Heatmap: Cluster_153 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
1.14 0.0 0.13 0.39 0.0 1.78 1.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.16
15.79 8.4 6.8 4.43 3.81 1.8 13.52 1.22 1.82 1.81 1.74 1.19 0.61 0.49 2.2 1.41 2.94 2.3 1.17 0.79
0.07 0.11 0.05 0.16 0.01 0.03 0.15 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02
6.65 8.27 11.92 12.15 13.01 23.12 14.47 9.01 6.08 4.92 6.95 7.08 5.61 6.27 7.45 10.07 10.62 4.62 4.43 4.04
0.06 0.03 0.03 0.14 0.22 60.06 215.61 0.42 0.08 0.06 0.09 0.57 0.07 0.15 0.04 0.1 2.66 0.34 1.55 0.15
0.0 0.0 0.03 2.92 0.03 1471.36 2375.65 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 1.62
6.09 2.22 3.16 4.83 3.3 19.99 26.87 1.51 1.0 1.25 1.85 0.56 0.7 1.21 1.92 0.98 0.77 2.61 2.22 1.37
8.76 6.49 9.83 5.65 9.33 19.46 36.8 0.6 0.26 0.58 0.08 0.45 0.1 0.47 1.61 0.06 0.26 5.77 0.79 1.88
13.03 16.29 19.52 15.13 17.86 40.45 70.28 2.34 2.06 2.39 1.59 1.5 0.55 0.48 1.37 0.0 0.06 9.84 24.33 5.09
9.36 6.59 7.23 5.43 9.89 15.46 23.78 2.51 1.67 1.46 1.33 1.68 0.8 0.9 1.42 1.78 2.14 8.0 8.73 6.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.71 0.27 0.6 0.3 0.33 2.38 3.3 0.04 0.03 0.03 0.03 0.01 0.03 0.05 0.02 0.01 0.02 0.09 0.32 0.03
0.01 0.05 0.1 0.07 0.0 0.11 0.62 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.02 0.04 0.04 0.0 0.0 0.18 0.1 0.06
0.03 0.0 0.0 0.0 0.06 16.32 27.02 0.28 0.15 0.29 0.09 0.19 0.89 1.08 0.14 0.0 0.03 0.0 0.0 0.15
4.59 3.58 3.95 6.18 0.89 3.59 9.75 0.15 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.14 0.08
6.99 2.53 9.54 3.9 1.17 3.26 8.96 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.15 0.06
0.62 0.08 0.22 0.29 0.18 0.04 0.56 0.08 0.09 0.1 0.17 0.01 0.05 0.04 0.27 0.0 0.09 0.09 0.28 0.27
1.62 1.03 1.26 1.29 1.99 192.32 274.27 0.37 0.04 0.0 0.0 0.24 0.06 0.0 0.0 2.36 0.14 0.85 18.75 5.18
2.53 1.58 1.39 0.72 0.84 0.1 2.02 0.29 0.15 0.16 0.41 0.13 0.11 0.13 0.53 0.18 0.31 0.95 0.66 1.44
0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.43 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02
10.34 23.66 17.42 4.2 9.02 47.06 60.37 2.55 5.47 6.55 25.6 0.69 3.28 2.46 21.93 0.23 0.8 4.21 20.36 29.42
0.6 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.54 0.07 0.0 0.0 0.12 0.03 0.14 0.05 0.0 0.14 0.17 0.0 0.2 0.1
0.29 0.41 0.19 0.4 0.07 0.23 0.77 0.11 0.04 0.07 0.06 0.03 0.05 0.02 0.05 0.15 0.22 0.33 0.06 0.05
17.32 0.0 0.89 0.19 0.38 22.27 0.03 3.71 2.43 2.95 8.69 4.02 4.65 4.26 5.59 0.96 1.86 0.14 0.02 1.28
4.08 3.22 3.22 3.15 6.62 6.61 15.04 0.35 0.06 0.07 0.07 0.24 0.04 0.07 0.05 0.12 0.55 2.05 2.25 2.71
2.13 0.44 0.43 0.0 0.05 0.19 2.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 0.12 0.68 0.0 0.06 0.0 0.45 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.04 0.0
