Heatmap: Cluster_297 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00836	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01042	0.63	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.71	0.36	0.11	0.0	0.6	0.17	0.36	0.0	0.26	0.87	0.43	0.0	0.32	0.29
Gb_01275	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02281	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0	0.71	0.0	0.3	0.27	0.54	0.32	0.06	0.2	0.0	0.14	0.74	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_02548	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02643	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.07	0.09	0.14	0.08	0.03	0.06	0.39	0.25	0.22	1.0	0.18	0.0	0.21	0.09
Gb_02755	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03574	0.17	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.13	0.15	0.01	0.04	0.18	0.03	0.0	0.47	0.08	0.0	0.0	0.28	1.0	0.1
Gb_03952	0.24	0.0	0.23	0.37	0.0	0.26	0.19	0.45	0.0	0.29	0.82	0.21	0.29	0.36	0.11	0.87	0.0	0.2	1.0	0.19
Gb_04179	0.0	0.0	0.0	0.0	0.91	0.0	0.0	0.13	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	0.0	1.0	0.0	0.0	0.85	0.0
Gb_04240	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.08	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_05729	0.81	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.34	0.45	0.0	0.29	0.0	0.14	0.0	0.19	0.0	0.0	1.0	0.0	0.18	0.0
Gb_05906	0.46	0.27	0.27	1.0	0.42	0.07	0.01	0.12	0.09	0.06	0.08	0.01	0.19	0.18	0.09	0.07	0.11	0.11	0.03	0.21
Gb_06700	0.05	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.06	0.09	0.06	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07165	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.28	0.58	0.1	0.63	0.1	0.16	0.15	0.35	1.0	0.0	0.0	0.63	0.0
Gb_07225	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07716	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.7	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0
Gb_08004	0.08	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.18	0.44
Gb_09044	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09691	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	1.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09755	0.29	0.0	0.14	1.0	0.0	0.16	0.09	0.08	0.05	0.17	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.2	0.0	0.14	0.0
Gb_09880	0.03	0.0	0.0	1.0	0.76	0.14	0.07	0.06	0.0	0.04	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.35	0.0	0.05	0.04	0.0
Gb_10483	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_11495	0.34	0.0	0.0	0.73	0.0	0.54	0.12	0.35	0.08	0.34	0.22	0.0	0.28	0.08	0.57	1.0	0.56	0.0	0.23	0.21
Gb_11706	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.69	0.27	0.19	0.0	0.0	0.13	0.09	0.16	0.93	0.0	0.32	1.0	0.0
Gb_11948	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.18	0.18	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0
Gb_13229	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.67	0.02	0.0
Gb_13258	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_13269	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.13	0.53	0.42	0.12	0.52	1.0	0.0	0.0	0.49	0.0	0.64	0.0
Gb_14373	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15648	0.0	0.01	0.0	0.43	0.0	0.03	0.07	0.58	0.44	0.5	0.18	1.0	0.29	0.35	0.12	0.04	0.44	0.08	0.0	0.59
Gb_16153	0.1	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.03	0.0	0.19	0.05	0.08	0.04	0.19	1.0	0.49	0.0	0.14	0.08
Gb_16192	0.2	0.86	0.0	0.0	0.82	0.0	0.0	0.23	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0
Gb_16820	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17284	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.12	0.0	0.23	0.0	0.0	0.39	0.0	0.34	0.07	0.28	1.0	0.0	0.0	0.12	0.0
Gb_18275	0.46	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.77	0.0	0.0	0.0	0.62	0.0
