Heatmap: Cluster_237 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
73.7 33.33 49.75 39.56 34.49 13.29 16.97 16.12 14.53 14.12 14.27 11.8 17.15 16.76 15.7 17.52 22.24 34.92 26.12 24.61
16.19 7.81 9.8 6.93 7.55 2.95 3.09 2.4 0.58 0.34 0.9 0.75 0.43 0.81 1.3 1.9 1.95 4.99 6.35 1.74
0.5 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.18 0.03 0.01 0.03 0.12 0.02 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.03 0.05 0.07
10.33 3.55 5.97 4.66 8.53 3.04 1.08 0.87 0.5 0.25 0.57 1.04 1.11 0.85 0.58 1.91 0.64 1.65 0.33 3.79
17.5 3.24 9.05 11.89 2.83 1.36 2.37 0.09 0.01 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 6.01 3.94
93.53 20.37 30.9 23.93 15.48 2.37 4.07 1.08 0.28 1.64 0.05 0.56 0.11 0.21 0.0 0.54 1.84 13.39 0.89 7.54
12.93 1.0 0.82 0.29 0.33 1.15 6.58 1.88 1.22 1.19 1.46 2.38 1.98 1.52 0.62 0.17 0.72 2.83 0.07 6.24
231.6 12.98 17.45 89.51 24.93 15.0 3.46 7.47 0.14 0.17 0.12 0.36 0.08 0.56 0.51 1.38 0.75 26.95 22.54 102.98
40.23 107.82 129.45 43.93 15.41 3.76 1.53 5.46 3.42 4.56 7.09 1.25 1.51 0.6 10.94 1.78 5.47 11.2 2.03 74.29
2.74 0.39 0.72 0.57 0.61 0.28 0.0 0.14 0.04 0.04 0.0 0.62 0.02 0.08 0.06 0.0 0.02 0.42 0.18 0.1
10.53 25.79 7.44 13.46 7.8 3.99 0.03 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 4.42 0.01 0.02
8.62 0.41 3.0 0.2 0.14 0.11 0.05 0.17 0.11 0.4 0.02 3.13 0.0 0.02 0.03 0.12 0.08 0.13 0.75 0.1
47.2 21.98 22.5 7.36 9.3 0.84 1.51 0.18 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 2.79 0.05 3.26
3.79 0.61 1.69 1.62 2.29 0.38 1.12 0.36 0.23 0.09 0.12 0.09 0.02 0.0 0.26 0.12 0.15 1.13 0.6 1.62
98.21 54.95 55.98 36.44 32.03 3.24 18.78 1.38 0.52 0.68 0.06 2.76 0.14 0.38 0.02 2.41 0.84 2.06 0.27 8.34
7.59 12.8 21.95 8.36 5.23 0.73 0.02 0.47 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 1.03 0.19 0.58
19.93 6.26 2.43 12.98 4.63 0.28 0.85 0.85 0.13 0.09 0.85 1.48 0.2 0.37 1.06 0.59 0.11 2.81 3.69 15.14
4.74 4.86 9.19 2.12 0.31 0.0 0.73 0.12 0.07 0.45 0.0 0.14 0.0 0.03 0.0 0.29 0.18 0.14 0.0 4.05
1.48 2.97 2.59 0.81 0.06 0.07 0.15 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.13 0.1 0.1
9.8 0.5 1.76 5.26 4.18 0.33 1.66 0.8 0.52 0.25 0.0 0.27 0.33 0.29 0.4 1.31 0.87 1.82 0.6 1.18
44.66 13.03 13.94 12.27 11.79 1.53 0.03 0.66 0.07 0.02 0.0 0.15 0.0 0.11 0.0 0.05 0.14 1.32 0.01 1.88
34.61 0.27 10.98 32.04 20.69 0.02 0.43 1.55 0.04 0.02 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.67 3.35 0.0 0.01
9.97 1.76 2.21 2.1 0.95 0.32 0.11 0.66 1.3 1.17 0.36 0.28 0.53 0.97 0.52 2.63 0.67 1.36 0.77 1.53
