1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_239 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.06 0.14 0.05 0.18 0.21 0.75 0.03 0.07 0.03 0.03 0.01 0.05 0.01 0.01 0.01 0.07 0.09 0.54 0.53 0.34
0.25 0.07 0.25 0.16 0.21 9.37 0.22 0.09 0.01 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.25 2.95 2.5 2.13
0.03 0.0 0.07 0.0 0.06 1.02 0.52 0.15 0.04 0.02 0.04 0.01 0.04 0.05 0.01 0.02 0.0 0.03 0.03 0.13
3.55 1.38 1.24 7.32 12.21 77.63 5.54 1.81 0.84 0.97 0.89 1.16 0.25 0.47 1.12 1.24 3.66 3.34 32.35 21.14
0.4 0.8 0.16 0.0 0.75 3.61 0.02 0.16 0.13 0.14 0.28 0.06 0.23 0.17 0.24 0.34 0.02 0.28 1.05 0.08
0.08 0.0 0.0 13.29 11.84 19.09 0.03 7.55 3.29 3.29 0.19 0.63 0.41 0.42 0.15 16.92 28.67 35.65 74.33 9.5
0.42 0.4 0.27 0.71 2.25 5.44 1.93 0.44 0.28 0.42 2.42 0.23 0.06 0.11 3.18 0.72 0.57 3.04 2.72 1.05
0.24 0.13 0.12 0.0 0.93 2.75 0.64 0.3 0.18 0.26 1.15 0.16 0.0 0.02 2.42 0.56 0.35 1.13 0.33 0.64
8.84 9.52 3.84 29.9 18.38 77.79 3.41 4.35 0.57 0.87 1.41 8.21 0.74 0.98 2.49 5.81 14.43 23.34 28.84 34.14
125.92 156.85 136.55 114.76 158.92 439.66 86.1 55.87 17.15 14.66 23.27 24.75 17.66 16.73 24.52 40.74 36.65 380.01 172.43 344.16
0.1 0.43 0.41 7.64 1.74 1.11 0.61 1.89 0.37 0.51 1.21 1.06 0.14 0.17 0.28 2.85 5.15 1.75 14.14 2.85
1.94 1.6 1.13 5.75 1.47 0.98 3.7 2.82 1.12 0.77 0.46 2.0 0.21 0.35 0.66 6.73 4.61 6.29 16.7 5.31
7.37 17.84 8.81 7.68 17.75 24.02 16.19 11.32 7.24 6.31 8.65 7.67 5.7 6.28 10.26 8.7 8.46 21.78 19.43 24.07
1.19 0.14 0.06 2.41 3.71 4.09 0.99 1.08 0.04 0.02 0.0 0.56 0.0 0.0 0.13 0.09 0.3 6.75 3.55 6.41
4.55 2.63 4.71 5.53 4.57 13.4 0.55 1.48 0.5 0.47 0.44 0.52 0.15 0.26 0.81 0.43 0.63 5.55 1.99 7.89
3.66 5.63 8.25 3.69 3.29 16.29 2.78 3.87 2.28 3.33 3.49 2.38 0.56 0.64 2.74 4.86 6.32 6.87 12.24 3.11
0.42 0.45 1.06 1.32 0.66 10.84 0.12 1.33 0.61 0.87 0.29 0.65 0.6 0.41 0.82 0.16 1.34 2.96 2.16 1.95
3.38 9.19 7.4 1.76 4.85 44.9 13.61 4.89 5.06 8.54 4.59 3.63 0.72 0.21 2.93 4.08 7.51 4.85 17.26 7.71
6.58 11.57 7.74 5.45 15.72 17.46 12.01 4.46 2.44 2.82 6.03 4.55 1.26 1.39 5.98 4.93 4.26 14.0 24.19 9.49
17.85 8.63 12.29 21.13 24.07 38.93 14.34 13.89 4.03 4.77 5.96 6.14 6.54 7.47 5.79 5.78 7.91 32.06 26.33 39.5
18.05 66.21 30.07 44.63 142.47 435.14 330.7 90.9 54.35 60.25 83.27 63.64 79.11 91.99 94.39 72.73 85.3 192.88 56.72 116.0
0.24 0.0 0.12 2.84 2.26 1.05 0.06 0.24 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.21 0.16 5.13 1.59 2.59
0.4 0.12 0.28 0.34 0.55 3.04 0.0 0.44 0.03 0.03 0.05 0.25 0.02 0.04 0.27 0.19 0.34 4.89 3.05 3.2
7.48 18.19 9.49 11.58 26.21 36.38 19.75 10.8 4.96 6.49 11.13 13.31 9.89 9.16 11.83 8.06 10.38 22.04 22.29 24.65
0.11 0.24 0.16 0.6 0.31 0.67 0.36 0.18 0.09 0.09 0.07 0.01 0.19 0.21 0.21 0.0 0.07 0.29 0.21 0.25
12.68 22.53 17.12 14.35 17.22 87.4 15.63 4.88 2.23 1.85 3.55 2.9 0.73 0.67 6.36 2.52 4.35 25.99 42.98 24.41
2.62 1.11 2.32 2.12 3.52 3.81 5.69 1.24 0.28 0.27 0.84 0.68 0.41 0.39 1.26 0.91 1.21 3.66 1.92 6.09
7.09 4.93 4.62 7.52 7.45 21.47 4.57 5.89 4.03 4.08 10.3 4.4 3.08 3.05 10.05 4.72 4.0 6.93 12.01 6.72
