Heatmap: Cluster_9 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00358	0.85	0.0	0.06	0.15	0.06	0.04	0.08	0.18	1.0	0.14	0.0	0.06	0.14	0.51	0.01	0.0	0.06	0.12	0.0	0.33
Gb_00704	0.33	0.64	0.32	0.02	0.47	0.35	0.13	0.31	1.0	0.6	0.23	0.36	0.34	0.59	0.3	0.56	0.22	0.51	0.34	0.46
Gb_00722	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_00877	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.74	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01237	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.98	0.14	0.0	1.0	0.0	0.0	0.33	0.29	0.0	0.0	0.9	0.0	0.0	0.79
Gb_01867	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.19	0.0	0.2	0.64	1.0	0.08	0.02	0.04	0.15	0.29	0.91	0.09	0.07	0.33	0.08
Gb_02185	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.25	0.04	0.44	1.0	0.31	0.0	0.81	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02252	0.19	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.47	0.3	0.23	0.0	0.36	0.0	0.0	0.12	0.33	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0
Gb_02272	0.03	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.47	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.34	0.14	0.0	0.0	0.05
Gb_02365	0.0	0.0	0.24	0.0	0.87	0.0	0.0	0.23	1.0	1.0	0.66	0.81	0.43	0.21	0.1	0.0	0.7	0.0	0.0	0.0
Gb_03765	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.59	0.0	0.84	0.0	0.0	0.0	0.85	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04914	0.22	0.16	0.0	0.17	0.38	0.19	0.07	0.29	0.81	1.0	0.49	0.29	0.12	0.09	0.19	0.45	0.27	0.42	0.34	0.31
Gb_05623	0.12	0.21	0.0	0.0	0.0	0.34	0.17	0.3	0.93	0.72	1.0	0.28	0.18	0.17	0.82	0.22	0.49	0.33	0.83	0.17
Gb_05873	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_06432	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.19	0.05	1.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.86	0.75	0.0	0.87	0.0
Gb_07211	0.39	0.0	0.0	0.84	0.53	0.0	0.61	0.12	1.0	0.91	0.74	0.07	0.11	0.57	0.67	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07272	0.05	0.0	0.06	0.13	0.0	0.0	0.01	0.28	0.81	1.0	0.1	0.42	0.0	0.07	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
Gb_07281	0.48	0.05	0.02	0.0	0.39	0.54	0.0	0.45	1.0	0.5	0.06	0.37	0.13	0.14	0.08	0.24	0.61	0.4	0.67	0.41
Gb_07539	0.04	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.77	0.49	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_07703	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_08454	0.04	0.01	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.11	0.41	1.0	0.06	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Gb_08853	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.1	0.11	1.0	0.0	0.11	0.0	0.02	0.05	0.0	0.09	0.08	0.56	0.24	0.09
Gb_08917	0.46	0.0	0.5	0.0	1.0	0.0	0.26	0.28	0.6	0.74	0.44	0.12	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0
Gb_08931	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.98	0.51	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.59	0.0	0.0	0.0
Gb_09750	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10233	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.36	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10381	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.69	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	1.0	0.19	0.84
Gb_10636	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.39	0.68	0.22	0.0	0.02	0.16	0.0	0.11	0.22	1.0	0.53	0.04	0.78
Gb_11017	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_11282	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.14	1.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.69	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0
Gb_11845	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	1.0	0.59	0.0	0.0	0.76	0.0	0.87	0.0	0.0	0.0	0.37	0.0
Gb_12073	0.22	0.0	0.27	0.0	0.25	0.0	0.03	0.27	0.01	0.0	1.0	0.02	0.44	0.05	0.8	0.0	0.29	0.0	0.02	0.18
Gb_12098	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_12531	0.19	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.12	0.17	0.84	0.71	0.45	0.05	0.0	0.04	0.09	1.0	0.51	0.08	0.06	0.0
Gb_13773	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14209	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	1.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14465	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14567	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14575	0.02	0.07	0.07	0.0	0.03	0.0	0.04	0.08	0.66	0.22	1.0	0.07	0.25	0.17	0.46	0.11	0.0	0.0	0.44	0.11
Gb_14967	0.08	0.69	0.15	1.0	0.0	0.0	0.17	0.26	0.25	0.0	0.0	0.0	0.06	0.22	0.0	0.44	0.0	0.0	0.38	0.0
Gb_15234	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16161	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16631	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.78	1.0	0.9	0.11	0.02	0.05	0.69	0.0	0.05	0.0	0.0	0.03
Gb_16678	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17225	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.71	0.64	1.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17397	0.02	0.06	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.12	0.31	1.0	0.0	0.55	0.01	0.03	0.0	0.0	0.07	0.05	0.04	0.12
Gb_17622	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.66	0.37	0.97	1.0	0.72	0.37	0.56	0.07	0.0	0.77	0.62	0.35	0.0	0.0
Gb_18100	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	1.0
Gb_18772	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Gb_19066	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.66	1.0	0.0	0.06	0.0	0.07	0.24	0.0	0.11	0.07	0.18	0.0
