Heatmap: Cluster_290 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00469	-1.8	-1.89	-1.58	-0.12	1.07	0.7	-2.21	0.54	0.01	-0.27	-0.66	0.2	0.11	0.28	-0.57	0.33	0.43	1.21	-0.06	-1.65
Gb_00554	-0.06	-0.74	-1.22	-0.25	0.66	-0.47	0.29	0.68	0.23	0.06	0.27	-0.4	0.24	0.1	0.18	-0.42	-0.55	-0.39	0.82	-0.91
Gb_02200	1.06	-0.94	-0.12	0.05	-1.28	-0.85	-0.88	0.62	-0.39	-0.44	0.6	0.37	-1.15	-1.5	0.46	-0.59	-0.27	0.36	1.22	-0.33
Gb_02760	0.33	-0.45	-0.4	0.59	0.69	-0.21	-0.98	0.34	-0.32	-0.37	0.13	0.28	-0.43	-0.49	0.24	-0.04	0.4	0.09	-0.02	-0.64
Gb_02761	0.39	0.2	-0.34	0.08	0.46	-0.31	-1.08	0.56	-0.52	-0.35	0.3	0.32	-0.15	-0.23	0.4	-0.2	0.31	-0.33	0.01	-0.69
Gb_03499	-0.27	-0.62	-1.43	-0.37	0.3	-0.28	-0.6	0.19	0.29	0.13	0.81	-0.57	-0.04	0.02	0.79	-0.03	-0.68	0.09	0.11	0.38
Gb_03848	0.41	-0.92	-0.44	0.33	0.27	0.27	-0.82	0.23	-0.53	-0.39	0.77	-0.22	-1.09	-1.28	0.7	-0.86	-0.72	0.14	-0.42	1.3
Gb_03849	0.51	-0.11	-0.02	0.4	0.01	-0.91	-0.69	0.42	-0.35	-0.26	0.75	-0.55	0.42	-0.33	0.94	-0.06	-0.56	-0.52	-0.16	-0.81
Gb_04315	-0.97	0.27	0.47	-0.49	0.42	-0.33	-1.68	0.46	-0.15	-0.28	0.0	0.18	0.12	-0.22	-0.02	-0.4	0.41	0.81	-0.11	-0.3
Gb_04759	-1.34	-3.05	-3.68	-4.69	0.75	0.36	-6.37	0.93	0.41	0.83	1.12	0.49	0.91	-0.02	0.84	-1.02	0.71	-0.46	-2.28	-3.32
Gb_04924	-0.07	-0.26	-0.57	0.04	0.18	-0.33	-1.23	0.34	0.07	-0.09	0.43	0.04	0.01	-0.18	0.42	0.01	-0.18	0.15	0.16	0.24
Gb_05168	0.64	-0.1	0.03	0.72	0.52	0.28	-2.99	0.24	-0.71	-0.63	-0.45	-0.31	0.03	-0.17	-0.56	-0.81	-0.4	0.61	-0.89	1.07
Gb_06404	-4.08	-	-3.84	-0.19	-2.6	-2.87	-4.26	0.81	1.23	0.34	-1.45	-0.61	1.07	1.35	-1.44	1.2	0.11	-0.19	0.86	0.21
Gb_06535	-0.1	-2.06	-1.49	-0.49	-0.32	-1.07	-0.58	0.85	-0.16	0.31	1.23	-0.75	1.05	0.59	1.29	-1.37	-0.82	-0.35	-0.34	-1.38
Gb_06691	-2.85	-3.46	-5.83	-1.48	-1.49	0.28	-1.86	0.07	0.78	0.69	0.74	0.37	1.29	1.01	1.0	-0.13	-0.76	-1.79	-0.93	0.52
Gb_06773	-0.09	-0.49	-0.51	-0.07	0.29	0.18	-0.55	0.51	-0.13	-0.0	0.66	0.0	0.22	0.14	0.29	-0.55	-0.4	0.33	-0.3	-0.44
Gb_06800	-0.55	-0.56	-0.58	-0.46	-0.21	-0.4	-0.42	0.73	0.13	-0.08	0.54	-0.12	0.9	0.49	0.4	-0.94	-0.77	-0.89	0.55	0.12
Gb_07487	0.2	-1.39	-0.44	-0.28	-0.09	0.28	-1.08	0.44	-0.03	-0.28	0.96	-0.85	1.01	0.71	0.74	-0.04	-0.37	-0.68	-0.66	-1.66