1.8 0.28 0.99 0.74 0.86 0.71 0.88 0.36 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.07 0.0 0.03 2.94 4.79 0.71
7.78 0.96 2.48 9.86 7.82 16.43 4.4 1.38 0.12 0.16 0.16 0.29 0.04 0.03 0.11 0.65 0.72 10.3 18.62 9.77
0.34 0.32 0.18 0.71 0.91 5.72 0.94 0.52 0.05 0.07 0.1 0.1 1.08 0.24 0.1 0.15 0.56 0.71 0.87 2.01
0.1 0.0 0.06 0.19 0.39 1.81 0.69 0.19 0.06 0.04 0.13 0.05 0.44 0.19 0.12 0.12 0.34 0.17 0.2 0.94
2.21 1.49 2.56 2.97 4.11 7.32 7.51 1.88 0.57 0.6 1.83 1.19 0.31 0.28 2.5 1.32 1.87 5.67 5.33 7.07
3.23 6.76 2.17 5.35 9.92 11.21 7.4 6.16 4.51 3.75 5.49 5.22 5.74 6.28 6.35 5.66 4.57 10.37 7.16 16.28
0.39 0.0 0.0 0.2 0.0 0.24 0.6 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.17 0.0 0.1
0.52 0.32 0.21 0.33 0.5 4.86 0.7 0.44 0.06 0.08 0.05 0.13 0.01 0.01 0.18 0.14 0.42 0.78 0.58 1.26
1.58 0.27 1.26 0.97 2.32 13.75 3.27 0.95 0.65 0.45 0.5 0.33 0.25 0.41 0.42 1.18 1.14 2.94 6.33 3.89
1.03 1.25 1.31 1.26 1.64 3.07 1.43 1.62 0.48 0.39 1.1 2.34 0.54 0.43 1.06 2.26 1.72 4.17 3.07 4.48
2.47 3.46 2.92 1.59 4.43 4.77 2.14 3.12 0.94 0.94 1.33 2.53 0.44 0.55 0.95 3.74 2.98 7.15 4.81 8.27
4.85 3.0 3.36 3.96 3.17 4.16 1.37 1.38 2.11 2.36 1.86 1.25 0.96 0.94 1.57 2.31 2.11 1.85 3.45 0.99
5.21 33.84 8.74 12.24 21.59 39.42 2.14 4.33 2.36 1.77 1.03 2.82 0.53 0.85 0.97 7.58 6.25 40.95 64.75 24.79
1.64 0.98 1.88 0.19 0.71 6.27 0.6 0.14 0.01 0.07 0.14 0.04 0.0 0.02 0.03 0.0 0.03 0.51 4.37 2.87
3.0 0.43 1.11 4.38 4.03 11.93 2.64 1.14 0.18 0.18 0.11 0.27 0.07 0.06 0.14 0.5 0.32 10.96 10.25 15.29
48.87 38.06 43.83 78.1 62.46 120.92 6.92 17.34 5.32 10.13 15.92 15.39 10.94 5.43 19.49 8.67 11.8 58.45 95.08 18.86
7.14 25.4 8.54 36.45 67.48 250.5 3.13 19.73 13.15 13.4 26.66 27.04 5.47 7.35 46.75 40.34 30.98 79.02 154.65 124.47
0.8 2.01 0.58 1.71 3.33 2.78 1.6 1.05 0.77 1.4 1.66 0.68 1.22 0.74 1.62 0.25 0.69 2.62 3.85 3.44
0.71 2.06 0.72 0.23 0.48 4.72 1.78 0.53 0.2 0.15 0.35 0.42 0.34 0.33 0.2 0.13 0.2 2.38 3.82 2.53
18.91 12.98 14.43 22.35 22.01 31.11 5.57 14.03 8.47 7.91 11.69 9.88 8.31 7.36 12.47 8.94 10.76 24.2 22.25 14.78
6.63 5.66 6.49 3.93 4.18 25.5 1.09 2.27 1.44 2.23 1.35 1.31 1.15 1.1 2.49 1.1 1.52 4.23 12.76 8.08
11.65 13.35 12.75 2.19 12.61 30.22 12.07 10.04 7.2 7.44 10.23 10.04 5.94 6.78 8.9 14.86 13.32 20.8 27.3 22.45
0.72 0.53 1.01 0.95 2.19 1.58 1.51 0.26 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.12 0.14 5.65 3.54 2.41
2.4 7.01 1.95 6.93 5.71 3.92 1.43 0.48 0.18 0.07 0.27 0.15 0.07 0.07 0.48 0.15 0.25 3.2 5.94 1.39
0.82 0.25 0.97 4.25 2.09 9.81 2.4 0.41 0.1 0.17 0.07 0.16 0.07 0.12 0.12 0.58 1.01 3.39 2.49 1.96
27.52 14.22 19.44 23.02 26.57 36.13 5.48 13.36 7.41 7.92 16.75 7.8 9.59 8.68 17.88 10.26 12.7 29.12 40.61 24.64
1.55 0.61 1.73 11.19 12.97 125.46 101.33 3.15 1.09 0.76 0.52 0.54 0.21 0.44 0.67 2.61 7.26 29.29 24.1 32.96
2.94 3.9 2.34 2.54 2.48 4.92 0.62 1.77 0.89 0.83 1.8 1.45 1.15 0.79 2.16 0.54 0.8 4.0 5.08 5.38
0.08 0.07 0.09 0.15 0.04 4.08 5.07 0.12 0.13 0.06 0.17 0.04 0.11 0.03 0.26 0.18 0.06 0.12 0.12 0.07
4.12 1.68 2.16 7.24 3.79 14.81 1.44 2.75 1.56 1.44 1.41 1.09 0.6 0.53 0.89 0.62 0.99 30.2 22.46 6.13

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)