1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_81 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.05 0.0 0.01 0.11 0.06 0.0 0.02 0.09 0.07 0.05 0.12 0.0 0.12 0.11 0.09 0.12 0.06 0.02 0.12 0.05
0.05 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.02 0.09 0.03 0.06 0.12 0.0 0.02 0.01 0.27 0.0 0.06 0.0 0.14 0.1
0.24 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.03 0.2 0.27 0.15 0.15 0.01 0.32 0.19 0.19 1.39 0.23 0.09 0.18 0.14
0.35 0.16 0.15 0.36 0.2 0.05 0.11 0.19 0.15 0.14 0.35 0.01 0.03 0.05 0.32 1.03 0.22 0.1 0.16 0.15
0.43 0.13 0.11 0.26 0.2 0.11 0.15 0.39 0.35 0.35 0.25 0.05 0.51 0.44 0.24 0.64 0.2 0.12 0.58 0.22
1.95 0.51 0.37 1.79 0.78 0.42 0.39 0.61 0.64 0.37 0.7 0.11 0.11 0.03 1.14 0.46 0.19 0.59 1.14 0.82
0.32 0.0 0.0 0.61 0.14 0.0 0.04 0.6 0.52 0.73 0.85 0.13 0.28 0.38 0.94 1.66 0.54 0.28 0.63 0.0
0.03 0.0 0.01 0.09 0.03 0.0 0.01 0.05 0.05 0.03 0.05 0.0 0.07 0.04 0.07 0.09 0.05 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.15 0.23 0.18 0.0 0.03 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0
0.33 0.13 0.01 0.46 0.06 0.03 0.09 0.23 0.12 0.21 0.19 0.01 0.27 0.27 0.16 0.7 0.31 0.05 0.34 0.14
0.09 0.11 0.05 0.16 0.0 0.0 0.07 0.12 0.13 0.05 0.14 0.01 0.04 0.07 0.14 0.61 0.18 0.04 0.26 0.06
0.21 0.04 0.0 0.12 0.08 0.0 0.02 0.07 0.1 0.02 0.21 0.0 0.01 0.03 0.08 0.29 0.16 0.0 0.16 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.11 0.0 0.09 0.01 0.09 0.11 0.09 0.15 0.03 0.0 0.0 0.0
1.39 0.22 0.4 1.94 0.2 0.11 0.47 0.7 0.37 0.4 0.66 0.0 0.15 0.19 0.78 1.45 0.74 0.27 0.79 0.5
1.46 0.59 0.35 1.53 0.72 0.32 0.22 0.94 0.83 0.62 0.5 0.16 0.96 0.95 0.86 1.01 0.48 0.66 2.01 0.54
1.81 0.26 0.83 2.05 0.68 0.05 0.38 0.97 0.94 0.47 0.82 0.11 2.94 2.0 0.84 1.7 0.36 0.55 1.77 0.45
0.12 0.09 0.05 0.09 0.05 0.03 0.0 0.08 0.07 0.11 0.08 0.0 0.28 0.28 0.09 0.24 0.12 0.0 0.13 0.02
0.33 0.08 0.16 0.23 0.16 0.11 0.15 0.15 0.12 0.15 0.07 0.0 0.06 0.07 0.12 0.47 0.22 0.08 0.53 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
1.25 0.39 0.17 1.7 0.17 0.22 0.76 1.37 0.8 0.7 0.69 0.09 0.65 1.44 1.1 2.62 1.62 0.48 2.61 1.29
0.11 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.01 0.04 0.04 0.07 0.12 0.0 0.02 0.01 0.11 0.32 0.13 0.0 0.04 0.01
1.91 0.68 0.46 2.13 0.66 0.2 0.41 0.67 0.75 0.72 0.71 0.07 1.24 0.75 0.7 0.86 0.2 0.87 1.84 0.79
0.11 0.18 0.0 0.27 0.2 0.0 0.2 0.43 0.6 0.59 1.02 0.04 0.12 0.23 1.1 0.87 0.37 0.03 0.16 0.04
