Heatmap: Cluster_81 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.39 0.0 0.08 0.92 0.46 0.0 0.18 0.72 0.59 0.37 0.98 0.0 1.0 0.89 0.73 0.98 0.5 0.13 0.94 0.41
0.19 0.0 0.09 0.0 0.19 0.0 0.06 0.33 0.12 0.22 0.46 0.0 0.07 0.04 1.0 0.0 0.23 0.0 0.54 0.39
0.17 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.02 0.15 0.2 0.11 0.11 0.01 0.23 0.14 0.14 1.0 0.16 0.07 0.13 0.1
0.34 0.16 0.14 0.34 0.19 0.04 0.11 0.18 0.14 0.14 0.34 0.01 0.03 0.05 0.31 1.0 0.21 0.09 0.16 0.15
0.68 0.21 0.18 0.41 0.32 0.17 0.23 0.61 0.55 0.55 0.38 0.08 0.8 0.69 0.38 1.0 0.3 0.19 0.9 0.34
1.0 0.26 0.19 0.92 0.4 0.22 0.2 0.31 0.33 0.19 0.36 0.05 0.06 0.02 0.59 0.24 0.1 0.3 0.58 0.42
0.19 0.0 0.0 0.37 0.08 0.0 0.02 0.36 0.31 0.44 0.51 0.08 0.17 0.23 0.56 1.0 0.32 0.17 0.38 0.0
0.37 0.0 0.1 1.0 0.31 0.0 0.06 0.56 0.52 0.36 0.59 0.0 0.84 0.45 0.74 1.0 0.51 0.0 0.53 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.46 0.74 0.55 0.0 0.11 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.47 0.18 0.02 0.66 0.08 0.05 0.12 0.33 0.17 0.3 0.27 0.02 0.39 0.38 0.23 1.0 0.45 0.08 0.49 0.21
0.14 0.17 0.08 0.25 0.0 0.0 0.12 0.2 0.21 0.09 0.22 0.01 0.06 0.12 0.24 1.0 0.29 0.07 0.42 0.1
0.74 0.14 0.0 0.41 0.28 0.0 0.07 0.26 0.35 0.07 0.73 0.02 0.05 0.12 0.29 1.0 0.56 0.0 0.55 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.4 0.74 0.0 0.63 0.04 0.6 0.72 0.58 1.0 0.18 0.0 0.0 0.0
0.72 0.11 0.2 1.0 0.11 0.06 0.24 0.36 0.19 0.2 0.34 0.0 0.08 0.1 0.4 0.75 0.38 0.14 0.41 0.26
0.73 0.29 0.17 0.76 0.36 0.16 0.11 0.47 0.41 0.31 0.25 0.08 0.48 0.47 0.43 0.5 0.24 0.33 1.0 0.27
0.61 0.09 0.28 0.7 0.23 0.02 0.13 0.33 0.32 0.16 0.28 0.04 1.0 0.68 0.29 0.58 0.12 0.19 0.6 0.15
0.42 0.32 0.19 0.31 0.16 0.11 0.0 0.3 0.25 0.38 0.28 0.01 0.99 1.0 0.33 0.86 0.43 0.0 0.46 0.08
0.62 0.15 0.3 0.43 0.29 0.21 0.28 0.29 0.22 0.29 0.13 0.0 0.11 0.12 0.23 0.88 0.41 0.15 1.0 0.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.48 0.15 0.07 0.65 0.07 0.08 0.29 0.52 0.31 0.27 0.26 0.03 0.25 0.55 0.42 1.0 0.62 0.18 1.0 0.49
0.34 0.0 0.0 0.15 0.14 0.0 0.03 0.12 0.13 0.23 0.39 0.0 0.08 0.03 0.35 1.0 0.4 0.0 0.11 0.04
0.9 0.32 0.21 1.0 0.31 0.09 0.19 0.31 0.35 0.34 0.33 0.03 0.58 0.35 0.33 0.41 0.1 0.41 0.86 0.37
0.1 0.17 0.0 0.24 0.18 0.0 0.18 0.39 0.54 0.54 0.93 0.04 0.11 0.21 1.0 0.79 0.34 0.02 0.15 0.04
0.07 0.11 0.03 1.0 0.0 0.03 0.01 0.06 0.0 0.01 0.02 0.0 0.12 0.03 0.04 0.0 0.0 0.02 0.21 0.02
