Heatmap: Cluster_263 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.41 0.2 0.18 0.36 0.95 0.68 0.09 0.22 0.11 0.1 0.13 0.07 0.02 0.03 0.1 0.16 0.24 0.54 0.23 1.0
0.01 0.01 0.03 0.02 0.06 0.39 0.0 0.04 0.01 0.01 0.02 0.04 0.02 0.01 0.01 0.01 0.05 0.09 0.04 1.0
0.01 0.0 0.05 0.01 0.08 0.59 0.01 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.07 0.11 0.09 1.0
0.35 0.0 0.02 0.0 0.01 0.31 0.09 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 1.0
0.02 0.01 0.01 0.01 0.04 1.0 0.01 0.08 0.0 0.0 0.01 0.05 0.03 0.04 0.01 0.0 0.02 0.1 0.11 0.23
0.03 0.01 0.01 0.01 0.04 1.0 0.01 0.07 0.01 0.01 0.01 0.05 0.04 0.07 0.01 0.0 0.03 0.12 0.04 0.37
0.15 0.05 0.05 0.21 0.23 1.0 0.19 0.08 0.02 0.03 0.07 0.1 0.01 0.03 0.04 0.07 0.09 0.41 0.14 0.31
0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 1.0 0.08 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.05 0.16 0.21 0.93
0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.03 0.9 0.01 0.01 0.01 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.04 0.26 0.37 0.19 1.0
0.46 1.0 0.56 0.38 0.21 0.23 0.13 0.29 0.1 0.12 0.22 0.53 0.16 0.11 0.14 0.07 0.26 0.33 0.16 0.55
0.67 0.73 0.5 0.41 0.18 1.0 0.23 0.22 0.13 0.1 0.11 0.16 0.12 0.2 0.07 0.16 0.14 0.17 0.03 0.15
0.2 0.07 0.12 0.04 0.03 1.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.03 0.12 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07
0.01 0.01 0.02 0.04 0.03 0.48 0.01 0.05 0.02 0.02 0.02 0.06 0.02 0.04 0.03 0.04 0.06 0.02 0.01 1.0
0.26 0.08 0.14 0.1 0.08 1.0 0.13 0.05 0.02 0.02 0.01 0.16 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.24 0.07 0.42
0.51 0.41 1.0 0.42 0.23 0.47 0.06 0.31 0.14 0.25 0.11 0.36 0.05 0.02 0.07 0.09 0.23 0.14 0.32 0.19
0.2 0.1 0.12 0.17 0.28 1.0 0.02 0.14 0.01 0.01 0.02 0.09 0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.35 0.03 0.54
0.44 0.36 0.41 0.15 0.11 0.74 0.12 0.24 0.27 0.2 0.12 0.17 0.23 0.19 0.11 0.25 0.16 0.22 0.04 1.0
0.22 0.53 0.12 0.18 0.17 1.0 0.58 0.11 0.13 0.28 0.04 0.22 0.1 0.24 0.03 0.05 0.05 0.07 0.0 0.24
0.03 0.03 0.03 0.06 0.08 1.0 0.07 0.05 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.07 0.08 0.26 0.02 0.22
0.1 0.18 0.09 0.25 0.2 1.0 0.05 0.33 0.15 0.19 0.13 0.26 0.31 0.18 0.16 0.08 0.12 0.12 0.02 0.2
0.43 0.29 0.29 0.31 0.2 1.0 0.07 0.31 0.25 0.32 0.17 0.59 0.21 0.15 0.15 0.25 0.31 0.13 0.01 0.2
0.65 0.29 0.6 0.28 0.03 1.0 0.55 0.23 0.33 0.55 0.21 0.4 0.34 0.33 0.51 0.46 0.33 0.1 0.05 0.68
0.04 0.18 0.1 0.04 0.08 0.71 0.31 0.15 0.01 0.01 0.04 0.03 0.01 0.03 0.03 0.05 0.1 0.18 0.07 1.0
0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 1.0 0.02 0.06 0.02 0.02 0.07 0.01 0.01 0.01 0.14 0.03 0.06 0.05 0.01 0.47
0.27 0.14 0.05 0.02 0.03 1.0 0.37 0.06 0.01 0.01 0.0 0.24 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.88
0.06 0.04 0.13 0.01 0.08 0.03 1.0 0.12 0.27 0.13 0.03 0.16 0.04 0.03 0.03 0.08 0.33 0.09 0.06 0.86
0.15 0.32 0.05 0.19 0.21 1.0 0.04 0.03 0.01 0.06 0.0 0.06 0.0 0.01 0.0 0.11 0.05 0.08 0.0 0.02
0.13 0.05 0.08 0.15 0.18 1.0 0.07 0.11 0.04 0.03 0.03 0.06 0.04 0.04 0.03 0.05 0.08 0.28 0.11 0.2
0.56 0.31 0.3 0.31 0.38 0.94 0.13 0.21 0.13 0.1 0.2 0.18 0.08 0.06 0.21 0.12 0.13 0.33 0.17 1.0
0.49 0.39 0.28 0.34 0.3 1.0 0.11 0.22 0.09 0.07 0.11 0.16 0.14 0.09 0.12 0.07 0.12 0.26 0.25 0.42
0.21 0.05 0.07 0.21 0.14 1.0 0.08 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.14 0.0 0.77
