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Heatmap: Cluster_322 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
-0.08 -0.5 0.06 -0.21 0.27 0.08 -0.12 0.2 -0.37 -0.38 0.23 -0.37 -0.3 -0.62 0.41 -0.51 -0.2 0.42 0.3 0.75
-0.06 0.6 -0.01 -0.69 0.33 -0.46 -0.27 0.01 -0.27 -0.2 0.57 -0.21 -0.93 -1.25 0.69 -0.18 -0.06 0.33 0.64 -0.28
1.15 0.08 0.47 1.02 0.42 0.5 -0.94 0.44 -0.61 -0.65 -0.82 -0.47 -3.27 -2.65 -0.78 -0.41 -0.3 0.95 0.38 -1.12
0.06 1.12 0.69 0.18 -0.03 -0.99 -0.5 0.44 -0.14 -0.49 0.18 -0.99 0.37 0.58 -0.14 -1.24 -1.3 0.23 0.22 -1.42
1.02 -0.41 1.21 0.35 0.03 -0.68 -0.77 0.56 -0.51 -1.38 0.31 -1.06 0.16 -0.68 0.34 -0.31 -0.26 0.27 -1.97 0.02
0.36 0.43 0.56 0.46 0.82 -1.17 -6.06 0.53 0.16 -0.1 -1.78 -0.88 -0.74 -0.32 -1.88 -0.52 -0.09 1.55 0.46 -1.46
0.65 -0.71 -0.81 0.18 -0.12 0.14 -0.75 0.06 -0.44 -0.9 0.82 -1.53 0.73 0.53 1.15 -1.18 -1.65 0.72 -0.49 -0.62
0.35 0.64 1.23 -0.12 0.2 -0.43 0.15 -0.1 -0.11 -0.25 0.19 -1.25 -0.64 -0.64 0.06 -0.79 -0.83 -0.1 0.15 0.16
-0.47 0.02 -1.3 -1.61 0.35 -0.72 -2.05 0.33 0.11 0.19 0.67 0.08 0.23 -0.09 0.34 0.52 0.62 0.48 -0.63 -0.18
-0.43 -0.86 -0.66 -0.49 0.25 -0.75 -1.76 0.1 0.21 0.28 -0.21 0.24 -0.24 -0.31 0.2 1.08 0.69 0.77 -0.95 0.06
-0.77 -0.14 -0.57 -0.06 -0.02 -0.83 -1.86 0.33 0.15 -0.1 -0.03 0.15 -1.08 -0.91 0.03 1.11 0.29 1.04 0.37 -0.15
0.38 -0.15 0.05 -0.07 1.12 0.17 -0.32 0.14 -0.77 -0.95 0.24 -0.28 -2.07 -2.4 0.4 -0.69 -0.37 0.56 0.96 -0.08
0.17 -0.47 0.09 -0.11 0.64 -0.53 -0.33 0.27 -0.22 -0.39 0.11 -0.08 -0.93 -0.96 0.15 -0.34 0.66 0.66 0.34 -0.19
0.56 0.69 0.41 0.39 0.42 -1.7 -1.06 0.42 -0.41 -0.93 0.25 -0.92 0.31 0.15 -0.94 -0.84 -1.08 0.92 -1.19 0.67
1.36 0.84 0.82 0.87 1.02 -1.97 -1.4 0.16 -0.83 -1.23 -3.31 -1.14 -1.5 -1.34 -1.46 0.02 -1.13 0.64 0.83 -0.3
0.43 1.28 0.49 0.27 0.87 -0.19 -0.38 -0.1 -1.25 -1.08 -0.34 -1.06 -0.53 -1.21 -0.18 -0.57 -1.0 0.09 1.17 -0.85
1.09 1.55 1.03 -0.5 0.89 - -1.82 -0.05 -0.92 -2.04 0.56 -0.49 -0.0 0.33 -0.82 -0.18 - 0.23 0.33 -