0.08 0.14 0.04 1.2 0.0 0.04 0.02 0.07 0.0 0.02 0.03 0.0 0.14 0.03 0.05 0.0 0.0 0.03 0.26 0.03
0.09 0.0 0.02 0.11 0.02 0.0 0.0 0.05 0.04 0.07 0.02 0.01 0.01 0.0 0.04 0.1 0.02 0.06 0.15 0.05
0.24 0.11 0.03 0.24 0.06 0.11 0.06 0.12 0.26 0.14 0.31 0.02 0.31 0.19 0.19 0.56 0.35 0.07 0.28 0.11
0.51 0.0 0.32 0.4 0.07 0.0 0.19 0.63 0.39 0.21 0.36 0.05 1.15 0.83 0.98 1.54 0.58 0.22 0.35 0.43
0.14 0.1 0.09 0.26 0.17 0.03 0.07 0.18 0.15 0.16 0.34 0.02 0.1 0.11 0.34 0.67 0.15 0.1 0.2 0.13
2.17 0.47 0.39 2.45 0.82 0.4 0.3 1.76 1.85 1.79 2.14 0.36 2.5 1.94 2.02 1.44 1.12 0.94 1.35 0.72
0.56 0.05 0.08 0.23 0.03 0.19 0.06 0.33 0.14 0.19 0.42 0.04 0.56 0.27 0.36 0.58 0.13 0.21 0.59 0.15
0.88 0.92 0.47 2.81 0.53 0.2 0.45 0.94 0.46 0.76 0.47 0.11 1.27 1.54 0.87 2.68 0.74 0.69 1.26 0.47
0.21 0.17 0.02 0.28 0.1 0.03 0.01 0.29 0.17 0.14 0.51 0.0 0.1 0.08 0.28 0.74 0.23 0.04 0.41 0.08
0.1 0.0 0.0 0.58 0.02 0.0 0.01 0.04 0.02 0.02 0.01 0.0 0.11 0.06 0.02 0.05 0.08 0.02 0.15 0.0
0.22 0.11 0.12 0.24 0.0 0.0 0.05 0.19 0.18 0.3 0.31 0.0 0.14 0.05 0.41 0.79 0.45 0.07 0.42 0.16
0.41 0.0 0.29 0.61 0.3 0.11 0.19 0.5 0.47 0.78 0.99 0.0 0.57 0.48 1.16 0.71 0.78 0.05 1.06 0.17
0.37 0.15 0.04 0.78 0.04 0.0 0.02 0.16 0.16 0.18 0.13 0.02 0.23 0.16 0.29 0.55 0.25 0.0 0.25 0.03
0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.26 0.36 0.28 0.96 0.14 0.03 0.32 0.34 0.22 0.2 0.64 0.06 0.37 0.3 0.73 0.68 0.39 0.45 0.86 0.74
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.01 0.0 0.02 0.0 0.03 0.01 0.04 0.07 0.08 0.11 0.04 0.04 0.02 0.03 0.04 0.12 0.21 0.01 0.09 0.01
1.37 1.01 0.27 2.05 1.4 1.45 1.22 2.36 3.39 3.49 2.52 0.29 0.17 0.66 3.52 6.62 2.24 1.2 2.7 0.45
0.5 0.43 0.23 0.94 0.6 0.32 0.44 0.97 1.12 1.01 1.48 0.14 0.17 0.32 1.59 2.09 1.11 0.38 1.11 0.28
1.37 0.16 0.22 1.41 0.64 0.0 0.28 0.97 1.01 0.82 1.52 0.04 1.09 0.82 1.14 0.91 1.05 0.33 0.71 0.46
0.58 0.19 0.14 1.25 0.29 0.0 0.21 0.59 0.57 0.49 0.41 0.01 0.52 0.29 0.6 1.39 0.48 0.12 0.94 0.3
0.0 0.0 0.05 0.44 0.0 0.0 0.0 0.1 0.09 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.2 0.18 0.0 0.0 0.19 0.0
0.65 0.47 0.18 0.91 0.26 0.08 0.15 0.53 0.39 0.41 0.87 0.11 0.41 0.26 1.17 1.29 0.37 0.34 0.72 0.3
0.32 0.17 0.19 0.38 0.04 0.0 0.05 0.22 0.17 0.16 0.15 0.02 0.16 0.13 0.21 0.78 0.3 0.22 0.41 0.42
0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.13 0.05 0.07 0.1 0.0 0.16 0.21 0.1 0.08 0.11 0.0 0.07 0.02
