Heatmap: Cluster_232 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00076	-0.13	0.75	0.56	-1.41	-0.75	-0.79	-1.99	0.87	0.38	0.01	0.91	-0.66	0.44	0.47	0.94	0.19	-0.98	-0.6	-1.81	-2.13
Gb_00111	0.12	0.0	0.54	-0.0	-0.11	0.34	-1.11	0.22	-0.43	-0.5	0.09	-0.19	0.27	0.13	0.3	0.0	0.42	-0.41	-0.3	-0.3
Gb_00154	0.74	0.25	0.58	0.59	0.49	-0.22	-2.35	0.27	0.48	-0.27	-0.07	-0.89	-0.41	-0.24	-0.18	0.57	-0.36	0.17	-1.33	-1.02
Gb_00387	1.61	0.33	1.06	0.16	0.81	-1.54	-0.7	0.26	0.02	-0.35	-0.2	-0.89	0.39	-0.28	-0.39	-0.12	-1.85	-0.37	-1.42	-2.92
Gb_00652	-0.45	-	-	-	-2.46	1.44	0.45	0.22	-0.37	0.2	1.37	-2.63	1.01	0.25	1.53	0.91	-3.44	-0.78	-1.92	-1.84
Gb_01058	-0.02	0.38	0.53	0.04	0.31	0.01	-0.87	0.23	0.03	-0.31	0.35	0.11	-0.54	-0.51	0.12	0.12	0.25	-0.09	-0.36	-0.69
Gb_01448	1.3	-1.88	1.09	1.24	0.6	-0.62	-1.16	0.46	-1.1	-1.59	-1.27	-0.9	0.76	0.81	-0.8	-1.58	-1.1	-0.12	0.06	-2.04
Gb_01966	0.0	0.12	0.04	0.24	-0.16	0.5	-1.48	0.97	0.14	-0.5	0.04	0.11	0.63	0.5	-0.35	-0.42	-0.83	0.05	-0.53	-1.41
Gb_02077	0.3	-0.87	-0.23	0.34	0.28	0.52	-0.6	0.15	-0.71	-0.85	0.25	-0.09	0.65	0.65	0.43	-0.16	0.06	-0.09	-1.51	-0.54
Gb_03269	0.02	-0.1	0.29	0.53	-0.25	-0.29	-0.27	0.15	-0.28	-0.3	0.55	0.1	0.48	0.52	0.42	-0.45	-0.26	-0.72	-0.62	-0.69
Gb_04225	1.16	-0.04	0.9	0.57	0.27	-1.02	-2.04	0.35	-0.2	-0.41	-0.31	-0.57	0.28	0.22	-0.32	-0.42	-0.21	-0.49	0.0	-0.72
Gb_04264	0.21	-0.68	-1.38	-0.98	1.03	-0.05	-0.77	1.01	0.16	0.43	-0.33	-0.43	-0.44	-0.2	-0.73	-1.45	-0.06	1.1	-0.16	0.21
Gb_04429	0.03	0.66	0.43	-1.45	-0.28	-0.4	-0.81	0.71	-0.09	-0.25	0.76	-0.01	-0.38	-0.32	0.08	0.86	0.45	-0.29	-1.89	-0.91
Gb_04665	0.02	-0.48	0.14	0.71	-0.02	-0.0	-0.23	0.44	-0.13	-0.29	0.54	-0.25	0.33	0.1	0.39	-0.94	-0.38	-0.13	-0.19	-0.73
Gb_06186	0.8	0.5	1.3	0.65	0.45	-0.64	-1.59	0.32	-0.5	-0.21	0.28	-0.75	-0.29	-0.73	0.01	-0.49	-0.48	-0.09	-0.99	-0.84
Gb_06612	-0.38	0.62	0.39	-1.18	-1.81	-0.61	1.17	1.32	0.39	0.7	0.51	0.66	0.64	0.64	0.02	-3.54	-4.58	-8.91	-10.85	-4.26
Gb_06613	0.37	0.52	-0.02	-1.6	-1.44	-0.39	1.19	1.59	0.55	0.72	1.11	1.06	-0.44	-2.63	-0.02	-2.91	-4.25	-5.52	-7.85	-3.77
Gb_06614	0.34	0.25	0.46	-0.77	-1.37	-0.13	1.12	1.3	0.35	0.59	0.34	0.11	0.84	0.65	-0.07	-3.76	-5.88	-9.01	-9.73	-3.24