0.49 0.86 1.08 1.51 1.02 -0.88 -0.18 -0.55 -1.0 -1.43 -1.53 -1.63 -0.55 -0.62 -1.14 -1.74 -2.42 0.1 1.17 -0.89
0.45 -0.19 0.0 0.55 0.38 -2.07 -0.87 0.03 0.27 0.03 -0.9 -1.61 -0.03 0.02 -1.21 -0.02 -0.28 0.23 0.73 1.02
0.29 -0.05 0.39 0.01 0.48 -0.79 -0.2 0.02 -0.25 -0.35 0.62 -0.14 -0.74 -0.87 0.63 -0.33 0.01 -0.06 -0.11 0.23
0.66 0.28 -0.17 0.3 0.44 -0.78 -0.28 -0.19 -0.42 -0.3 0.81 -1.33 -0.89 -1.34 0.78 -0.59 -0.38 -0.43 1.17 -0.63
-0.58 -0.09 0.22 0.06 0.57 0.19 0.52 0.03 -0.06 -0.2 0.26 -0.23 -2.0 -1.95 0.25 -0.55 -0.87 0.48 0.91 0.02
1.03 0.73 0.92 0.41 0.69 -1.09 -0.43 0.18 -0.44 -0.58 0.08 -0.19 -1.46 -2.04 -0.51 -0.67 -1.2 0.29 1.04 -3.01
0.82 0.68 0.61 1.68 1.15 -0.45 -0.92 -0.16 -1.54 -0.56 -0.4 -0.69 -3.89 -2.96 -1.17 -2.72 -1.11 0.49 0.94 -0.8
0.56 0.53 0.15 0.27 0.11 0.32 -0.7 -0.13 -0.36 -0.64 0.38 -0.89 -1.33 -1.48 0.4 0.37 0.03 0.17 0.48 -0.41
0.46 0.8 0.99 -0.53 0.33 -1.05 -0.46 0.01 -0.0 -0.14 0.33 -0.74 0.03 0.04 -0.53 -0.34 -0.38 -0.13 -0.51 0.06
0.19 0.57 0.39 0.35 0.74 0.38 -1.52 0.2 -0.08 0.0 0.18 -0.04 -2.16 -1.99 0.16 0.39 -0.09 -0.0 -0.27 -0.76
-0.4 -0.15 -0.25 0.19 -0.07 0.13 -1.56 0.17 0.24 0.03 0.02 -0.61 -0.1 -0.03 0.26 0.68 0.34 0.55 -0.16 -0.65
0.04 0.81 -0.22 0.58 1.02 0.11 -1.55 0.14 -0.7 -0.74 -0.43 -1.22 0.2 -0.23 -0.56 -1.58 -1.23 0.9 1.25 -2.15
0.12 0.93 0.36 0.89 0.56 -0.21 -0.74 0.19 -0.39 -0.36 0.36 -0.72 -0.42 -0.9 0.11 -0.94 -1.44 0.27 0.49 -0.99
-0.12 0.04 -0.17 -0.12 0.57 0.73 -0.94 0.06 -0.7 -0.65 0.19 -0.6 0.23 0.12 0.36 -0.76 -0.31 -0.18 0.56 0.26
0.33 -0.03 0.22 0.33 0.24 -0.4 0.01 -0.27 -0.45 -0.31 0.73 -0.53 -2.07 -2.14 0.88 -0.12 -0.32 0.12 0.92 -0.56
-1.42 -0.4 0.01 0.07 0.12 -1.57 -4.43 0.62 0.43 0.03 -0.53 0.26 -3.3 -1.16 -0.43 0.36 1.45 1.29 0.35 -0.95
0.82 -0.09 1.0 0.45 0.82 -0.54 -0.47 0.07 -0.85 -0.88 -0.12 -0.16 -2.32 -2.09 0.16 -0.63 0.07 0.09 -0.32 0.74
0.81 -0.31 1.04 0.37 0.83 -0.51 -0.24 0.22 -0.69 -0.77 0.44 -0.08 -2.59 -2.18 0.13 -0.91 0.08 -0.1 -1.08 0.69
0.67 1.22 0.93 0.6 0.59 -0.32 -0.17 0.03 -0.7 -0.28 -0.51 -0.81 -0.89 -1.19 -0.05 -1.28 -1.15 0.32 0.09 -0.75