10.81 0.68 0.79 0.27 0.45 0.16 0.05 0.44 0.04 0.05 0.04 0.1 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 2.9 0.35 0.38
14.81 16.07 12.4 4.73 3.52 1.67 1.45 1.05 0.84 0.86 1.27 0.47 0.61 0.5 0.67 0.86 0.49 1.16 1.24 0.59
46.7 46.08 31.59 13.85 8.68 3.27 2.85 2.4 1.94 1.53 2.66 1.27 0.54 0.81 2.38 1.76 1.49 3.54 5.13 2.42
6.11 0.97 2.02 2.2 2.07 1.01 0.04 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.1 0.53
26.55 7.91 11.36 11.78 14.87 0.19 0.61 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.45 3.11 9.07
3.75 0.95 0.87 1.31 0.94 0.15 0.42 0.4 0.41 0.16 0.2 0.12 0.18 0.2 0.18 0.43 0.13 0.6 1.11 0.26
10.12 1.42 6.15 1.9 0.54 0.02 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.38 0.36 1.26
0.5 0.16 0.56 0.79 0.16 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
114.72 38.17 74.98 17.17 55.07 7.43 7.41 5.44 3.69 2.66 1.29 3.18 2.72 2.98 0.91 3.11 2.45 22.99 29.01 7.71
6.79 1.29 2.65 2.5 0.77 0.1 0.03 0.42 0.23 0.44 0.11 0.17 0.1 0.05 0.01 0.14 0.22 0.69 0.0 0.04
8.74 2.47 7.07 1.44 1.84 0.0 1.49 0.17 0.23 0.13 0.0 0.13 0.03 0.05 0.2 0.09 0.21 0.32 0.07 0.43
18.9 5.63 11.15 1.35 4.71 0.04 0.0 0.86 1.83 1.5 1.44 1.3 0.31 0.18 1.47 6.54 2.76 0.05 0.0 0.0
37.14 19.86 28.35 9.7 26.44 14.44 4.3 3.49 1.96 1.61 1.8 2.8 2.76 2.69 1.72 6.71 2.94 8.73 2.5 16.32
0.45 0.16 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
4079.48 1017.64 1997.35 1740.29 45.21 33.82 841.77 14.94 0.09 0.06 0.08 0.21 0.08 0.28 0.12 0.04 0.3 16.48 1.59 8.59
2670.97 428.26 493.73 431.64 32.91 185.4 195.23 4.36 0.39 0.3 0.33 0.17 0.04 0.12 0.35 0.43 0.87 3.85 5.79 3.34
96.45 2.65 18.3 29.63 1.05 37.18 4.64 3.44 0.51 0.47 0.1 0.51 0.57 0.74 0.13 2.07 0.14 1.06 0.01 1.46
38.13 9.32 7.31 3.75 2.47 13.75 2.95 1.83 0.27 0.39 0.24 1.86 0.21 0.51 0.18 0.18 0.9 0.5 0.05 8.02
4.67 0.35 0.43 0.06 0.07 0.05 1.25 0.05 0.02 0.05 0.0 0.12 0.0 0.01 0.0 0.1 0.0 0.11 0.04 1.09
269.58 73.98 104.56 37.27 14.58 50.25 1.12 4.27 0.68 1.42 0.05 4.37 0.17 1.03 0.0 0.28 0.82 7.72 0.33 43.48
22.36 3.76 16.35 8.03 2.34 0.15 1.75 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.09 9.03
0.43 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.91 0.26 0.51 0.62 0.06 0.04 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0
0.38 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
12.64 4.69 10.69 1.02 3.17 0.0 0.0 0.79 1.83 1.48 1.43 1.35 0.17 0.08 0.89 7.01 3.29 0.03 0.01 0.01
12.25 4.47 15.63 1.48 2.1 0.0 0.0 0.91 1.76 1.47 2.26 1.54 0.16 0.01 1.5 8.17 4.05 0.03 0.0 0.0
