Heatmap: Cluster_66 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.0 0.0 0.12 0.0 9.98 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.0 0.07 0.22 0.15 0.08 0.2 0.03 0.02 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0
0.18 0.15 0.07 0.0 0.8 0.15 0.13 0.51 0.24 0.38 0.26 0.03 0.55 0.25 0.99 0.52 0.15 0.06 0.47 0.44
0.81 0.74 0.88 1.07 7.22 1.28 0.0 1.18 0.56 0.68 0.64 0.59 0.28 0.13 0.51 0.56 1.75 4.17 1.54 2.22
7.17 1.29 1.95 5.17 7.09 4.9 3.53 0.38 0.03 0.03 0.03 0.14 0.05 0.06 0.07 0.56 1.56 3.44 0.79 4.8
1.44 1.11 2.72 3.2 8.89 0.64 3.05 0.55 0.21 0.09 0.1 0.1 0.06 0.14 0.24 1.49 0.27 4.12 5.64 1.66
0.62 0.29 1.73 0.97 6.1 0.27 1.4 0.36 0.11 0.08 0.18 0.11 0.11 0.11 0.21 1.14 0.09 2.94 2.44 1.89
0.0 0.0 0.0 0.0 2.91 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.02 0.0 0.06 0.36 0.39 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.13 0.02 0.05
3.65 11.26 8.4 6.55 14.15 14.55 5.04 5.5 4.76 4.67 7.81 2.57 2.82 3.75 6.57 5.24 5.86 5.91 4.9 12.1
0.0 0.0 0.0 0.0 1.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.59 0.0 0.0 1.15 0.0 0.32 0.31 0.39 0.25 0.0 0.02 0.4 0.06 0.81 0.61 0.22 0.17 0.4 0.36
0.34 0.68 1.79 0.19 7.84 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.07 0.16 0.13
0.12 0.0 0.0 0.0 0.13 0.67 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.13 2.25 2.25 4.65 10.08 2.32 1.9 2.65 2.65 2.79 0.94 2.38 1.2 1.24 0.97 4.27 5.01 3.23 5.69 1.82
2.57 3.74 1.2 72.8 55.37 2.63 4.66 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.32 0.03 0.05
7.1 4.25 3.14 8.67 31.36 19.38 7.27 3.85 3.98 6.33 3.89 4.62 3.79 9.07 4.55 3.43 5.19 4.36 8.92 6.91
0.02 0.18 0.08 0.09 1.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.18 0.42 0.0 0.03 0.06 0.08 0.09 0.0 0.0 0.04 0.2 0.0 0.09 0.06 0.0 0.12 0.0
2.27 4.72 1.02 31.46 60.81 4.46 1.19 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.01 0.02 0.02 0.14 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
5.7 10.36 14.48 6.68 10.87 1.49 0.08 3.3 8.04 5.92 3.31 2.23 0.75 1.92 2.78 6.84 4.03 2.65 0.01 0.2
0.45 0.49 1.44 0.24 6.12 0.1 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.0 0.0 0.43 4.81 0.0 0.08 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.05 0.0 0.05 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.23 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
68.42 29.75 105.55 54.83 75.66 45.24 4.78 2.2 0.25 0.32 0.04 1.03 0.37 0.26 0.23 1.48 2.34 47.89 28.09 30.68
0.0 0.0 0.02 0.0 16.42 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.02 0.0 0.04 0.0 0.24 0.0 0.27 0.01 0.0 0.0 0.17 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.02 0.0
15.35 16.5 25.65 22.68 19.83 7.81 8.57 9.22 7.92 6.84 8.4 4.63 8.29 7.46 8.9 6.26 5.25 12.98 10.22 8.85
12.47 20.23 29.04 10.16 16.13 5.11 7.48 7.42 5.63 3.95 5.56 3.93 4.21 2.73 4.55 5.1 4.53 10.68 10.07 6.53
7.42 20.4 53.65 5.21 403.74 182.46 36.16 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.03
1.89 0.52 0.72 0.39 2.04 1.14 1.65 0.14 0.05 0.02 0.04 0.02 0.04 0.05 0.06 0.01 0.04 0.57 0.89 0.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 16.26 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.8 0.57 5.33 2.02 7.74 1.8 0.33 0.54 0.26 0.15 0.51 0.17 0.02 0.43 0.57 0.03 0.98 1.52 0.0 0.1
0.17 0.0 0.13 0.06 0.13 0.04 0.08 0.03 0.05 0.03 0.02 0.04 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.07 0.09
0.68 0.85 1.54 0.35 2.77 0.33 0.85 0.08 0.08 0.0 0.05 0.01 0.09 0.06 0.0 0.24 0.0 0.0 0.25 0.0