0.17 -0.23 0.41 1.53 1.09 -1.68 -1.38 0.16 -0.92 -2.2 -0.43 -0.13 0.41 0.52 -0.85 -1.61 -0.88 0.92 0.39 -3.65
1.2 0.56 0.83 1.56 1.26 -0.01 -0.43 -0.3 -1.81 -1.79 -1.07 -0.32 -2.43 -2.21 -1.49 -1.78 -1.48 0.65 0.44 -1.39
-0.14 0.53 -0.93 -0.32 0.72 0.34 0.47 -0.14 -0.97 -0.89 -0.22 -0.28 -1.33 -0.9 -0.26 0.03 -0.33 0.53 1.26 -0.04
-0.01 0.91 -0.07 -0.09 0.81 0.37 -0.01 -0.11 -1.07 -1.35 -0.85 -0.32 -1.75 -1.65 -0.68 -0.58 -0.4 0.83 1.41 -0.08
0.44 0.87 1.6 0.68 0.93 -0.58 -0.47 -0.56 -0.83 -0.7 -0.65 -1.22 -1.12 -2.05 -0.19 -3.5 -1.68 0.75 1.21 -
0.36 0.47 0.02 -0.4 0.61 -0.14 -0.02 0.18 -0.38 -0.25 0.18 -0.97 -0.14 -0.52 0.15 -0.97 -1.26 0.19 1.07 -0.22
0.4 0.19 0.21 0.89 0.87 0.25 0.12 0.22 -0.36 -0.51 0.39 -0.08 -1.9 -1.89 0.79 -1.57 -0.91 -0.14 -0.26 -0.63
0.67 0.22 0.32 1.33 0.8 -0.8 -0.74 0.21 -0.57 -0.63 -0.25 -1.3 -0.52 -0.66 -0.56 -0.55 -1.37 0.44 0.92 -0.97
0.37 0.65 0.46 -0.33 0.47 -0.76 -0.43 0.58 -0.3 -0.35 0.19 -0.53 -0.13 -0.68 0.07 -0.9 -1.03 0.47 1.06 -2.17
1.02 0.37 0.7 0.78 0.63 0.23 0.14 0.09 -0.5 -0.62 -0.59 -0.69 -0.91 -1.19 -0.54 -0.76 -0.2 0.13 0.02 -0.79
-0.06 -0.29 -0.13 0.6 0.45 0.39 0.33 0.12 -0.37 -0.13 0.24 -0.19 -1.39 -1.49 0.3 -0.87 -0.3 0.32 0.13 0.44
-0.43 0.1 0.75 0.09 -0.12 -0.84 -0.7 0.18 0.32 0.24 0.0 0.26 -0.99 -1.06 -0.2 0.09 0.52 -0.23 0.63 -0.25
0.13 0.3 0.37 0.71 0.03 -0.03 -0.7 0.34 -0.21 -0.08 0.56 -0.49 -0.76 -1.23 0.46 -0.91 -0.67 0.16 0.71 -0.82
0.58 0.69 0.36 0.41 0.66 0.77 -0.51 0.06 -0.93 -1.37 -0.04 -0.79 -0.36 -0.89 0.05 -0.82 -1.1 0.27 0.69 -0.78
-0.74 0.42 -0.96 -0.64 0.67 0.37 0.24 -0.04 -0.27 -0.22 0.61 -0.46 -2.37 -2.56 0.68 -0.78 -1.06 0.84 0.88 0.35
0.96 -0.12 0.13 -0.07 0.37 0.34 -0.53 0.16 -0.36 -0.58 0.14 -0.38 -1.11 -1.29 0.18 -0.0 -0.08 0.7 0.04 -0.33
-0.2 0.83 0.18 -0.11 0.14 -0.5 0.15 -0.23 -0.11 -0.2 0.47 -0.48 -0.58 -0.66 0.52 -0.67 -0.57 0.09 0.51 0.12
0.43 -0.27 0.78 -0.51 0.36 -0.59 -0.23 0.31 -0.32 -0.27 0.79 -0.12 -0.56 -1.06 0.61 -0.85 -0.22 -0.04 0.34 -0.39