0.26 0.1 0.11 0.05 0.02 0.02 0.03 0.18 0.22 0.16 0.43 0.02 0.28 0.22 0.3 0.31 0.22 0.03 0.24 0.28
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.02
0.54 0.14 0.06 0.73 0.06 0.18 0.16 0.36 0.31 0.31 0.31 0.02 0.25 0.23 0.44 1.47 0.53 0.19 0.6 0.34
0.07 0.1 0.05 0.3 0.05 0.04 0.07 0.12 0.09 0.07 0.09 0.03 0.02 0.02 0.28 0.43 0.15 0.08 0.16 0.01
0.55 0.64 0.22 0.74 0.15 0.17 0.22 0.48 0.31 0.27 0.48 0.02 0.21 0.25 0.29 0.87 0.35 0.2 0.97 0.5
0.05 0.08 0.04 0.11 0.0 0.0 0.04 0.1 0.05 0.08 0.17 0.01 0.11 0.09 0.13 0.04 0.13 0.06 0.02 0.0
0.04 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.02 0.03 0.0 0.0 0.03 0.14 0.01
1.05 0.96 0.17 1.71 0.59 0.24 0.16 0.55 0.47 0.6 0.53 0.09 1.02 0.85 0.62 1.35 0.78 0.55 0.71 0.44
2.18 1.57 0.96 3.33 1.61 0.76 1.7 1.92 1.99 2.24 3.71 0.66 1.32 1.04 3.2 5.13 1.57 1.09 3.65 3.98
0.33 0.0 0.05 0.16 0.0 0.06 0.15 0.33 0.21 0.2 1.18 0.03 0.08 0.23 0.82 0.24 0.33 0.0 0.39 0.08
0.26 0.08 0.09 0.14 0.08 0.11 0.08 0.17 0.23 0.24 0.53 0.03 0.11 0.11 0.46 0.32 0.12 0.09 0.23 0.07
0.63 0.27 0.36 1.19 0.0 0.0 0.07 0.3 0.08 0.21 0.24 0.03 0.39 0.09 0.21 0.54 0.3 0.0 0.51 0.34
0.57 0.18 0.16 0.44 0.42 0.23 0.12 0.45 0.7 0.51 0.97 0.09 0.18 0.19 1.1 1.49 0.7 0.33 0.65 0.19
1.17 0.18 0.55 1.78 0.59 0.68 0.24 0.99 0.98 0.67 1.29 0.19 0.57 0.96 2.04 3.88 1.64 0.58 1.0 0.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.01 0.02 0.03 0.0 0.06 0.03 0.03 0.24 0.0 0.0 0.02 0.0
0.02 0.09 0.04 0.13 0.0 0.0 0.02 0.04 0.01 0.0 0.04 0.0 0.09 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.04 0.06
0.02 0.02 0.05 0.06 0.02 0.0 0.01 0.02 0.02 0.04 0.08 0.0 0.0 0.02 0.08 0.04 0.04 0.0 0.01 0.0
0.41 0.21 0.05 0.92 0.0 0.22 0.03 0.25 0.19 0.16 0.14 0.0 0.21 0.27 0.34 0.54 0.54 0.17 0.29 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.02 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.18 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
0.66 0.85 0.21 0.47 0.15 0.32 0.45 0.83 0.6 0.51 0.64 0.11 0.66 0.49 1.04 2.71 0.89 0.3 0.68 0.49
0.26 0.03 0.06 0.74 0.14 0.01 0.0 0.11 0.07 0.07 0.15 0.01 0.06 0.08 0.19 0.18 0.09 0.11 0.09 0.03
0.05 0.0 0.0 0.15 0.05 0.0 0.04 0.04 0.03 0.01 0.17 0.02 0.02 0.02 0.1 0.08 0.0 0.04 0.16 0.02
0.3 0.13 0.03 0.73 0.03 0.09 0.13 0.16 0.12 0.13 0.09 0.03 0.06 0.1 0.09 0.28 0.09 0.07 0.39 0.19