0.57 0.0 0.12 0.73 0.12 0.0 0.0 0.34 0.28 0.44 0.1 0.06 0.04 0.0 0.29 0.63 0.16 0.42 1.0 0.3
0.43 0.2 0.05 0.43 0.1 0.2 0.11 0.22 0.47 0.25 0.55 0.04 0.55 0.33 0.34 1.0 0.62 0.12 0.49 0.2
0.33 0.0 0.21 0.26 0.05 0.0 0.12 0.41 0.25 0.14 0.23 0.03 0.75 0.54 0.64 1.0 0.38 0.15 0.23 0.28
0.2 0.15 0.14 0.39 0.26 0.04 0.11 0.26 0.22 0.23 0.51 0.04 0.15 0.17 0.51 1.0 0.23 0.15 0.31 0.2
0.86 0.19 0.15 0.98 0.33 0.16 0.12 0.7 0.74 0.72 0.85 0.14 1.0 0.77 0.81 0.58 0.45 0.38 0.54 0.29
0.94 0.09 0.13 0.39 0.04 0.32 0.1 0.55 0.24 0.32 0.7 0.06 0.94 0.45 0.61 0.98 0.21 0.36 1.0 0.25
0.31 0.33 0.17 1.0 0.19 0.07 0.16 0.33 0.16 0.27 0.17 0.04 0.45 0.55 0.31 0.95 0.26 0.24 0.45 0.17
0.29 0.22 0.03 0.38 0.13 0.03 0.02 0.4 0.23 0.19 0.7 0.0 0.13 0.11 0.38 1.0 0.31 0.05 0.55 0.11
0.18 0.0 0.0 1.0 0.04 0.0 0.02 0.07 0.03 0.04 0.02 0.0 0.18 0.1 0.03 0.09 0.14 0.04 0.26 0.0
0.27 0.14 0.16 0.3 0.0 0.0 0.06 0.24 0.23 0.37 0.39 0.0 0.18 0.06 0.51 1.0 0.57 0.09 0.52 0.2
0.35 0.0 0.25 0.53 0.26 0.1 0.17 0.44 0.41 0.67 0.86 0.0 0.49 0.41 1.0 0.61 0.68 0.04 0.92 0.14
0.48 0.2 0.05 1.0 0.05 0.0 0.03 0.21 0.2 0.23 0.17 0.02 0.3 0.21 0.38 0.71 0.33 0.0 0.32 0.04
0.12 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.15 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 0.37 0.29 1.0 0.15 0.03 0.34 0.36 0.23 0.21 0.67 0.07 0.39 0.31 0.76 0.71 0.41 0.47 0.9 0.77
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.47 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0
0.03 0.0 0.09 0.0 0.13 0.05 0.18 0.32 0.37 0.56 0.22 0.18 0.11 0.15 0.22 0.58 1.0 0.07 0.46 0.07
0.21 0.15 0.04 0.31 0.21 0.22 0.18 0.36 0.51 0.53 0.38 0.04 0.03 0.1 0.53 1.0 0.34 0.18 0.41 0.07
0.24 0.2 0.11 0.45 0.29 0.15 0.21 0.47 0.54 0.48 0.71 0.07 0.08 0.15 0.76 1.0 0.53 0.18 0.53 0.13
0.9 0.11 0.14 0.93 0.42 0.0 0.18 0.64 0.66 0.54 1.0 0.02 0.72 0.54 0.75 0.6 0.69 0.22 0.46 0.3
0.42 0.14 0.1 0.9 0.21 0.0 0.15 0.42 0.41 0.35 0.3 0.01 0.37 0.21 0.44 1.0 0.34 0.09 0.68 0.22
0.0 0.0 0.11 1.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.19 0.0 0.0 0.0 0.08 0.15 0.45 0.42 0.0 0.0 0.43 0.0
0.5 0.36 0.14 0.71 0.2 0.07 0.12 0.42 0.3 0.32 0.67 0.08 0.32 0.2 0.91 1.0 0.29 0.27 0.56 0.24
0.41 0.22 0.25 0.49 0.06 0.0 0.07 0.28 0.21 0.2 0.19 0.03 0.2 0.17 0.27 1.0 0.38 0.29 0.53 0.54
0.15 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.62 0.25 0.34 0.48 0.0 0.78 1.0 0.51 0.37 0.53 0.0 0.33 0.09
0.61 0.24 0.25 0.12 0.04 0.04 0.06 0.42 0.52 0.37 1.0 0.06 0.66 0.5 0.71 0.72 0.52 0.07 0.56 0.65
