Heatmap: Cluster_1 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00041	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_00077	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_00339	0.0	0.0	0.0	0.06	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	1.0
Gb_00371	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_01677	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_01738	0.04	0.03	0.0	0.04	0.0	0.09	0.12	0.03	0.04	0.06	0.06	0.01	0.04	0.02	0.04	0.07	0.05	0.06	0.01	1.0
Gb_03949	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.96	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_04896	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0
Gb_05137	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_06028	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_07132	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.04	1.0
Gb_08238	0.0	0.05	0.09	0.07	0.0	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.06	0.03	1.0
Gb_09342	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_09751	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0
Gb_10323	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.04	0.0	0.01	0.0	0.01	1.0
Gb_10523	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	1.0
Gb_10597	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10875	0.0	0.05	0.0	0.0	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.2	0.02	0.2	0.07	0.19	0.0	0.03	0.03	0.06	1.0
Gb_12036	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.17	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_13047	0.03	0.0	0.01	0.09	0.0	0.1	0.01	0.05	0.02	0.03	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.06	0.01	0.05	0.05	1.0
Gb_13158	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_15030	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0
Gb_15130	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_16582	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.0	0.0	0.07	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.05	0.86
Gb_16583	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	1.0
Gb_16620	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_17579	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0
Gb_18409	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_18410	0.01	0.08	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	1.0
Gb_18428	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.05	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_19416	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.09	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_20405	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_22186	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.02	0.01	0.07	0.04	0.06	0.28	0.12	0.09	0.22	0.33	0.01	0.01	0.08	0.04	1.0
Gb_22504	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_23444	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0
Gb_24454	0.02	0.09	0.03	0.0	0.0	0.02	0.01	0.09	0.03	0.01	0.0	0.04	0.01	0.01	0.03	0.11	0.08	0.03	0.0	1.0
Gb_25782	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0
Gb_26726	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_27584	0.57	0.56	0.0	0.97	0.62	0.06	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.05	0.0	1.0
Gb_27984	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_28362	0.01	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.03	0.02	0.02	0.02	0.0	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_28422	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_29145	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29470	0.2	0.0	0.01	0.08	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.03	0.04	0.0	0.0	0.13	0.03	1.0
Gb_30208	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_30236	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_30307	0.02	0.02	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.02	0.05	0.02	0.1	0.01	0.0	0.0	0.09	0.02	0.01	0.04	0.0	1.0
Gb_30489	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.04	0.07	0.06	0.02	0.02	0.09	0.05	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0
Gb_30839	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.63	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_31471	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.08	1.0
Gb_32087	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0
Gb_32518	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_32676	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0
Gb_33057	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_33058	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.06	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_33309	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_33837	0.04	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.2	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.12	1.0
Gb_35611	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_36248	0.52	0.23	0.27	0.25	0.22	0.0	0.04	0.02	0.04	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.03	0.0	0.04	1.0
Gb_37315	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_37571	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_37719	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	1.0
Gb_38183	0.11	0.0	0.0	0.03	0.0	0.02	0.12	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.03	0.0	0.04	0.0	0.04	0.0	0.02	1.0
Gb_38757	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_39397	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.08	0.0	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.0	0.01	0.02	0.04	1.0
Gb_39503	0.01	0.0	0.01	0.11	0.08	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.08	0.01	0.08	0.04	0.04	0.01	0.02	0.04	0.0	1.0
Gb_40082	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.01	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_40853	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41034	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_41090	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_41167	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_41622	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41813	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)