0.88 0.72 0.58 2.01 1.19 0.48 1.22 0.87 1.01 0.61 1.38 0.19 0.29 0.32 1.35 2.06 0.87 0.48 1.73 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.41 0.22 0.09 0.52 0.19 0.07 0.48 0.7 0.72 0.66 1.65 0.07 0.14 0.16 1.65 1.39 0.46 0.38 1.52 0.52
0.44 0.0 0.1 0.32 0.0 0.22 0.35 0.44 0.58 0.45 1.78 0.03 0.61 0.28 1.58 0.36 0.0 0.37 0.35 0.59
0.3 0.3 0.08 0.52 0.0 0.03 0.03 0.14 0.13 0.12 0.21 0.01 0.15 0.11 0.18 0.58 0.14 0.03 0.22 0.13
0.13 0.11 0.02 0.23 0.0 0.0 0.03 0.11 0.04 0.07 0.05 0.01 0.19 0.16 0.06 0.55 0.03 0.0 0.11 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0
0.34 0.26 0.05 0.68 0.12 0.06 0.1 0.1 0.05 0.11 0.04 0.0 0.26 0.18 0.04 0.45 0.12 0.07 0.25 0.06
0.53 0.85 0.28 1.08 0.46 0.0 0.28 0.58 0.65 0.62 0.95 0.1 0.62 0.38 0.81 1.02 0.29 0.35 1.44 0.09
0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.1 0.15 0.12 0.38 0.0 0.18 0.23 0.39 0.2 0.25 0.0 0.06 0.05
0.18 0.0 0.1 0.33 0.32 0.0 0.2 0.12 0.04 0.0 0.0 0.01 0.02 0.06 0.09 0.12 0.0 0.05 0.24 0.04
3.62 0.91 0.84 1.86 2.91 3.4 1.8 3.06 1.75 1.6 1.64 1.1 0.92 1.07 2.61 3.77 2.03 2.43 5.34 2.59
0.7 0.6 0.53 2.14 0.32 0.33 0.16 0.6 0.47 0.69 0.76 0.03 0.87 0.53 0.39 3.2 0.55 0.16 0.72 0.25
0.41 0.16 0.04 0.77 0.51 0.19 0.63 0.46 0.57 0.28 0.7 0.07 0.25 0.23 0.64 1.02 0.45 0.21 0.63 0.56
0.43 0.15 0.02 0.37 0.25 0.0 0.15 0.33 0.44 0.43 0.52 0.04 0.28 0.17 0.62 0.67 0.33 0.1 0.28 0.25
0.02 0.0 0.0 0.05 0.02 0.04 0.02 0.04 0.03 0.04 0.03 0.01 0.09 0.09 0.11 0.07 0.1 0.0 0.04 0.01
0.2 0.0 0.0 0.58 0.12 0.03 0.03 0.1 0.12 0.03 0.02 0.0 0.14 0.07 0.02 0.26 0.15 0.0 0.33 0.04
0.06 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.01 0.07 0.05 0.06 0.09 0.0 0.07 0.05 0.1 0.29 0.13 0.0 0.02 0.02
0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.04 0.01 0.23 0.01 0.01 0.03 0.13 0.16 0.0 0.02 0.08 0.0
0.22 0.0 0.0 0.12 0.08 0.04 0.02 0.07 0.06 0.04 0.07 0.01 0.23 0.04 0.09 0.14 0.0 0.0 0.13 0.13
0.45 0.16 0.24 0.71 0.24 0.18 0.23 0.26 0.33 0.21 0.14 0.02 0.03 0.06 0.32 0.53 0.0 0.14 0.33 0.37
0.0 0.0 0.0 0.11 0.07 0.0 0.11 0.04 0.02 0.02 0.09 0.0 0.01 0.05 0.05 0.18 0.0 0.03 0.17 0.03
1.37 1.18 0.47 1.94 0.66 0.22 0.62 1.33 1.3 1.05 1.47 0.09 1.34 0.97 1.53 2.92 0.93 0.54 2.51 0.55
3.2 3.24 1.27 3.7 0.43 0.13 0.67 1.55 1.13 1.01 2.67 0.24 2.47 1.6 1.84 5.83 1.69 0.29 2.03 2.51
0.49 0.09 0.06 0.31 0.0 0.04 0.05 0.62 0.29 0.21 1.12 0.09 0.08 0.48 1.06 1.34 0.62 0.09 0.41 0.26
0.16 0.23 0.0 0.34 0.08 0.09 0.1 0.31 0.29 0.06 0.76 0.02 0.17 0.18 0.71 0.62 0.45 0.06 0.42 0.16
