Heatmap: Cluster_237 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00326	1.0	0.45	0.68	0.54	0.47	0.18	0.23	0.22	0.2	0.19	0.19	0.16	0.23	0.23	0.21	0.24	0.3	0.47	0.35	0.33
Gb_00327	1.0	0.48	0.6	0.43	0.47	0.18	0.19	0.15	0.04	0.02	0.06	0.05	0.03	0.05	0.08	0.12	0.12	0.31	0.39	0.11
Gb_00811	1.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.36	0.05	0.02	0.07	0.24	0.03	0.0	0.0	0.05	0.1	0.0	0.06	0.1	0.15
Gb_00866	1.0	0.34	0.58	0.45	0.83	0.29	0.1	0.08	0.05	0.02	0.06	0.1	0.11	0.08	0.06	0.18	0.06	0.16	0.03	0.37
Gb_00952	1.0	0.19	0.52	0.68	0.16	0.08	0.14	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.34	0.22
Gb_01504	1.0	0.22	0.33	0.26	0.17	0.03	0.04	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.14	0.01	0.08
Gb_01863	1.0	0.08	0.06	0.02	0.03	0.09	0.51	0.15	0.09	0.09	0.11	0.18	0.15	0.12	0.05	0.01	0.06	0.22	0.01	0.48
Gb_01872	1.0	0.06	0.08	0.39	0.11	0.06	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.12	0.1	0.44
Gb_02245	0.31	0.83	1.0	0.34	0.12	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.05	0.01	0.01	0.0	0.08	0.01	0.04	0.09	0.02	0.57
Gb_02311	1.0	0.14	0.26	0.21	0.22	0.1	0.0	0.05	0.01	0.01	0.0	0.23	0.01	0.03	0.02	0.0	0.01	0.15	0.06	0.04
Gb_03095	0.41	1.0	0.29	0.52	0.3	0.15	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0
Gb_03917	1.0	0.05	0.35	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01
Gb_04301	1.0	0.47	0.48	0.16	0.2	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.07
Gb_05154	1.0	0.16	0.45	0.43	0.6	0.1	0.29	0.1	0.06	0.02	0.03	0.02	0.01	0.0	0.07	0.03	0.04	0.3	0.16	0.43
Gb_06298	1.0	0.56	0.57	0.37	0.33	0.03	0.19	0.01	0.01	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.02	0.0	0.08
Gb_06384	0.35	0.58	1.0	0.38	0.24	0.03	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.01	0.03
Gb_07049	1.0	0.31	0.12	0.65	0.23	0.01	0.04	0.04	0.01	0.0	0.04	0.07	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.14	0.19	0.76
Gb_07369	0.52	0.53	1.0	0.23	0.03	0.0	0.08	0.01	0.01	0.05	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.02	0.0	0.44
Gb_07960	0.5	1.0	0.87	0.27	0.02	0.02	0.05	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.03
Gb_08001	1.0	0.05	0.18	0.54	0.43	0.03	0.17	0.08	0.05	0.03	0.0	0.03	0.03	0.03	0.04	0.13	0.09	0.19	0.06	0.12
Gb_08465	1.0	0.29	0.31	0.27	0.26	0.03	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.04
Gb_09277	1.0	0.01	0.32	0.93	0.6	0.0	0.01	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.1	0.0	0.0
Gb_10602	1.0	0.18	0.22	0.21	0.1	0.03	0.01	0.07	0.13	0.12	0.04	0.03	0.05	0.1	0.05	0.26	0.07	0.14	0.08	0.15
Gb_11225	1.0	0.06	0.07	0.03	0.04	0.01	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.03	0.03
Gb_13058	0.92	1.0	0.77	0.29	0.22	0.1	0.09	0.07	0.05	0.05	0.08	0.03	0.04	0.03	0.04	0.05	0.03	0.07	0.08	0.04
Gb_13059	1.0	0.99	0.68	0.3	0.19	0.07	0.06	0.05	0.04	0.03	0.06	0.03	0.01	0.02	0.05	0.04	0.03	0.08	0.11	0.05
Gb_14478	1.0	0.16	0.33	0.36	0.34	0.16	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.02	0.09
Gb_14503	1.0	0.3	0.43	0.44	0.56	0.01	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.12	0.34
Gb_14835	1.0	0.25	0.23	0.35	0.25	0.04	0.11	0.11	0.11	0.04	0.05	0.03	0.05	0.05	0.05	0.11	0.03	0.16	0.3	0.07
Gb_15674	1.0	0.14	0.61	0.19	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.12
Gb_15778	0.63	0.2	0.72	1.0	0.2	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0
Gb_16374	1.0	0.33	0.65	0.15	0.48	0.06	0.06	0.05	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.2	0.25	0.07
Gb_17074	1.0	0.19	0.39	0.37	0.11	0.01	0.0	0.06	0.03	0.06	0.02	0.02	0.02	0.01	0.0	0.02	0.03	0.1	0.0	0.01
Gb_17150	1.0	0.28	0.81	0.16	0.21	0.0	0.17	0.02	0.03	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05
Gb_17585	1.0	0.3	0.59	0.07	0.25	0.0	0.0	0.05	0.1	0.08	0.08	0.07	0.02	0.01	0.08	0.35	0.15	0.0	0.0	0.0
Gb_18211	1.0	0.53	0.76	0.26	0.71	0.39	0.12	0.09	0.05	0.04	0.05	0.08	0.07	0.07	0.05	0.18	0.08	0.24	0.07	0.44
