1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_9 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
11.91 0.0 0.8 2.05 0.88 0.56 1.15 2.53 14.0 1.94 0.0 0.91 1.97 7.19 0.08 0.07 0.85 1.7 0.0 4.67
5.6 11.06 5.42 0.27 8.14 5.97 2.25 5.4 17.16 10.25 4.02 6.19 5.76 10.12 5.19 9.55 3.78 8.78 5.82 7.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.1 0.0 0.11 0.35 0.55 0.04 0.01 0.02 0.08 0.16 0.5 0.05 0.04 0.18 0.04
0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.92 0.13 1.57 3.61 1.13 0.0 2.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.78 0.0 0.0 4.02 0.0 0.0 1.88 1.19 0.91 0.0 1.45 0.0 0.0 0.48 1.34 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0
0.1 0.0 3.69 0.0 0.0 0.0 0.11 1.74 0.02 0.08 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 1.24 0.51 0.0 0.01 0.17
0.0 0.0 0.08 0.0 0.28 0.0 0.0 0.08 0.33 0.33 0.22 0.27 0.14 0.07 0.03 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.17 0.0 0.19 0.4 0.2 0.08 0.31 0.86 1.06 0.52 0.3 0.13 0.09 0.2 0.47 0.29 0.44 0.36 0.33
0.06 0.1 0.0 0.0 0.0 0.17 0.08 0.15 0.47 0.36 0.5 0.14 0.09 0.09 0.41 0.11 0.25 0.17 0.42 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.0 0.06 0.0
0.1 0.0 0.0 0.21 0.13 0.0 0.15 0.03 0.25 0.23 0.18 0.02 0.03 0.14 0.17 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
0.47 0.0 0.57 1.23 0.0 0.0 0.13 2.54 7.46 9.24 0.9 3.9 0.0 0.66 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21
14.6 1.42 0.49 0.0 12.1 16.56 0.09 13.81 30.69 15.22 1.95 11.32 3.86 4.35 2.32 7.32 18.66 12.33 20.49 12.68
0.01 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.16 0.1 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.21 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.04 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.43 1.55 3.81 0.23 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.05 0.41 0.0 0.05 0.0 0.01 0.02 0.0 0.04 0.03 0.23 0.1 0.04
0.05 0.0 0.05 0.0 0.11 0.0 0.03 0.03 0.06 0.08 0.05 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.24 0.12 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.09 0.02 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.11 0.2 0.06 0.0 0.01 0.04 0.0 0.03 0.06 0.29 0.15 0.01 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.39 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.27 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.05 0.0 0.0 0.06 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
2.29 0.0 2.85 0.0 2.55 0.0 0.3 2.82 0.08 0.0 10.37 0.25 4.52 0.57 8.31 0.0 3.01 0.0 0.19 1.83
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.09 0.13 0.62 0.52 0.33 0.04 0.0 0.03 0.07 0.73 0.37 0.06 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.08 0.07 0.0 0.04 0.0 0.04 0.08 0.71 0.24 1.07 0.08 0.27 0.18 0.49 0.11 0.0 0.0 0.46 0.11
0.03 0.25 0.06 0.37 0.0 0.0 0.06 0.09 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.0 0.16 0.0 0.0 0.14 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.6 0.78 0.7 0.09 0.02 0.04 0.54 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.13 0.06 0.06 0.04 0.09 0.07 0.26 0.71 2.28 0.0 1.26 0.03 0.06 0.0 0.0 0.17 0.12 0.09 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.22 0.13 0.33 0.34 0.24 0.13 0.19 0.02 0.0 0.26 0.21 0.12 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.12 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.99 0.38 2.56 2.64 1.5 0.39 0.0 2.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0
0.0 0.14 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0
0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
0.07 0.0 0.12 0.0 0.76 0.0 0.6 0.35 0.76 1.2 1.08 0.13 0.96 0.05 1.14 0.0 0.13 0.34 0.45 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.21 1.32 0.6 0.12 0.05 1.19 0.18 0.1 0.13 0.01 0.0 0.0 0.01
0.33 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.02 1.61 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.01 0.02 0.25 0.3 0.15 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.07 0.03 0.0 0.07 0.27 0.34 0.01 0.42 0.26 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.03 0.12 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.04 0.0 0.04 0.18 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
1.44 0.07 0.05 0.03 1.11 1.93 0.12 1.32 1.37 1.13 0.27 0.82 0.38 0.28 0.31 0.23 0.82 2.27 1.95 1.92
0.14 0.08 0.0 0.22 0.08 0.0 0.0 0.4 7.38 1.93 0.0 0.02 0.18 0.04 0.15 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 1.93 0.0 0.0 0.0 1.07 0.15 0.41 2.24 1.62 0.0 0.09 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.16 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.36 0.0 0.14 0.0 0.42 4.82 0.05 0.79 6.93 8.65 0.36 0.29 0.6 0.29 0.4 0.28 0.64 1.17 2.39 1.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.07 0.07 0.0 0.03 0.05 0.15 0.0 0.0 0.0 0.23 0.06 0.0
0.05 0.0 0.1 0.0 0.78 0.8 0.05 0.12 0.79 0.58 0.19 0.02 0.15 0.05 0.11 0.29 0.36 0.23 0.1 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.12 0.05 0.09 0.03 0.1 0.0 0.17 0.54 0.69 0.03 0.03 0.06 0.16 0.05 0.45 0.08 0.1 0.23 0.04
35.36 34.8 32.0 35.08 21.65 29.05 13.47 28.08 52.71 36.57 35.77 23.61 8.38 10.73 33.32 33.28 25.49 33.48 28.02 9.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.02 0.04 0.0 0.12 0.0 0.08 0.34 1.38 0.26 0.08 0.06 0.14 0.15 0.0 1.57 0.63 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.08 0.0 3.26 31.36 17.24 0.0 1.77 22.34 19.11 0.16 33.14 6.52 0.33 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.05 0.89 0.15 0.1 0.13 0.12 0.99 0.02 0.0 0.0 0.9 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 0.09 0.05 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0
0.06 38.04 6.46 0.54 1.75 0.09 0.38 9.05 123.42 26.74 2.22 17.45 21.3 180.77 0.23 1.93 0.88 51.02 0.83 0.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.92 0.0 0.25 1.51 0.0 0.0 0.79 1.32 2.12 1.3 0.0 1.55 0.0 0.93 0.0
1.77 1.44 0.11 1.45 2.43 3.41 0.67 2.47 15.26 5.65 0.61 3.36 8.25 5.0 0.39 0.1 0.01 0.61 0.8 3.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.26 0.08 0.0 0.09 0.0 0.0 0.06 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.1
0.07 0.17 0.21 0.2 0.06 0.0 0.11 0.09 0.36 0.12 0.07 0.01 0.11 0.06 0.05 0.02 0.0 0.02 0.17 0.08
0.13 0.09 0.09 0.27 0.04 0.19 0.05 0.06 0.18 0.46 0.0 0.01 0.19 0.12 0.11 0.39 0.14 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
0.04 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.11 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0
0.15 0.11 0.0 0.0 0.11 0.11 0.33 0.07 0.39 0.23 0.48 0.15 0.19 0.43 0.22 0.42 0.41 0.0 0.09 0.08
0.74 0.22 0.1 2.28 0.7 0.24 0.42 0.29 3.27 0.54 0.82 0.55 0.41 0.47 0.45 2.39 0.96 0.18 0.15 0.13

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)