Gb_06724	0.4	-0.9	0.18	0.94	0.23	0.01	-0.42	0.26	-0.24	-0.44	0.37	-1.34	0.19	-0.01	0.35	-0.67	-1.24	-0.1	0.29	0.1
Gb_06814	-	-	-	-	1.24	-	-	1.59	1.56	0.33	2.05	-	-0.28	0.62	1.97	-	-	-	-	-
Gb_07116	-0.08	1.01	-0.69	-1.41	-0.32	-0.21	-0.73	0.4	0.2	0.17	0.26	-1.44	1.11	0.69	0.25	-0.92	-1.75	-0.16	-0.35	0.2
Gb_07793	0.01	-0.55	-0.08	-0.09	0.1	0.15	0.14	0.22	-0.36	-0.44	0.31	-0.02	0.44	0.22	0.29	-0.6	-0.3	0.03	-0.33	0.29
Gb_08148	0.31	-0.72	0.26	0.6	0.07	0.49	-0.5	0.79	-0.43	-0.43	0.25	-0.24	0.28	-0.27	0.11	-1.24	-0.2	-0.21	0.24	-0.81
Gb_08303	0.21	-1.86	-0.81	1.19	0.19	-2.08	-3.13	1.19	0.53	0.44	-0.55	-0.12	1.35	1.6	-0.73	-1.33	-0.31	-2.94	-	-6.15
Gb_08328	-0.6	0.31	-0.19	-0.28	0.12	0.24	-0.94	0.35	0.21	0.11	0.2	0.22	-0.85	-0.64	0.31	0.9	-0.1	0.36	-0.25	-1.22
Gb_08649	0.1	-0.15	0.28	0.13	0.25	-0.16	-0.23	0.36	-0.32	-0.34	0.36	-0.19	0.21	0.23	0.25	-0.45	-0.1	0.07	-0.38	-0.41
Gb_09295	0.65	-0.19	0.24	0.27	0.01	0.32	-1.2	0.51	0.2	-0.16	-0.3	-0.16	-0.35	-0.55	-0.42	0.61	0.65	0.06	-1.3	-0.91
Gb_09547	0.85	-0.34	0.28	0.97	-0.03	-1.54	-0.64	0.41	-0.37	-0.5	0.22	-0.51	0.84	0.78	0.24	-0.5	-0.79	-0.61	-0.7	-1.47
Gb_09900	-1.31	-0.31	-1.26	-1.34	-0.89	-0.74	-5.64	1.58	0.48	0.64	-2.14	-1.03	2.17	1.19	-3.18	-2.03	-1.4	-0.47	-3.2	0.84
Gb_10029	-0.13	-2.2	-2.07	-0.96	0.21	-0.55	-0.57	1.02	0.46	0.91	0.7	-1.51	-0.12	-0.3	1.58	-0.37	-0.57	-0.27	0.4	-4.47
Gb_10499	-0.51	-0.37	0.03	-0.01	0.06	-0.44	-1.19	0.33	0.12	-0.29	-0.29	-0.58	0.37	0.23	-0.22	0.72	0.57	0.43	-0.15	-0.11
Gb_10611	0.93	-0.66	-0.93	1.62	-0.09	0.25	-	0.57	-1.06	-0.95	0.51	-1.53	1.14	1.15	0.08	-0.05	-0.42	-1.87	-6.59	-
Gb_10614	0.53	-0.39	-0.73	1.05	-0.66	-0.06	-5.09	0.71	-1.03	-0.26	1.08	-1.37	1.17	0.78	0.88	-0.05	-0.35	-1.16	-5.93	-
Gb_10838	1.01	-1.07	-0.79	0.5	-1.84	-1.71	-4.74	1.38	0.39	0.73	0.44	-0.26	1.87	0.84	0.09	-3.25	-3.79	-1.39	-4.12	-6.0
Gb_11510	-0.02	-0.96	-0.26	0.25	-0.02	0.06	-2.49	0.37	0.18	-0.07	0.01	-0.87	1.45	0.87	0.0	-0.94	-0.41	-0.45	-1.31	0.45
Gb_11534	0.88	-0.19	0.14	0.73	0.46	0.24	-0.78	0.13	-0.36	-0.81	-0.82	-0.06	-0.06	-0.04	-0.71	-0.22	0.18	0.22	0.11	-0.66