0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.32 0.12 0.59 0.2 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 1.0 0.34
0.36 0.09 0.04 0.5 0.04 0.12 0.11 0.25 0.21 0.21 0.21 0.01 0.17 0.16 0.3 1.0 0.36 0.13 0.41 0.23
0.16 0.24 0.11 0.7 0.11 0.09 0.16 0.29 0.2 0.15 0.21 0.06 0.05 0.04 0.65 1.0 0.34 0.2 0.36 0.03
0.56 0.66 0.23 0.76 0.16 0.17 0.22 0.49 0.32 0.27 0.5 0.02 0.21 0.26 0.3 0.9 0.35 0.2 1.0 0.51
0.32 0.47 0.23 0.68 0.0 0.0 0.27 0.58 0.32 0.48 1.0 0.06 0.68 0.54 0.75 0.26 0.75 0.37 0.14 0.0
0.28 0.0 0.0 0.36 0.44 0.0 0.0 0.23 0.03 0.12 0.11 0.0 0.05 0.12 0.19 0.0 0.0 0.2 1.0 0.09
0.62 0.56 0.1 1.0 0.35 0.14 0.09 0.33 0.27 0.35 0.31 0.05 0.6 0.5 0.36 0.79 0.46 0.32 0.42 0.26
0.43 0.3 0.19 0.65 0.31 0.15 0.33 0.37 0.39 0.44 0.72 0.13 0.26 0.2 0.62 1.0 0.31 0.21 0.71 0.78
0.28 0.0 0.05 0.14 0.0 0.05 0.13 0.28 0.18 0.17 1.0 0.02 0.07 0.2 0.7 0.2 0.28 0.0 0.33 0.07
0.49 0.15 0.17 0.27 0.15 0.2 0.15 0.31 0.44 0.45 1.0 0.06 0.21 0.2 0.86 0.61 0.23 0.16 0.43 0.13
0.53 0.23 0.31 1.0 0.0 0.0 0.06 0.25 0.06 0.17 0.2 0.03 0.33 0.08 0.18 0.46 0.26 0.0 0.43 0.29
0.38 0.12 0.11 0.3 0.28 0.16 0.08 0.3 0.47 0.34 0.65 0.06 0.12 0.13 0.73 1.0 0.47 0.22 0.44 0.13
0.3 0.05 0.14 0.46 0.15 0.18 0.06 0.25 0.25 0.17 0.33 0.05 0.15 0.25 0.53 1.0 0.42 0.15 0.26 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.04 0.08 0.14 0.0 0.24 0.11 0.14 1.0 0.0 0.0 0.1 0.0
0.1 0.46 0.23 0.67 0.0 0.0 0.13 0.21 0.07 0.0 0.2 0.0 0.48 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.22 0.34
0.23 0.25 0.55 0.72 0.25 0.0 0.13 0.26 0.28 0.45 0.96 0.0 0.0 0.2 1.0 0.45 0.48 0.0 0.12 0.0
0.45 0.23 0.06 1.0 0.0 0.24 0.03 0.27 0.21 0.17 0.15 0.0 0.22 0.3 0.36 0.58 0.59 0.18 0.32 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.21 0.12 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 1.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0
0.25 0.31 0.08 0.18 0.06 0.12 0.17 0.31 0.22 0.19 0.24 0.04 0.24 0.18 0.39 1.0 0.33 0.11 0.25 0.18
0.35 0.04 0.08 1.0 0.18 0.01 0.01 0.14 0.09 0.09 0.2 0.02 0.08 0.11 0.26 0.24 0.12 0.14 0.12 0.04
0.27 0.0 0.0 0.85 0.29 0.0 0.24 0.25 0.2 0.07 1.0 0.1 0.1 0.1 0.58 0.48 0.0 0.23 0.91 0.12
0.41 0.18 0.04 1.0 0.04 0.12 0.18 0.23 0.16 0.18 0.12 0.04 0.09 0.14 0.13 0.38 0.12 0.09 0.53 0.27
