Heatmap: Cluster_178 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00014	0.26	0.0	0.0	0.0	0.17	0.21	0.0	0.13	0.02	0.1	0.0	0.16	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.64	0.11	1.0
Gb_00186	0.25	0.01	0.03	0.11	0.02	0.03	0.0	0.1	0.11	0.15	0.01	0.0	0.05	0.06	0.0	0.15	0.38	0.32	0.32	1.0
Gb_00283	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_00699	0.04	0.0	0.08	0.83	0.27	0.1	0.05	0.06	0.16	0.15	0.0	0.0	0.15	0.09	0.15	1.0	0.12	0.0	0.12	0.0
Gb_00807	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.17	0.02	0.01	0.02	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03
Gb_01324	0.09	0.04	0.0	0.05	0.16	0.04	0.0	0.05	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.05	0.04	0.04	0.14	1.0
Gb_01823	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.56	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_01904	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02360	0.0	0.0	0.0	1.0	0.31	0.39	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0
Gb_02933	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04280	0.15	0.0	0.03	0.12	0.1	0.17	0.0	0.15	0.1	0.09	0.16	0.05	0.07	0.12	0.18	0.1	0.03	0.08	0.44	1.0
Gb_04286	0.18	0.0	0.03	0.07	0.13	0.11	0.0	0.11	0.07	0.08	0.09	0.06	0.08	0.12	0.11	0.08	0.02	0.09	0.29	1.0
Gb_04691	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_05036	0.15	0.48	0.41	0.44	0.8	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.11	0.67	0.41
Gb_05394	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	1.0	0.03	0.0	0.05	0.0	0.02	0.04	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.01	0.96
Gb_05483	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.2	0.0
Gb_05967	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_06040	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Gb_06633	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.14	0.57	0.48	0.16	0.09	0.06	0.18	0.0	0.0	0.71	0.0	0.0	0.16
Gb_07236	0.48	0.28	0.73	0.0	0.38	0.0	0.07	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.21	0.26	1.0
Gb_07252	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_07492	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07711	0.65	1.0	0.28	0.0	0.3	0.0	0.04	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.16	0.0
Gb_07735	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.07	0.07	0.04	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.13	0.0
Gb_07808	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51
Gb_08234	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.59	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.93	0.0	0.0
Gb_09512	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0
Gb_09575	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09686	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.34	0.0	0.0	0.0	0.19	0.09	1.0	0.0	0.0	0.0	0.51	0.0
Gb_09910	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10322	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.69	0.16	0.77	0.0	0.0	0.0	0.0	0.95	0.0	0.0	0.0	0.0	0.72	0.77
Gb_10325	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10583	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.09
Gb_10685	0.04	0.02	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.1	0.0	0.0	0.04	0.0	0.15	1.0
Gb_10706	0.04	0.0	0.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.09	0.07	0.1	0.0	0.0	0.07	0.03	0.07	1.0	0.0	0.0	0.17	0.39
Gb_10733	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.07	0.52	0.0	0.45	0.0	1.0	0.0
Gb_11271	0.59	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_11452	0.22	0.0	0.27	0.0	0.0	0.07	0.18	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_11844	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0
Gb_12366	0.08	0.0	0.02	0.2	0.06	0.04	0.01	0.11	0.09	0.08	0.04	0.04	0.14	0.25	0.09	0.02	0.01	0.13	0.74	1.0
Gb_12378	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0	0.91	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_14047	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.29	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0
Gb_14886	0.01	0.0	0.0	0.02	0.05	0.0	0.02	0.21	0.25	0.25	0.2	0.12	0.26	0.3	0.12	0.05	0.41	0.05	0.52	1.0
Gb_15655	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.09	0.1	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15701	0.16	0.0	0.15	0.5	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.14	0.0	0.06	0.06	0.13	1.0	0.0	0.0	0.32	0.68
Gb_15856	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16119	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16230	0.0	0.5	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.07	0.0	0.0	0.03	0.09	0.0	0.07	0.03	0.11	0.0	0.26	0.0
Gb_16237	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16584	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01
Gb_17190	0.49	0.3	0.38	0.42	0.52	0.53	0.36	0.18	0.09	0.09	0.08	0.11	0.08	0.07	0.08	0.05	0.11	0.15	0.13	1.0
Gb_17402	0.19	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.39	0.0	0.37	0.0	0.19	0.13	0.46
