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Heatmap: Cluster_46 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
-0.91 0.8 0.9 0.71 0.88 -2.1 -2.5 -0.83 -0.41 0.19 -1.09 0.1 -3.99 -3.19 -1.12 1.07 0.44 1.47 0.13 -4.66
0.17 -0.48 -0.44 0.1 0.09 0.14 -2.04 -0.17 0.03 -0.06 0.5 -0.08 0.12 0.06 0.58 0.23 0.23 0.22 -0.57 -0.17
0.88 -0.02 0.4 0.89 0.97 -1.3 -0.48 -0.57 0.01 -0.29 -0.64 -0.79 -0.13 -0.36 -0.68 1.03 -0.26 0.03 -0.45 -1.93
0.66 0.1 1.02 0.15 0.47 -0.31 -1.33 0.04 -0.26 -0.38 -0.35 0.0 0.18 0.07 -0.43 0.12 0.52 -0.23 -1.28 -1.01
-0.09 -0.08 0.43 0.03 0.47 -0.08 -1.72 -0.25 0.17 0.03 -0.32 -0.31 -0.52 -0.69 -0.32 1.23 0.81 0.51 -1.15 -1.24
-0.31 -0.26 0.03 0.17 0.26 0.43 -0.3 -0.15 0.16 0.04 0.09 -0.21 -0.4 -0.47 -0.07 -0.12 0.23 0.23 0.16 0.07
0.03 1.13 0.31 1.67 0.87 - - 0.36 -1.73 -0.25 -0.07 0.58 -0.51 0.49 -2.26 0.75 -0.54 -0.63 -1.55 -
0.1 0.51 0.5 0.5 -0.51 -0.96 -2.53 -0.09 0.29 -0.15 -0.16 0.03 -0.51 -0.02 -0.03 1.19 0.23 0.55 -1.01 -2.18
0.7 -1.12 -0.57 -0.81 -0.29 -3.88 -1.24 -0.58 0.59 -0.17 1.29 -1.12 -2.4 -1.68 0.63 1.58 1.46 -0.03 -3.38 -0.93
1.3 -0.2 1.02 -0.14 0.91 -3.97 -1.47 -0.72 0.18 -0.33 -0.64 -0.74 -0.04 -0.41 -1.03 0.62 -0.7 0.65 -0.43 -0.06
0.39 0.25 0.29 0.64 0.25 0.08 -2.44 0.06 0.01 -0.0 0.34 -0.12 0.69 0.27 0.17 -0.25 -0.96 0.46 -2.6 -2.18
0.2 0.45 0.37 0.17 -0.06 0.03 -1.68 -0.14 -0.01 -0.12 -0.53 -0.3 -0.28 -0.06 -0.72 0.54 0.28 0.65 -0.19 -0.08
0.59 -0.07 -0.42 0.93 0.83 -1.02 -4.35 -0.02 0.22 -0.18 0.14 -0.64 0.34 0.14 0.03 0.04 -0.74 0.84 -1.84 -0.52
-0.4 -0.96 -1.0 -0.27 0.19 -0.51 -0.6 -0.03 0.07 0.31 0.56 -0.31 -0.43 -0.53 0.63 0.34 0.61 0.23 -0.19 0.59
-0.71 0.24 0.53 -0.35 0.29 0.2 -0.35 0.24 0.12 0.24 -0.05 0.64 -0.2 -0.95 -0.44 0.29 0.21 0.39 -0.91 -0.93
0.36 0.24 0.63 -0.17 0.46 0.03 -1.83 -0.13 0.14 0.12 -0.32 0.47 -0.28 -0.26 -0.51 0.32 0.71 -0.1 -1.32 -0.82
0.34 0.66 0.91 0.58 0.43 0.02 -1.71 -0.16 0.0 0.05 -1.13 -0.19 0.12 0.03 -0.81 -0.07 0.3 -0.18 -0.85 -0.86