Gb_11771	0.5	-0.53	0.13	0.59	-0.17	-0.84	-2.04	0.58	-0.35	-0.63	0.87	-0.26	0.5	0.3	0.77	0.29	-0.23	-0.38	-0.97	-1.63
Gb_11825	0.15	-0.85	-0.22	0.1	-0.9	-2.28	-1.25	0.35	0.75	0.44	0.73	-0.16	0.58	0.11	0.61	0.58	0.27	-1.87	-0.47	-0.74
Gb_11880	0.23	-0.8	0.27	-0.3	-0.16	0.33	-0.72	0.26	-0.29	-0.17	0.39	0.41	0.23	0.01	0.37	-0.65	0.19	-0.12	-0.43	0.01
Gb_12164	0.73	0.22	-0.24	1.09	0.79	-4.66	-9.53	1.03	0.28	-0.45	-1.46	0.03	1.14	0.6	-0.77	0.31	-0.04	-1.06	-4.75	-5.43
Gb_12725	0.42	0.79	1.09	0.88	0.04	-0.58	0.35	-0.26	-1.02	-0.87	-0.32	-0.77	0.28	0.2	-0.21	-0.75	-1.0	-0.16	-0.37	-0.43
Gb_13165	0.07	0.19	0.12	-0.49	0.17	-0.84	-0.85	0.6	-0.31	-0.43	0.61	-0.27	1.07	0.68	0.4	-1.2	-1.34	0.05	-0.39	-0.54
Gb_13174	0.61	0.17	0.03	0.32	0.24	0.74	-1.47	0.08	-0.09	-0.18	0.35	-0.2	-0.8	-0.81	0.4	-0.31	-0.52	0.57	-0.51	-0.53
Gb_13450	-0.43	-0.13	0.19	0.16	-0.01	-0.05	-0.8	0.1	-0.12	0.01	0.12	-0.18	0.59	0.39	0.28	0.18	0.13	-0.09	-0.48	-0.63
Gb_13600	0.09	-0.39	-1.35	-0.31	-0.86	-0.57	0.08	1.07	0.15	0.11	0.79	0.07	-0.07	0.03	0.96	-0.27	0.19	-0.15	-1.9	-0.82
Gb_13669	1.15	-0.3	0.49	0.46	0.4	-0.36	-1.52	-0.08	-0.1	-0.74	-0.01	-0.82	-0.58	-0.38	-0.02	-0.95	-0.53	0.37	0.68	0.26
Gb_13671	1.03	-0.94	0.0	0.55	0.2	-0.44	-1.73	0.06	-0.06	-0.58	0.62	-1.07	0.08	-0.15	0.44	-0.88	-0.95	0.18	0.4	0.32
Gb_14329	0.08	0.47	0.53	0.3	-0.27	-1.5	0.21	-0.05	0.08	0.04	0.24	-0.35	0.26	0.24	0.2	-0.08	-0.21	-0.51	-0.27	-0.61
Gb_14711	1.38	-1.16	0.18	0.95	0.15	1.29	-0.5	1.03	-1.19	-1.53	-1.48	-1.78	-0.68	-1.1	-1.71	-1.99	-0.99	1.36	-0.38	-0.59
Gb_14860	-1.13	0.57	-0.2	0.84	0.26	0.07	-1.96	0.82	0.43	-0.61	-1.14	0.67	0.81	0.26	-1.16	-1.01	-0.2	-1.23	-0.18	-0.0
Gb_14865	-1.55	-0.32	-0.52	-0.71	-0.42	0.77	-1.52	0.47	-0.43	-0.47	-0.25	1.4	0.26	0.31	-0.31	-0.37	0.94	-0.62	0.22	-0.6
Gb_15439	-1.72	-2.26	-2.28	0.16	0.89	2.14	-7.12	1.09	-0.93	-0.51	-0.1	0.11	-2.27	-1.5	0.08	0.27	0.5	1.08	-3.4	-3.74
Gb_15451	-0.35	-1.6	-1.65	-1.06	0.47	0.53	-2.52	0.89	0.35	0.52	0.82	-2.7	-0.13	0.12	1.8	0.49	-0.86	0.18	-4.39	-
Gb_16037	-4.56	-	-5.02	-	-	0.97	-3.11	1.77	0.39	-0.41	0.07	1.36	1.69	1.93	-0.36	-1.61	-0.85	-4.34	-	-4.44
