Heatmap: Cluster_39 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_01356	0.22	0.0	0.0	1.0	0.11	0.0	0.14	0.06	0.11	0.31	0.0	0.0	0.0	0.04	0.1	0.37	0.0	0.0	0.28	0.44
Gb_01657	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01916	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02021	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	0.0	0.0	0.23	0.0
Gb_02043	0.07	0.33	0.0	0.92	0.16	0.0	0.15	0.13	0.09	0.17	0.14	0.0	0.65	0.46	0.0	1.0	0.32	0.29	0.21	0.0
Gb_02449	0.01	0.04	0.07	0.28	0.22	0.06	0.09	0.38	0.09	0.13	0.33	0.03	0.03	0.02	0.24	0.21	0.02	0.07	1.0	0.45
Gb_02590	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0
Gb_03082	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_03104	0.19	0.18	0.0	1.0	0.07	0.0	0.03	0.12	0.11	0.07	0.25	0.04	0.04	0.08	0.13	0.29	0.0	0.23	0.56	0.28
Gb_03193	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03267	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03284	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03439	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03594	0.0	0.0	0.1	1.0	0.21	0.0	0.43	0.16	0.31	0.09	0.0	0.0	0.0	0.19	0.4	0.12	0.0	0.2	0.68	0.0
Gb_03957	0.16	0.0	0.34	0.0	0.34	0.0	0.0	0.07	0.1	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.53	1.0	0.33	0.0	0.21	0.0
Gb_04172	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04337	0.15	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.11	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.86	0.0
Gb_04435	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	1.0
Gb_04628	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0
Gb_05607	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_05895	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_06155	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07329	0.0	0.0	0.0	0.98	0.0	0.0	0.19	0.13	0.09	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_07373	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.4	0.0	0.0	0.41	0.65	1.0
Gb_08390	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_08590	0.3	0.0	0.34	1.0	0.75	0.0	0.16	0.13	0.05	0.03	0.18	0.02	0.1	0.11	0.06	0.45	0.0	0.05	0.22	0.21
Gb_08711	0.05	0.42	0.0	1.0	0.0	0.0	0.06	0.05	0.09	0.32	0.09	0.0	0.08	0.04	0.1	0.15	0.1	0.08	0.26	0.0
Gb_09187	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09586	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09892	0.28	0.25	0.0	1.0	0.16	0.0	0.02	0.08	0.0	0.06	0.11	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.15
Gb_09909	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.14	0.07	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.21	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10154	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10168	0.34	0.2	0.43	1.0	0.23	0.1	0.06	0.17	0.09	0.2	0.17	0.0	0.16	0.26	0.08	0.0	0.81	0.0	0.53	0.25
Gb_10295	0.01	0.0	0.0	0.04	0.06	0.0	0.79	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.01	1.0
Gb_10531	0.2	0.32	0.55	0.28	0.18	0.0	0.16	0.17	0.19	0.25	0.61	0.02	0.72	0.17	1.0	0.11	0.02	0.0	0.02	0.26
Gb_10541	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10826	0.44	0.0	0.0	1.0	0.35	0.09	0.07	0.23	0.16	0.06	0.15	0.03	0.22	0.1	0.34	0.55	0.0	0.07	0.71	0.15
Gb_11242	0.05	0.0	0.0	1.0	0.31	0.0	0.12	0.07	0.05	0.0	0.13	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0
Gb_13044	0.0	0.48	0.08	1.0	0.15	0.0	0.09	0.09	0.1	0.04	0.09	0.02	0.03	0.03	0.21	0.12	0.08	0.25	0.5	0.0
Gb_13887	0.14	0.0	0.12	0.43	0.0	0.0	0.1	0.24	0.07	0.21	0.51	0.04	0.0	0.0	1.0	0.37	0.12	0.1	0.9	0.0
Gb_13933	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14009	0.31	0.92	0.41	0.77	0.41	0.0	0.0	0.17	0.54	0.12	0.4	0.0	0.08	0.0	0.19	0.0	0.0	0.18	1.0	0.0
Gb_14608	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0
Gb_15173	0.0	1.0	0.25	0.85	0.22	0.0	0.0	0.17	0.35	0.17	0.21	0.0	0.0	0.0	0.43	0.27	0.0	0.0	0.91	0.24
Gb_16220	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16863	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_16968	0.0	0.0	0.0	1.0	0.08	0.0	0.0	0.03	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.29	0.0	0.0	0.63	0.0
Gb_17052	0.08	0.0	0.0	0.53	0.16	0.0	0.0	0.12	0.05	0.0	0.0	0.02	0.07	0.03	0.14	1.0	0.11	0.0	0.4	0.0
Gb_17507	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17516	0.58	0.14	0.05	0.42	0.32	0.0	0.18	0.11	0.04	0.17	0.06	0.0	0.0	0.0	0.4	0.28	0.0	0.22	1.0	0.09
Gb_17642	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17991	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.1	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.64	0.0
Gb_18293	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_18490	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19601	0.03	0.0	0.1	1.0	0.14	0.0	0.11	0.06	0.01	0.0	0.04	0.0	0.0	0.06	0.04	0.19	0.09	0.12	0.69	0.26