Gb_07689	-0.3	-0.06	-0.54	-0.14	0.14	-0.1	-1.23	0.87	-0.54	-0.45	-0.21	0.55	0.26	-0.3	-0.25	-1.45	-0.63	0.9	1.16	-0.64
Gb_07718	0.93	-0.7	0.68	-1.04	0.35	-0.9	-1.08	0.48	0.47	0.63	0.93	-0.98	-0.91	-0.89	0.52	0.33	-0.35	-0.49	-0.51	-1.29
Gb_08724	0.19	-0.34	-1.04	1.03	0.8	-0.23	-1.38	0.65	-0.3	-0.03	-0.8	0.45	0.18	-0.29	-1.09	-0.56	-0.18	0.51	0.48	-1.12
Gb_09394	-2.51	-	-	-	-	-0.35	-0.4	2.16	1.86	1.96	-1.55	0.18	1.18	-1.93	-0.98	-1.26	0.33	-	-3.03	-
Gb_09422	0.67	-0.09	0.1	0.5	0.59	-0.43	-2.15	0.23	-0.41	-0.34	0.43	-0.88	0.12	0.08	0.26	-0.43	-0.21	0.55	-0.26	-0.59
Gb_11152	0.21	-0.27	-0.36	0.07	0.32	-0.05	-0.43	0.15	-0.18	-0.32	0.09	-0.8	-0.12	0.14	0.23	0.01	0.53	0.09	0.12	0.01
Gb_11455	-0.25	-0.62	-0.69	0.08	0.36	-0.0	-0.01	0.41	-0.04	0.02	0.6	0.18	-0.06	-0.41	0.55	-0.46	-0.44	0.01	0.11	-0.21
Gb_11658	-0.38	-0.9	-0.86	-0.39	0.07	0.01	-0.76	0.2	0.08	0.1	0.95	-0.38	0.16	-0.29	1.03	-0.04	-0.14	-0.16	-0.35	0.28
Gb_12034	-1.46	-1.46	-3.42	-0.11	1.45	-1.9	-2.07	0.81	-0.15	0.58	-0.45	-0.26	0.6	0.22	-0.59	-3.19	-1.63	1.66	0.42	0.03
Gb_12626	-0.19	-0.71	-0.87	-0.01	0.33	-0.0	-0.95	0.27	0.11	0.35	0.49	0.14	0.2	-0.08	0.52	-0.94	-0.33	0.38	-0.79	0.49
Gb_13007	-0.69	-0.48	-0.66	-0.31	-0.75	0.62	-1.49	0.22	0.08	0.01	0.64	-0.1	0.86	0.32	0.65	0.3	0.48	-0.6	-0.76	-1.01
Gb_13230	-1.16	-2.49	-1.93	-0.56	0.81	-0.11	-2.68	0.74	0.44	0.38	-0.39	0.04	1.95	1.35	-0.77	-3.96	-2.64	1.02	-2.42	-4.07
Gb_13294	-0.47	-1.38	-1.14	0.08	-0.4	-0.46	-2.86	1.04	0.12	0.22	0.81	0.65	0.35	-0.09	0.67	-0.12	-0.53	-0.5	-3.03	0.91
Gb_13302	0.1	-0.03	0.1	-0.28	0.26	0.65	0.44	-0.24	0.35	0.49	-0.01	-0.75	-1.17	-1.28	-0.33	0.44	0.51	-1.24	0.35	-0.51
Gb_13565	0.8	-1.07	-0.39	0.64	0.88	0.11	-0.96	0.21	-0.41	-0.48	0.67	-0.5	-1.4	-1.13	0.58	-0.24	0.15	0.4	-1.37	0.16
Gb_13753	-0.83	-1.51	-0.92	-0.22	0.38	0.96	-0.88	0.42	0.02	0.01	0.12	-0.19	0.03	0.06	-0.11	-0.9	-0.11	0.36	0.04	0.87
Gb_14056	0.77	-1.54	0.1	-0.2	0.17	-1.05	-0.34	0.77	-0.18	0.38	0.55	-0.56	0.32	-0.08	0.72	-2.3	-0.45	0.69	-0.52	-1.03
Gb_14070	0.17	-0.39	-0.02	0.04	0.19	0.57	-1.02	0.39	-0.1	-0.34	0.24	-0.4	0.37	0.22	0.16	-0.03	-0.58	0.19	-0.53	-0.07
