Heatmap: Cluster_153 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00407	0.64	0.0	0.08	0.22	0.0	1.0	0.67	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.09
Gb_00555	1.0	0.53	0.43	0.28	0.24	0.11	0.86	0.08	0.12	0.11	0.11	0.08	0.04	0.03	0.14	0.09	0.19	0.15	0.07	0.05
Gb_00898	0.43	0.69	0.32	1.0	0.08	0.19	0.95	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.13
Gb_01106	0.29	0.36	0.52	0.53	0.56	1.0	0.63	0.39	0.26	0.21	0.3	0.31	0.24	0.27	0.32	0.44	0.46	0.2	0.19	0.17
Gb_01452	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0
Gb_01479	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01949	0.23	0.08	0.12	0.18	0.12	0.74	1.0	0.06	0.04	0.05	0.07	0.02	0.03	0.04	0.07	0.04	0.03	0.1	0.08	0.05
Gb_02025	0.24	0.18	0.27	0.15	0.25	0.53	1.0	0.02	0.01	0.02	0.0	0.01	0.0	0.01	0.04	0.0	0.01	0.16	0.02	0.05
Gb_02028	0.19	0.23	0.28	0.22	0.25	0.58	1.0	0.03	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.14	0.35	0.07
Gb_02168	0.39	0.28	0.3	0.23	0.42	0.65	1.0	0.11	0.07	0.06	0.06	0.07	0.03	0.04	0.06	0.07	0.09	0.34	0.37	0.25
Gb_02224	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03322	0.22	0.08	0.18	0.09	0.1	0.72	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.03	0.1	0.01
Gb_03873	0.02	0.08	0.16	0.12	0.0	0.17	1.0	0.03	0.02	0.0	0.0	0.01	0.03	0.07	0.06	0.0	0.0	0.29	0.15	0.09
Gb_04279	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6	1.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.03	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_04502	0.47	0.37	0.41	0.63	0.09	0.37	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.01	0.01
Gb_04505	0.73	0.27	1.0	0.41	0.12	0.34	0.94	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.02	0.01
Gb_05113	1.0	0.13	0.36	0.46	0.3	0.07	0.9	0.12	0.14	0.16	0.28	0.01	0.08	0.07	0.43	0.0	0.15	0.15	0.46	0.43
Gb_05478	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.7	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.07	0.02
Gb_07595	1.0	0.62	0.55	0.29	0.33	0.04	0.8	0.12	0.06	0.06	0.16	0.05	0.04	0.05	0.21	0.07	0.12	0.38	0.26	0.57
Gb_07877	0.07	0.0	0.0	0.0	0.05	0.81	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.06	0.0	0.03
Gb_08664	0.17	0.39	0.29	0.07	0.15	0.78	1.0	0.04	0.09	0.11	0.42	0.01	0.05	0.04	0.36	0.0	0.01	0.07	0.34	0.49
Gb_08737	0.69	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.61	0.08	0.0	0.0	0.13	0.03	0.16	0.05	0.0	0.16	0.19	0.0	0.23	0.11
Gb_08738	0.37	0.53	0.25	0.52	0.08	0.3	1.0	0.14	0.05	0.09	0.08	0.04	0.07	0.03	0.07	0.19	0.28	0.43	0.08	0.07
Gb_09068	0.78	0.0	0.04	0.01	0.02	1.0	0.0	0.17	0.11	0.13	0.39	0.18	0.21	0.19	0.25	0.04	0.08	0.01	0.0	0.06
Gb_09482	0.27	0.21	0.21	0.21	0.44	0.44	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.14	0.15	0.18
Gb_09863	1.0	0.21	0.2	0.0	0.02	0.09	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09926	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10453	0.5	0.18	1.0	0.0	0.09	0.0	0.66	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.09	0.0	0.06	0.0
Gb_10809	0.96	0.68	0.79	0.89	0.06	0.02	1.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.37
