1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_2 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.1 0.18 0.17 0.12 0.11 0.06 0.09 0.31 0.88 1.0 0.79 0.31 0.1 0.09 0.68 0.46 0.33 0.22 0.28 0.09
0.21 0.09 0.09 0.03 0.01 0.02 0.01 0.16 0.28 0.4 1.0 0.27 0.27 0.11 0.81 0.0 0.21 0.02 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.34 0.94 1.0 0.25 0.53 0.38 0.98 0.0 0.73 0.0 0.0 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.65 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.55
0.27 0.21 0.53 0.25 0.26 0.15 0.14 0.56 0.4 0.59 1.0 0.95 0.52 0.37 0.88 0.15 0.75 0.32 0.56 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.53 0.18 0.0 0.73 0.0 0.57 0.21 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13
0.04 0.07 0.04 0.07 0.21 0.11 0.0 0.27 0.07 0.11 0.03 0.0 1.0 0.21 0.05 0.0 0.0 0.17 0.0 0.01
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.23 0.61 0.76 0.03 0.0 0.0 0.61 1.0 0.11 0.0 0.04 0.0
0.26 0.32 0.1 0.34 0.32 0.06 0.1 0.42 0.14 0.21 1.0 0.02 0.18 0.17 0.74 0.53 0.22 0.14 0.39 0.22
0.16 0.14 0.06 0.41 0.0 0.14 0.0 0.83 0.85 0.79 0.61 0.05 1.0 0.64 0.95 0.94 0.8 0.0 0.51 0.0
0.15 0.22 0.33 0.02 0.29 0.52 1.0 0.53 0.17 0.18 0.64 0.29 0.46 0.46 0.66 0.11 0.23 0.09 0.02 0.53
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.33 0.0 0.09 0.0 1.0 0.9 0.19 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.53 0.0 0.06 1.0 0.58 0.54 0.22 0.34 0.15 0.1 0.0 0.0 0.12 0.02 0.12 0.0 0.09 0.22 0.09 0.0
0.42 0.65 0.32 0.0 0.08 0.08 0.22 0.48 0.37 0.2 0.0 0.04 0.36 0.1 0.0 0.59 0.0 0.2 1.0 0.0
0.04 0.02 0.03 0.02 0.03 1.0 0.0 0.67 0.36 0.59 0.25 0.2 0.7 0.35 0.28 0.06 0.08 0.35 0.15 0.01
0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.19 0.0 0.72 0.28 0.38 0.19 0.17 1.0 0.51 0.22 0.04 0.06 0.03 0.02 0.0
0.11 0.0 0.0 0.22 0.09 0.11 0.13 0.31 0.46 0.68 1.0 0.04 0.51 0.21 0.88 0.14 0.13 0.06 0.02 0.04
0.05 0.05 0.05 0.15 0.02 0.05 0.15 0.23 1.0 0.98 0.63 0.14 0.01 0.02 0.36 0.85 0.29 0.0 0.08 0.25
0.32 0.7 0.53 0.0 0.11 0.26 1.0 0.76 0.4 0.42 0.69 0.74 0.77 0.34 0.09 0.13 0.67 0.28 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.32 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0
0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.13 0.13 0.5 1.0 0.57 0.05 0.15 0.07 0.51 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0
0.63 0.0 0.07 0.35 0.04 0.0 0.05 0.39 0.37 1.0 0.65 0.09 0.49 0.23 0.89 0.1 0.46 0.1 0.07 0.03
0.21 0.0 0.04 0.27 0.14 0.0 0.03 0.95 0.21 1.0 0.04 0.31 0.19 0.31 0.15 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0
0.05 0.02 0.01 0.01 0.01 0.66 0.24 0.24 0.12 0.15 0.22 0.43 0.1 0.08 0.18 0.3 0.5 0.16 0.11 1.0
0.32 0.09 0.24 0.57 0.09 0.02 0.0 0.87 1.0 0.36 0.03 0.3 0.25 0.12 0.03 0.08 0.16 0.1 0.17 0.0
0.5 0.66 0.62 0.64 0.68 0.19 0.23 0.4 0.13 0.22 0.26 0.08 0.64 0.21 0.22 0.0 0.0 1.0 0.31 0.15
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.15 0.31 0.7 0.33 0.0 0.25 0.04 0.8 0.72 0.57 1.0 0.14 0.0 0.55 0.35