0.43 0.35 0.28 0.98 0.58 0.23 0.59 0.42 0.49 0.3 0.67 0.09 0.14 0.15 0.65 1.0 0.42 0.23 0.84 0.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.08 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.25 0.13 0.05 0.32 0.11 0.04 0.29 0.42 0.44 0.4 1.0 0.04 0.09 0.1 1.0 0.84 0.28 0.23 0.92 0.32
0.25 0.0 0.05 0.18 0.0 0.13 0.2 0.25 0.33 0.25 1.0 0.01 0.34 0.16 0.89 0.2 0.0 0.21 0.2 0.33
0.51 0.51 0.14 0.89 0.0 0.06 0.06 0.24 0.23 0.21 0.36 0.02 0.26 0.19 0.31 1.0 0.24 0.04 0.38 0.23
0.24 0.19 0.04 0.41 0.0 0.0 0.05 0.2 0.07 0.12 0.08 0.01 0.33 0.3 0.11 1.0 0.06 0.0 0.2 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.16 0.75 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.2 0.0
0.49 0.38 0.08 1.0 0.18 0.08 0.14 0.15 0.07 0.16 0.06 0.0 0.38 0.27 0.06 0.66 0.17 0.1 0.36 0.09
0.37 0.59 0.2 0.75 0.32 0.0 0.19 0.4 0.45 0.43 0.66 0.07 0.43 0.26 0.56 0.71 0.2 0.24 1.0 0.06
0.04 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.25 0.39 0.3 0.99 0.0 0.47 0.59 1.0 0.5 0.65 0.0 0.15 0.12
0.54 0.0 0.31 1.0 0.99 0.0 0.63 0.37 0.12 0.0 0.0 0.04 0.07 0.17 0.27 0.37 0.0 0.15 0.74 0.13
0.68 0.17 0.16 0.35 0.54 0.64 0.34 0.57 0.33 0.3 0.31 0.21 0.17 0.2 0.49 0.71 0.38 0.45 1.0 0.49
0.22 0.19 0.17 0.67 0.1 0.1 0.05 0.19 0.15 0.22 0.24 0.01 0.27 0.17 0.12 1.0 0.17 0.05 0.23 0.08
0.41 0.15 0.03 0.76 0.5 0.18 0.62 0.45 0.56 0.28 0.69 0.07 0.24 0.22 0.63 1.0 0.44 0.21 0.62 0.55
0.65 0.23 0.03 0.55 0.37 0.0 0.23 0.49 0.66 0.65 0.77 0.06 0.42 0.26 0.92 1.0 0.49 0.15 0.43 0.37
0.21 0.0 0.0 0.45 0.15 0.32 0.18 0.38 0.29 0.4 0.27 0.07 0.82 0.76 1.0 0.62 0.89 0.0 0.33 0.12
0.34 0.0 0.0 1.0 0.21 0.05 0.06 0.17 0.21 0.05 0.04 0.0 0.24 0.11 0.04 0.45 0.25 0.0 0.56 0.07
0.2 0.0 0.03 0.22 0.0 0.0 0.02 0.24 0.16 0.19 0.32 0.0 0.23 0.16 0.35 1.0 0.46 0.0 0.08 0.06
0.11 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.28 0.19 0.06 1.0 0.06 0.04 0.12 0.56 0.72 0.0 0.09 0.36 0.0
0.94 0.0 0.0 0.5 0.34 0.18 0.09 0.28 0.24 0.17 0.3 0.04 1.0 0.17 0.41 0.62 0.0 0.0 0.55 0.56
0.63 0.23 0.34 1.0 0.34 0.26 0.32 0.36 0.47 0.29 0.2 0.03 0.05 0.08 0.45 0.75 0.0 0.2 0.46 0.53
0.0 0.0 0.0 0.57 0.38 0.0 0.61 0.22 0.12 0.1 0.49 0.0 0.07 0.25 0.26 1.0 0.0 0.16 0.92 0.14
0.47 0.4 0.16 0.67 0.23 0.08 0.21 0.45 0.44 0.36 0.5 0.03 0.46 0.33 0.52 1.0 0.32 0.19 0.86 0.19
0.55 0.56 0.22 0.64 0.07 0.02 0.12 0.27 0.19 0.17 0.46 0.04 0.42 0.27 0.32 1.0 0.29 0.05 0.35 0.43
0.36 0.06 0.04 0.23 0.0 0.03 0.04 0.46 0.22 0.16 0.84 0.07 0.06 0.36 0.79 1.0 0.46 0.07 0.31 0.2
0.21 0.31 0.0 0.45 0.1 0.12 0.13 0.41 0.38 0.08 1.0 0.02 0.22 0.24 0.93 0.81 0.58 0.08 0.55 0.21