Gb_10896	0.17	0.28	0.12	0.07	0.11	0.4	1.0	0.14	0.12	0.1	0.04	0.05	0.16	0.13	0.07	0.05	0.03	0.05	0.03	0.12
Gb_11415	0.88	0.32	0.27	0.7	0.68	0.17	1.0	0.15	0.07	0.06	0.38	0.19	0.08	0.09	0.26	0.1	0.27	0.17	0.0	0.47
Gb_12045	0.78	0.49	0.44	0.27	0.14	0.0	1.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.37	0.2	0.17
Gb_12128	0.41	0.26	0.38	0.14	0.14	0.8	1.0	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.07	0.04	0.18	0.0
Gb_13850	0.84	0.12	0.11	0.1	0.57	0.24	1.0	0.13	0.2	0.17	0.25	0.03	0.03	0.03	0.17	0.2	0.03	0.29	0.29	0.34
Gb_13947	1.0	0.34	0.36	0.81	0.06	0.04	0.4	0.22	0.15	0.15	0.52	0.19	0.12	0.18	0.51	0.73	0.71	0.03	0.0	0.01
Gb_14787	0.01	0.0	0.0	0.03	0.01	0.65	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.02
Gb_14889	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15920	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16297	1.0	0.38	0.43	0.69	0.05	0.03	0.42	0.25	0.16	0.17	0.52	0.22	0.14	0.2	0.5	0.76	0.89	0.04	0.0	0.0
Gb_16478	0.29	0.38	0.43	0.0	0.0	0.12	1.0	0.02	0.01	0.02	0.0	0.02	0.0	0.05	0.0	0.0	0.02	0.07	0.17	0.02
Gb_16948	0.69	0.37	1.0	0.64	0.29	0.12	0.52	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.18	0.22	0.01
Gb_17297	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.72	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.02
Gb_17474	0.9	0.0	0.06	0.4	0.32	0.21	1.0	0.04	0.02	0.03	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.17	0.15	0.0	0.2	0.05
Gb_19118	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19528	0.47	0.51	0.64	0.23	0.12	0.12	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.1	0.03
Gb_19957	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.58	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01
Gb_20681	0.2	0.1	0.14	0.18	0.25	1.0	0.36	0.1	0.05	0.05	0.06	0.06	0.07	0.08	0.06	0.04	0.06	0.18	0.08	0.14
Gb_21866	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.58	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22030	0.69	0.58	1.0	0.83	0.48	0.26	0.88	0.08	0.09	0.07	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.23	0.02	0.05
Gb_23240	0.6	1.0	0.91	0.53	0.54	0.45	0.76	0.16	0.19	0.13	0.15	0.14	0.14	0.14	0.14	0.19	0.11	0.29	0.34	0.17
Gb_23297	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23901	0.2	0.84	0.0	0.0	0.26	0.43	1.0	0.07	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.32	0.22
Gb_25221	1.0	0.38	0.4	0.14	0.04	0.0	0.91	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_25282	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05	0.01
Gb_25388	0.88	0.53	0.39	0.36	0.23	0.02	1.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.03	0.0	0.0	0.01	0.0	0.65
Gb_25552	0.36	0.2	0.23	0.26	0.12	0.48	1.0	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01
Gb_25871	0.77	0.62	0.68	0.92	0.79	0.98	1.0	0.41	0.33	0.33	0.46	0.4	0.4	0.43	0.46	0.39	0.62	0.67	0.69	0.61
Gb_26294	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.85	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.03