0.02 0.0 0.04 0.08 0.08 0.18 0.0 0.37 0.12 0.13 0.11 1.0 0.2 0.37 0.11 0.03 0.46 0.92 0.09 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.48 1.0 0.14 0.0 0.14 0.16 0.26 0.6 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.19 0.84 1.0 0.17 0.0 0.0 0.13 0.08 0.9 0.29 0.0 0.09 0.0
0.2 0.65 0.41 0.0 0.15 0.04 0.04 0.21 0.14 0.2 0.14 0.02 0.0 0.0 0.1 0.48 0.02 0.11 0.0 1.0
0.8 0.0 0.4 0.81 0.13 0.0 0.07 0.54 0.12 0.14 0.12 0.0 1.0 0.64 0.16 0.2 0.31 0.5 0.22 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.07 0.0 0.2 0.26 0.5 0.19 0.54 0.23 0.31 0.38 0.19 0.63 0.7 0.19 0.18 0.32 0.28 0.24 1.0
0.11 0.08 0.05 0.07 0.34 0.77 0.36 0.29 0.35 0.36 0.19 0.13 0.23 0.24 0.21 0.29 0.46 0.41 0.28 1.0
0.04 0.01 0.01 0.12 0.12 0.5 0.11 0.28 0.34 0.34 0.13 0.13 0.19 0.25 0.15 0.33 0.33 0.12 0.13 1.0
0.01 0.0 0.14 0.0 0.16 0.12 0.04 0.47 0.05 0.0 0.68 0.0 0.29 0.23 1.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.12 0.0 0.23 0.05 0.02 0.03 0.19 1.0 0.39 0.04 0.01 0.02 0.09 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.23 0.24 0.5 1.0 0.38 0.12 0.18 0.24 0.18 0.08 0.0 0.0 0.09 0.12
0.06 0.02 0.05 0.42 0.68 0.82 0.05 0.48 0.26 0.26 0.02 0.61 0.1 0.14 0.02 0.22 0.26 0.5 0.31 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.92 0.6 0.55 0.47 0.0 1.0 0.73 0.89 0.49 0.87 0.0 0.16 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.14 0.45 0.28 0.17 0.07 0.55 0.04 0.0 0.12 0.03 0.23 0.0 0.0 0.21 0.0 0.46 0.1 0.0
0.32 0.43 1.0 0.22 0.29 0.4 0.14 0.45 0.15 0.14 0.26 0.28 0.14 0.11 0.23 0.18 0.35 0.29 0.19 0.22
0.14 0.93 0.14 1.0 0.42 0.32 0.38 0.64 0.18 0.08 0.14 0.0 0.82 0.11 0.37 0.0 0.2 0.0 0.36 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.22 0.09 0.0 0.0 0.0 0.34 0.51 1.0 0.39 0.0 0.0 0.04 0.0
0.09 0.04 0.0 0.1 0.34 0.0 1.0 0.43 0.0 0.0 0.71 0.4 0.0 0.0 0.12 0.4 0.0 0.0 0.04 0.0
0.69 0.82 0.22 0.23 0.37 0.0 0.1 0.7 0.27 0.2 0.35 0.12 0.5 0.44 0.39 0.55 0.26 0.55 1.0 0.06
0.01 0.0 0.0 0.39 0.03 0.0 0.05 0.74 0.17 0.6 0.99 0.0 0.49 0.32 1.0 0.45 0.38 0.42 0.03 0.02
0.38 0.0 0.1 0.31 0.0 0.0 0.12 0.22 0.27 0.8 0.74 0.17 0.18 0.17 1.0 0.8 0.0 0.37 0.24 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.15 0.82 0.88 0.56 0.02 0.07 0.14 1.0 0.1 0.02 0.0 0.01 0.02
0.18 0.38 0.59 0.04 0.22 0.12 0.24 0.2 0.46 0.5 1.0 0.16 0.07 0.08 0.99 0.51 0.67 0.34 0.06 0.21
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.15 1.0 0.2 0.34 0.72 0.27 0.72 0.0 0.0 0.12 0.04 0.0
0.26 0.19 0.18 0.88 0.42 0.09 0.54 1.0 0.47 0.22 0.08 0.07 0.46 0.28 0.1 0.04 0.29 0.34 0.48 0.01
0.04 0.01 0.04 0.03 0.03 0.09 0.01 0.41 0.72 0.74 0.72 0.66 0.38 0.17 0.69 0.01 1.0 0.06 0.14 0.05
0.03 0.13 0.03 0.08 0.12 0.06 0.18 0.37 0.09 0.05 0.16 0.32 0.26 0.23 0.21 0.03 0.0 0.4 0.38 1.0
0.23 0.72 0.1 0.0 0.11 0.0 0.07 0.24 0.79 1.0 0.34 0.27 0.16 0.13 0.41 0.72 0.31 0.09 0.1 0.03