Gb_18039	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18367	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_18709	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19474	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_19564	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19737	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.51	0.0	0.0	0.41	0.08	0.36	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0
Gb_20205	0.18	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.07	0.27	0.26	0.0	0.34	0.78	0.0	0.62	0.62
Gb_20601	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21069	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.67	1.0
Gb_21117	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.68	0.07	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21643	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23848	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.22	0.0	0.29	0.0	0.0	0.33	0.25	0.19	0.0	0.0	0.41	0.0
Gb_23939	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0
Gb_24372	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24450	0.0	0.0	0.06	1.0	0.09	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.04	0.01	0.0	0.0	0.35	0.0
Gb_24797	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24966	0.14	0.0	0.1	0.24	0.25	0.0	1.0	0.19	0.01	0.03	0.05	0.0	0.28	0.4	0.19	0.06	0.06	0.17	0.33	0.04
Gb_25441	0.16	0.44	0.2	0.11	0.49	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.33
Gb_26031	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26236	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.14	1.0	0.0	0.0	0.2	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_27298	0.48	0.05	0.11	0.0	0.08	0.01	0.0	0.04	0.07	0.02	0.07	0.03	0.02	0.01	0.07	0.0	0.01	0.98	0.71	1.0
Gb_27501	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28150	0.76	0.04	0.14	0.07	0.15	0.06	0.02	0.15	0.16	0.15	0.11	0.09	0.11	0.12	0.08	0.04	0.04	0.38	0.61	1.0
Gb_28218	0.26	0.0	0.6	1.0	0.04	0.09	0.19	0.2	0.13	0.04	0.41	0.02	0.07	0.15	0.34	0.19	0.2	0.11	1.0	0.38
Gb_29129	0.06	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_29587	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.19	0.55	0.58	0.0	0.1	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.6
Gb_30029	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30358	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30485	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30728	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32734	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.06	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_33025	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.13	0.51	0.19	0.12	0.0	0.33	0.25	0.15	0.0	0.33	0.29	0.58	1.0	0.34
Gb_33334	0.0	0.0	0.0	1.0	0.52	0.46	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.7	0.5
Gb_33588	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.07	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.22	0.0
Gb_33698	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33911	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.42	0.0	0.0	0.16	0.38	0.72	0.63	0.0	0.45	0.0
Gb_34189	0.0	0.0	0.44	1.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0	0.0	0.76	0.0
Gb_34893	0.0	0.0	0.31	1.0	0.61	0.0	0.0	0.05	0.11	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.29
Gb_35551	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_35621	0.22	0.04	0.26	1.0	0.0	0.44	0.61	0.66	0.26	0.41	0.08	0.01	0.72	0.84	0.45	0.4	0.44	0.06	0.91	0.19
Gb_35903	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36144	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_36693	0.32	0.0	0.77	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.25	0.19	1.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.57
Gb_36854	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_36919	0.08	0.0	0.02	0.2	0.06	0.04	0.01	0.11	0.09	0.08	0.04	0.04	0.14	0.25	0.09	0.02	0.01	0.13	0.74	1.0
Gb_37467	0.13	0.11	0.25	0.03	0.12	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_37606	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Gb_37821	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.05	0.18	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.06	1.0
Gb_38373	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.09	0.14	0.0	0.0	0.12	0.04	0.21	0.0	0.0	0.0	1.0	0.1
Gb_39912	0.31	0.0	0.0	1.0	0.17	0.0	0.18	0.22	0.25	0.53	0.15	0.0	0.12	0.22	0.0	0.81	0.0	0.14	0.5	0.25
Gb_40052	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.31	0.29
Gb_40427	0.06	0.0	0.0	0.07	0.02	0.0	0.09	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.07	1.0
Gb_40716	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41089	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_41144	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41156	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.19	0.0	0.0	0.08	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.53

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)