0.06 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.05 0.02 0.03 0.03 0.01 0.01 0.03 0.08 0.34 0.06 0.0 0.11 0.02
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.0 0.0 0.15 0.0
1.81 2.05 0.61 2.98 0.49 0.52 0.9 1.34 0.91 1.12 0.14 0.12 1.74 0.85 1.06 2.97 1.42 0.44 4.21 3.11
0.58 0.68 0.2 1.27 0.0 0.0 0.2 0.5 0.37 0.09 0.58 0.05 1.21 0.26 0.45 2.06 0.47 0.64 0.47 0.62
0.86 0.23 0.16 0.5 0.5 0.3 0.34 0.46 0.32 0.23 0.83 0.06 0.06 0.04 0.55 0.7 0.27 0.56 1.64 0.48
0.61 0.0 0.0 0.62 0.47 0.09 0.24 0.6 0.76 0.6 1.33 0.09 0.34 0.51 1.9 1.61 0.49 0.15 1.11 1.0
0.23 0.05 0.02 0.68 0.03 0.0 0.06 0.22 0.16 0.27 0.64 0.04 0.25 0.14 0.92 0.53 0.25 0.04 0.29 0.23
0.76 0.0 0.26 0.2 0.2 0.14 0.18 0.28 0.29 0.14 0.3 0.03 0.64 0.63 0.16 1.08 0.13 0.06 0.42 0.21
0.11 0.0 0.05 0.26 0.05 0.0 0.03 0.08 0.04 0.09 0.18 0.01 0.11 0.03 0.02 0.28 0.13 0.0 0.07 0.06
0.86 0.1 0.15 0.84 0.27 0.08 0.15 0.44 0.29 0.27 0.8 0.08 0.33 0.35 0.51 1.32 0.34 0.19 0.58 0.53
3.16 1.87 0.6 1.36 0.46 0.0 0.93 1.91 2.38 2.06 1.75 0.37 3.14 2.28 2.33 3.5 2.49 0.49 3.36 3.59
0.12 0.0 0.0 0.2 0.03 0.0 0.08 0.12 0.1 0.09 0.18 0.0 0.09 0.02 0.11 0.1 0.23 0.0 0.35 0.0
0.01 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.02 0.03 0.02 0.03 0.07 0.0 0.01 0.02 0.15 0.1 0.0 0.0 0.04 0.0
1.03 0.69 0.33 0.5 0.49 0.1 0.3 0.67 0.64 0.14 0.3 0.02 0.8 0.5 1.11 2.78 0.19 0.57 0.45 0.66
0.06 0.0 0.06 0.19 0.0 0.0 0.04 0.11 0.07 0.07 0.0 0.0 0.12 0.02 0.0 0.34 0.21 0.0 0.1 0.0
0.31 0.08 0.22 0.24 0.19 0.05 0.14 0.14 0.13 0.08 0.43 0.01 0.03 0.07 0.2 1.05 0.36 0.17 0.27 0.07
0.09 0.06 0.08 0.42 0.06 0.09 0.09 0.28 0.11 0.18 0.55 0.03 0.12 0.12 0.18 0.56 0.06 0.1 0.23 0.07
0.19 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.07 0.02 0.06 0.13 0.01 0.17 0.08 0.03 0.81 0.15 0.0 0.06 0.0
0.36 0.0 0.0 0.75 0.12 0.44 0.28 0.99 0.65 1.13 0.33 0.09 0.28 0.35 3.19 1.19 0.7 0.42 1.87 0.44
0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.01 0.0
1.33 1.21 0.39 1.64 1.05 0.07 0.4 1.09 0.87 0.86 1.55 0.15 0.78 1.21 1.01 3.51 1.01 0.69 0.95 0.51
9.52 12.96 4.38 8.14 1.54 1.66 2.57 5.98 9.07 2.4 2.81 0.0 20.91 8.26 6.38 30.28 5.06 4.2 4.4 2.72
0.62 0.0 0.08 0.24 0.0 0.0 0.09 0.21 0.19 0.04 0.14 0.0 0.18 0.19 0.28 1.01 0.57 0.07 0.26 0.06
1.11 0.47 0.05 1.02 0.49 0.05 0.45 0.66 0.73 0.95 0.69 0.15 1.05 0.87 0.98 1.08 0.57 0.22 0.8 0.41

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)