0.84 0.59 0.69 0.78 0.05 0.02 0.87 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.32
1.24 2.0 0.89 0.5 0.81 2.87 7.16 0.99 0.85 0.68 0.32 0.38 1.12 0.92 0.5 0.34 0.18 0.32 0.24 0.89
0.69 0.25 0.21 0.55 0.53 0.14 0.79 0.12 0.05 0.05 0.3 0.15 0.06 0.07 0.2 0.08 0.21 0.13 0.0 0.37
0.81 0.5 0.45 0.28 0.14 0.0 1.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.38 0.21 0.17
10.16 6.31 9.37 3.38 3.43 19.87 24.69 0.83 0.61 0.59 0.37 0.18 0.02 0.12 0.19 0.17 1.83 1.1 4.41 0.08
0.85 0.12 0.11 0.1 0.58 0.25 1.01 0.13 0.21 0.17 0.25 0.03 0.03 0.03 0.17 0.2 0.03 0.3 0.3 0.35
3.71 1.25 1.32 2.99 0.21 0.14 1.49 0.82 0.55 0.54 1.92 0.7 0.46 0.66 1.89 2.71 2.64 0.09 0.0 0.05
0.11 0.0 0.06 0.33 0.1 7.7 11.81 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.04 0.05 0.95 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
66.46 25.2 28.86 45.64 3.41 1.96 27.73 16.62 10.48 11.27 34.64 14.7 9.02 13.6 32.98 50.77 59.18 2.52 0.0 0.05
0.32 0.42 0.48 0.0 0.0 0.13 1.1 0.02 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.07 0.19 0.02
5.06 2.72 7.38 4.75 2.16 0.91 3.85 0.15 0.0 0.0 0.12 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 1.35 1.61 0.1
0.25 0.13 0.17 0.0 0.15 21.2 29.59 0.04 0.01 0.0 0.06 0.03 0.0 0.0 0.05 0.14 0.06 0.27 1.38 0.52
0.21 0.0 0.01 0.09 0.08 0.05 0.24 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.05 0.01
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
6.93 7.41 9.37 3.32 1.72 1.82 14.64 0.08 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.39 1.5 0.4
0.37 0.0 0.07 0.24 0.12 13.03 22.27 0.07 0.05 0.15 0.04 0.12 0.13 0.06 0.0 0.09 0.04 0.07 0.32 0.17
10.23 4.97 7.16 9.26 12.73 51.49 18.76 5.28 2.38 2.42 3.09 3.06 3.45 4.23 3.07 1.99 2.84 9.31 4.35 7.31
0.27 0.37 0.26 0.42 0.17 353.99 205.9 0.08 0.02 0.0 0.04 0.03 0.01 0.05 0.06 0.0 0.02 0.25 0.01 0.27
4.97 4.21 7.22 6.01 3.46 1.9 6.38 0.61 0.64 0.47 0.04 0.19 0.11 0.16 0.05 0.06 0.08 1.68 0.16 0.34
9.08 15.15 13.74 8.0 8.16 6.82 11.53 2.37 2.88 1.95 2.28 2.14 2.07 2.09 2.1 2.94 1.73 4.42 5.11 2.65
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.2 0.0 0.0 0.06 0.1 0.23 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.05
5.9 2.22 2.36 0.83 0.25 0.0 5.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.22 0.0 0.11 0.18 0.29 60.93 22.65 0.07 0.05 0.03 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.33 0.08 0.25 3.17 0.87
18.59 11.14 8.22 7.49 4.86 0.36 21.07 0.07 0.34 0.05 0.26 0.02 0.14 0.2 0.53 0.05 0.02 0.13 0.0 13.62
1.86 1.04 1.18 1.35 0.6 2.45 5.13 0.16 0.09 0.12 0.04 0.08 0.03 0.02 0.07 0.06 0.41 0.1 0.09 0.06
14.65 11.67 12.96 17.4 15.01 18.48 18.96 7.71 6.33 6.21 8.73 7.6 7.68 8.1 8.67 7.39 11.82 12.62 13.13 11.47
1.22 0.76 0.36 0.55 1.6 128.02 151.11 0.29 0.11 0.24 0.0 0.11 0.0 0.03 0.08 0.76 0.0 0.67 5.1 3.97
