.94	0.81	0.65	0.54	0.62	0.58	0.4	0.43	0.69	0.49	0.44	0.42	0.64	0.4	0.42	0.51	0.88	0.5
Gb_25983	0.86	0.42	0.8	0.98	0.78	0.41	0.36	0.87	0.72	0.75	0.99	0.62	0.9	0.87	1.0	0.72	0.82	0.76	0.6	0.41
Gb_26328	0.86	0.45	0.72	0.84	0.8	0.65	0.41	0.63	0.46	0.45	0.96	0.4	0.54	0.53	1.0	0.36	0.66	0.96	0.69	0.98
Gb_26957	1.0	0.93	1.0	0.9	0.79	0.21	0.31	0.71	0.54	0.51	0.75	0.57	0.8	0.75	0.71	0.59	0.45	0.48	0.66	0.35
Gb_27380	0.75	0.88	1.0	0.8	0.69	0.41	0.46	0.55	0.47	0.47	0.54	0.55	0.49	0.45	0.5	0.37	0.39	0.49	0.59	0.29
Gb_27595	0.72	0.92	1.0	0.57	0.6	0.36	0.6	0.52	0.36	0.36	0.36	0.41	0.27	0.27	0.4	0.3	0.56	0.52	0.81	0.33
Gb_27661	1.0	0.48	0.75	0.99	0.99	0.88	0.35	0.67	0.43	0.43	0.52	0.5	0.8	0.59	0.53	0.62	0.86	0.85	0.78	0.46
Gb_27679	1.0	0.39	0.75	0.83	0.79	0.43	0.29	0.69	0.45	0.39	0.79	0.41	0.59	0.58	0.77	0.72	0.77	0.67	0.54	0.25
Gb_27850	1.0	0.65	0.77	0.65	0.52	0.16	0.22	0.41	0.39	0.26	0.43	0.21	0.41	0.47	0.47	0.71	0.28	0.44	0.2	0.35
Gb_28928	1.0	0.6	0.89	0.79	0.73	0.39	0.27	0.46	0.39	0.3	0.57	0.29	0.42	0.43	0.55	0.36	0.3	0.55	0.3	0.32
Gb_29665	1.0	0.55	0.81	0.76	0.84	0.43	0.41	0.69	0.76	0.6	0.87	0.48	0.43	0.57	0.73	0.95	0.74	0.86	0.27	0.58
Gb_30418	0.98	0.56	1.0	0.89	0.9	0.16	0.1	0.59	0.44	0.4	0.34	0.28	0.46	0.42	0.33	0.39	0.37	0.73	0.38	0.41
Gb_30440	0.83	0.87	1.0	0.65	0.73	0.55	0.43	0.64	0.34	0.34	0.52	0.45	0.52	0.36	0.5	0.26	0.35	0.56	0.82	0.52
Gb_32146	0.97	0.57	0.99	1.0	0.77	0.11	0.17	0.57	0.42	0.37	0.49	0.35	0.24	0.23	0.49	0.46	0.49	0.73	0.31	0.33
Gb_33295	0.71	0.47	1.0	0.51	0.67	0.47	0.25	0.44	0.36	0.37	0.68	0.32	0.51	0.35	0.59	0.36	0.4	0.49	0.17	0.37
Gb_34877	0.9	0.47	0.59	0.71	0.67	0.68	0.62	0.56	0.44	0.45	0.63	0.36	0.46	0.46	0.64	0.48	0.5	0.78	0.64	1.0
Gb_35687	0.52	0.57	1.0	0.89	0.4	0.29	0.49	0.52	0.27	0.3	0.71	0.44	0.46	0.38	0.58	0.39	0.44	0.4	0.75	0.45
Gb_36459	0.83	0.98	1.0	0.98	0.96	0.48	0.45	0.67	0.5	0.51	0.68	0.56	0.58	0.62	0.61	0.41	0.55	0.87	0.7	0.54
Gb_37118	0.95	0.42	1.0	0.73	0.65	0.16	0.34	0.54	0.29	0.27	0.64	0.33	0.35	0.33	0.61	0.38	0.35	0.42	0.42	0.35
Gb_37490	0.61	1.0	0.99	0.83	0.97	0.23	0.17	0.31	0.28	0.28	0.19	0.28	0.48	0.42	0.2	0.21	0.22	0.31	0.33	0.12
Gb_39640	0.9	0.41	0.72	1.0	0.6	0.73	0.5	0.65	0.41	0.39	0.89	0.47	0.31	0.28	0.76	0.36	0.66	0.73	0.61	0.46
Gb_39668	0.85	0.88	1.0	0.92	0.7	0.33	0.63	0.55	0.44	0.41	0.6	0.49	0.56	0.54	0.57	0.33	0.4	0.59	0.98	0.62
Gb_40828	0.98	0.79	1.0	0.59	0.68	0.64	0.56	0.71	0.58	0.57	0.82	0.54	0.47	0.5	0.82	0.59	0.48	0.66	0.71	0.62
Gb_41457	0.86	0.6	0.89	0.9	0.78	0.51	0.53	0.92	0.72	0.69	0.95	0.55	0.71	0.74	1.0	0.75	0.77	0.93	0.82	0.59

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)