0.04 0.0 0.0 0.26 0.0 0.02 0.12 0.16 0.23 0.49 1.0 0.02 0.38 0.11 0.73 0.05 0.04 0.03 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.38 1.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0
0.15 0.02 0.08 0.15 0.21 0.01 0.55 0.96 0.55 0.62 0.41 0.19 0.55 0.49 0.32 0.16 0.33 0.19 0.07 1.0
0.16 0.06 0.0 0.11 0.16 0.03 0.64 0.93 0.87 1.0 0.22 0.37 0.86 0.72 0.53 0.16 0.46 0.2 0.02 0.83
0.92 0.39 1.0 0.59 0.57 0.2 0.08 0.56 0.34 0.22 0.32 0.23 0.2 0.2 0.27 0.49 0.4 0.31 0.11 0.07
0.06 0.76 0.02 0.48 0.8 0.06 0.07 0.61 0.15 0.87 0.05 0.52 1.0 0.39 0.08 0.0 0.0 0.17 0.09 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.48 0.49 0.75 0.39 0.1 1.0 0.87 0.0 0.16 0.0 0.0 0.14 0.01
0.04 0.03 0.0 0.18 0.07 0.07 0.32 0.52 0.3 0.12 0.16 0.18 1.0 0.8 0.25 0.12 0.19 0.16 0.02 0.1
0.0 0.02 0.0 0.03 0.15 0.08 0.02 0.85 0.34 0.24 0.15 1.0 0.34 0.35 0.09 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.16 0.6 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.31 0.0 0.0 1.0 0.22 0.0 0.32 0.28 0.0 0.06 0.2 0.03 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.36 0.13 0.0
0.61 0.24 0.3 1.0 0.93 0.49 0.06 0.84 0.56 0.35 0.13 0.49 0.13 0.34 0.1 0.63 0.61 0.42 0.32 0.26
1.0 0.05 0.22 0.3 0.71 0.05 0.0 0.39 0.08 0.08 0.0 0.1 0.16 0.11 0.06 0.0 0.14 0.06 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 1.0 0.28 0.0 0.56 0.0 0.14 0.3 0.8 0.36 0.24 0.0 0.12 0.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.0 0.25 0.07 0.03 0.02 0.06 1.0 0.18 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.01 0.05 0.12 0.0 0.28 0.09 0.05 0.02 0.06 1.0 0.15 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0
0.14 0.31 0.0 0.0 0.0 0.17 0.58 0.39 0.79 0.7 0.86 0.17 0.77 1.0 0.61 0.45 0.39 0.06 0.14 0.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.16 0.34 1.0 0.64 0.05 0.87 0.34 0.11 0.05 0.01 0.01 0.14 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.1 0.32 0.0 0.04 0.24 1.0 0.04 0.36 0.14 0.28 0.05 0.76 0.05 0.73 0.04 0.06 0.34 0.05 0.01 0.57
0.02 0.04 0.01 0.06 0.06 0.0 0.01 0.77 0.01 0.02 0.17 0.0 1.0 0.69 0.38 0.0 0.06 0.01 0.25 0.0
0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.0 0.02 1.0 0.3 0.46 0.47 0.2 0.38 0.36 0.27 0.04 0.04 0.18 0.01 0.01
0.23 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.27 0.57 0.27 0.26 0.13 0.05 1.0 0.82 0.51 0.0 0.14 0.11 0.18 0.0
0.45 0.0 0.75 0.26 0.24 0.1 0.49 0.12 0.43 0.83 1.0 0.06 0.12 0.14 0.91 0.98 0.29 0.38 0.19 0.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.23 0.35 0.33 0.14 0.39 0.06 0.35 0.45 0.45 0.07 0.11 0.33 0.21 0.11 0.19 0.05 0.04 0.0 0.02
0.17 1.0 0.0 0.94 0.63 0.16 0.17 0.88 0.27 0.78 0.29 0.78 1.0 0.41 0.36 0.0 0.0 0.12 0.02 0.72
0.25 0.51 0.14 0.21 0.16 0.29 0.26 0.15 0.84 0.5 1.0 0.1 0.09 0.01 0.81 0.47 0.7 0.09 0.26 0.11
0.19 0.3 0.14 0.0 0.29 0.06 0.16 0.2 0.58 0.99 0.86 0.26 0.09 0.12 1.0 0.29 0.63 0.17 0.29 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.46 0.67 1.0 0.02 0.0 0.0 0.38 0.0 0.2 0.0 0.11 0.0