Gb_19649	0.58	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.19	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_19910	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20052	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20721	0.0	1.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.16	0.09	0.08	0.13	0.0	0.2	0.0	0.0	0.26	0.31	0.0	0.7	0.0
Gb_21427	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.27	0.0
Gb_22293	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.38	0.08	0.05	0.0	0.44	0.0	0.07	0.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.46	0.0
Gb_22707	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.05	0.0
Gb_23276	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.04	0.0	0.0	0.0	0.06	0.06	0.33	0.5	0.0	0.0	0.28	0.0
Gb_24181	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.87	0.0	0.0	0.0
Gb_24841	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24847	0.19	0.16	0.0	0.24	0.0	0.09	0.09	0.22	0.21	0.25	0.11	0.02	0.06	0.03	0.0	1.0	0.0	0.0	0.85	0.0
Gb_25212	0.08	0.0	0.0	1.0	0.0	0.03	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.61	0.0
Gb_25411	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_25656	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26387	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.92	0.83	0.0	1.0	0.0	0.0	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_27116	0.46	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.19	0.0	0.0	0.26	0.0
Gb_27173	0.29	0.0	0.26	0.66	0.52	0.05	0.0	0.36	0.39	0.09	0.08	0.19	0.05	0.1	0.07	0.28	1.0	0.08	0.01	0.85
Gb_27233	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.0
Gb_28110	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28449	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28469	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28543	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28908	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29655	0.05	0.0	0.0	0.21	0.11	0.03	0.0	0.05	0.03	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.03	0.25	0.04	0.03	1.0	0.0
Gb_29932	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29979	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30072	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.0	0.03	0.12	0.3	0.0	0.81	0.0	0.19	0.0	0.75	0.65	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_30087	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30317	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_31152	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.63	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_31472	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_31662	0.16	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.18	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.0
Gb_32519	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32900	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33662	0.29	0.0	0.0	1.0	0.0	0.28	0.16	0.11	0.0	0.14	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.0
Gb_33689	0.16	0.3	0.0	1.0	0.03	0.04	0.05	0.13	0.14	0.08	0.11	0.0	0.02	0.06	0.19	0.49	0.14	0.1	0.38	0.09
Gb_33865	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_34263	0.12	0.0	0.29	1.0	0.22	0.0	0.19	0.19	0.04	0.05	0.07	0.0	0.12	0.0	0.31	0.33	0.0	0.29	0.88	0.0
Gb_34544	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0
Gb_35815	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.33	0.0	0.0	0.0	0.27	0.22	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36396	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.1	0.02	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.14	0.5	0.0
Gb_37125	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0
Gb_37314	0.13	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.05	0.21	0.15	0.0	0.0	0.02	0.1	0.09	0.79	0.79	0.46	0.0	0.72	0.07
Gb_37487	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37584	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_37612	0.14	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.18	0.15	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.8	0.0	0.0	0.74	0.0
Gb_38194	0.48	0.0	0.81	0.97	0.0	0.0	0.17	0.51	0.3	0.13	0.22	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.83	1.0
Gb_38288	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38553	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.14	0.17	0.0	0.0	0.07	0.0	0.48	0.18	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_38720	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39078	0.15	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.41	0.0	0.21	0.27
Gb_39089	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40969	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.21	0.5	1.0	0.0	0.0	0.52	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)