Heatmap: Cluster_271 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00078	0.8	0.67	0.8	0.88	0.65	0.55	0.3	0.55	0.46	0.33	0.52	0.35	0.06	0.04	0.44	0.59	0.69	0.57	1.0	0.26
Gb_01259	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.47	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.73	0.0	0.05
Gb_01819	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03004	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.06	0.12	0.0	0.0	0.24	0.0	0.17	0.0	0.0	0.19	1.0	0.0
Gb_03249	0.55	0.0	0.42	1.0	0.16	0.0	0.0	0.06	0.1	0.13	0.17	0.08	0.25	0.11	0.0	0.0	0.0	0.22	0.02	0.17
Gb_03591	0.9	0.82	0.54	1.0	0.38	0.14	0.27	0.28	0.45	0.24	0.12	0.22	0.95	0.95	0.04	0.71	0.5	0.19	0.19	0.05
Gb_03726	0.1	0.43	0.11	1.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.0
Gb_03764	0.19	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0
Gb_04383	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_04604	0.0	0.0	0.05	1.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.03	0.03	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.08	0.0	0.04	0.03	0.0
Gb_05567	0.0	0.0	0.0	1.0	0.13	0.04	0.0	0.09	0.06	0.06	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.29	0.0
Gb_06008	0.1	0.14	0.07	1.0	0.07	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_06203	0.11	0.0	0.1	1.0	0.0	0.0	0.11	0.04	0.0	0.0	0.1	0.05	0.05	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.1	0.0
Gb_06297	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0
Gb_06925	0.16	0.23	0.05	1.0	0.05	0.06	0.0	0.05	0.03	0.03	0.05	0.0	0.08	0.02	0.14	0.15	0.13	0.0	0.04	0.0
Gb_07839	0.8	1.0	0.71	0.56	0.79	0.78	0.4	0.6	0.46	0.46	0.5	0.44	0.14	0.11	0.45	0.37	0.48	0.76	0.68	0.27
Gb_08339	0.15	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.09	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.17	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10933	0.83	0.37	1.0	0.68	0.42	0.81	0.16	0.39	0.48	0.51	0.22	0.4	0.04	0.06	0.23	0.9	0.53	0.2	0.47	0.02
Gb_11411	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_12194	0.27	0.09	0.16	1.0	0.19	0.15	0.08	0.24	0.17	0.12	0.19	0.14	0.15	0.12	0.16	0.16	0.2	0.17	0.45	0.19
Gb_12681	0.87	1.0	0.84	0.97	0.52	0.42	0.18	0.35	0.32	0.46	0.49	0.23	0.03	0.02	0.29	0.18	0.2	0.48	0.88	0.22
Gb_13178	0.54	0.72	1.0	0.65	0.52	0.29	0.21	0.31	0.22	0.19	0.14	0.32	0.0	0.0	0.1	0.2	0.89	0.7	0.5	0.37
Gb_13245	0.19	0.0	0.0	1.0	0.28	0.0	0.1	0.03	0.0	0.05	0.0	0.0	0.03	0.0	0.31	0.0	0.1	0.0	0.04	0.0
Gb_13381	0.0	0.0	0.19	1.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.07	0.0	0.0	0.05	0.13	0.0	0.0	0.13	0.0	0.04	0.0
Gb_13524	0.05	0.02	0.01	1.0	0.03	0.0	0.0	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.04	0.07	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01
Gb_13626	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_13903	0.61	0.06	0.13	1.0	0.21	0.15	0.09	0.1	0.13	0.2	0.22	0.06	0.07	0.06	0.18	0.25	0.0	0.05	0.39	0.07
Gb_13909	0.43	0.18	0.1	1.0	0.28	0.1	0.23	0.17	0.18	0.2	0.16	0.04	0.17	0.02	0.2	0.52	0.3	0.1	0.33	0.14
Gb_15714	0.17	0.14	0.03	1.0	0.2	0.0	0.02	0.08	0.06	0.02	0.15	0.02	0.06	0.11	0.13	0.0	0.03	0.03	0.15	0.05
Gb_16790	0.03	0.0	0.0	1.0	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01
Gb_16993	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18778	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19200	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20528	0.42	0.36	0.57	1.0	0.0	0.0	0.06	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_21597	0.1	0.0	0.02	1.0	0.0	0.1	0.01	0.07	0.01	0.03	0.07	0.02	0.06	0.12	0.04	0.0	0.0	0.0	0.1	0.04
Gb_22132	0.11	0.0	0.0	1.0	0.17	0.0	0.01	0.06	0.03	0.03	0.0	0.0	0.26	0.07	0.04	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0
Gb_22331	0.0	0.0	0.0	1.0	0.32	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_22497	0.0	0.0	0.0	1.0	0.16	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24002	0.0	0.0	0.11	1.0	0.21	0.23	0.07	0.14	0.07	0.17	0.1	0.06	0.04	0.08	0.18	0.33	0.0	0.0	0.07	0.26
Gb_24619	0.31	0.0	0.06	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.59	0.15	0.04	0.09	0.0
Gb_24749	0.54	0.49	0.99	0.26	0.16	0.15	0.06	0.33	0.54	0.41	0.35	0.26	0.09	0.1	0.4	1.0	0.87	0.27	0.63	0.15
Gb_24941	0.0	0.0	0.0	0.91	0.0	0.17	0.24	0.49	0.13	0.0	0.79	0.0	0.49	0.25	0.0	0.0	0.19	0.13	1.0	0.0
Gb_24970	0.06	0.14	0.0	1.0	0.1	0.0	0.1	0.05	0.02	0.0	0.08	0.0	0.04	0.0	0.12	0.17	0.12	0.0	0.16	0.06
Gb_25340	0.13	0.0	0.0	1.0	0.07	0.0	0.03	0.02	0.01	0.01	0.0	0.02	0.02	0.03	0.0	0.02	0.11	0.11	0.03	0.0
Gb_26377	0.26	0.0	0.1	1.0	0.0	0.0	0.1	0.04	0.13	0.05	0.08	0.01	0.0	0.08	0.18	0.07	0.25	0.28	0.11	0.0
Gb_28057	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28371	0.43	0.0	0.09	1.0	0.18	0.11	0.05	0.1	0.13	0.02	0.13	0.01	0.22	0.05	0.04	0.25	0.47	0.04	0.14	0.12
Gb_29871	0.22	0.09	0.2	1.0	0.25	0.14	0.19	0.15	0.17	0.37	0.19	0.12	0.03	0.06	0.1	0.11	0.12	0.14	0.71	0.13
Gb_30747	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32906	0.24	0.0	0.0	1.0	0.04	0.0	0.05	0.04	0.01	0.03	0.03	0.04	0.29	0.34	0.0	0.03	0.02	0.04	0.0	0.01
Gb_33465	0.19	0.33	0.07	0.67	0.39	0.09	0.32	0.15	0.07	0.13	0.29	0.02	0.23	0.16	0.13	0.24	0.08	0.07	1.0	0.07
Gb_34457	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0
Gb_34534	0.0	0.16	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_36717	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0
Gb_37012	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0
Gb_39075	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39341	0.0	0.0	0.0	1.0	0.31	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40105	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40178	0.15	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40362	0.23	0.0	0.02	1.0	0.05	0.0	0.22	0.21	0.23	0.22	0.0	0.01	0.18	0.14	0.02	0.05	0.74	0.07	0.3	0.02
Gb_40770	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)