Heatmap: Cluster_271 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
28.01 23.41 28.0 30.6 22.59 19.29 10.36 19.21 16.05 11.56 18.14 12.15 1.96 1.32 15.34 20.46 23.97 19.78 34.89 9.22
2.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 1.01 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 1.56 0.0 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.1 0.0 0.0 0.2 0.0 0.14 0.0 0.0 0.16 0.84 0.0
0.4 0.0 0.31 0.72 0.11 0.0 0.0 0.05 0.07 0.09 0.13 0.06 0.18 0.08 0.0 0.0 0.0 0.16 0.02 0.12
9.98 9.15 6.02 11.11 4.23 1.54 3.01 3.12 4.98 2.64 1.38 2.47 10.52 10.52 0.5 7.9 5.55 2.15 2.1 0.51
0.02 0.07 0.02 0.17 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0
0.2 0.0 0.0 1.07 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.02 0.49 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 3.39 0.44 0.14 0.0 0.32 0.2 0.2 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.99 0.0
0.11 0.15 0.08 1.11 0.07 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.07 0.7 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.0 0.07 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 7.4 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0
0.04 0.06 0.01 0.27 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.04 0.04 0.03 0.0 0.01 0.0
15.16 18.96 13.41 10.65 15.0 14.87 7.59 11.45 8.81 8.76 9.43 8.36 2.61 2.13 8.48 7.01 9.08 14.39 12.95 5.04
0.1 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.11 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0
5.92 2.63 7.17 4.89 3.0 5.81 1.14 2.78 3.42 3.66 1.61 2.89 0.25 0.4 1.64 6.45 3.81 1.4 3.39 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.84 1.62 2.82 17.98 3.41 2.78 1.45 4.31 3.03 2.17 3.44 2.47 2.74 2.23 2.86 2.86 3.52 2.97 8.01 3.41
3.88 4.44 3.73 4.3 2.29 1.86 0.78 1.57 1.43 2.05 2.2 1.02 0.12 0.1 1.28 0.8 0.88 2.11 3.92 0.98
3.39 4.51 6.23 4.04 3.21 1.79 1.31 1.93 1.37 1.21 0.89 1.98 0.0 0.0 0.63 1.22 5.55 4.35 3.13 2.3
0.05 0.0 0.0 0.27 0.07 0.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.08 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.16 0.82 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.06 0.0 0.0 0.04 0.11 0.0 0.0 0.11 0.0 0.03 0.0
9.67 3.05 1.0 186.11 5.68 0.0 0.67 1.92 4.82 9.44 1.77 5.3 7.73 12.76 1.07 0.66 0.54 2.33 1.63 2.24
0.0 0.0 0.0 183.99 0.0 0.0 0.0 4.51 0.0 0.0 0.0 0.0 10.03 19.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.7 0.07 0.15 1.16 0.25 0.17 0.1 0.11 0.15 0.23 0.26 0.07 0.08 0.06 0.21 0.29 0.0 0.06 0.45 0.08
0.56 0.24 0.13 1.3 0.37 0.13 0.3 0.22 0.24 0.26 0.21 0.05 0.23 0.03 0.26 0.67 0.39 0.13 0.44 0.18
0.34 0.27 0.06 2.0 0.4 0.0 0.04 0.16 0.11 0.04 0.29 0.03 0.13 0.21 0.26 0.0 0.07 0.05 0.3 0.11
2.84 0.0 0.0 98.22 3.47 1.36 0.0 0.3 0.17 0.17 0.0 0.41 0.0 0.1 0.0 0.0 0.52 0.0 0.35 1.17
0.05 0.0 0.14 458.61 0.0 0.2 0.16 9.93 0.12 2.65 0.29 9.81 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 2.96 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.14 0.22 0.39 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.83 0.0 0.21 8.55 0.03 0.82 0.06 0.63 0.1 0.26 0.6 0.17 0.55 1.03 0.37 0.0 0.0 0.0 0.85 0.32
0.15 0.0 0.0 1.37 0.23 0.0 0.01 0.08 0.04 0.04 0.0 0.0 0.35 0.1 0.06 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0
0.0 0.0 0.0 0.39 0.13 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.19 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.19 0.04 0.04 0.01 0.03 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.06 0.0 0.0 0.01 0.05
0.44 0.0 0.09 1.42 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.83 0.21 0.06 0.12 0.0
12.66 11.4 22.98 6.11 3.74 3.6 1.32 7.8 12.51 9.67 8.21 6.13 2.21 2.3 9.35 23.31 20.17 6.35 14.79 3.45
0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.03 0.04 0.09 0.02 0.0 0.14 0.0 0.09 0.04 0.0 0.0 0.03 0.02 0.18 0.0
0.12 0.3 0.0 2.12 0.22 0.0 0.2 0.1 0.04 0.0 0.17 0.0 0.09 0.0 0.26 0.36 0.26 0.0 0.35 0.12
0.19 0.0 0.0 1.42 0.09 0.0 0.04 0.04 0.01 0.02 0.0 0.03 0.02 0.04 0.0 0.03 0.15 0.15 0.05 0.0
0.75 0.0 0.28 2.89 0.0 0.0 0.28 0.13 0.38 0.15 0.22 0.04 0.0 0.24 0.52 0.19 0.71 0.8 0.31 0.0
0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.13 0.0 0.23 2.64 0.48 0.29 0.14 0.27 0.35 0.06 0.34 0.03 0.58 0.13 0.1 0.66 1.24 0.1 0.36 0.31
0.07 0.03 0.07 0.33 0.08 0.05 0.06 0.05 0.06 0.12 0.06 0.04 0.01 0.02 0.03 0.04 0.04 0.05 0.23 0.04
0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.64 0.0 0.0 6.75 0.27 0.0 0.31 0.3 0.04 0.21 0.17 0.26 1.95 2.33 0.0 0.18 0.11 0.29 0.0 0.04
0.18 0.31 0.07 0.63 0.37 0.09 0.3 0.14 0.06 0.12 0.27 0.02 0.22 0.15 0.12 0.23 0.08 0.07 0.95 0.07
0.0 0.0 0.0 1.86 0.0 0.0 0.07 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0
0.0 0.31 0.0 1.93 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 7.4 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0
0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0
0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.39 0.12 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.58 0.0 0.0 3.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
7.08 0.0 0.57 31.3 1.63 0.1 6.73 6.62 7.33 6.74 0.0 0.18 5.64 4.49 0.6 1.44 23.22 2.21 9.53 0.73
0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)