0.01 0.06 0.02 0.0 0.02 0.02 0.01 0.53 0.07 0.05 0.12 0.35 1.0 0.42 0.14 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0
0.36 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.89 0.0 0.8 1.0 0.0 0.27 0.13 0.63 1.0 0.99 0.31 0.64 0.0
0.16 0.05 0.35 0.09 0.12 0.67 0.25 0.47 0.61 1.0 0.94 0.78 0.44 0.31 0.92 0.06 0.87 0.16 0.22 0.68
0.07 0.06 0.28 0.07 0.11 0.41 0.02 0.24 0.33 0.54 0.19 1.0 0.16 0.15 0.15 0.05 0.97 0.07 0.01 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.45 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.27 0.23 0.45 0.15 0.14 0.2 0.45 0.45 0.25 0.04 0.21 0.44 0.33 1.0 0.23 0.04 0.58 0.07 0.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.07 0.03 0.05 0.16 1.0 0.0 0.7 0.26 0.18 0.25 0.11 0.19 0.09 0.2 0.04 0.25 0.39 0.02 0.07
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 1.0 0.4 0.23 0.37 0.15 0.21 0.09 0.29 0.02 0.18 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.17 0.01 0.02 0.03 0.0 0.38 0.6 0.81 0.56 0.4 0.35 0.22 0.45 0.01 1.0 0.04 0.0 0.0
0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.27 0.94 1.0 0.0 0.02 0.44 0.54 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.87 0.55 1.0 0.29 0.62 0.95 0.59 0.42 0.0 0.16 0.0 0.09 0.0
0.01 0.21 0.0 0.75 0.2 0.66 0.0 0.82 0.16 0.0 0.32 0.05 0.95 0.39 1.0 0.0 0.0 0.09 0.21 0.0
0.06 0.0 0.12 0.0 0.12 0.0 0.07 0.26 0.92 0.79 1.0 0.77 0.09 0.04 0.0 0.19 0.16 0.0 0.08 0.09
0.15 0.17 0.04 0.22 0.16 0.42 0.11 0.4 0.08 0.02 0.42 0.07 1.0 0.37 0.37 0.06 0.17 0.38 0.16 0.0
0.39 0.0 0.0 0.19 0.0 0.08 0.29 0.69 0.31 0.12 0.85 0.44 1.0 0.89 0.8 0.6 0.01 0.01 0.26 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.94 0.0 0.92 1.0 0.65 0.0 0.38 0.69 0.38 0.0 0.6 0.0 0.76 0.0 0.27 0.5 0.0 0.0 0.46 0.26
0.01 0.0 0.0 0.02 0.11 0.0 0.0 0.11 0.63 1.0 0.25 0.15 0.15 0.2 0.21 0.09 0.34 0.03 0.07 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.49 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.07 0.0 0.01 0.0 0.02 0.16 0.45 0.58 0.19 1.0 0.37 0.43 0.16 0.01 0.27 0.02 0.4 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.15 1.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.5 0.35 0.77 0.45 0.46 0.5 0.04 0.46 0.68 0.71 0.37 0.67 0.38 0.38 0.38 0.59 1.0 0.44 0.08 0.13
0.04 0.02 0.02 0.04 0.01 0.06 0.06 0.21 0.36 0.7 1.0 0.07 0.29 0.09 0.73 0.01 0.13 0.02 0.01 0.03
0.48 0.69 0.56 0.57 0.53 0.44 1.0 0.72 0.47 0.41 0.63 0.47 0.38 0.41 0.67 0.66 0.51 0.43 0.58 0.49
0.02 0.01 0.05 0.16 0.04 0.18 0.88 0.65 0.12 0.18 0.71 0.28 0.95 1.0 0.61 0.18 0.2 0.15 0.03 0.12
0.03 0.01 0.2 0.04 0.04 0.02 0.18 0.27 0.49 0.73 0.41 1.0 0.3 0.21 0.36 0.02 0.51 0.09 0.02 0.05
0.2 0.45 0.06 0.16 0.21 0.23 0.19 0.46 0.85 0.57 0.91 0.12 1.0 0.78 0.87 0.79 0.43 0.14 0.31 0.77
0.32 0.09 0.24 0.57 0.09 0.02 0.0 0.87 1.0 0.36 0.03 0.3 0.25 0.12 0.03 0.08 0.16 0.1 0.17 0.0
0.36 0.25 0.42 0.33 0.05 0.04 0.0 0.88 1.0 0.38 0.03 0.24 0.23 0.11 0.02 0.08 0.13 0.09 0.15 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)