Gb_18620	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.32	0.05	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.16	1.0	0.18	0.0	0.06	0.0
Gb_19942	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20148	0.05	0.12	0.12	0.12	0.08	0.04	0.02	0.44	0.12	0.07	1.0	0.22	0.14	0.16	0.79	0.66	0.04	0.08	0.06	0.04
Gb_20149	0.0	0.15	0.0	0.22	0.04	0.04	0.0	0.33	0.02	0.04	0.39	0.07	0.03	0.02	0.53	1.0	0.1	0.12	0.12	0.0
Gb_21719	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.74	0.34	0.0	0.0	0.98	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.21
Gb_21867	0.1	0.0	0.04	1.0	0.28	0.08	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.03	0.05	0.04
Gb_22024	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22113	0.0	0.0	0.0	0.9	0.23	0.86	0.0	0.47	0.0	0.0	0.34	0.0	0.0	0.54	0.0	0.42	0.38	0.74	1.0	0.0
Gb_22160	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22678	0.14	0.0	0.11	0.5	0.0	0.0	0.0	0.08	0.06	0.19	0.0	0.08	0.0	0.03	0.0	0.02	0.0	0.3	0.48	1.0
Gb_22813	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23102	0.14	0.12	0.04	0.3	0.17	0.09	0.09	0.36	0.11	0.11	0.37	0.12	0.49	0.49	0.47	1.0	0.1	0.26	0.11	0.07
Gb_23892	0.0	0.0	0.0	0.47	0.15	0.0	0.0	1.0	0.18	0.16	0.0	0.26	0.11	0.1	0.0	0.35	0.15	0.0	0.0	0.0
Gb_26099	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26110	0.03	0.03	0.05	1.0	0.15	0.0	0.0	0.15	0.31	0.26	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.09	0.33	0.03
Gb_26724	0.39	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.09	0.06	0.09	0.0	0.0	0.0	0.03	0.11	0.06	0.36	0.0	0.13	0.1	0.0
Gb_26759	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.27	0.32	0.19	0.0	0.61	0.0	0.0	0.18	0.5	0.0	0.0	0.0	1.0	0.09
Gb_27714	0.8	0.0	0.34	1.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.31	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.81	0.75	0.0	0.0	0.22	0.0
Gb_28042	0.49	0.09	0.4	1.0	0.92	0.26	0.22	0.38	0.44	0.42	0.12	0.3	0.27	0.37	0.11	0.8	0.95	0.4	0.16	0.46
Gb_28161	0.1	0.0	0.06	1.0	0.6	0.0	0.0	0.05	0.13	0.11	0.12	0.08	0.05	0.02	0.05	0.37	0.13	0.06	0.0	0.0
Gb_28990	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.6	0.39	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0
Gb_29210	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30211	0.05	0.0	0.03	0.0	1.0	0.0	0.04	0.03	0.26	0.25	0.1	0.5	0.08	0.1	0.24	0.0	0.04	0.0	0.0	0.15
Gb_31180	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33163	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33237	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33820	0.0	0.06	0.0	0.04	0.01	0.03	0.01	0.24	0.65	0.83	0.13	0.94	0.36	0.28	0.15	0.2	0.58	0.01	0.0	1.0
Gb_34869	0.25	0.0	0.0	0.76	1.0	0.0	0.13	0.18	0.3	0.34	0.22	0.0	0.18	0.0	0.0	0.86	0.0	0.0	0.33	0.0
Gb_35901	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38030	0.19	0.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.1	0.12	0.15	0.0	0.07	0.0	0.15	0.0	0.13	1.0	0.45	0.0	0.23	0.47
Gb_39331	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39395	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.72	0.0
Gb_39999	0.08	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0	0.0	0.14	0.04	0.0	1.0	0.0	0.0	0.17	0.13	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0
Gb_40124	0.13	0.0	0.0	1.0	0.25	0.58	0.46	0.57	0.08	0.36	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.91	0.0	0.0	0.47	0.0
Gb_40206	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.73	0.0	0.0	0.69	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40524	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40558	0.03	0.06	0.05	0.03	0.03	0.06	0.03	0.17	0.03	0.02	0.35	0.03	0.07	0.07	0.24	1.0	0.09	0.03	0.02	0.01
Gb_41390	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41658	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.11	0.0	1.0	0.1	0.07	0.03	0.54	0.14	0.0	0.0	0.15	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)