Gb_16177	-0.1	-0.23	-0.45	0.01	0.16	0.33	-0.05	0.19	-0.35	-0.47	0.35	-0.44	0.41	0.14	0.29	-0.21	-0.26	0.25	-0.0	-0.09
Gb_16984	0.14	-0.8	-0.59	0.22	0.84	-0.99	-1.39	0.44	-0.42	-0.41	-0.2	-0.47	0.95	0.85	-0.03	-1.11	-0.45	0.6	0.19	-0.32
Gb_17137	-1.67	0.85	-0.99	-1.3	-0.79	-0.74	-3.52	0.35	-0.71	-1.11	0.42	1.56	0.96	0.67	0.39	-0.49	0.8	-0.41	-0.25	-2.46
Gb_17196	0.17	0.62	0.55	0.48	0.43	-0.09	-0.97	-0.01	-0.33	-0.52	0.44	-0.26	-0.39	-0.64	0.4	-0.18	-0.6	0.13	-0.71	0.05
Gb_17312	0.17	-0.25	0.01	-0.43	-0.37	-0.4	-1.41	0.44	0.23	0.45	-0.52	-0.35	1.13	0.8	-0.32	-0.77	-0.31	-0.01	-0.6	0.32
Gb_17790	-0.45	-0.14	-0.31	-0.26	-0.08	-0.75	-0.16	0.57	0.08	-0.34	0.31	-0.73	0.19	-0.23	0.53	0.92	0.35	0.48	-0.58	-1.18
Gb_18589	-0.45	-0.1	-0.28	1.23	0.66	1.66	-0.83	0.89	-0.37	-0.9	-1.7	-0.87	-0.86	-1.15	-1.8	-1.13	-1.16	1.22	-0.39	-0.85
Gb_18841	-3.11	-0.59	-2.71	-2.58	-0.59	-1.09	-0.51	0.9	-0.56	-0.72	0.81	1.67	0.93	0.53	0.63	-1.74	0.92	-1.56	-0.79	-0.04
Gb_19254	0.21	-0.53	-0.0	-0.38	0.21	0.46	-1.25	0.33	-0.02	-0.22	0.45	-0.29	-0.48	-0.34	0.39	-0.02	0.38	0.4	-0.22	-0.21
Gb_19443	0.08	-0.59	0.22	0.11	-0.51	0.28	-0.54	0.78	-1.46	-1.22	0.19	0.54	0.84	0.76	0.06	-1.67	0.23	-0.18	-1.35	0.06
Gb_19498	0.35	0.07	0.42	0.26	0.07	-0.13	-0.75	0.43	-0.06	0.01	0.38	-0.17	-0.34	-0.29	0.37	-0.35	-0.17	-0.07	-0.11	-0.67
Gb_19538	-2.28	2.52	-0.38	1.0	1.4	-1.26	-	1.04	-0.49	0.71	-	0.48	0.14	-2.89	-0.04	-	-	-	-2.05	-
Gb_19804	-0.88	0.54	-0.14	-0.43	0.14	-1.09	-1.82	0.49	0.37	0.17	0.15	0.56	0.54	0.74	-0.15	0.89	0.22	-0.82	-3.4	-1.41
Gb_20059	0.6	0.11	0.69	0.6	0.04	-0.25	-0.33	0.18	-0.63	-1.0	0.04	-0.49	0.21	-0.02	0.02	-0.25	-0.41	0.06	-0.01	-0.31
Gb_20344	-0.29	0.84	0.21	-0.39	0.03	-0.26	-1.26	0.38	-0.11	-0.79	0.45	-0.38	-0.25	0.03	0.18	0.86	0.64	-0.31	-1.32	-0.55
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Gb_24715	0.72	-0.24	0.15	0.15	-0.37	0.01	-0.55	0.35	-0.26	-0.12	-0.92	-0.61	0.52	-0.04	0.19	0.14	0.77	-0.44	-0.31	-0.48
Gb_24716	0.34	-0.73	-1.88	1.1	-0.43	-0.67	-1.46	0.44	-0.39	-0.63	0.5	0.1	0.89	0.15	0.58	-0.47	-0.01	0.11	-0.19	-0.73
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Gb_29016	0.56	-0.76	-0.03	0.42	0.37	0.34	-1.1	0.39	-0.07	-0.41	-0.04	-0.46	-0.34	-0.21	-0.26	0.66	0.57	0.34	-1.43	-0.53