Gb_14095	0.04	-0.98	-0.75	0.51	0.37	0.73	-0.12	0.46	0.05	0.1	0.4	-0.05	-0.28	-0.7	0.64	-0.28	-0.51	0.47	-0.93	-1.46
Gb_15000	-0.79	-0.17	-0.9	-0.34	0.11	-0.42	-1.68	0.56	0.22	0.27	0.58	-0.18	0.87	0.22	0.62	-0.86	-0.67	-0.08	-0.13	0.35
Gb_15045	-0.17	-0.82	-0.48	0.05	0.81	0.96	-0.17	0.12	-0.57	-0.4	0.54	-0.34	-0.03	-0.13	0.54	-0.48	-0.1	0.22	-0.41	-0.91
Gb_15322	-1.28	-0.96	-1.34	-1.09	-0.2	0.61	0.36	0.79	-0.03	-0.23	0.37	-0.04	0.65	0.31	0.1	-0.69	-0.18	0.34	-0.66	0.51
Gb_15424	0.19	-0.18	-0.15	0.16	0.17	-0.16	-1.23	0.45	-0.16	-0.08	0.5	-0.31	0.24	-0.02	0.51	-0.29	-0.18	0.15	-0.12	-0.38
Gb_15501	-0.13	-0.91	-1.43	-0.52	-0.3	-0.19	-5.08	1.0	0.44	0.38	0.08	-0.39	0.87	0.04	0.07	-0.37	-0.21	0.6	-0.18	0.44
Gb_16179	1.01	-1.0	-0.25	0.72	0.19	-1.25	-0.91	-0.03	-0.25	-0.43	1.3	-1.02	-1.5	-1.64	0.92	0.42	0.13	-1.19	-0.51	0.32
Gb_17098	-3.1	-3.35	-4.86	-2.69	-3.67	-1.12	-1.85	1.69	0.75	1.09	0.61	1.04	1.03	0.15	0.06	-1.49	1.03	-3.09	-1.02	-0.09
Gb_17829	0.38	0.96	1.23	0.24	0.1	0.68	-1.13	0.73	-0.13	-0.27	-0.28	-0.52	0.12	-0.08	-0.27	-0.75	-0.82	-1.66	-3.45	-0.4
Gb_17901	-1.7	-1.39	-1.6	-1.83	0.5	1.61	-1.65	0.98	-0.68	-1.03	0.36	-1.16	-0.52	-1.21	0.52	0.23	-0.23	1.77	-0.48	-1.34
Gb_18482	-0.1	-1.57	-0.9	-0.29	0.48	0.09	-1.75	0.52	-0.01	0.09	0.8	-0.31	0.28	-0.03	0.86	-0.24	-0.04	0.4	-0.32	-0.62
Gb_18752	-0.22	-0.54	-0.78	-0.61	-0.23	0.14	-0.98	0.78	0.23	-0.04	0.94	0.26	0.55	0.48	0.85	-0.62	0.21	-0.67	-1.45	-1.67
Gb_18942	-0.15	1.01	-0.67	-0.65	-0.01	-1.31	-1.59	0.94	0.31	0.63	-0.17	0.5	0.04	-0.09	-0.63	-1.25	-1.0	1.01	0.15	-1.26
Gb_18946	-0.18	0.76	-1.03	-0.47	-0.06	-1.5	-1.83	1.0	-0.04	0.3	-0.78	0.15	1.21	0.61	-0.74	-1.83	-1.3	0.79	0.59	-1.49
Gb_19146	-0.34	-0.75	-1.2	-0.26	0.18	0.03	-0.66	0.59	-0.04	-0.09	0.49	0.12	0.34	-0.0	0.34	-0.38	-0.38	0.24	0.21	0.33
Gb_19245	-0.36	-0.29	0.06	-0.13	0.7	-0.24	-1.27	0.45	-0.06	-0.11	-0.18	0.17	-0.13	-0.49	0.17	-0.17	0.26	0.88	-0.07	-0.52
Gb_19723	-8.46	-6.4	-7.42	-4.86	-4.37	-	-2.05	0.23	1.51	1.75	1.13	1.54	0.96	0.26	1.47	-2.84	-2.1	-	-1.38	-0.97
Gb_19856	-1.15	-0.61	-0.72	-0.06	0.31	0.53	-1.79	0.73	0.26	0.25	0.01	0.3	0.31	0.02	-0.09	-0.4	-0.01	0.76	-0.62	-0.34
