Heatmap: Cluster_66 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00289	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_00485	0.78	0.0	0.34	1.0	0.69	0.35	0.91	0.14	0.1	0.18	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.81	0.0	0.0
Gb_02668	0.18	0.15	0.08	0.0	0.81	0.16	0.13	0.52	0.24	0.38	0.26	0.03	0.56	0.26	1.0	0.52	0.15	0.06	0.47	0.44
Gb_03543	0.11	0.1	0.12	0.15	1.0	0.18	0.0	0.16	0.08	0.09	0.09	0.08	0.04	0.02	0.07	0.08	0.24	0.58	0.21	0.31
Gb_03904	1.0	0.18	0.27	0.72	0.99	0.68	0.49	0.05	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.22	0.48	0.11	0.67
Gb_04047	0.16	0.13	0.31	0.36	1.0	0.07	0.34	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.17	0.03	0.46	0.63	0.19
Gb_04051	0.1	0.05	0.28	0.16	1.0	0.04	0.23	0.06	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.19	0.02	0.48	0.4	0.31
Gb_04276	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_05398	0.05	0.0	0.05	0.0	0.16	0.93	1.0	0.03	0.04	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.33	0.06	0.13
Gb_06218	0.25	0.77	0.58	0.45	0.97	1.0	0.35	0.38	0.33	0.32	0.54	0.18	0.19	0.26	0.45	0.36	0.4	0.41	0.34	0.83
Gb_06235	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07600	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07602	0.0	0.51	0.0	0.0	1.0	0.0	0.28	0.27	0.34	0.22	0.0	0.02	0.35	0.06	0.7	0.53	0.19	0.15	0.35	0.31
Gb_07964	0.04	0.09	0.23	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.02
Gb_08750	0.18	0.0	0.0	0.0	0.19	1.0	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_08802	0.31	0.22	0.22	0.46	1.0	0.23	0.19	0.26	0.26	0.28	0.09	0.24	0.12	0.12	0.1	0.42	0.5	0.32	0.56	0.18
Gb_09403	0.04	0.05	0.02	1.0	0.76	0.04	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09577	0.23	0.14	0.1	0.28	1.0	0.62	0.23	0.12	0.13	0.2	0.12	0.15	0.12	0.29	0.15	0.11	0.17	0.14	0.28	0.22
Gb_09768	0.02	0.15	0.06	0.07	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09894	0.06	0.0	0.0	0.42	1.0	0.0	0.08	0.13	0.19	0.22	0.0	0.0	0.1	0.46	0.0	0.21	0.14	0.0	0.28	0.0
Gb_11313	0.04	0.08	0.02	0.52	1.0	0.07	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_12948	0.15	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.75	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0
Gb_13009	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.07	0.13	0.08	0.74	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0
Gb_13023	0.39	0.72	1.0	0.46	0.75	0.1	0.01	0.23	0.56	0.41	0.23	0.15	0.05	0.13	0.19	0.47	0.28	0.18	0.0	0.01
Gb_15188	0.07	0.08	0.23	0.04	1.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15925	0.03	0.0	0.0	0.09	1.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
Gb_16094	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16679	0.47	0.0	0.96	0.0	0.97	1.0	0.54	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16880	0.0	1.0	0.0	0.0	0.95	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16923	0.65	0.28	1.0	0.52	0.72	0.43	0.05	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.45	0.27	0.29
Gb_17570	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18063	0.08	0.0	0.16	0.0	0.9	0.0	1.0	0.04	0.0	0.0	0.62	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.06	0.0
Gb_19131	0.6	0.64	1.0	0.88	0.77	0.3	0.33	0.36	0.31	0.27	0.33	0.18	0.32	0.29	0.35	0.24	0.2	0.51	0.4	0.35
Gb_19132	0.43	0.7	1.0	0.35	0.56	0.18	0.26	0.26	0.19	0.14	0.19	0.14	0.14	0.09	0.16	0.18	0.16	0.37	0.35	0.22
Gb_19651	0.02	0.05	0.13	0.01	1.0	0.45	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19726	0.93	0.25	0.35	0.19	1.0	0.56	0.81	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.28	0.44	0.18
Gb_19779	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.72
Gb_20254	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20399	0.36	0.07	0.69	0.26	1.0	0.23	0.04	0.07	0.03	0.02	0.07	0.02	0.0	0.06	0.07	0.0	0.13	0.2	0.0	0.01
Gb_20789	1.0	0.0	0.76	0.33	0.77	0.25	0.47	0.18	0.3	0.17	0.1	0.25	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.36	0.39	0.51
Gb_20844	0.25	0.31	0.55	0.13	1.0	0.12	0.31	0.03	0.03	0.0	0.02	0.01	0.03	0.02	0.0	0.09	0.0	0.0	0.09	0.0