1.78 - 0.01 -5.12 0.7 -1.31 -4.03 -0.97 0.64 0.42 - -2.39 -0.73 -0.03 - 1.88 1.56 0.45 -5.73 -2.14
0.45 1.41 0.95 0.32 1.07 -0.26 -4.4 -0.3 -0.12 -0.15 0.28 -0.33 0.0 -0.11 0.64 -0.6 -0.27 -2.24 -10.97 -9.58
-0.04 0.5 0.42 - 1.38 -1.64 -3.12 -0.84 -0.02 0.37 0.47 0.4 -2.75 -0.97 0.76 0.48 0.71 0.92 -1.26 -
0.45 0.1 0.33 0.27 -0.72 -0.67 0.53 -0.26 0.57 0.56 -0.37 -0.82 -0.09 -0.17 -0.75 0.91 0.45 0.42 -2.43 -3.3
0.93 0.72 1.16 -0.87 -0.19 1.02 -2.53 0.2 -0.21 -0.95 0.5 -0.13 -1.07 -1.52 -0.32 0.75 -0.19 -0.27 -0.68 -3.4
-0.09 -0.15 -0.63 -0.61 1.26 -0.43 -0.71 -0.47 -1.07 0.47 - 0.65 - - - 2.03 0.66 1.53 -2.24 -2.4
0.74 1.29 0.8 -0.52 0.82 -0.85 -0.94 -0.57 -0.21 -0.37 -0.98 -0.93 -3.69 -6.9 -1.06 0.94 0.45 0.72 0.18 -0.67
1.34 0.64 0.19 -0.19 1.22 -0.4 -3.31 0.68 0.78 1.01 -0.49 -2.29 -1.79 -2.25 -0.79 -0.61 -0.44 0.73 -4.03 -1.91
0.68 0.72 0.15 0.0 0.31 -0.79 -1.27 -0.04 -0.77 -1.07 0.04 0.74 -0.99 -1.05 -0.51 1.38 0.35 0.56 -2.19 -1.2
0.85 - - 0.83 -2.27 -2.67 - 1.15 1.4 2.15 -0.6 0.65 - - 0.4 -1.84 -0.95 1.17 - -2.67
0.71 0.24 0.92 0.84 0.69 -1.12 -3.13 0.28 0.04 -0.42 -0.2 -0.81 -0.39 -0.54 -0.16 0.23 -0.79 1.01 -1.76 -1.05
0.44 0.18 0.62 0.66 0.62 -0.82 -0.51 -0.2 0.11 -0.14 0.5 -0.49 -0.23 -0.02 0.42 0.2 -0.18 -0.56 -1.57 -1.37
0.15 0.5 0.76 0.11 0.25 0.33 -0.58 -0.16 -0.16 -0.13 -0.04 -0.26 -0.5 -0.68 0.13 -0.42 -0.08 -0.06 -0.3 0.24
0.75 -0.35 0.13 -0.44 0.15 -0.22 0.56 0.14 0.19 -0.36 -0.22 -1.19 0.31 0.3 -0.36 0.81 0.21 -0.64 -1.87 -0.18
0.01 0.47 0.52 -0.05 0.04 -0.89 -0.71 -0.14 0.41 0.4 -0.09 -0.06 -0.41 -0.46 -0.09 0.48 0.6 0.4 -3.64 -0.26
0.54 1.5 0.25 -0.47 0.32 -1.88 0.5 -0.78 -0.18 -0.05 -1.05 0.06 -0.48 0.18 -0.95 1.42 -0.14 -0.74 -5.17 -1.55
1.4 1.54 1.83 -0.18 0.29 -3.58 -2.91 -0.39 0.12 -0.28 -0.22 -1.67 -0.63 -0.68 -0.76 -0.6 -1.18 0.16 -4.33 -0.77
-0.15 0.13 -0.06 -0.45 -0.14 1.1 -0.15 -0.13 0.4 0.19 -0.41 -0.52 -0.97 -0.1 -0.29 1.18 0.35 -0.01 -1.29 -1.62
1.02 0.09 0.39 0.49 -0.06 -0.37 -0.56 -0.08 -0.06 -0.2 0.05 -0.25 0.17 0.13 0.13 0.03 -0.05 -0.34 -1.04 -0.86
