1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_2 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
2.15 3.9 3.68 2.72 2.53 1.27 2.04 6.84 19.45 22.05 17.47 6.82 2.11 2.05 15.1 10.21 7.35 4.95 6.14 2.05
9.1 3.97 3.9 1.43 0.39 0.78 0.59 6.84 11.88 17.08 43.21 11.78 11.66 4.92 34.92 0.21 8.96 0.66 0.79 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.35 0.98 1.04 0.26 0.55 0.39 1.01 0.0 0.75 0.0 0.0 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.18 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.16
4.7 3.55 9.05 4.24 4.39 2.66 2.35 9.64 6.85 10.2 17.18 16.39 8.97 6.43 15.18 2.58 12.9 5.46 9.54 3.51
0.0 0.0 0.0 0.0 4.15 0.0 0.0 5.35 1.78 0.0 7.37 0.0 5.81 2.14 10.16 0.0 0.0 0.0 0.0 1.34
0.11 0.2 0.13 0.19 0.59 0.32 0.0 0.76 0.19 0.31 0.09 0.0 2.84 0.6 0.13 0.0 0.0 0.49 0.0 0.03
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.13 0.16 0.01 0.0 0.0 0.13 0.21 0.02 0.0 0.01 0.0
0.24 0.3 0.1 0.32 0.3 0.06 0.09 0.4 0.13 0.19 0.94 0.01 0.17 0.16 0.69 0.5 0.21 0.13 0.37 0.21
0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.05 0.05 0.04 0.03 0.0 0.06 0.04 0.05 0.05 0.04 0.0 0.03 0.0
238.91 362.89 532.81 37.72 474.68 849.98 1630.33 870.96 284.61 297.22 1040.12 474.3 753.8 751.99 1071.11 182.84 383.06 139.94 37.59 859.97
0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.68 0.65 0.01 0.19 0.0 1.99 1.79 0.38 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.22 0.0 0.03 0.41 0.24 0.22 0.09 0.14 0.06 0.04 0.0 0.0 0.05 0.01 0.05 0.0 0.04 0.09 0.04 0.0
0.23 0.36 0.18 0.0 0.04 0.05 0.12 0.27 0.21 0.11 0.0 0.02 0.2 0.06 0.0 0.33 0.0 0.11 0.55 0.0
0.27 0.16 0.21 0.15 0.21 7.1 0.01 4.79 2.54 4.22 1.77 1.44 4.97 2.48 1.98 0.4 0.59 2.51 1.04 0.09
0.45 0.08 0.02 0.39 0.73 8.64 0.03 32.42 12.58 16.93 8.76 7.83 44.94 22.94 9.76 1.79 2.83 1.19 0.97 0.07
0.08 0.0 0.0 0.16 0.07 0.08 0.09 0.23 0.35 0.51 0.75 0.03 0.38 0.15 0.66 0.11 0.1 0.05 0.02 0.03
0.22 0.24 0.23 0.7 0.11 0.26 0.73 1.1 4.76 4.69 2.99 0.65 0.04 0.08 1.72 4.04 1.37 0.0 0.37 1.2
0.33 0.73 0.55 0.0 0.12 0.27 1.04 0.78 0.41 0.43 0.72 0.77 0.8 0.35 0.09 0.13 0.69 0.29 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.5 0.0 0.0 1.57 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.28 0.0 0.0
0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.18 0.36 0.21 0.02 0.06 0.03 0.18 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.37 0.0 0.04 0.21 0.02 0.0 0.03 0.23 0.22 0.6 0.39 0.05 0.29 0.14 0.53 0.06 0.27 0.06 0.04 0.02
0.05 0.0 0.01 0.07 0.04 0.0 0.01 0.24 0.05 0.26 0.01 0.08 0.05 0.08 0.04 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0
1.1 0.42 0.15 0.31 0.3 15.22 5.67 5.61 2.87 3.52 5.11 9.98 2.21 1.95 4.16 7.01 11.48 3.73 2.62 23.17
6.49 1.78 4.82 11.64 1.75 0.31 0.0 17.83 20.45 7.29 0.63 6.11 5.02 2.39 0.61 1.63 3.24 2.0 3.39 0.0
1.72 2.29 2.15 2.22 2.36 0.66 0.8 1.38 0.44 0.77 0.92 0.27 2.22 0.73 0.76 0.0 0.0 3.47 1.07 0.52
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.05 0.1 0.05 0.0 0.04 0.01 0.12 0.11 0.08 0.15 0.02 0.0 0.08 0.05