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Gb_30123	1.05	0.6	0.36	0.74	0.78	-2.85	-6.22	0.12	0.03	-0.04	0.1	0.32	0.64	0.11	-0.01	-0.6	-0.38	-0.97	-1.61	-1.75
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Gb_30988	-1.45	-0.23	-0.41	-0.22	-0.52	0.26	-0.3	0.54	0.06	-0.05	0.49	-0.19	-0.01	-0.22	0.58	0.2	0.2	-0.17	-0.45	0.54
Gb_31990	0.94	0.01	0.8	1.3	0.4	-0.33	-1.16	0.04	-1.53	-1.55	-0.55	-0.31	0.35	0.46	-0.75	-1.39	-1.11	0.29	0.16	-0.58
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Gb_35967	0.27	0.54	0.68	0.04	0.17	0.25	-1.0	0.23	-0.14	-0.32	-0.45	-0.38	-1.07	-1.02	-0.5	0.82	0.57	0.08	-0.16	-0.66
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Gb_38382	0.58	0.25	0.31	0.46	0.4	-0.38	-0.88	0.19	-0.04	-0.48	-0.12	-0.52	0.54	0.73	-0.08	-0.15	-0.24	-0.03	-1.04	-1.54
Gb_38536	0.46	-0.29	-0.01	0.74	0.63	0.66	0.45	0.46	-0.83	-1.21	-0.82	-0.33	-0.57	-0.63	-1.06	-0.83	-0.47	0.17	0.66	0.17
Gb_39109	-1.43	-2.72	-6.64	-1.53	-1.55	-0.49	-0.08	0.56	-0.27	-0.87	0.78	-0.71	0.67	0.84	0.91	0.63	-0.01	1.19	0.75	-2.46
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Gb_40394	-0.02	0.13	0.3	0.23	0.31	0.12	-0.79	0.16	-0.02	-0.22	-0.14	-0.39	0.37	0.11	-0.06	0.27	0.28	-0.27	-1.3	-0.01
Gb_40621	-3.0	-4.06	-4.15	-1.2	-1.27	-0.4	-	1.82	0.37	0.58	-2.27	-0.82	2.67	1.9	-2.81	-3.06	-2.62	-1.21	-	-3.31
Gb_41074	-1.62	-1.77	-1.25	-0.98	-0.02	2.47	-4.81	1.62	-0.28	-0.44	1.09	0.24	-0.96	-1.16	0.58	-1.24	-0.62	-1.62	-3.68	-6.23
Gb_41172	0.26	-0.64	-0.15	0.89	0.42	0.34	-1.66	0.11	-0.59	-1.07	0.51	-0.69	0.86	0.81	0.37	-0.82	-0.45	-0.31	-0.53	-0.81
Gb_41211	0.5	-0.28	0.05	0.45	-0.35	-2.47	-0.69	0.14	0.35	0.33	0.42	-0.15	0.71	0.59	0.33	-0.08	-0.33	-1.5	-0.45	-0.54
Gb_41273	-0.42	-0.3	-0.02	0.34	-0.24	0.28	-0.7	0.27	-0.33	-0.37	0.12	0.42	0.93	0.7	0.24	-0.41	-0.12	-0.4	-0.43	-1.23
Gb_41391	-0.55	-1.15	-0.68	-0.48	-0.44	1.08	-0.7	0.67	-0.26	-0.36	0.49	-0.05	0.73	0.49	0.55	-0.5	-0.12	-0.04	-0.48	-0.65
Gb_41700	0.23	-2.27	-3.35	-	-0.44	0.82	-2.22	0.96	0.51	1.43	1.29	-2.4	0.13	0.2	1.52	-0.31	-1.62	-1.76	-0.83	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.