0.48 -1.04 1.2 -1.44 0.3 -0.74 -0.71 -0.56 0.16 -0.16 -1.23 -0.8 0.57 0.64 -0.63 0.35 0.56 0.22 -0.53 0.01
-0.01 -0.65 -0.27 -1.7 -3.35 -0.84 0.49 0.27 0.49 -0.11 0.5 0.22 0.16 -0.09 0.22 1.18 0.39 0.41 -1.83 -0.65
0.1 -0.5 -0.65 -0.96 -0.77 -0.16 -0.08 0.11 -0.2 -0.39 0.55 -0.24 0.14 -0.12 0.56 0.97 0.05 0.95 -0.68 -0.78
0.5 1.82 0.02 1.79 0.46 -3.25 -4.41 -0.03 0.49 0.03 -1.59 -2.26 -1.24 -1.2 -1.51 0.17 -0.86 1.14 -8.02 -6.41
-0.12 1.55 -0.08 1.75 0.96 -4.54 -5.29 0.32 0.35 -0.28 -1.18 -1.71 -0.34 0.1 -1.11 0.15 -1.12 0.85 -5.64 -
-0.1 -0.24 0.39 -0.09 -0.4 -2.24 -1.59 -0.68 0.9 0.33 -1.5 -0.72 -0.08 0.19 -1.22 1.74 1.24 -0.73 -0.34 -1.51
1.31 0.42 1.25 0.08 0.12 -0.65 -0.91 -0.19 0.11 0.05 -1.27 -0.09 -0.27 -0.32 -1.01 0.12 -0.02 -0.04 -1.42 -0.72
0.27 1.09 1.09 0.7 0.19 -1.61 -7.2 -0.24 0.36 0.14 0.11 -0.42 -0.03 -0.45 0.05 0.31 -0.31 0.62 -4.62 -5.57
0.03 0.43 0.8 0.57 0.44 -0.7 -0.78 -0.05 0.08 -0.01 -0.1 -0.45 0.19 0.17 0.11 -0.17 -0.4 0.15 -0.65 -1.17
1.57 0.94 0.85 -0.91 0.33 0.31 1.46 -0.73 -0.88 -1.08 -1.48 -0.42 0.26 -0.22 -1.48 -0.55 -0.08 -0.76 - -2.5
-0.1 -0.27 1.16 -0.47 0.87 -1.83 -2.51 -1.04 -0.48 0.56 -0.62 0.25 -2.73 -2.88 0.24 1.7 0.15 1.01 -1.0 -2.84
0.28 0.35 -0.21 0.37 0.4 -0.56 -2.8 0.27 0.11 -0.07 0.06 -0.16 0.47 0.15 0.18 0.08 -0.22 0.6 -2.0 -0.45
0.37 1.59 0.26 0.1 0.4 -1.2 0.16 -0.48 -0.59 -0.33 -1.23 -0.17 0.11 0.57 -0.91 0.93 -0.31 -0.25 -3.76 -1.54
0.53 1.84 0.45 0.21 0.47 -0.96 0.09 -0.44 -0.53 -0.4 -1.35 0.03 -0.5 -0.15 -0.91 0.9 -0.44 -0.44 -2.64 -1.95
0.82 -2.46 -1.03 0.61 0.23 0.37 -1.31 -0.06 0.58 0.15 -0.44 0.02 -0.09 -0.27 -0.88 0.86 0.82 0.07 -1.9 -0.6
-0.06 -0.92 -0.3 -0.1 0.06 0.19 -0.51 0.09 0.17 0.16 0.62 0.22 -1.5 -1.3 0.6 0.25 0.55 0.32 -0.5 -0.0
0.41 0.41 0.93 0.68 0.51 0.03 -2.26 0.17 -0.52 -0.74 -0.55 -0.09 -0.74 -0.63 -0.45 0.07 0.26 0.57 -0.55 -0.42
0.94 0.43 1.14 0.28 0.11 -0.45 -1.31 -0.12 0.07 -0.05 -0.39 -0.3 -0.11 -0.23 -0.24 -0.24 -0.0 0.28 -2.25 -0.51
0.83 0.29 0.55 0.29 0.31 -0.92 -0.95 -0.15 0.24 -0.0 -0.33 -0.27 -0.2 -0.32 -0.21 0.49 0.4 -0.2 -1.39 -0.3