0.44 0.84 0.72 -0.15 0.52 0.04 -1.17 0.12 -0.14 -0.01 0.64 -0.27 -2.43 -2.79 0.41 -0.61 0.0 0.33 -0.19 -0.8
-0.32 0.37 -0.57 -0.28 0.26 -0.06 -0.27 0.12 -0.32 -0.17 0.8 -0.69 -0.66 -0.9 0.86 -0.61 -0.76 0.73 0.72 -0.42
0.31 0.75 0.59 0.09 0.19 -0.23 -0.32 -0.06 -0.16 -0.25 0.16 -0.53 -0.7 -1.09 0.18 -0.54 -0.33 -0.12 0.91 -0.52
-0.57 0.93 0.28 -0.8 0.06 -0.44 -0.18 -0.02 -0.33 -0.17 0.15 -0.51 -0.14 -0.45 0.18 -0.41 -0.25 0.04 0.95 0.2
-0.57 0.92 0.34 -0.17 0.19 -0.51 0.08 -0.09 -0.3 -0.19 0.74 -0.55 -1.1 -1.64 0.57 -0.89 -0.43 -0.05 0.87 0.06
0.02 -0.42 -0.22 -0.2 -0.34 -0.47 -0.65 -0.03 -0.22 -0.1 0.97 -0.72 -0.3 -0.13 0.95 -0.29 -0.25 0.36 -0.27 0.67
0.61 0.77 0.89 0.47 1.1 -0.68 -0.38 0.09 -0.71 -0.72 -0.86 -1.37 0.15 -0.22 -0.74 -1.3 -1.27 0.05 0.83 -0.87
-0.04 -0.65 -0.19 0.04 0.41 0.42 -0.97 0.07 -0.0 -0.12 -0.27 -0.36 -0.88 -0.66 0.01 0.41 0.04 1.09 0.03 0.05
0.63 -0.25 1.37 2.05 1.22 -1.33 -1.89 -0.21 -1.13 -1.12 -1.59 -0.02 -4.56 -3.4 -2.3 -1.62 -1.32 0.81 0.9 -3.54
0.9 -0.4 -0.22 1.24 0.9 -0.4 -1.05 0.51 -0.47 -1.18 -0.26 -0.89 0.19 0.1 -0.39 -1.03 -0.94 0.35 0.63 -1.8
0.77 -0.36 0.73 0.79 0.9 -0.0 -1.12 0.29 -0.9 -0.78 -0.62 -0.56 -0.19 -0.6 -0.36 -1.18 -0.23 0.93 -0.25 -0.38
0.05 0.75 0.52 0.59 1.01 -1.07 -0.61 -0.08 -0.28 -0.51 -0.42 -0.2 0.14 -0.03 -0.54 -0.82 -0.84 0.05 0.7 -0.85
0.67 -0.7 -0.02 0.19 0.35 -1.14 -3.01 0.3 0.25 0.05 -0.13 -0.95 -0.87 -0.83 -0.25 0.56 0.21 1.27 0.09 -0.23
1.11 -0.0 0.21 0.02 0.71 0.01 -0.55 0.45 0.0 0.05 -0.41 -0.2 -1.03 -1.28 -0.01 -0.74 -0.71 0.38 0.6 -1.35
-0.28 -0.21 -1.01 0.66 0.86 0.08 -1.55 0.22 -0.72 -0.64 0.27 -0.92 0.42 0.21 0.14 -1.64 -0.85 0.82 1.27 -2.21
-0.04 -0.07 0.83 0.72 0.46 -0.53 -0.57 0.03 -0.56 -0.13 -0.07 -0.46 -0.9 -1.68 -0.14 -0.82 -0.4 0.63 0.95 0.08
0.21 0.21 0.44 -0.12 -0.15 -0.17 -0.04 0.17 -0.2 -0.16 0.46 -0.03 -0.59 -0.79 0.36 -0.27 -0.06 -0.0 0.36 -0.33
0.47 1.05 0.76 0.7 0.6 -1.62 -1.02 0.06 -0.1 -0.31 0.43 -0.51 -1.38 -2.96 0.41 -1.04 -1.14 0.36 0.26 -0.34

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.