0.34 0.13 0.23 0.21 0.09 1.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.17 0.05 0.74
0.1 0.05 0.11 0.04 0.04 1.0 0.04 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.03 0.02 0.64
0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.22 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.58 0.41 0.56 0.41 0.53 0.95 0.53 0.5 0.29 0.34 0.25 0.4 0.57 0.57 0.24 0.32 0.32 0.68 0.28 1.0
0.44 0.32 0.18 0.29 0.27 1.0 0.16 0.17 0.07 0.08 0.02 0.16 0.05 0.06 0.02 0.08 0.14 0.21 0.16 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0
0.16 0.0 0.0 0.0 0.31 0.28 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.53 0.0 1.0
0.09 0.09 0.06 0.04 0.09 0.21 0.12 0.01 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.02 0.07 0.13 1.0
0.8 0.0 0.17 0.0 0.0 1.0 0.46 0.26 0.12 0.31 0.25 0.02 0.0 0.06 0.0 0.0 0.35 0.55 0.0 0.38
0.49 0.06 0.07 0.03 0.06 1.0 0.1 0.13 0.11 0.17 0.07 0.22 0.04 0.08 0.03 0.08 0.1 0.13 0.01 0.68
0.33 0.43 0.3 0.25 0.44 1.0 0.18 0.47 0.18 0.18 0.4 0.39 0.34 0.23 0.39 0.19 0.2 0.54 0.42 0.51
0.0 0.0 0.06 0.05 0.08 0.76 0.9 0.04 0.01 0.03 0.03 0.02 0.01 0.01 0.07 0.07 0.04 0.27 0.49 1.0
0.04 0.05 0.13 0.07 0.14 0.53 0.24 0.02 0.01 0.01 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.12 0.28 1.0
0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 1.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.06 0.08 0.79
0.04 0.05 0.1 0.0 0.01 1.0 0.13 0.03 0.01 0.0 0.06 0.02 0.01 0.02 0.07 0.0 0.02 0.13 0.0 0.8
0.22 0.12 0.08 0.01 0.01 1.0 0.16 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.87
0.37 0.0 0.02 0.0 0.0 1.0 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.16 0.74
0.08 0.07 0.06 0.04 0.06 1.0 0.04 0.11 0.02 0.03 0.05 0.05 0.06 0.05 0.05 0.03 0.06 0.11 0.12 0.19
0.04 0.06 0.03 0.0 0.0 0.03 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.21 0.0 0.12 0.03 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.01 0.02 0.04 0.03 0.03 1.0 0.08 0.11 0.0 0.0 0.02 0.07 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.03 0.0 0.39
0.01 0.0 0.0 0.09 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0
0.42 0.42 0.34 0.18 0.18 0.81 1.0 0.06 0.03 0.04 0.12 0.39 0.05 0.07 0.08 0.07 0.04 0.13 0.06 0.17
0.63 0.61 0.5 0.47 0.53 1.0 0.38 0.37 0.14 0.17 0.18 0.44 0.42 0.6 0.15 0.22 0.14 0.53 0.17 0.66
0.49 0.07 0.17 0.03 0.05 0.16 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.07 0.07 0.03 0.08 1.0
0.06 0.01 0.06 0.06 0.01 0.31 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.22 0.03 1.0
0.52 0.44 0.45 0.44 0.4 1.0 0.17 0.45 0.41 0.41 0.43 0.38 0.51 0.52 0.41 0.39 0.46 0.52 0.43 0.77
0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 1.0 0.16 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.21 0.0 0.11 0.0 0.0
0.43 0.34 0.54 0.49 0.36 1.0 0.27 0.27 0.13 0.12 0.19 0.26 0.17 0.15 0.18 0.14 0.16 0.27 0.26 0.28
0.11 0.04 0.1 0.09 0.05 1.0 0.51 0.04 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.04 0.07 0.01 0.74
0.26 0.37 0.25 0.1 0.1 1.0 0.1 0.03 0.02 0.03 0.04 0.05 0.03 0.05 0.03 0.0 0.01 0.03 0.02 0.3
0.26 0.17 0.1 0.34 0.18 1.0 0.03 0.11 0.03 0.02 0.07 0.14 0.09 0.1 0.04 0.06 0.06 0.15 0.02 0.13
0.51 0.06 0.31 0.3 0.12 0.71 0.04 0.04 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.09 0.02 1.0
0.3 0.04 0.11 0.11 0.23 0.25 0.05 0.03 0.04 0.01 0.0 0.02 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.17 0.23 1.0