Gb_19159	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.06	1.0	0.16	0.0	0.0	0.06	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0
Gb_19882	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	1.0	0.57	0.0	0.0	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20055	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	0.14	0.97	1.0	0.57	0.15	0.0	0.81	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0
Gb_20091	0.0	1.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.15	0.51	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.63	0.0	0.0	0.0
Gb_21343	0.82	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.0
Gb_21538	0.06	0.0	0.1	0.0	0.63	0.0	0.5	0.29	0.63	1.0	0.89	0.11	0.8	0.04	0.94	0.0	0.11	0.28	0.37	0.08
Gb_21747	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_21812	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22056	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.16	1.0	0.45	0.09	0.04	0.91	0.14	0.07	0.1	0.01	0.0	0.0	0.01
Gb_22654	0.2	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.01	1.0	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0
Gb_22858	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.04	0.06	0.74	0.89	0.44	0.0	0.0	0.01	0.02	0.05	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_22895	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23899	0.15	0.17	0.08	0.0	0.16	0.63	0.79	0.03	1.0	0.61	0.0	0.02	0.0	0.03	0.07	0.0	0.0	0.07	0.29	0.13
Gb_24245	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.03
Gb_24855	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24898	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.25	0.0	0.23	0.0	0.19	1.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0
Gb_25704	0.64	0.03	0.02	0.01	0.49	0.85	0.05	0.58	0.6	0.5	0.12	0.36	0.17	0.12	0.13	0.1	0.36	1.0	0.86	0.84
Gb_25713	0.02	0.01	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.05	1.0	0.26	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_25984	0.0	0.86	0.0	0.0	0.0	0.48	0.07	0.18	1.0	0.72	0.0	0.04	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07
Gb_27846	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28068	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.69	0.0	0.17	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28213	0.27	0.0	0.02	0.0	0.05	0.56	0.01	0.09	0.8	1.0	0.04	0.03	0.07	0.03	0.05	0.03	0.07	0.13	0.28	0.16
Gb_28412	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29326	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.16	0.3	0.28	0.0	0.14	0.21	0.63	0.0	0.0	0.0	1.0	0.24	0.0
Gb_29579	0.06	0.0	0.13	0.0	0.97	1.0	0.07	0.15	0.98	0.72	0.24	0.02	0.19	0.06	0.13	0.36	0.45	0.29	0.12	0.47
Gb_29860	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.81	0.34	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30736	0.12	0.17	0.08	0.13	0.04	0.14	0.0	0.24	0.78	1.0	0.04	0.05	0.09	0.23	0.07	0.65	0.11	0.14	0.34	0.07
Gb_31849	0.67	0.66	0.61	0.67	0.41	0.55	0.26	0.53	1.0	0.69	0.68	0.45	0.16	0.2	0.63	0.63	0.48	0.64	0.53	0.18
Gb_32046	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32223	0.73	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32473	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32660	0.03	0.02	0.03	0.0	0.08	0.0	0.05	0.22	0.88	0.17	0.05	0.04	0.09	0.1	0.0	1.0	0.4	0.01	0.0	0.0
Gb_33257	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.95	0.52	0.0	0.05	0.67	0.58	0.0	1.0	0.2	0.01	0.0	0.0
Gb_33468	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33571	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33765	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.05	0.89	0.15	0.11	0.13	0.12	1.0	0.02	0.0	0.0	0.9	0.0	0.08
Gb_33870	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33872	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_35193	0.07	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	1.0	0.96	0.49	0.2	0.0	0.05	0.22	0.16	0.27	0.0	0.05	0.0
Gb_36910	0.0	0.21	0.04	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05	0.68	0.15	0.01	0.1	0.12	1.0	0.0	0.01	0.0	0.28	0.0	0.01
Gb_37087	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	1.0	0.58	0.47	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44
Gb_37594	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.9	0.0	0.12	0.71	0.0	0.0	0.37	0.62	1.0	0.61	0.0	0.73	0.0	0.44	0.0
Gb_37972	0.12	0.09	0.01	0.09	0.16	0.22	0.04	0.16	1.0	0.37	0.04	0.22	0.54	0.33	0.03	0.01	0.0	0.04	0.05	0.21
Gb_38017	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	1.0	0.3	0.0	0.36	0.0	0.0	0.25	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38278	0.0	0.0	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.0	1.0
Gb_38431	0.19	0.48	0.58	0.56	0.16	0.0	0.32	0.25	1.0	0.34	0.2	0.02	0.31	0.16	0.14	0.07	0.0	0.05	0.47	0.22
Gb_38701	0.28	0.2	0.19	0.59	0.09	0.42	0.11	0.13	0.38	1.0	0.0	0.02	0.4	0.27	0.23	0.85	0.29	0.0	0.06	0.0
Gb_38848	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38963	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_39643	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40821	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0
Gb_40901	0.26	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.26	0.67	0.86	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.69	0.0
Gb_40942	0.32	0.23	0.0	0.0	0.23	0.24	0.69	0.15	0.81	0.48	1.0	0.31	0.4	0.89	0.46	0.89	0.85	0.0	0.18	0.17
Gb_40943	0.23	0.07	0.03	0.7	0.21	0.07	0.13	0.09	1.0	0.17	0.25	0.17	0.13	0.14	0.14	0.73	0.29	0.05	0.05	0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)