Gb_20448	0.64	-0.89	-0.0	1.12	0.06	0.43	-0.33	0.51	-0.99	-0.89	0.48	0.21	-1.26	-1.18	0.45	-0.59	-0.4	0.29	-0.76	0.09
Gb_20474	0.21	-0.43	-0.08	-0.02	-0.42	-0.9	-0.92	0.05	-0.03	-0.06	0.93	-0.93	0.08	-0.37	0.75	0.94	0.53	-0.71	-0.6	-0.3
Gb_20817	0.25	-0.64	-0.16	0.55	0.19	-0.33	-1.06	0.41	-0.21	-0.19	0.44	0.28	0.04	-0.21	0.36	-0.44	-0.02	-0.01	-0.12	-0.07
Gb_21202	-1.44	-2.13	-0.86	1.11	1.29	-4.04	-7.24	0.87	-0.6	-0.17	-0.65	0.56	0.43	-0.57	-0.96	-1.87	-1.15	2.1	-0.27	-1.68
Gb_21624	0.48	-0.9	-0.41	1.34	0.53	-0.34	-0.84	0.0	-0.63	-0.83	-0.1	-0.96	0.23	0.01	-0.05	-0.31	-0.71	0.42	0.55	-0.04
Gb_22220	0.55	-	-0.22	0.41	-0.17	-0.02	-1.14	1.19	0.03	0.89	-1.33	-0.25	1.22	-0.14	0.13	-	0.55	-0.46	-0.49	-1.38
Gb_22470	-0.01	-0.82	0.11	0.18	0.42	-0.29	-2.25	0.43	0.0	-0.11	-0.01	0.29	-0.62	-0.51	-0.04	0.05	1.18	0.11	0.12	-0.8
Gb_23159	0.08	-1.83	-1.25	-0.32	-0.13	-0.53	-2.35	0.73	0.08	0.19	0.83	-0.97	1.03	0.67	0.78	-1.22	-1.0	0.83	0.26	-2.01
Gb_23472	-0.17	-1.17	-0.83	-0.1	0.32	-0.34	-2.27	0.77	0.18	0.2	0.61	0.92	0.14	-0.18	0.61	-0.75	-0.06	0.33	-0.69	-0.77
Gb_23502	-0.48	0.06	-1.34	-0.2	0.62	1.35	-0.98	0.36	-0.12	-0.52	-0.8	-0.47	0.89	0.77	-0.88	-0.67	-0.85	-0.01	-0.12	-0.02
Gb_23507	-0.29	-0.01	-0.61	0.11	0.6	0.3	-0.76	0.25	-0.01	-0.22	0.22	-0.22	-0.41	-0.37	0.35	-0.07	-0.18	0.46	0.22	-0.19
Gb_23844	0.31	-0.51	-0.14	0.41	-0.05	0.37	-0.85	0.24	-0.28	-0.26	0.58	-0.86	-0.09	-0.35	0.6	-0.03	0.26	-0.33	0.01	-0.15
Gb_24098	0.61	-0.85	-0.28	0.13	0.19	0.1	-1.36	0.38	-0.21	-0.22	0.99	-0.59	0.62	0.3	0.87	-0.53	-1.0	-0.79	-0.04	-1.41
Gb_24136	0.19	-0.54	-0.24	0.22	0.38	0.15	-0.58	0.54	-0.58	-0.55	0.05	-0.08	0.14	-0.18	-0.05	-0.73	-0.37	0.21	0.21	0.74
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Gb_38606	0.03	-0.75	-1.01	0.17	0.18	-0.42	-1.33	0.29	0.31	0.08	1.1	-0.36	-0.39	-0.43	0.74	0.34	-0.4	0.28	0.02	-0.7
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Gb_40950	-0.45	-0.7	-0.16	0.18	0.1	0.23	0.04	0.22	-0.49	-0.31	0.42	-0.53	0.46	0.59	0.31	-0.72	-0.03	0.01	0.04	-0.15
Gb_41098	-0.4	-1.8	-1.42	-0.89	0.52	0.26	-0.4	0.25	-0.02	-0.3	0.6	-0.3	0.08	0.29	0.46	-0.1	-0.16	0.39	-0.16	0.71
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.