1.18 0.36 0.72 -0.05 0.52 -1.19 -2.02 -0.17 -0.05 -0.17 -0.31 -0.36 0.06 -0.09 -0.46 -0.4 -0.4 0.22 -0.71 0.47
0.07 0.19 -0.1 -0.19 -0.13 0.15 -0.86 0.01 0.42 0.17 0.43 -0.34 -0.79 -0.83 0.38 1.01 0.38 -0.03 -0.57 -1.34
0.88 0.65 1.39 0.1 -0.19 -0.21 -1.05 -0.36 -0.03 0.33 -1.22 -0.38 -0.64 -1.05 -0.11 0.36 0.21 -0.22 -1.03 -0.66
-0.88 -0.32 -0.41 -1.1 0.52 0.63 -0.39 0.34 0.01 -0.53 0.49 0.4 -0.31 -0.77 0.1 0.25 -0.12 0.4 0.29 -0.18
0.11 2.52 0.62 1.41 1.44 -3.25 -4.93 0.14 -1.94 -0.83 -2.6 0.11 -1.24 -1.23 -4.05 -1.25 -1.26 0.25 -8.36 -4.47
0.49 0.73 0.14 0.83 0.52 -0.96 -2.56 -0.06 -0.17 -0.43 -0.75 -0.51 -0.51 -0.09 -0.79 0.07 0.73 0.87 -1.93 0.05
1.1 1.91 0.6 0.27 -0.05 -3.2 1.38 -0.94 -0.53 -0.81 -1.77 -0.78 -4.0 -4.07 -1.21 0.09 0.47 -0.49 -0.71 -0.49
0.34 -1.29 -0.27 0.39 0.4 -0.85 -0.85 -0.22 0.86 0.32 -0.32 0.23 -1.02 -0.73 -0.32 1.05 0.96 -0.03 -0.89 -1.24
0.34 -1.29 -0.27 0.39 0.4 -0.85 -0.85 -0.22 0.86 0.32 -0.32 0.23 -1.02 -0.73 -0.32 1.05 0.96 -0.03 -0.89 -1.24
0.24 0.21 0.38 -0.01 0.5 -0.63 -0.94 -0.4 0.64 0.34 -1.42 0.22 -0.64 -0.16 -1.3 1.01 1.01 -0.62 -1.07 -0.82
1.53 -0.32 0.17 -1.19 0.76 0.23 -0.58 -0.38 0.46 -0.04 -0.45 -0.77 -0.91 -1.47 0.0 0.45 0.13 0.31 -1.4 -0.33
1.07 0.3 0.84 0.5 0.22 -0.3 -0.74 -0.06 -0.61 -0.67 -0.33 -0.42 0.13 0.19 -0.17 0.24 -0.26 -0.28 -0.81 -0.77
0.73 0.34 0.77 -0.12 0.27 -0.29 -0.62 -0.0 -0.19 -0.24 -0.07 -0.11 -0.0 -0.14 -0.01 -0.55 -0.38 -0.26 -0.26 0.22
0.73 0.31 0.82 0.06 0.43 -0.59 -0.54 -0.37 0.6 0.43 -0.39 -1.02 -0.77 -1.17 -0.16 0.16 -0.17 0.32 -0.88 -0.03
-0.54 0.81 -0.33 - -0.46 -0.96 -2.43 -0.02 1.51 1.13 0.11 -0.63 -2.04 -1.24 -0.02 1.84 0.67 -0.4 - -4.59
-0.24 0.28 0.72 -0.24 0.14 -0.4 -1.92 -0.3 0.11 0.43 0.12 -0.14 -0.89 -0.92 0.18 0.73 0.88 0.41 -1.62 -0.46
-0.31 -0.59 0.61 0.29 -0.16 -1.05 -1.08 0.05 0.32 0.19 0.07 0.26 -0.22 -0.12 0.14 0.97 0.57 0.1 -1.09 -1.38
-0.55 -0.12 0.52 0.46 -0.2 -0.33 -1.5 -0.16 0.33 0.57 0.51 -0.07 -1.63 -2.14 0.62 0.6 0.39 0.19 -0.44 -0.38