Gb_26384	1.0	0.36	0.87	0.45	0.31	0.08	0.73	0.12	0.08	0.1	0.25	0.06	0.05	0.06	0.17	0.06	0.03	0.13	0.16	0.07
Gb_27229	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87	0.0	0.0
Gb_28401	0.54	0.22	0.16	0.58	0.11	0.04	1.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.24	0.0	0.27
Gb_29099	0.46	0.44	0.43	0.44	0.49	0.98	1.0	0.3	0.15	0.16	0.26	0.17	0.16	0.15	0.27	0.2	0.19	0.46	0.43	0.33
Gb_29628	0.06	0.05	0.05	0.08	0.17	1.0	0.56	0.05	0.02	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.05	0.02	0.03	0.18	0.22	0.12
Gb_29669	1.0	0.12	0.07	0.24	0.07	0.04	0.97	0.08	0.13	0.14	0.12	0.1	0.09	0.09	0.1	0.11	0.08	0.11	0.26	0.1
Gb_30207	0.73	0.49	0.92	0.36	0.46	0.13	1.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.1	0.13	0.0
Gb_30591	0.04	0.02	0.03	0.01	0.02	0.75	1.0	0.04	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.14	0.14
Gb_31438	0.38	0.17	0.53	0.0	0.42	0.49	1.0	0.3	0.31	0.23	0.24	0.17	0.49	0.48	0.27	0.29	0.36	0.03	0.2	0.21
Gb_32335	0.08	0.03	0.07	0.13	0.03	0.93	1.0	0.09	0.21	0.19	0.21	0.06	0.1	0.17	0.03	0.11	0.14	0.12	0.04	0.23
Gb_32654	0.44	0.0	0.04	0.02	0.05	1.0	0.0	0.28	0.53	0.61	0.48	0.49	0.37	0.32	0.49	0.16	0.4	0.01	0.0	0.06
Gb_32691	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32928	0.32	0.0	1.0	0.45	0.3	0.09	0.47	0.01	0.02	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.19
Gb_33219	0.44	0.2	0.59	0.29	0.37	0.47	1.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0
Gb_33750	1.0	0.0	0.47	0.89	0.09	0.0	0.88	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.09
Gb_34951	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0
Gb_35096	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.7	1.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.04
Gb_35847	0.47	0.58	0.55	0.46	0.47	0.48	1.0	0.04	0.01	0.02	0.09	0.06	0.0	0.01	0.07	0.03	0.0	0.07	0.12	0.08
Gb_35940	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36399	0.97	0.41	0.23	1.0	0.14	0.02	0.0	0.29	0.19	0.35	0.0	0.09	0.02	0.08	0.0	0.38	0.69	0.11	0.0	0.0
Gb_37429	1.0	0.52	0.55	0.26	0.2	0.4	0.8	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.06
Gb_39036	0.09	0.06	0.19	0.15	0.09	0.33	1.0	0.14	0.06	0.04	0.16	0.08	0.07	0.07	0.11	0.07	0.14	0.19	0.23	0.23
Gb_39935	0.82	0.34	0.11	1.0	0.17	0.4	0.15	0.05	0.08	0.06	0.03	0.04	0.01	0.03	0.04	0.09	0.02	0.12	0.0	0.01
Gb_40292	0.03	0.02	0.03	0.04	0.13	1.0	0.97	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.0	0.01	0.01	0.02	0.04	0.05	0.02	0.02
Gb_40661	0.88	0.22	0.34	0.54	0.38	0.89	1.0	0.05	0.02	0.04	0.03	0.02	0.0	0.02	0.01	0.01	0.09	0.23	0.24	0.19
Gb_40663	0.55	0.5	0.43	0.42	0.43	0.86	1.0	0.05	0.01	0.02	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.02	0.05	0.28	0.35	0.18
Gb_41221	0.59	0.16	0.28	0.28	0.55	0.33	1.0	0.13	0.05	0.05	0.04	0.06	0.07	0.05	0.03	0.14	0.21	0.29	0.03	0.12
Gb_41264	0.28	0.17	0.38	0.23	0.19	0.6	1.0	0.09	0.04	0.03	0.03	0.04	0.01	0.02	0.02	0.06	0.06	0.19	0.37	0.16
Gb_41490	0.64	0.44	0.72	0.41	0.32	0.99	1.0	0.36	0.31	0.26	0.19	0.27	0.06	0.05	0.24	0.11	0.11	0.13	0.19	0.27

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)