2.87 4.48 8.24 2.76 11.22 19.64 0.63 0.31 0.02 0.03 0.35 0.05 0.03 0.0 0.43 0.03 0.14 1.32 0.16 1.11
1.85 1.44 4.71 1.52 10.0 15.31 0.78 0.24 0.01 0.01 0.08 0.02 0.06 0.03 0.41 0.12 0.09 0.69 0.07 1.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.69 10.22 4.32 0.99 11.83 0.34 0.74 0.25 0.05 0.06 0.07 1.09 0.0 0.02 0.08 1.84 1.25 0.47 0.14 1.25
0.19 0.96 1.06 0.17 23.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.0 13.48 0.24 1.97 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
2.49 0.15 0.39 3.04 5.57 0.38 0.23 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.18 0.33 0.67
70.97 0.0 21.42 8.29 228.93 23.95 24.27 43.12 24.67 26.4 23.87 23.46 43.44 51.9 33.37 20.68 28.35 37.33 0.0 41.23
0.0 0.0 0.0 0.0 3.83 0.0 0.02 0.19 0.66 0.0 0.32 0.29 0.36 0.37 0.2 1.13 0.23 1.95 0.45 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
1.41 1.49 1.91 1.84 2.94 4.16 3.15 1.49 0.74 0.84 1.25 1.87 0.35 0.4 0.98 0.93 1.87 2.12 2.28 3.21
0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 21.44 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.57 8.06 14.0 2.62 53.54 2.52 4.86 0.11 0.01 0.03 0.0 0.08 0.03 0.01 0.01 0.02 0.07 0.12 0.2 8.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.3 0.0 0.0 0.0 1.39 1.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.5 0.94 1.97 2.55 12.44 0.02 0.27 0.07 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.1 0.0 0.0 0.01 0.08
5.85 54.75 34.73 0.0 53.18 0.0 0.0 1.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.71 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.0 0.1 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.44 0.74 4.58 0.67 32.59 0.05 8.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.3 0.26 0.55 0.0 0.58 0.0 0.13 0.07 0.0 0.1 0.05 0.02 0.09 0.02 0.25 0.17 0.0 0.22 0.1 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
2.1 0.0 1.07 1.02 3.29 0.79 0.83 0.29 0.37 0.17 0.65 0.3 0.41 0.52 0.73 0.27 0.21 0.34 0.27 0.91
3.25 2.43 5.01 2.25 8.74 1.68 1.83 0.53 0.48 0.9 0.91 0.51 0.46 0.87 0.65 0.18 0.92 0.83 0.85 1.58
3.13 2.25 2.25 4.65 10.08 2.32 1.9 2.65 2.65 2.79 0.94 2.38 1.2 1.24 0.97 4.27 5.01 3.23 5.69 1.82
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.22 0.26 0.58 3.71 6.5 0.68 0.84 0.16 0.15 0.25 0.08 0.06 0.02 0.71 0.13 1.04 7.75 1.23 3.31
2.78 0.33 4.0 16.11 36.79 0.0 0.34 0.31 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.19 0.21 0.24 3.95 0.0 0.0
0.54 0.0 0.0 0.0 1.89 0.01 0.08 0.14 0.33 0.12 0.0 0.05 0.11 0.16 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.11
0.01 0.02 0.0 0.0 0.5 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.02 0.01 0.0
0.19 0.0 0.18 0.45 0.23 0.19 0.07 0.24 0.21 0.13 0.4 0.09 0.06 0.06 0.4 0.25 0.29 0.27 0.08 0.57
0.24 0.07 0.16 0.3 0.67 0.51 0.11 0.24 0.13 0.14 0.21 0.06 0.08 0.12 0.17 0.16 0.36 0.52 0.14 0.66
0.14 0.05 0.55 0.94 0.68 0.34 0.11 0.31 0.11 0.13 0.23 0.07 0.18 0.15 0.26 0.1 0.13 0.26 0.29 0.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.15 0.17 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.35 0.0 0.39 0.32 0.74 0.12 0.3 0.14 0.16 0.06 0.1 0.05 0.15 0.18 0.17 0.16 0.0 0.44 0.0 0.53
3.72 6.17 9.95 2.77 6.33 6.34 2.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.44 0.0 6.81
1.24 0.13 0.64 0.0 0.01 0.02 0.0 0.04 0.08 0.09 0.01 0.09 0.0 0.0 0.03 0.06 0.02 0.19 0.04 0.13

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)