Heatmap: Cluster_39 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_01356	0.01	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.02
Gb_01657	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01916	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02021	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.02	0.0
Gb_02043	0.02	0.08	0.0	0.21	0.04	0.0	0.03	0.03	0.02	0.04	0.03	0.0	0.15	0.11	0.0	0.23	0.07	0.07	0.05	0.0
Gb_02449	0.16	0.39	0.73	3.13	2.45	0.64	0.97	4.16	1.04	1.43	3.58	0.36	0.31	0.21	2.65	2.27	0.23	0.81	11.0	4.97
Gb_02590	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0
Gb_03082	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_03104	0.19	0.18	0.0	0.99	0.07	0.0	0.03	0.12	0.11	0.07	0.25	0.04	0.04	0.08	0.13	0.29	0.0	0.23	0.55	0.28
Gb_03193	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03267	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03284	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03439	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03594	0.0	0.0	0.01	0.09	0.02	0.0	0.04	0.01	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.01	0.0	0.02	0.06	0.0
Gb_03957	0.08	0.0	0.18	0.0	0.18	0.0	0.0	0.04	0.05	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.28	0.53	0.18	0.0	0.11	0.0
Gb_04172	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04337	0.03	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.06	0.02	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.16	0.0
Gb_04435	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_04628	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0
Gb_05607	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_05895	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_06155	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07329	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0
Gb_07373	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.37	0.0	0.0	0.38	0.61	0.93
Gb_08390	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_08590	0.11	0.0	0.12	0.37	0.28	0.0	0.06	0.05	0.02	0.01	0.07	0.01	0.04	0.04	0.02	0.17	0.0	0.02	0.08	0.08
Gb_08711	0.02	0.2	0.0	0.47	0.0	0.0	0.03	0.02	0.04	0.15	0.04	0.0	0.04	0.02	0.05	0.07	0.05	0.04	0.12	0.0
Gb_09187	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09586	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09892	0.07	0.06	0.0	0.25	0.04	0.0	0.01	0.02	0.0	0.02	0.03	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.04
Gb_09909	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10154	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10168	0.06	0.04	0.08	0.18	0.04	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.0	0.03	0.05	0.01	0.0	0.14	0.0	0.09	0.04
Gb_10295	0.01	0.0	0.0	0.03	0.04	0.0	0.52	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.66
Gb_10531	0.1	0.15	0.26	0.13	0.08	0.0	0.08	0.08	0.09	0.12	0.29	0.01	0.34	0.08	0.47	0.05	0.01	0.0	0.01	0.12
Gb_10541	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10826	0.16	0.0	0.0	0.36	0.13	0.03	0.02	0.08	0.06	0.02	0.05	0.01	0.08	0.04	0.12	0.2	0.0	0.03	0.25	0.05
Gb_11242	0.04	0.0	0.0	0.75	0.23	0.0	0.09	0.05	0.04	0.0	0.09	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0
Gb_13044	0.0	0.06	0.01	0.12	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.01	0.03	0.06	0.0
Gb_13887	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.05	0.02	0.01	0.01	0.05	0.0
Gb_13933	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14009	0.03	0.09	0.04	0.07	0.04	0.0	0.0	0.02	0.05	0.01	0.04	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.09	0.0
Gb_14608	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0
Gb_15173	0.0	0.02	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01
Gb_16220	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16863	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0
Gb_16968	0.0	0.0	0.0	0.45	0.04	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.13	0.0	0.0	0.28	0.0
Gb_17052	0.05	0.0	0.0	0.34	0.11	0.0	0.0	0.08	0.03	0.0	0.0	0.01	0.04	0.02	0.09	0.65	0.07	0.0	0.26	0.0
Gb_17507	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17516	0.05	0.01	0.0	0.04	0.03	0.0	0.02	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.04	0.03	0.0	0.02	0.09	0.01
Gb_17642	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17991	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.03	0.0
Gb_18293	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0
Gb_18490	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19601	0.01	0.0	0.02	0.2	0.03	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.14	0.05
Gb_19649	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0
Gb_19910	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20052	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20721	0.0	0.11	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.03	0.03	0.0	0.08	0.0
Gb_21427	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.03	0.0
Gb_22293	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.12	0.02	0.02	0.0	0.14	0.0	0.02	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.14	0.0
Gb_22707	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_23276	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.08	0.12	0.0	0.0	0.07	0.0
Gb_24181	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.0	0.0	0.0
Gb_24841	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24847	0.12	0.11	0.0	0.16	0.0	0.06	0.06	0.14	0.14	0.16	0.07	0.01	0.04	0.02	0.0	0.66	0.0	0.0	0.56	0.0
Gb_25212	0.05	0.0	0.0	0.6	0.0	0.02	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.37	0.0
Gb_25411	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_25656	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26387	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_27116	0.51	0.0	0.0	0.0	1.1	0.0	0.0	0.11	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.21	0.0	0.0	0.28	0.0
Gb_27173	0.07	0.0	0.07	0.16	0.13	0.01	0.0	0.09	0.1	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.02	0.07	0.25	0.02	0.0	0.21
Gb_27233	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0
Gb_28110	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28449	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28469	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28543	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28908	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29655	0.01	0.0	0.0	0.06	0.03	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.08	0.01	0.01	0.3	0.0
Gb_29932	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29979	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30072	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0
Gb_30087	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30317	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_31152	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0
Gb_31472	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_31662	0.02	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_32519	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32900	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33662	0.02	0.0	0.0	0.07	0.0	0.02	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_33689	0.14	0.27	0.0	0.91	0.03	0.03	0.05	0.12	0.12	0.07	0.1	0.0	0.02	0.06	0.18	0.44	0.12	0.1	0.35	0.08
Gb_33865	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_34263	0.25	0.0	0.58	2.0	0.44	0.0	0.38	0.37	0.09	0.09	0.13	0.01	0.24	0.0	0.62	0.66	0.0	0.57	1.75	0.0
Gb_34544	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0
Gb_35815	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36396	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.03	0.1	0.0
Gb_37125	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0
Gb_37314	0.07	0.0	0.0	0.56	0.0	0.0	0.03	0.12	0.09	0.0	0.0	0.01	0.06	0.05	0.44	0.44	0.26	0.0	0.4	0.04
Gb_37487	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37584	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0
Gb_37612	0.02	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.09	0.0
Gb_38194	0.05	0.0	0.09	0.11	0.0	0.0	0.02	0.06	0.03	0.01	0.02	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.09	0.11
Gb_38288	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38553	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_38720	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39078	0.04	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.12	0.0	0.06	0.08
Gb_39089	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40969	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.03	0.06	0.0	0.0	0.03	0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)