Gb_19215	1.0	0.36	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0
Gb_21101	1.0	0.25	0.49	0.43	0.01	0.01	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21106	1.0	0.16	0.18	0.16	0.01	0.07	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21603	1.0	0.03	0.19	0.31	0.01	0.39	0.05	0.04	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.02
Gb_23408	1.0	0.24	0.19	0.1	0.06	0.36	0.08	0.05	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.21
Gb_23794	1.0	0.08	0.09	0.01	0.01	0.01	0.27	0.01	0.0	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.01	0.23
Gb_24133	1.0	0.27	0.39	0.14	0.05	0.19	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.16
Gb_24732	1.0	0.17	0.73	0.36	0.1	0.01	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4
Gb_25534	1.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24
Gb_26102	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26419	1.0	0.29	0.56	0.69	0.06	0.04	0.01	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0
Gb_26658	1.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_26788	1.0	0.37	0.85	0.08	0.25	0.0	0.0	0.06	0.14	0.12	0.11	0.11	0.01	0.01	0.07	0.55	0.26	0.0	0.0	0.0
Gb_26789	0.78	0.29	1.0	0.09	0.13	0.0	0.0	0.06	0.11	0.09	0.14	0.1	0.01	0.0	0.1	0.52	0.26	0.0	0.0	0.0
Gb_26899	1.0	0.39	0.5	0.42	0.23	0.02	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.34	0.19	0.03
Gb_26900	1.0	0.17	0.13	0.16	0.02	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.18	0.0
Gb_27839	1.0	0.27	0.36	0.44	0.11	0.0	0.03	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.02	0.0
Gb_28036	1.0	0.0	0.27	0.15	0.05	0.02	0.15	0.03	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.24	0.03	0.4
Gb_28500	1.0	0.41	0.55	0.64	0.71	0.1	0.1	0.2	0.18	0.19	0.21	0.13	0.12	0.13	0.14	0.15	0.23	0.33	0.3	0.25
Gb_29238	1.0	0.45	0.67	0.49	0.16	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.01	0.0
Gb_29591	0.71	1.0	0.83	0.32	0.16	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Gb_29593	0.52	1.0	0.52	0.34	0.12	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Gb_32111	1.0	0.33	0.48	0.44	0.32	0.25	0.17	0.19	0.19	0.21	0.32	0.15	0.15	0.15	0.3	0.2	0.2	0.31	0.38	0.21
Gb_33125	1.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.05	0.09	0.07	0.05	0.06	0.13	0.03	0.02	0.01	0.03	0.0	0.0	0.07	0.01	0.2
Gb_34817	1.0	0.52	0.5	0.25	0.3	0.13	0.04	0.26	0.14	0.15	0.36	0.16	0.22	0.16	0.3	0.09	0.08	0.43	0.03	0.18
Gb_35263	1.0	0.52	0.23	0.06	0.15	0.1	0.0	0.09	0.1	0.11	0.06	0.09	0.03	0.04	0.06	0.05	0.06	0.08	0.0	0.09
Gb_35342	0.37	0.03	1.0	0.18	0.03	0.0	0.07	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.05	0.01	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.01
Gb_36084	0.76	1.0	0.54	0.12	0.15	0.01	0.04	0.03	0.14	0.11	0.05	0.01	0.02	0.03	0.03	0.13	0.07	0.07	0.0	0.0
Gb_36185	1.0	0.03	0.27	0.01	0.01	0.57	0.13	0.09	0.02	0.03	0.0	0.1	0.06	0.05	0.01	0.01	0.04	0.1	0.01	0.43
Gb_36284	0.9	0.53	1.0	0.35	0.12	0.0	0.3	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Gb_36608	1.0	0.28	0.63	0.91	0.67	0.17	0.19	0.21	0.21	0.18	0.25	0.16	0.17	0.15	0.29	0.25	0.2	0.47	0.48	0.38
Gb_38222	1.0	0.82	0.76	0.57	0.06	0.0	0.07	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.04	0.02
Gb_38223	1.0	0.73	0.82	0.8	0.23	0.0	0.05	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.05	0.03
Gb_38270	1.0	0.07	0.28	0.49	0.21	0.0	0.02	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.04	0.0
Gb_38809	1.0	0.14	0.3	0.32	0.11	0.05	0.08	0.07	0.02	0.02	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.07	0.0	0.0
Gb_39502	1.0	0.53	0.59	0.44	0.05	0.01	0.06	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.01
Gb_39747	1.0	0.15	0.31	0.41	0.47	0.3	0.1	0.08	0.07	0.06	0.03	0.07	0.08	0.06	0.03	0.22	0.05	0.16	0.07	0.27
Gb_40113	1.0	0.08	0.14	0.57	0.46	0.14	0.13	0.11	0.15	0.11	0.15	0.1	0.15	0.23	0.14	0.08	0.1	0.28	0.11	0.25

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)