Gb_21561	0.15	0.23	0.42	0.14	0.57	1.0	0.03	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.07	0.01	0.06
Gb_21566	0.12	0.09	0.31	0.1	0.65	1.0	0.05	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.04	0.0	0.1
Gb_22468	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23647	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0
Gb_24680	0.06	0.86	0.37	0.08	1.0	0.03	0.06	0.02	0.0	0.0	0.01	0.09	0.0	0.0	0.01	0.16	0.11	0.04	0.01	0.11
Gb_25721	0.01	0.04	0.04	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26549	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0	0.0
Gb_27177	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0	0.02	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_27802	0.45	0.03	0.07	0.55	1.0	0.07	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.06	0.12
Gb_28498	0.31	0.0	0.09	0.04	1.0	0.1	0.11	0.19	0.11	0.12	0.1	0.1	0.19	0.23	0.15	0.09	0.12	0.16	0.0	0.18
Gb_29500	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.05	0.17	0.0	0.08	0.08	0.09	0.1	0.05	0.29	0.06	0.51	0.12	0.0
Gb_30205	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.04	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0
Gb_30597	0.34	0.36	0.46	0.44	0.71	1.0	0.76	0.36	0.18	0.2	0.3	0.45	0.09	0.1	0.24	0.22	0.45	0.51	0.55	0.77
Gb_31150	0.46	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.53	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.8	0.0	0.0
Gb_31399	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_31437	0.07	0.15	0.26	0.05	1.0	0.05	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16
Gb_31626	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75
Gb_31770	0.22	0.0	0.0	0.0	1.0	0.93	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32012	0.12	0.08	0.16	0.21	1.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_32434	0.11	1.0	0.63	0.0	0.97	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33614	0.24	0.0	0.2	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0
Gb_34059	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_34128	0.01	0.02	0.14	0.02	1.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_34304	0.51	0.45	0.94	0.0	1.0	0.0	0.23	0.12	0.0	0.17	0.09	0.03	0.16	0.04	0.43	0.28	0.0	0.38	0.17	0.18
Gb_34368	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.12	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0
Gb_35024	0.64	0.0	0.33	0.31	1.0	0.24	0.25	0.09	0.11	0.05	0.2	0.09	0.13	0.16	0.22	0.08	0.07	0.1	0.08	0.28
Gb_35027	0.37	0.28	0.57	0.26	1.0	0.19	0.21	0.06	0.06	0.1	0.1	0.06	0.05	0.1	0.07	0.02	0.11	0.09	0.1	0.18
Gb_35748	0.31	0.22	0.22	0.46	1.0	0.23	0.19	0.26	0.26	0.28	0.09	0.24	0.12	0.12	0.1	0.42	0.5	0.32	0.56	0.18
Gb_36256	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.72
Gb_36808	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37284	0.02	0.03	0.03	0.07	0.48	0.84	0.09	0.11	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.0	0.09	0.02	0.13	1.0	0.16	0.43
Gb_37818	0.08	0.01	0.11	0.44	1.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.11	0.0	0.0
Gb_38668	0.29	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.04	0.07	0.17	0.06	0.0	0.02	0.06	0.09	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.06
Gb_39085	0.01	0.05	0.0	0.0	1.0	0.0	0.03	0.03	0.02	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.06	0.03	0.04	0.02	0.0
Gb_39121	0.34	0.0	0.32	0.78	0.4	0.32	0.12	0.41	0.37	0.23	0.69	0.16	0.1	0.11	0.69	0.43	0.5	0.47	0.15	1.0
Gb_39123	0.36	0.1	0.25	0.45	1.0	0.76	0.16	0.36	0.19	0.22	0.32	0.09	0.12	0.17	0.25	0.25	0.54	0.78	0.21	1.0
Gb_39124	0.14	0.05	0.59	1.0	0.72	0.37	0.12	0.33	0.12	0.13	0.25	0.07	0.2	0.16	0.27	0.11	0.14	0.28	0.31	0.56
Gb_39719	0.0	0.0	0.0	0.0	0.88	0.91	1.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39723	0.48	0.0	0.53	0.43	1.0	0.17	0.41	0.2	0.22	0.08	0.13	0.07	0.21	0.24	0.23	0.21	0.0	0.6	0.0	0.71
Gb_40065	0.37	0.62	1.0	0.28	0.64	0.64	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.0	0.68
Gb_40629	1.0	0.1	0.51	0.0	0.01	0.01	0.0	0.03	0.06	0.07	0.01	0.07	0.0	0.0	0.02	0.05	0.02	0.16	0.03	0.1

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)