1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_178 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.55 0.0 0.0 0.0 0.36 0.46 0.0 0.29 0.05 0.21 0.0 0.34 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 1.36 0.24 2.14
0.69 0.03 0.09 0.29 0.04 0.08 0.0 0.28 0.31 0.41 0.04 0.01 0.15 0.17 0.01 0.42 1.04 0.89 0.89 2.76
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.08 0.83 0.27 0.1 0.05 0.06 0.16 0.15 0.0 0.0 0.15 0.09 0.15 1.0 0.12 0.0 0.12 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.06 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.05 0.02 0.0 0.03 0.1 0.02 0.0 0.03 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.03 0.02 0.02 0.09 0.62
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.13 0.04 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
2.0 0.0 0.39 1.53 1.33 2.22 0.05 1.95 1.36 1.12 2.04 0.67 0.98 1.63 2.42 1.29 0.45 1.08 5.77 13.13
2.8 0.05 0.42 1.1 2.07 1.66 0.03 1.74 1.13 1.21 1.35 0.86 1.27 1.85 1.74 1.27 0.34 1.43 4.54 15.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.94 2.96 2.54 2.74 4.91 6.18 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.67 4.16 2.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.82 0.02 0.0 0.04 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.78
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.04 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.04 0.17 0.14 0.05 0.03 0.02 0.05 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.05
0.18 0.11 0.28 0.0 0.15 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.08 0.1 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.18 0.05 0.0 0.05 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.03 0.03 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.05 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.04
0.84 0.44 0.1 0.0 0.11 0.48 0.05 0.27 0.03 0.0 0.0 0.11 0.83 2.15 0.0 0.0 0.77 0.0 3.13 21.29
0.01 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.23 0.0 0.0 0.04 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.05 0.0 0.1 0.0
0.05 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.0 0.13 0.0 0.0 0.03 0.09 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.3 0.0 0.06 0.7 0.21 0.15 0.05 0.37 0.31 0.27 0.16 0.15 0.51 0.89 0.32 0.07 0.04 0.46 2.63 3.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.46 0.04 0.15 0.94 2.01 0.07 0.63 8.08 9.6 9.72 7.65 4.55 9.99 11.78 4.79 1.84 15.9 1.83 20.35 38.82
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.21 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.03 0.01 0.05 0.0 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
12.65 7.75 9.83 10.77 13.43 13.63 9.32 4.63 2.19 2.18 2.04 2.71 2.0 1.8 2.1 1.4 2.85 3.92 3.43 25.64
0.22 0.0 0.0 1.14 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.44 0.0 0.43 0.0 0.21 0.15 0.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.05 0.01 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.05 0.0 0.04 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 1.82 2.73
0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.15 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.21 9.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.57 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.2 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.03 0.07 0.07 0.0 0.27 0.05 0.0 0.01 0.01 0.0 0.08 0.11 0.05 0.02 0.02 0.05 0.09 0.01
1.26 3.53 1.66 0.93 4.01 0.01 8.11 0.01 0.01 0.01 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.53 2.65
0.0 0.0 0.0 6.91 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.07 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.42 0.05 0.1 0.0 0.07 0.01 0.0 0.03 0.06 0.02 0.06 0.03 0.02 0.01 0.06 0.0 0.01 0.88 0.63 0.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
3.81 0.2 0.69 0.35 0.73 0.32 0.1 0.75 0.79 0.74 0.54 0.44 0.54 0.58 0.4 0.22 0.18 1.91 3.07 5.01
0.11 0.0 0.26 0.43 0.02 0.04 0.08 0.09 0.05 0.02 0.17 0.01 0.03 0.07 0.15 0.08 0.09 0.05 0.43 0.16
0.46 0.0 0.02 0.0 0.06 0.02 0.01 0.09 0.02 0.02 0.02 0.07 0.07 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 8.17
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.08 0.08 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.09 0.03 0.02 0.0 0.06 0.04 0.03 0.0 0.06 0.05 0.1 0.18 0.06
0.0 0.0 0.0 0.62 0.32 0.28 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.05 0.12 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.1 0.0
0.0 0.0 0.08 0.26 0.16 0.0 0.0 0.01 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1
0.22 0.04 0.26 1.0 0.0 0.44 0.61 0.66 0.26 0.41 0.08 0.01 0.72 0.84 0.45 0.4 0.44 0.06 0.91 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82
0.03 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.02 0.09 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.3 0.0 0.06 0.7 0.21 0.15 0.05 0.37 0.31 0.27 0.16 0.15 0.51 0.89 0.32 0.07 0.04 0.46 2.63 3.55
0.96 0.84 1.84 0.2 0.91 0.0 3.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 7.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.14 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.06 0.0 0.0 0.05 0.02 0.1 0.0 0.0 0.0 0.45 0.04
0.02 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.01 0.02 0.02 0.04 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.06 0.0 0.01 0.04 0.02
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.04 0.04
0.21 0.0 0.0 0.22 0.05 0.01 0.3 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.24 3.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)