0.18 0.0 0.0 0.11 0.0 0.04 0.0 0.13 0.06 0.08 0.1 0.04 0.04 0.08 0.22 1.0 0.18 0.0 0.34 0.06
0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.28 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.33 0.0 0.0 1.0 0.0
0.43 0.49 0.14 0.71 0.12 0.12 0.21 0.32 0.22 0.27 0.03 0.03 0.41 0.2 0.25 0.7 0.34 0.1 1.0 0.74
0.28 0.33 0.1 0.62 0.0 0.0 0.1 0.24 0.18 0.04 0.28 0.03 0.59 0.13 0.22 1.0 0.23 0.31 0.23 0.3
0.52 0.14 0.1 0.3 0.3 0.19 0.21 0.28 0.2 0.14 0.51 0.04 0.04 0.02 0.34 0.43 0.17 0.34 1.0 0.3
0.32 0.0 0.0 0.33 0.25 0.05 0.13 0.32 0.4 0.32 0.7 0.05 0.18 0.27 1.0 0.85 0.26 0.08 0.58 0.52
0.25 0.06 0.03 0.73 0.03 0.0 0.06 0.24 0.17 0.29 0.69 0.05 0.27 0.15 1.0 0.58 0.27 0.05 0.32 0.25
0.7 0.0 0.24 0.19 0.18 0.13 0.17 0.26 0.26 0.13 0.28 0.03 0.59 0.58 0.15 1.0 0.12 0.05 0.38 0.19
0.41 0.0 0.18 0.94 0.19 0.0 0.1 0.3 0.15 0.31 0.63 0.03 0.4 0.1 0.06 1.0 0.47 0.0 0.27 0.21
0.65 0.07 0.12 0.63 0.21 0.06 0.11 0.33 0.22 0.2 0.61 0.06 0.25 0.27 0.39 1.0 0.26 0.15 0.44 0.4
0.88 0.52 0.17 0.38 0.13 0.0 0.26 0.53 0.66 0.57 0.49 0.1 0.87 0.63 0.65 0.97 0.69 0.14 0.94 1.0
0.33 0.0 0.0 0.56 0.1 0.0 0.23 0.35 0.28 0.27 0.51 0.0 0.25 0.05 0.32 0.28 0.67 0.0 1.0 0.0
0.09 0.0 0.0 0.39 0.06 0.0 0.11 0.21 0.11 0.2 0.46 0.0 0.07 0.16 1.0 0.65 0.0 0.0 0.27 0.0
0.37 0.25 0.12 0.18 0.18 0.03 0.11 0.24 0.23 0.05 0.11 0.01 0.29 0.18 0.4 1.0 0.07 0.2 0.16 0.24
0.18 0.0 0.18 0.57 0.0 0.0 0.11 0.33 0.21 0.2 0.0 0.0 0.35 0.07 0.0 1.0 0.63 0.0 0.31 0.0
0.29 0.08 0.21 0.23 0.19 0.05 0.13 0.13 0.12 0.08 0.41 0.01 0.03 0.07 0.19 1.0 0.34 0.16 0.25 0.06
0.16 0.1 0.14 0.74 0.1 0.16 0.16 0.49 0.19 0.31 0.97 0.06 0.22 0.22 0.32 1.0 0.11 0.18 0.41 0.12
0.24 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.09 0.03 0.07 0.16 0.01 0.21 0.1 0.04 1.0 0.19 0.0 0.08 0.0
0.11 0.0 0.0 0.24 0.04 0.14 0.09 0.31 0.2 0.36 0.1 0.03 0.09 0.11 1.0 0.37 0.22 0.13 0.59 0.14
0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.06 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.09 0.0
0.38 0.34 0.11 0.47 0.3 0.02 0.11 0.31 0.25 0.24 0.44 0.04 0.22 0.35 0.29 1.0 0.29 0.2 0.27 0.15
0.31 0.43 0.14 0.27 0.05 0.05 0.08 0.2 0.3 0.08 0.09 0.0 0.69 0.27 0.21 1.0 0.17 0.14 0.15 0.09
0.61 0.0 0.08 0.24 0.0 0.0 0.09 0.21 0.18 0.04 0.14 0.0 0.18 0.19 0.27 1.0 0.57 0.07 0.25 0.06
1.0 0.43 0.04 0.92 0.44 0.05 0.4 0.59 0.66 0.86 0.62 0.13 0.95 0.78 0.89 0.97 0.51 0.2 0.72 0.37

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)