2.91 1.04 2.55 1.3 0.9 0.25 2.13 0.35 0.25 0.3 0.73 0.18 0.15 0.17 0.49 0.18 0.07 0.38 0.46 0.2
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
13.0 5.32 3.93 13.95 2.56 0.88 24.05 1.18 0.07 0.01 0.0 0.31 0.21 0.29 0.0 0.15 0.0 5.88 0.0 6.41
14.04 13.36 13.27 13.6 14.84 29.91 30.58 9.21 4.6 4.78 7.95 5.34 4.9 4.5 8.26 6.11 5.77 14.21 13.12 10.03
3.28 2.67 3.08 4.96 9.77 58.88 33.05 2.86 0.9 1.26 2.38 1.66 1.52 1.83 2.96 1.34 1.9 10.73 12.84 7.18
30.07 3.55 2.08 7.2 2.19 1.05 29.07 2.49 3.81 4.35 3.68 3.02 2.77 2.62 3.13 3.36 2.42 3.19 7.69 3.05
0.21 0.14 0.27 0.11 0.14 0.04 0.29 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0
12.45 7.61 7.88 4.35 6.59 236.15 314.24 13.67 2.66 3.36 0.94 2.99 0.47 1.15 1.11 1.54 3.49 6.15 43.78 43.03
4.26 1.87 6.03 0.0 4.77 5.54 11.28 3.33 3.51 2.55 2.66 1.9 5.55 5.36 3.1 3.22 4.1 0.37 2.23 2.35
1.49 0.5 1.37 2.59 0.54 18.42 19.84 1.77 4.26 3.79 4.08 1.2 2.07 3.46 0.64 2.21 2.69 2.32 0.86 4.56
23.64 0.11 2.0 0.92 2.56 54.14 0.12 15.3 28.65 33.22 26.06 26.59 19.93 17.2 26.29 8.64 21.61 0.77 0.12 3.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 2.64 2.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 0.0 1.09 0.49 0.33 0.09 0.51 0.02 0.02 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.21
0.57 0.26 0.78 0.38 0.48 0.61 1.31 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0
3.35 0.0 1.59 2.98 0.3 0.0 2.95 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
1.07 1.22 0.52 0.15 0.34 54.05 76.74 0.45 0.25 0.54 0.11 1.85 0.06 0.12 0.1 0.52 0.9 0.15 0.52 2.75
0.85 1.06 1.0 0.85 0.85 0.87 1.83 0.08 0.02 0.04 0.16 0.11 0.0 0.02 0.12 0.06 0.0 0.14 0.21 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
58.32 24.54 13.52 60.03 8.57 1.21 0.0 17.21 11.7 20.92 0.22 5.3 1.34 4.95 0.18 22.75 41.66 6.7 0.02 0.03
15.38 8.07 8.48 3.98 3.09 6.18 12.3 0.31 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.06 2.35 0.02 0.86
1.12 0.76 2.29 1.84 1.09 4.06 12.35 1.67 0.79 0.45 2.02 0.98 0.8 0.88 1.38 0.83 1.71 2.29 2.89 2.89
332.59 138.9 43.08 406.28 68.99 161.2 62.85 22.23 31.75 24.68 10.48 15.85 2.88 12.74 14.97 37.78 6.16 47.67 0.0 3.46
0.57 0.39 0.53 0.64 2.1 16.59 16.06 0.42 0.08 0.12 0.15 0.46 0.05 0.1 0.14 0.28 0.64 0.89 0.41 0.29
5.93 1.46 2.26 3.62 2.53 5.99 6.7 0.36 0.11 0.26 0.18 0.15 0.02 0.11 0.06 0.04 0.62 1.54 1.6 1.3
6.96 6.32 5.53 5.33 5.52 10.99 12.72 0.62 0.17 0.23 0.01 0.28 0.03 0.13 0.05 0.27 0.59 3.54 4.51 2.26
11.83 3.3 5.6 5.58 11.15 6.59 20.16 2.53 1.08 1.05 0.85 1.24 1.33 1.11 0.66 2.84 4.32 5.89 0.63 2.45
3.61 2.15 4.91 2.97 2.46 7.74 12.89 1.12 0.49 0.39 0.34 0.53 0.16 0.23 0.32 0.79 0.8 2.49 4.77 2.02
18.96 12.9 21.37 12.16 9.48 29.14 29.48 10.69 9.27 7.77 5.48 7.96 1.66 1.43 7.16 3.33 3.21 3.88 5.74 7.92

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)