1.07 0.09 2.78 5.59 5.36 11.98 0.0 25.22 8.24 8.64 7.74 68.31 13.54 25.02 7.48 2.3 31.27 62.91 6.06 8.08
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 2.2 4.58 0.66 0.0 0.66 0.74 1.21 2.75 0.24 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.27 1.22 1.45 0.24 0.0 0.0 0.19 0.11 1.3 0.42 0.0 0.13 0.0
16.39 52.97 33.52 0.0 12.2 3.02 3.55 17.26 11.5 15.84 11.11 1.43 0.0 0.0 8.06 39.11 1.98 9.25 0.0 81.16
0.4 0.0 0.2 0.41 0.07 0.0 0.03 0.27 0.06 0.07 0.06 0.0 0.5 0.32 0.08 0.1 0.16 0.25 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.36 0.47 0.0 1.38 1.78 3.37 1.32 3.65 1.58 2.1 2.54 1.27 4.24 4.76 1.26 1.2 2.18 1.9 1.59 6.76
3.69 2.52 1.58 2.45 11.18 25.24 11.71 9.5 11.48 11.75 6.34 4.27 7.59 7.73 6.97 9.38 15.02 13.46 9.03 32.71
0.4 0.13 0.12 1.14 1.16 4.95 1.04 2.76 3.35 3.36 1.3 1.26 1.93 2.52 1.47 3.32 3.25 1.14 1.3 9.91
0.11 0.0 1.05 0.0 1.19 0.92 0.28 3.63 0.41 0.0 5.21 0.0 2.19 1.73 7.66 0.0 0.37 0.0 0.05 1.12
0.01 0.05 0.0 0.03 0.21 1.56 0.0 3.02 0.62 0.33 0.44 2.57 13.33 5.16 0.52 0.08 0.33 1.15 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.34 0.35 0.73 1.46 0.55 0.17 0.27 0.35 0.26 0.12 0.0 0.0 0.13 0.18
1.22 0.35 0.87 7.97 12.86 15.63 0.9 9.11 4.9 5.03 0.3 11.58 1.9 2.57 0.36 4.25 5.01 9.58 5.91 19.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.16 0.1 0.09 0.08 0.0 0.17 0.13 0.15 0.09 0.15 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.0 0.04 0.11 0.07 0.04 0.02 0.13 0.01 0.0 0.03 0.01 0.06 0.0 0.0 0.05 0.0 0.11 0.02 0.0
56.29 75.99 177.78 39.4 51.67 71.22 25.11 80.79 26.55 25.24 45.33 49.42 24.88 19.43 41.21 32.58 61.7 51.06 33.78 38.25
0.04 0.24 0.04 0.26 0.11 0.08 0.1 0.17 0.05 0.02 0.04 0.0 0.21 0.03 0.1 0.0 0.05 0.0 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.12 0.05 0.0 0.0 0.0 0.18 0.27 0.53 0.21 0.0 0.0 0.02 0.0
0.11 0.05 0.0 0.12 0.41 0.0 1.2 0.52 0.0 0.0 0.85 0.48 0.0 0.0 0.15 0.48 0.0 0.0 0.05 0.0
0.19 0.23 0.06 0.06 0.1 0.0 0.03 0.19 0.08 0.06 0.1 0.03 0.14 0.12 0.11 0.15 0.07 0.15 0.28 0.02
0.01 0.0 0.0 0.71 0.06 0.0 0.1 1.36 0.31 1.11 1.83 0.0 0.9 0.58 1.85 0.83 0.7 0.77 0.06 0.03
0.51 0.0 0.14 0.41 0.0 0.0 0.16 0.28 0.36 1.06 0.97 0.23 0.24 0.22 1.32 1.06 0.0 0.48 0.31 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.19 1.0 1.08 0.69 0.03 0.09 0.17 1.22 0.12 0.03 0.0 0.01 0.03
1.16 2.47 3.8 0.24 1.43 0.77 1.57 1.29 2.99 3.23 6.46 1.01 0.44 0.53 6.4 3.31 4.32 2.21 0.4 1.33
0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.64 0.63 4.26 0.84 1.46 3.05 1.14 3.06 0.0 0.0 0.51 0.17 0.0
36.55 26.78 25.49 121.36 57.3 12.26 74.35 137.92 65.32 30.09 11.58 9.85 63.44 38.38 13.47 5.81 40.43 46.31 66.6 1.2
19.14 7.18 21.28 13.4 17.01 45.72 5.76 203.95 359.73 367.13 355.17 326.12 186.28 82.53 344.22 5.71 496.39 29.3 67.72 24.52
0.06 0.22 0.06 0.14 0.21 0.1 0.31 0.63 0.16 0.08 0.28 0.55 0.44 0.4 0.36 0.05 0.0 0.68 0.64 1.71
0.38 1.18 0.17 0.0 0.17 0.0 0.12 0.39 1.28 1.62 0.56 0.44 0.25 0.21 0.66 1.17 0.51 0.14 0.16 0.05