239.45 93.76 119.81 99.71 54.03 5.75 1.2 5.92 0.0 0.09 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 2.78 3.24 81.71 45.65 6.64
6.54 1.1 0.86 1.07 0.16 0.0 0.09 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.31 1.17 0.0
25.5 6.85 9.16 11.1 2.89 0.0 0.84 0.86 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.08 0.49 0.0
2.06 0.0 0.57 0.3 0.1 0.04 0.31 0.07 0.01 0.0 0.0 0.02 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.5 0.05 0.82
7.17 2.94 3.94 4.61 5.06 0.74 0.7 1.41 1.33 1.38 1.51 0.91 0.88 0.96 1.01 1.05 1.65 2.38 2.13 1.76
23.02 10.43 15.45 11.34 3.59 0.05 0.76 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.28 0.17 0.0
194.92 274.81 227.86 88.56 45.13 0.04 0.01 3.7 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 5.07 0.0 0.16
733.49 1410.93 737.94 478.39 173.09 3.8 0.04 12.8 0.28 0.71 0.03 0.01 0.08 0.09 0.04 0.43 0.24 22.87 0.41 0.22
6.03 1.98 2.92 2.63 1.96 1.52 1.0 1.16 1.13 1.24 1.94 0.88 0.88 0.91 1.82 1.21 1.18 1.85 2.27 1.27
1.65 0.0 0.14 0.0 0.0 0.08 0.16 0.12 0.08 0.09 0.22 0.04 0.04 0.02 0.05 0.0 0.0 0.12 0.02 0.33
50.44 26.29 25.05 12.81 15.18 6.68 2.12 13.09 7.1 7.42 18.15 7.93 10.95 8.07 15.03 4.33 4.23 21.86 1.64 9.24
18.23 9.54 4.22 1.14 2.65 1.82 0.07 1.62 1.79 1.92 1.13 1.59 0.59 0.73 1.18 0.98 1.12 1.48 0.05 1.6
0.65 0.05 1.76 0.32 0.05 0.0 0.12 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.09 0.02 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.02
36.65 47.98 25.87 5.66 7.21 0.63 1.81 1.32 6.49 5.14 2.24 0.61 1.12 1.45 1.45 6.15 3.2 3.48 0.14 0.17
11.46 0.34 3.05 0.12 0.12 6.56 1.51 1.03 0.27 0.37 0.0 1.13 0.67 0.52 0.07 0.06 0.48 1.15 0.07 4.89
37.42 21.87 41.61 14.53 5.01 0.13 12.62 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.01
24.39 6.71 15.31 22.11 16.39 4.15 4.69 5.24 5.11 4.48 6.18 3.98 4.1 3.68 6.98 5.99 4.85 11.34 11.66 9.29
2.21 1.82 1.69 1.26 0.12 0.0 0.15 0.09 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.1 0.04
3.09 2.25 2.55 2.48 0.71 0.0 0.17 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.15 0.08
1.39 0.09 0.4 0.69 0.29 0.0 0.02 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.06 0.0
10.35 1.4 3.14 3.33 1.17 0.48 0.78 0.72 0.2 0.24 0.0 1.93 0.0 0.01 0.0 0.03 0.13 0.72 0.03 0.0
1.97 1.04 1.16 0.87 0.1 0.02 0.12 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.02
33.52 4.91 10.26 13.89 15.84 10.01 3.27 2.57 2.22 2.04 1.06 2.44 2.64 2.06 1.04 7.39 1.7 5.21 2.24 9.22
9.26 0.71 1.25 5.29 4.25 1.25 1.24 1.02 1.44 1.03 1.36 0.97 1.4 2.1 1.31 0.73 0.88 2.56 1.0 2.29

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)