0.12 0.49 -0.14 0.3 -0.06 -1.42 -1.14 -0.17 0.07 -0.41 -0.0 -0.75 -0.26 -0.25 0.0 1.47 0.5 0.08 -0.1 -1.21
-0.11 -0.61 -0.55 0.28 -0.64 -1.79 0.97 -0.07 0.07 0.05 0.43 -0.05 -1.03 -0.82 0.18 1.1 1.05 0.29 -1.45 -1.83
0.72 0.4 0.28 -0.8 0.26 0.4 -1.4 0.25 0.63 0.33 -0.21 0.29 -3.11 -3.02 -0.01 0.89 0.25 0.04 -0.96 -1.18
0.04 -0.37 -0.59 -0.56 -0.91 -0.49 -1.25 0.12 1.01 0.59 0.86 0.15 -0.07 -0.05 0.48 1.07 0.26 -0.7 -2.88 -1.77
0.33 -0.94 -0.4 0.46 -0.8 -2.34 -6.52 1.11 0.56 1.26 -2.5 1.7 -2.12 -2.22 -2.37 -0.51 0.54 1.59 - -5.87
0.62 0.43 0.94 0.95 1.15 -1.07 - 0.68 0.5 0.6 -1.15 -1.57 -0.85 -1.42 -1.18 -0.85 -0.04 1.2 -4.37 -
0.55 1.33 0.71 0.01 -0.49 -1.0 -0.55 -0.27 0.59 0.45 -0.9 -0.6 0.23 0.04 -0.76 0.5 -0.68 -0.3 -2.2 -0.48
-0.57 -0.56 -0.09 0.35 -0.2 -1.8 0.85 -0.16 -0.14 -0.1 0.32 -0.32 -1.12 -0.8 0.2 1.13 1.05 0.57 -1.14 -1.73
1.79 0.28 0.67 1.29 0.88 -3.75 -3.95 -0.35 -0.32 -0.27 -0.29 -0.63 -0.99 -1.03 -0.26 -0.24 0.22 0.17 -3.48 -1.41
1.95 0.97 0.89 0.38 1.05 -2.56 -3.5 -0.19 -0.58 -0.43 -0.32 -0.76 -1.93 -2.09 -0.14 -0.34 -0.1 0.36 -2.7 -1.15
0.3 1.23 1.53 -0.71 -0.43 -1.09 -0.46 -0.48 0.34 0.01 -1.17 -0.26 -3.84 -5.76 -0.94 0.96 0.48 0.37 0.14 -1.48
-1.06 0.26 0.96 -0.19 -0.51 - -2.63 -0.78 -0.32 0.47 0.21 0.15 - -1.71 0.43 1.59 1.19 0.89 -1.24 -1.4
1.21 -0.21 -0.64 -0.4 -0.61 -0.88 -0.57 -0.15 -0.21 -0.67 1.0 -0.74 -0.07 -0.52 0.66 0.79 0.47 0.16 -0.68 -1.08
-0.4 0.02 0.13 -0.2 0.36 -0.18 -0.16 0.04 0.27 0.06 0.55 0.35 -2.61 -2.56 0.3 0.34 0.26 0.02 -0.4 0.49
0.32 -0.11 -0.46 -0.7 -0.5 0.09 -0.96 0.02 0.89 0.55 0.13 -0.24 0.22 0.1 -0.13 1.1 0.11 -0.05 -1.9 -1.6
-0.72 0.02 -0.17 -1.44 -0.99 -2.91 0.29 0.21 1.26 0.74 0.67 -0.12 -0.66 -0.23 0.24 1.39 0.66 -2.47 -1.62 -2.77
0.48 0.3 -0.03 0.05 0.14 0.2 -2.59 0.04 0.05 -0.34 0.32 -0.71 -0.21 -0.5 0.27 0.31 -0.31 0.69 -0.01 -0.31
0.51 -0.07 -0.3 0.06 0.39 -0.24 -2.43 -0.03 0.05 -0.24 0.26 -0.85 0.23 0.34 0.14 0.57 -0.14 0.41 -0.59 -0.19

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.