1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_297 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.05 0.07 0.11 0.06 0.03 0.05 0.29 0.18 0.16 0.75 0.13 0.0 0.15 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.04 0.0 0.01 0.05 0.01 0.0 0.14 0.02 0.0 0.0 0.08 0.29 0.03
0.06 0.0 0.06 0.1 0.0 0.07 0.05 0.12 0.0 0.08 0.21 0.05 0.08 0.09 0.03 0.22 0.0 0.05 0.26 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
12.09 7.02 7.02 26.49 11.05 1.9 0.3 3.26 2.41 1.66 2.0 0.15 5.01 4.81 2.47 1.73 2.83 3.04 0.79 5.68
0.01 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.07 0.01 0.08 0.01 0.02 0.02 0.04 0.13 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.05 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.11 0.27
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.02 0.14 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.0 0.02 0.0
0.01 0.0 0.0 0.36 0.28 0.05 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.13 0.0 0.02 0.02 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.05 0.01 0.04 0.01 0.03 0.02 0.0 0.03 0.01 0.06 0.1 0.06 0.0 0.02 0.02
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.05 0.0 0.02 0.05 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 3.37 0.0 0.0 0.47 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.27 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.04 0.03 0.01 0.04 0.08 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 1.14 0.0 0.08 0.18 1.54 1.18 1.34 0.47 2.66 0.77 0.94 0.31 0.1 1.16 0.2 0.0 1.57
0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.07 0.02 0.03 0.01 0.07 0.38 0.19 0.0 0.05 0.03
0.01 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.01 0.04 0.16 0.0 0.0 0.02 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.17 0.03 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.05 0.05 0.05 0.03 0.02 0.01 0.16 0.04 0.03 0.37 0.08 0.05 0.06 0.3 0.25 0.02 0.03 0.02 0.01
0.0 0.02 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 0.01 0.06 0.01 0.0 0.0 0.08 0.15 0.01 0.02 0.02 0.0
0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.37 0.17 0.0 0.0 0.49 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.11
4.89 0.1 2.07 50.88 14.41 4.11 0.3 1.65 0.57 0.56 1.09 1.89 0.71 0.38 0.87 0.98 4.1 1.31 2.7 1.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
2.2 0.0 1.82 8.1 0.0 0.0 0.0 1.37 1.04 3.08 0.0 1.28 0.0 0.54 0.0 0.35 0.0 4.85 7.83 16.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.5 0.43 0.15 1.08 0.6 0.33 0.33 1.31 0.41 0.4 1.34 0.43 1.8 1.77 1.7 3.64 0.36 0.96 0.4 0.24
0.0 0.0 0.0 0.31 0.1 0.0 0.0 0.67 0.12 0.11 0.0 0.17 0.07 0.07 0.0 0.23 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.17 0.27 4.98 0.74 0.02 0.0 0.77 1.54 1.29 0.14 0.12 0.06 0.04 0.14 0.14 0.12 0.43 1.65 0.13
0.23 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.05 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.04 0.22 0.0 0.08 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.07 0.04 0.0 0.12 0.0 0.0 0.04 0.1 0.0 0.0 0.0 0.2 0.02
0.34 0.0 0.15 0.43 0.0 0.0 0.0 0.12 0.13 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.35 0.32 0.0 0.0 0.09 0.0
11.14 2.13 9.06 22.83 21.1 5.91 5.01 8.69 10.13 9.54 2.64 6.95 6.07 8.38 2.49 18.33 21.73 9.05 3.68 10.44
0.01 0.0 0.01 0.14 0.08 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.05 0.02 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.01 0.0 0.23 0.0 0.01 0.01 0.06 0.06 0.02 0.12 0.02 0.02 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 2.43 0.03 1.38 0.21 1.26 0.23 9.08 24.52 31.11 4.8 35.32 13.65 10.66 5.74 7.63 22.04 0.52 0.0 37.67
0.01 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.04 0.05 0.06 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.05 0.41 0.18 0.0 0.1 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.03 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.46 0.0 0.0 0.08 0.06 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.17 2.05 1.65 1.07 1.09 2.0 0.89 5.93 0.97 0.75 12.23 1.14 2.43 2.41 8.47 35.4 3.2 1.13 0.79 0.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.08 0.0 0.72 0.07 0.05 0.02 0.38 0.1 0.0 0.0 0.1 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)