0.05 0.0 0.0 0.29 0.0 0.02 0.13 0.17 0.25 0.53 1.09 0.02 0.42 0.12 0.8 0.05 0.04 0.03 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.15 0.07 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
1.96 0.26 1.05 2.04 2.8 0.14 7.33 12.94 7.36 8.27 5.53 2.54 7.39 6.55 4.36 2.16 4.45 2.49 0.91 13.41
1.13 0.41 0.0 0.79 1.14 0.21 4.61 6.69 6.26 7.18 1.56 2.65 6.17 5.15 3.83 1.16 3.3 1.43 0.11 5.99
39.31 16.47 42.61 25.26 24.48 8.72 3.35 23.82 14.28 9.38 13.65 9.92 8.64 8.52 11.45 20.83 16.98 13.19 4.78 3.18
0.14 1.73 0.04 1.1 1.81 0.14 0.15 1.38 0.35 1.96 0.12 1.18 2.26 0.87 0.18 0.0 0.0 0.38 0.21 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.08 0.12 0.06 0.02 0.16 0.13 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0
0.1 0.09 0.0 0.53 0.22 0.2 0.92 1.5 0.86 0.35 0.46 0.51 2.91 2.33 0.72 0.35 0.55 0.47 0.07 0.29
0.0 0.03 0.0 0.05 0.24 0.13 0.03 1.33 0.54 0.38 0.23 1.56 0.53 0.55 0.13 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.05 0.2 0.33 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.0 0.0 0.66 0.14 0.0 0.21 0.18 0.0 0.04 0.13 0.02 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.24 0.09 0.0
1.26 0.49 0.62 2.06 1.91 1.01 0.12 1.72 1.16 0.72 0.27 1.01 0.27 0.71 0.22 1.3 1.25 0.86 0.66 0.53
1.76 0.09 0.38 0.53 1.25 0.09 0.0 0.68 0.14 0.14 0.0 0.17 0.28 0.2 0.11 0.0 0.25 0.11 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.43 0.12 0.0 0.24 0.0 0.06 0.13 0.35 0.15 0.1 0.0 0.05 0.18
0.04 0.0 0.0 0.0 0.46 1.25 0.0 4.25 1.25 0.56 0.3 1.0 16.71 2.98 0.54 0.0 0.2 0.17 0.0 0.0
0.0 0.17 0.0 0.16 0.63 1.41 0.0 3.29 1.02 0.59 0.2 0.75 11.88 1.83 0.18 0.1 0.14 0.26 0.0 0.0
0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.07 0.14 0.13 0.15 0.03 0.14 0.18 0.11 0.08 0.07 0.01 0.03 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.9 1.89 5.53 3.55 0.28 4.8 1.87 0.59 0.25 0.07 0.07 0.75 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.38
0.55 1.69 0.0 0.19 1.28 5.34 0.19 1.94 0.75 1.47 0.24 4.06 0.24 3.91 0.23 0.31 1.8 0.28 0.07 3.03
0.09 0.18 0.05 0.29 0.27 0.0 0.03 3.44 0.04 0.08 0.76 0.0 4.48 3.11 1.72 0.0 0.25 0.05 1.1 0.0
0.04 0.24 0.0 0.69 0.72 0.05 0.46 27.91 8.51 12.86 13.04 5.59 10.63 9.94 7.51 1.05 1.07 4.9 0.15 0.17
0.32 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.38 0.8 0.38 0.36 0.18 0.07 1.4 1.15 0.72 0.0 0.19 0.16 0.25 0.0
0.23 0.0 0.39 0.14 0.13 0.05 0.25 0.06 0.22 0.43 0.52 0.03 0.06 0.07 0.47 0.51 0.15 0.2 0.1 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
86.35 19.51 30.43 28.86 12.22 33.46 5.16 29.85 39.07 38.92 5.96 9.3 28.27 18.38 9.69 16.29 4.51 3.73 0.18 1.74
0.65 3.81 0.0 3.6 2.4 0.6 0.64 3.38 1.05 2.98 1.12 2.98 3.83 1.57 1.39 0.0 0.0 0.45 0.08 2.74
0.21 0.42 0.12 0.17 0.13 0.24 0.22 0.12 0.7 0.41 0.83 0.09 0.08 0.01 0.67 0.39 0.58 0.08 0.22 0.09
0.06 0.1 0.05 0.0 0.09 0.02 0.05 0.07 0.19 0.33 0.28 0.09 0.03 0.04 0.33 0.1 0.2 0.06 0.1 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.55 0.81 1.21 0.02 0.0 0.0 0.46 0.0 0.24 0.0 0.13 0.0