0.31 0.04 0.11 0.12 0.21 0.27 0.04 0.03 0.03 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.17 0.34 1.0
0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.3 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81
0.29 0.01 0.08 0.22 0.19 0.57 0.15 0.1 0.05 0.03 0.01 0.05 0.02 0.0 0.06 0.06 0.14 0.12 0.03 1.0
0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.72 0.0 0.05 0.02 0.01 0.05 0.17 0.03 0.03 0.02 0.01 0.07 0.03 0.06 1.0
0.56 0.09 0.13 0.01 0.07 0.25 0.35 0.09 0.09 0.07 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.07 0.16 0.4 1.0
0.46 0.06 0.09 0.0 0.07 0.19 0.28 0.07 0.09 0.06 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.05 0.14 0.21 1.0
0.17 0.13 0.11 0.13 0.13 1.0 0.03 0.08 0.04 0.02 0.05 0.03 0.01 0.03 0.06 0.04 0.04 0.3 0.06 0.41
0.32 0.22 0.3 0.28 0.12 1.0 0.07 0.14 0.18 0.12 0.03 0.11 0.01 0.01 0.02 0.7 0.4 0.34 0.23 0.25
0.11 0.28 0.3 0.06 0.07 0.53 0.14 0.11 0.23 0.12 0.28 0.12 0.03 0.06 0.19 0.0 0.02 0.03 0.11 1.0
0.43 0.16 0.33 0.08 0.2 0.76 0.32 0.06 0.02 0.04 0.07 0.03 0.05 0.05 0.05 0.01 0.02 0.02 0.02 1.0
0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.4
0.05 0.02 0.03 0.0 0.02 0.53 0.08 0.07 0.03 0.02 0.02 0.15 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.04 0.01 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.82
0.02 0.02 0.03 0.05 0.05 0.47 0.19 0.13 0.06 0.06 0.07 0.08 0.03 0.03 0.08 0.09 0.13 0.17 0.05 1.0
0.4 0.31 0.36 0.12 0.01 1.0 0.16 0.04 0.06 0.08 0.01 0.14 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.82
0.13 0.03 0.05 0.05 0.07 0.71 0.03 0.2 0.15 0.12 0.08 0.18 0.23 0.19 0.06 0.07 0.12 0.19 0.0 1.0
0.02 0.07 0.09 0.04 0.08 0.63 0.03 0.07 0.09 0.06 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.2 0.23 0.15 1.0
0.18 0.24 0.12 0.25 0.26 1.0 0.22 0.14 0.19 0.16 0.09 0.13 0.18 0.19 0.11 0.21 0.13 0.37 0.34 0.65
0.4 0.19 0.46 0.31 0.32 0.6 0.09 0.17 0.18 0.15 0.24 0.1 0.17 0.15 0.2 0.19 0.21 0.24 0.15 1.0
0.53 0.04 0.04 0.16 0.05 1.0 0.37 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.27
0.36 0.11 0.17 0.09 0.03 0.66 0.27 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 1.0
0.16 0.04 0.07 0.11 0.07 0.38 0.1 0.1 0.03 0.03 0.04 0.06 0.06 0.09 0.04 0.04 0.06 0.07 0.09 1.0
0.07 0.4 0.0 0.0 0.0 1.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12
0.61 0.13 0.48 0.35 0.21 1.0 0.08 0.24 0.13 0.14 0.17 0.15 0.07 0.06 0.18 0.14 0.22 0.19 0.18 0.85
0.07 0.0 0.02 0.14 0.38 1.0 0.13 0.02 0.01 0.0 0.02 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.07 0.07 0.99
0.4 0.12 0.04 0.14 0.08 1.0 0.0 0.4 0.14 0.2 0.02 0.47 0.06 0.25 0.01 0.03 0.19 0.06 0.0 0.02
0.15 0.06 0.13 0.18 0.21 0.09 0.34 0.12 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.25 0.06 1.0
0.39 0.01 0.07 0.01 0.01 0.75 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.13 0.08 1.0
0.02 0.05 0.01 0.0 0.01 0.45 0.07 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 1.0
0.01 0.05 0.03 0.0 0.03 1.0 0.05 0.06 0.13 0.12 0.03 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.04 0.0 0.1 0.83
0.05 0.33 0.24 0.19 0.07 0.08 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.01
0.09 0.05 0.0 0.01 0.02 1.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.03 0.02 0.0 0.01 0.01 0.04 0.07 0.04 0.0 0.03
0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.14

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)