0.87 7.52 2.19 0.0 2.94 1.93 0.78 66.28 9.17 6.02 14.97 43.99 125.24 53.21 17.04 0.0 1.05 1.49 3.06 0.0
0.07 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.18 0.0 0.16 0.21 0.0 0.06 0.03 0.13 0.21 0.2 0.06 0.13 0.0
7.0 2.1 15.08 3.77 5.21 29.17 10.89 20.24 26.4 43.37 40.67 33.87 18.9 13.57 39.71 2.68 37.66 6.97 9.65 29.33
1.85 1.44 7.21 1.9 2.73 10.46 0.61 6.02 8.46 13.78 4.76 25.29 4.03 3.8 3.8 1.16 24.65 1.86 0.34 5.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.06 0.12 0.04 0.04 0.06 0.12 0.12 0.07 0.01 0.06 0.12 0.09 0.27 0.06 0.01 0.16 0.02 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.18 0.08 0.13 0.41 2.52 0.0 1.76 0.66 0.46 0.63 0.28 0.47 0.23 0.5 0.09 0.62 0.99 0.04 0.17
0.04 0.0 0.15 0.18 0.04 1.54 0.0 28.35 11.35 6.55 10.57 4.32 5.98 2.54 8.29 0.7 5.04 0.11 0.01 0.06
113.24 4.27 306.48 12.42 30.75 45.08 4.6 689.77 1070.92 1448.1 1009.1 712.95 634.16 385.72 808.53 13.96 1793.72 70.0 0.72 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.09 0.3 0.32 0.0 0.01 0.14 0.17 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.25 0.0 0.0 0.08 0.02 4.09 2.57 4.71 1.38 2.93 4.47 2.79 1.98 0.0 0.78 0.0 0.44 0.0
0.01 0.11 0.0 0.4 0.11 0.35 0.0 0.44 0.08 0.0 0.17 0.03 0.51 0.21 0.53 0.0 0.0 0.05 0.11 0.0
0.78 0.0 1.52 0.0 1.62 0.0 0.94 3.4 12.17 10.4 13.17 10.13 1.16 0.54 0.0 2.47 2.15 0.0 1.04 1.24
2.02 2.25 0.61 3.0 2.13 5.77 1.5 5.51 1.07 0.3 5.69 0.96 13.64 5.09 5.04 0.87 2.25 5.14 2.17 0.0
2.8 0.0 0.0 1.33 0.0 0.59 2.05 4.94 2.25 0.86 6.11 3.14 7.18 6.4 5.72 4.34 0.07 0.09 1.88 0.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.0 0.14 0.15 0.1 0.0 0.06 0.11 0.06 0.0 0.09 0.0 0.12 0.0 0.04 0.08 0.0 0.0 0.07 0.04
0.07 0.0 0.0 0.11 0.56 0.0 0.0 0.56 3.12 4.94 1.23 0.74 0.75 0.97 1.03 0.44 1.69 0.12 0.36 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.54 0.0 0.0 1.1 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0
11.48 84.61 240.28 0.0 17.49 8.01 53.36 551.57 1523.78 1960.46 637.2 3356.44 1229.94 1438.5 527.65 40.96 916.75 53.67 1338.58 629.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.36 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
18.33 12.89 28.32 16.37 16.97 18.42 1.54 16.95 24.95 25.83 13.47 24.62 14.03 13.99 13.71 21.73 36.56 16.05 2.92 4.8
0.28 0.12 0.11 0.23 0.07 0.4 0.36 1.3 2.24 4.43 6.3 0.46 1.85 0.55 4.62 0.07 0.84 0.11 0.06 0.21
90.08 129.47 105.74 107.4 99.76 82.91 188.69 136.51 88.9 76.73 119.8 87.94 72.1 76.84 127.29 125.47 95.98 81.46 108.71 92.94
0.06 0.04 0.15 0.52 0.13 0.6 2.84 2.1 0.38 0.6 2.31 0.89 3.06 3.23 1.98 0.57 0.66 0.49 0.11 0.37
2.93 1.45 22.45 4.21 4.46 2.68 19.79 29.68 54.51 81.65 45.33 111.85 33.99 23.32 39.75 2.06 57.19 9.67 2.21 5.92
0.02 0.05 0.01 0.02 0.02 0.03 0.02 0.05 0.1 0.07 0.11 0.01 0.12 0.09 0.1 0.09 0.05 0.02 0.04 0.09
6.49 1.78 4.82 11.64 1.75 0.31 0.0 17.83 20.45 7.29 0.63 6.11 5.02 2.39 0.61 1.63 3.24 2.0 3.39 0.0
5.08 3.49 5.88 4.53 0.68 0.61 0.0 12.3 13.93 5.31 0.37 3.35 3.21 1.47 0.24 1.14 1.86 1.21 2.11 0.09

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)